Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G15510.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr1:5329111-5331711 FORWARD LENGTH=2601 \| 201606
Sequence	ATGGCGTCTTCTGCTCAAAGTCCTCATTTTTATCTCAATCCAGGCAAGTCCAACTCTTTT CAGAGCAAAGCTTATAAACAGAGAAACGTTAATTTCTATTGGAATTTTGGAATTCGGAGA CTTTTCTTGAGAAAATCTCAAGGACTATCTGTTCTTAGCTCGAGTTCGAGTAGTACCCAC TTTTCGAATTCTCAGTTACATGGACTCTGCGCGAATGGGAAGCTGGAGGAAGCTATGAAG CTTCTCAATTCTATGCAGGAGTTGCGGGTTGCGGTAGACGAAGATGTGTTTGTGGCTTTG GTTAGGCTGTGCGAGTGGAAGAGAGCACAGGAGGAAGGTTCTAAGGTTTATTCTATTGCT CTCAGTTCCATGAGCAGTCTTGGTGTTGAACTCGGTAACGCGTTTCTCGCTATGTTTGTG AGGTTTGGTAATTTGGTTGATGCCTGGTATGTTTTTGGTAAAATGTCTGAGAGAAACTTG TTTTCTTGGAATGTGTTGGTTGGTGGCTATGCAAAGCAAGGCTATTTCGATGAGGCTATG TGTTTGTATCATAGAATGTTGTGGGTTGGTGGTGTGAAGCCTGATGTCTATACGTTCCCC TGTGTGTTGAGAACCTGTGGAGGTATACCTGATCTAGCTCGAGGAAAAGAGGTTCATGTT CATGTGGTTCGATACGGATATGAATTGGATATTGATGTGGTTAACGCTTTGATTACTATG TATGTGAAGTGTGGTGATGTGAAGAGCGCGAGGTTGCTTTTTGATAGAATGCCTAGGAGA GATATAATCTCATGGAACGCAATGATCTCAGGGTATTTTGAGAATGGGATGTGTCATGAA GGATTGGAGTTATTCTTTGCAATGCGTGGGCTTTCCGTTGATCCTGATTTGATGACCTTG ACTAGTGTTATCTCTGCCTGTGAGCTTCTTGGAGATAGAAGGTTAGGAAGGGATATTCAT GCGTATGTGATAACCACGGGTTTCGCTGTTGACATATCTGTCTGCAACTCTTTAACGCAG ATGTACTTAAATGCTGGGTCATGGCGTGAAGCTGAAAAACTGTTCAGCAGAATGGAGCGC AAAGACATTGTGTCATGGACCACTATGATTTCAGGCTATGAATATAATTTTCTGCCCGAT AAGGCCATAGACACTTACAGAATGATGGATCAAGATTCTGTGAAGCCAGACGAGATAACA GTAGCTGCTGTTCTATCTGCTTGTGCTACTCTAGGTGATCTTGACACTGGTGTTGAGCTC CATAAGCTTGCGATTAAGGCAAGGCTCATATCCTATGTGATTGTCGCAAACAATCTCATT AATATGTACTCAAAGTGCAAATGCATTGATAAGGCCTTGGATATCTTCCATAACATCCCC CGCAAGAATGTAATATCTTGGACATCGATTATTGCAGGGCTTCGACTCAACAACCGGTGT TTTGAGGCCTTGATATTCCTCCGGCAAATGAAAATGACGTTGCAGCCAAATGCAATAACC TTAACAGCTGCATTAGCAGCTTGTGCTAGAATCGGGGCTCTGATGTGTGGGAAAGAGATT CATGCCCATGTACTGAGAACAGGAGTGGGGCTTGATGATTTTCTTCCAAATGCACTCTTA GACATGTATGTACGGTGCGGGAGAATGAACACTGCTTGGAGTCAGTTCAACTCACAGAAA AAAGATGTCACATCATGGAACATTCTTCTTACTGGATATTCAGAGCGGGGTCAAGGGTCG ATGGTGGTAGAGTTATTTGATAGAATGGTTAAGTCCAGAGTAAGGCCAGATGAGATTACA TTCATCTCATTGTTATGTGGTTGTAGCAAATCCCAAATGGTGAGACAAGGTTTGATGTAC TTTAGCAAAATGGAGGATTATGGTGTTACCCCAAACTTGAAGCACTATGCGTGCGTGGTT GATTTGCTAGGCCGTGCAGGCGAGTTACAAGAAGCACACAAGTTTATTCAGAAAATGCCA GTAACACCAGATCCAGCCGTATGGGGAGCTTTGCTTAATGCATGCAGGATTCACCACAAA ATTGATCTTGGTGAGCTATCAGCGCAACATATATTTGAGCTGGACAAGAAAAGTGTTGGC TATTACATTCTGTTATGTAATCTGTATGCTGATTGTGGAAAATGGAGAGAAGTTGCAAAA GTGAGAAGAATGATGAAAGAAAACGGGCTAACAGTTGATGCAGGATGCAGTTGGGTTGAA GTAAAGGGTAAAGTTCACGCCTTTCTTAGCGATGACAAGTACCATCCTCAAACAAAAGAG ATCAACACTGTTTTAGAGGGGTTCTATGAGAAAATGAGTGAAGTTGGGCTTACTAAAATT TCAGAATCGAGTTCTATGGATGAGACAGAGATTTCGAGAGATGAGATATTCTGTGGACAT AGCGAGAGAAAGGCCATTGCATTTGGTCTGATCAACACGGTCCCAGGAATGCCAATTTGG GTAACAAAGAATCTCAGTATGTGTGAAAATTGCCATGATACAGTAAAGTTCATCTCCAAA ACAGTAAGAAGAGAAATCTCAGTAAGAGATGCTGAGCATTTCCACCACTTTAAAGATGGA GAATGTTCATGTGGAGATTAG

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G15510.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr1:5329111-5331711 FORWARD LENGTH=866 \| 201606
Sequence	MASSAQSPHFYLNPGKSNSFQSKAYKQRNVNFYWNFGIRRLFLRKSQGLSVLSSSSSSTH FSNSQLHGLCANGKLEEAMKLLNSMQELRVAVDEDVFVALVRLCEWKRAQEEGSKVYSIA LSSMSSLGVELGNAFLAMFVRFGNLVDAWYVFGKMSERNLFSWNVLVGGYAKQGYFDEAM CLYHRMLWVGGVKPDVYTFPCVLRTCGGIPDLARGKEVHVHVVRYGYELDIDVVNALITM YVKCGDVKSARLLFDRMPRRDIISWNAMISGYFENGMCHEGLELFFAMRGLSVDPDLMTL TSVISACELLGDRRLGRDIHAYVITTGFAVDISVCNSLTQMYLNAGSWREAEKLFSRMER KDIVSWTTMISGYEYNFLPDKAIDTYRMMDQDSVKPDEITVAAVLSACATLGDLDTGVEL HKLAIKARLISYVIVANNLINMYSKCKCIDKALDIFHNIPRKNVISWTSIIAGLRLNNRC FEALIFLRQMKMTLQPNAITLTAALAACARIGALMCGKEIHAHVLRTGVGLDDFLPNALL DMYVRCGRMNTAWSQFNSQKKDVTSWNILLTGYSERGQGSMVVELFDRMVKSRVRPDEIT FISLLCGCSKSQMVRQGLMYFSKMEDYGVTPNLKHYACVVDLLGRAGELQEAHKFIQKMP VTPDPAVWGALLNACRIHHKIDLGELSAQHIFELDKKSVGYYILLCNLYADCGKWREVAK VRRMMKENGLTVDAGCSWVEVKGKVHAFLSDDKYHPQTKEINTVLEGFYEKMSEVGLTKI SESSSMDETEISRDEIFCGHSERKAIAFGLINTVPGMPIWVTKNLSMCENCHDTVKFISK TVRREISVRDAEHFHHFKDGECSCGD

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G15510.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr1:5329064-5331711 FORWARD LENGTH=2648 \| 201606
Sequence	AAAACCTCTACGAGAGTGACCATGTTCTTTGCTCTGTCTCTCCTACGATGGCGTCTTCTG CTCAAAGTCCTCATTTTTATCTCAATCCAGGCAAGTCCAACTCTTTTCAGAGCAAAGCTT ATAAACAGAGAAACGTTAATTTCTATTGGAATTTTGGAATTCGGAGACTTTTCTTGAGAA AATCTCAAGGACTATCTGTTCTTAGCTCGAGTTCGAGTAGTACCCACTTTTCGAATTCTC AGTTACATGGACTCTGCGCGAATGGGAAGCTGGAGGAAGCTATGAAGCTTCTCAATTCTA TGCAGGAGTTGCGGGTTGCGGTAGACGAAGATGTGTTTGTGGCTTTGGTTAGGCTGTGCG AGTGGAAGAGAGCACAGGAGGAAGGTTCTAAGGTTTATTCTATTGCTCTCAGTTCCATGA GCAGTCTTGGTGTTGAACTCGGTAACGCGTTTCTCGCTATGTTTGTGAGGTTTGGTAATT TGGTTGATGCCTGGTATGTTTTTGGTAAAATGTCTGAGAGAAACTTGTTTTCTTGGAATG TGTTGGTTGGTGGCTATGCAAAGCAAGGCTATTTCGATGAGGCTATGTGTTTGTATCATA GAATGTTGTGGGTTGGTGGTGTGAAGCCTGATGTCTATACGTTCCCCTGTGTGTTGAGAA CCTGTGGAGGTATACCTGATCTAGCTCGAGGAAAAGAGGTTCATGTTCATGTGGTTCGAT ACGGATATGAATTGGATATTGATGTGGTTAACGCTTTGATTACTATGTATGTGAAGTGTG GTGATGTGAAGAGCGCGAGGTTGCTTTTTGATAGAATGCCTAGGAGAGATATAATCTCAT GGAACGCAATGATCTCAGGGTATTTTGAGAATGGGATGTGTCATGAAGGATTGGAGTTAT TCTTTGCAATGCGTGGGCTTTCCGTTGATCCTGATTTGATGACCTTGACTAGTGTTATCT CTGCCTGTGAGCTTCTTGGAGATAGAAGGTTAGGAAGGGATATTCATGCGTATGTGATAA CCACGGGTTTCGCTGTTGACATATCTGTCTGCAACTCTTTAACGCAGATGTACTTAAATG CTGGGTCATGGCGTGAAGCTGAAAAACTGTTCAGCAGAATGGAGCGCAAAGACATTGTGT CATGGACCACTATGATTTCAGGCTATGAATATAATTTTCTGCCCGATAAGGCCATAGACA CTTACAGAATGATGGATCAAGATTCTGTGAAGCCAGACGAGATAACAGTAGCTGCTGTTC TATCTGCTTGTGCTACTCTAGGTGATCTTGACACTGGTGTTGAGCTCCATAAGCTTGCGA TTAAGGCAAGGCTCATATCCTATGTGATTGTCGCAAACAATCTCATTAATATGTACTCAA AGTGCAAATGCATTGATAAGGCCTTGGATATCTTCCATAACATCCCCCGCAAGAATGTAA TATCTTGGACATCGATTATTGCAGGGCTTCGACTCAACAACCGGTGTTTTGAGGCCTTGA TATTCCTCCGGCAAATGAAAATGACGTTGCAGCCAAATGCAATAACCTTAACAGCTGCAT TAGCAGCTTGTGCTAGAATCGGGGCTCTGATGTGTGGGAAAGAGATTCATGCCCATGTAC TGAGAACAGGAGTGGGGCTTGATGATTTTCTTCCAAATGCACTCTTAGACATGTATGTAC GGTGCGGGAGAATGAACACTGCTTGGAGTCAGTTCAACTCACAGAAAAAAGATGTCACAT CATGGAACATTCTTCTTACTGGATATTCAGAGCGGGGTCAAGGGTCGATGGTGGTAGAGT TATTTGATAGAATGGTTAAGTCCAGAGTAAGGCCAGATGAGATTACATTCATCTCATTGT TATGTGGTTGTAGCAAATCCCAAATGGTGAGACAAGGTTTGATGTACTTTAGCAAAATGG AGGATTATGGTGTTACCCCAAACTTGAAGCACTATGCGTGCGTGGTTGATTTGCTAGGCC GTGCAGGCGAGTTACAAGAAGCACACAAGTTTATTCAGAAAATGCCAGTAACACCAGATC CAGCCGTATGGGGAGCTTTGCTTAATGCATGCAGGATTCACCACAAAATTGATCTTGGTG AGCTATCAGCGCAACATATATTTGAGCTGGACAAGAAAAGTGTTGGCTATTACATTCTGT TATGTAATCTGTATGCTGATTGTGGAAAATGGAGAGAAGTTGCAAAAGTGAGAAGAATGA TGAAAGAAAACGGGCTAACAGTTGATGCAGGATGCAGTTGGGTTGAAGTAAAGGGTAAAG TTCACGCCTTTCTTAGCGATGACAAGTACCATCCTCAAACAAAAGAGATCAACACTGTTT TAGAGGGGTTCTATGAGAAAATGAGTGAAGTTGGGCTTACTAAAATTTCAGAATCGAGTT CTATGGATGAGACAGAGATTTCGAGAGATGAGATATTCTGTGGACATAGCGAGAGAAAGG CCATTGCATTTGGTCTGATCAACACGGTCCCAGGAATGCCAATTTGGGTAACAAAGAATC TCAGTATGTGTGAAAATTGCCATGATACAGTAAAGTTCATCTCCAAAACAGTAAGAAGAG AAATCTCAGTAAGAGATGCTGAGCATTTCCACCACTTTAAAGATGGAGAATGTTCATGTG GAGATTAG