Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G19290.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:6666249-6668963 FORWARD LENGTH=2715 \| 201606
Sequence	ATGCTCCGACGGTCTCCGGCACGCGTTGTTGCCTATCAGTTGCTTCCGTTTCTCTATACT CGTAGCTTCTCCGAAGCCTCGAGAACCTTACGCCGCGAGCTTCGAGGAGGAAACGGGCGA ATTCGACCCGAATTACTCGAGCGGGTCTCACGTTTGCTCGTACTTGGCAGGTACGAAGCT TTACATGATCTATCACTCGATTTCTCAGATGAACTTCTCAACTCCATCCTGCGTAGATTG AGGCTTAACCCAGAGGCATGTCTGGAGATTTTCAATTTGGCTTCAAAGCAACAAAAGTTC CGGCCTGATTACAAGGCTTACTGTAAAATGGTTCACATCTTGTCCAGGGCTAGAAATTAC CAACAGACAAAATCGTATTTATGTGAACTGGTTGCTCTTAATCACTCGGGCTTCGTTGTC TGGGGAGAGCTCGTTCGGGTTTTCAAGGAATTTTCCTTCTCTCCTACAGTCTTTGACATG ATACTGAAAGTTTATGCAGAGAAGGGTTTGGTTAAGAATGCTTTACATGTGTTTGACAAC ATGGGAAACTATGGAAGAATTCCTAGTTTGTTGTCTTGTAATAGCTTGTTGAGCAATTTG GTCAGGAAAGGGGAAAACTTTGTGGCTTTACATGTTTATGATCAGATGATTAGCTTTGAG GTTTCTCCGGATGTGTTTACTTGCAGTATTGTTGTTAATGCTTATTGTAGAAGTGGGAAT GTGGATAAAGCCATGGTATTTGCGAAAGAAACGGAGAGTTCATTGGGTTTGGAGCTGAAT GTGGTAACTTACAATAGTTTGATCAATGGGTATGCTATGATCGGAGATGTTGAGGGAATG ACAAGAGTGTTGCGGTTGATGTCTGAGAGAGGGGTTTCTAGGAACGTTGTTACGTATACT TCGTTGATTAAGGGTTACTGCAAAAAGGGTTTGATGGAAGAAGCGGAACATGTGTTTGAA TTGCTAAAGGAAAAGAAACTTGTTGCGGATCAGCATATGTACGGTGTGTTGATGGATGGA TATTGTCGTACTGGTCAAATCCGTGATGCTGTTAGGGTTCATGATAATATGATTGAGATA GGCGTAAGAACAAATACTACCATTTGTAACTCCTTGATCAATGGGTACTGCAAATCTGGT CAATTAGTTGAAGCGGAACAAATATTTTCTCGGATGAACGATTGGAGCTTGAAACCAGAT CATCACACGTACAATACCCTTGTGGATGGGTATTGCAGGGCTGGTTATGTTGACGAGGCT TTAAAGCTTTGTGATCAAATGTGCCAAAAAGAAGTTGTACCAACAGTTATGACTTACAAT ATTCTGCTTAAAGGTTATAGTAGGATTGGTGCTTTTCATGATGTTTTGAGCCTTTGGAAG ATGATGCTTAAAAGAGGCGTAAACGCCGATGAGATTAGTTGTAGCACCCTACTCGAAGCA TTGTTCAAGCTTGGCGATTTTAATGAAGCTATGAAGCTGTGGGAGAATGTCTTAGCAAGA GGTCTATTGACTGATACGATAACATTAAATGTAATGATCAGTGGGCTGTGTAAAATGGAG AAGGTCAATGAAGCCAAAGAGATTCTAGATAATGTGAACATTTTCAGATGTAAGCCAGCT GTGCAAACATATCAAGCGTTGAGCCATGGGTATTATAAAGTCGGAAATTTGAAAGAAGCC TTTGCGGTTAAAGAGTATATGGAAAGGAAAGGAATCTTCCCCACCATAGAGATGTATAAC ACTCTGATATCTGGTGCTTTCAAATATAGACACTTGAATAAAGTAGCGGATCTTGTGATC GAGCTACGCGCAAGAGGATTAACTCCTACTGTTGCTACATATGGTGCTCTCATCACCGGC TGGTGCAATATTGGAATGATAGATAAAGCCTACGCTACATGTTTCGAAATGATAGAGAAA GGGATTACCTTAAATGTGAATATTTGCAGCAAGATTGCAAATAGTTTGTTTCGTCTTGAT AAGATTGATGAGGCTTGTTTGCTATTGCAGAAGATTGTGGATTTTGATCTGCTTCTTCCC GGTTACCAGAGCTTGAAAGAGTTTCTTGAGGCCAGTGCTACGACGTGTCTTAAAACACAA AAAATCGCTGAGTCTGTCGAGAATAGCACCCCTAAGAAGCTCTTAGTTCCCAATAACATT GTTTACAATGTTGCTATCGCAGGTCTCTGTAAAGCTGGGAAACTCGAGGATGCTCGAAAA CTCTTCTCGGATTTACTATCAAGTGATAGGTTTATTCCAGACGAATACACATACACGATC CTAATTCACGGATGTGCTATTGCTGGTGATATAAACAAAGCCTTTACCCTGAGGGATGAG ATGGCTCTAAAAGGTATTATCCCGAACATTGTTACATACAACGCTTTGATAAAAGGCTTG TGCAAGTTGGGTAATGTAGATCGTGCTCAGAGGCTTTTACATAAGCTTCCACAGAAGGGC ATAACTCCTAATGCTATTACCTATAACACATTAATTGATGGACTAGTTAAAAGTGGTAAT GTTGCTGAAGCTATGCGTTTAAAAGAAAAAATGATTGAGAAAGGCTTGGTTAGAGGGTCC GATAAACAGGGGGATGTTGACATACCAAAGGAGGTGGTTTTGGATCCGGAAGTTAAATTG GGGAGCACAGGAGTGATCGAAATGAACTCAAATGAGCTTTATGATGTTAGGAGAGTTTCT GAAGCAGTAGTATGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G19290.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:6666249-6668963 FORWARD LENGTH=904 \| 201606
Sequence	MLRRSPARVVAYQLLPFLYTRSFSEASRTLRRELRGGNGRIRPELLERVSRLLVLGRYEA LHDLSLDFSDELLNSILRRLRLNPEACLEIFNLASKQQKFRPDYKAYCKMVHILSRARNY QQTKSYLCELVALNHSGFVVWGELVRVFKEFSFSPTVFDMILKVYAEKGLVKNALHVFDN MGNYGRIPSLLSCNSLLSNLVRKGENFVALHVYDQMISFEVSPDVFTCSIVVNAYCRSGN VDKAMVFAKETESSLGLELNVVTYNSLINGYAMIGDVEGMTRVLRLMSERGVSRNVVTYT SLIKGYCKKGLMEEAEHVFELLKEKKLVADQHMYGVLMDGYCRTGQIRDAVRVHDNMIEI GVRTNTTICNSLINGYCKSGQLVEAEQIFSRMNDWSLKPDHHTYNTLVDGYCRAGYVDEA LKLCDQMCQKEVVPTVMTYNILLKGYSRIGAFHDVLSLWKMMLKRGVNADEISCSTLLEA LFKLGDFNEAMKLWENVLARGLLTDTITLNVMISGLCKMEKVNEAKEILDNVNIFRCKPA VQTYQALSHGYYKVGNLKEAFAVKEYMERKGIFPTIEMYNTLISGAFKYRHLNKVADLVI ELRARGLTPTVATYGALITGWCNIGMIDKAYATCFEMIEKGITLNVNICSKIANSLFRLD KIDEACLLLQKIVDFDLLLPGYQSLKEFLEASATTCLKTQKIAESVENSTPKKLLVPNNI VYNVAIAGLCKAGKLEDARKLFSDLLSSDRFIPDEYTYTILIHGCAIAGDINKAFTLRDE MALKGIIPNIVTYNALIKGLCKLGNVDRAQRLLHKLPQKGITPNAITYNTLIDGLVKSGN VAEAMRLKEKMIEKGLVRGSDKQGDVDIPKEVVLDPEVKLGSTGVIEMNSNELYDVRRVS EAVV

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G19290.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:6666074-6669576 FORWARD LENGTH=3394 \| 201606
Sequence	AACCGAACCAAATTCCAATTTAAAGGTTTCTTCTTTACACACTCTCACTCTTCGTCGCCG ACGTAGTCGTCGTCAATCGTCGACTAAAACCTTAGACACATTCCAAAGTACGGAACTTTG AGGTCCCAAGTTTAATGGGTTCCAGCGTTAATCATCCGACAACAAAATTCTCCTGATGCT CCGACGGTCTCCGGCACGCGTTGTTGCCTATCAGTTGCTTCCGTTTCTCTATACTCGTAG CTTCTCCGAAGCCTCGAGAACCTTACGCCGCGAGCTTCGAGGAGGAAACGGGCGAATTCG ACCCGAATTACTCGAGCGGGTCTCACGTTTGCTCGTACTTGGCAGGTACGAAGCTTTACA TGATCTATCACTCGATTTCTCAGATGAACTTCTCAACTCCATCCTGCGTAGATTGAGGCT TAACCCAGAGGCATGTCTGGAGATTTTCAATTTGGCTTCAAAGCAACAAAAGTTCCGGCC TGATTACAAGGCTTACTGTAAAATGGTTCACATCTTGTCCAGGGCTAGAAATTACCAACA GACAAAATCGTATTTATGTGAACTGGTTGCTCTTAATCACTCGGGCTTCGTTGTCTGGGG AGAGCTCGTTCGGGTTTTCAAGGAATTTTCCTTCTCTCCTACAGTCTTTGACATGATACT GAAAGTTTATGCAGAGAAGGGTTTGGTTAAGAATGCTTTACATGTGTTTGACAACATGGG AAACTATGGAAGAATTCCTAGTTTGTTGTCTTGTAATAGCTTGTTGAGCAATTTGGTCAG GAAAGGGGAAAACTTTGTGGCTTTACATGTTTATGATCAGATGATTAGCTTTGAGGTTTC TCCGGATGTGTTTACTTGCAGTATTGTTGTTAATGCTTATTGTAGAAGTGGGAATGTGGA TAAAGCCATGGTATTTGCGAAAGAAACGGAGAGTTCATTGGGTTTGGAGCTGAATGTGGT AACTTACAATAGTTTGATCAATGGGTATGCTATGATCGGAGATGTTGAGGGAATGACAAG AGTGTTGCGGTTGATGTCTGAGAGAGGGGTTTCTAGGAACGTTGTTACGTATACTTCGTT GATTAAGGGTTACTGCAAAAAGGGTTTGATGGAAGAAGCGGAACATGTGTTTGAATTGCT AAAGGAAAAGAAACTTGTTGCGGATCAGCATATGTACGGTGTGTTGATGGATGGATATTG TCGTACTGGTCAAATCCGTGATGCTGTTAGGGTTCATGATAATATGATTGAGATAGGCGT AAGAACAAATACTACCATTTGTAACTCCTTGATCAATGGGTACTGCAAATCTGGTCAATT AGTTGAAGCGGAACAAATATTTTCTCGGATGAACGATTGGAGCTTGAAACCAGATCATCA CACGTACAATACCCTTGTGGATGGGTATTGCAGGGCTGGTTATGTTGACGAGGCTTTAAA GCTTTGTGATCAAATGTGCCAAAAAGAAGTTGTACCAACAGTTATGACTTACAATATTCT GCTTAAAGGTTATAGTAGGATTGGTGCTTTTCATGATGTTTTGAGCCTTTGGAAGATGAT GCTTAAAAGAGGCGTAAACGCCGATGAGATTAGTTGTAGCACCCTACTCGAAGCATTGTT CAAGCTTGGCGATTTTAATGAAGCTATGAAGCTGTGGGAGAATGTCTTAGCAAGAGGTCT ATTGACTGATACGATAACATTAAATGTAATGATCAGTGGGCTGTGTAAAATGGAGAAGGT CAATGAAGCCAAAGAGATTCTAGATAATGTGAACATTTTCAGATGTAAGCCAGCTGTGCA AACATATCAAGCGTTGAGCCATGGGTATTATAAAGTCGGAAATTTGAAAGAAGCCTTTGC GGTTAAAGAGTATATGGAAAGGAAAGGAATCTTCCCCACCATAGAGATGTATAACACTCT GATATCTGGTGCTTTCAAATATAGACACTTGAATAAAGTAGCGGATCTTGTGATCGAGCT ACGCGCAAGAGGATTAACTCCTACTGTTGCTACATATGGTGCTCTCATCACCGGCTGGTG CAATATTGGAATGATAGATAAAGCCTACGCTACATGTTTCGAAATGATAGAGAAAGGGAT TACCTTAAATGTGAATATTTGCAGCAAGATTGCAAATAGTTTGTTTCGTCTTGATAAGAT TGATGAGGCTTGTTTGCTATTGCAGAAGATTGTGGATTTTGATCTGCTTCTTCCCGGTTA CCAGAGCTTGAAAGAGTTTCTTGAGGCCAGTGCTACGACGTGTCTTAAAACACAAAAAAT CGCTGAGTCTGTCGAGAATAGCACCCCTAAGAAGCTCTTAGTTCCCAATAACATTGTTTA CAATGTTGCTATCGCAGGTCTCTGTAAAGCTGGGAAACTCGAGGATGCTCGAAAACTCTT CTCGGATTTACTATCAAGTGATAGGTTTATTCCAGACGAATACACATACACGATCCTAAT TCACGGATGTGCTATTGCTGGTGATATAAACAAAGCCTTTACCCTGAGGGATGAGATGGC TCTAAAAGGTATTATCCCGAACATTGTTACATACAACGCTTTGATAAAAGGCTTGTGCAA GTTGGGTAATGTAGATCGTGCTCAGAGGCTTTTACATAAGCTTCCACAGAAGGGCATAAC TCCTAATGCTATTACCTATAACACATTAATTGATGGACTAGTTAAAAGTGGTAATGTTGC TGAAGCTATGCGTTTAAAAGAAAAAATGATTGAGAAAGGCTTGGTTAGAGGGTCCGATAA ACAGGGGGATGTTGACATACCAAAGGAGGTGGTTTTGGATCCGGAAGTTAAATTGGGGAG CACAGGAGTGATCGAAATGAACTCAAATGAGCTTTATGATGTTAGGAGAGTTTCTGAAGC AGTAGTATGATGACGAATAACAAATCCTGACCTCTTGTAGAACTCTTTGAAAGATCACTT TGAGTCTTCAATGTTGCTATGATTGATGGGTAACATGAAAGGAGGCTACAACGAATCTCC TCCATTGATGTGGTATGATTGTATACTTCAAAGAAAACAGTGCCATTGTCTCAAGATCAT TTGGAAATTGTGATCCTTCTACCAAACAATCCATCACTTGGCTTCAAATTTATCGGCCTT CTCTTCTGATCCTTGATGTTTTAAAGATACGAGACATCACATTCATGGAGCCTGAAATTT CGAGCGGCCTCAGGTTTATATAGTAAAGGCCAAACGATCGATATTAGTCACTGGTCTTTT TGATAAGCTGATCAACCGATCAAACCAGTAAGCTCCCCATCTCACGGTTGTTCTTGTACC TTCCAAAGCCAGATAAGACTCTGTGATCAGATATGTACCATATATAATGTTCAATGTAAT AAATGAGATCTTGATTAAATAAGTAAAGTTGCTT