Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G13190.1
CDS Infomation	\| RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein \| Chr1:4499633-4501354 FORWARD LENGTH=1722 \| 201606
Sequence	ATGACTGAAGAAAACGATTATGGAGGTAATCAGAAGATACTTCATCAAGGAAGTGGAACT ATACCTGCTCTAGCGGATGAAGAACTGATGGGAGACGATGATGAGTATGATGATTTGTAT AGCGATGTTAATGTTGGTGAGAGTTTCTTCCAAGCTCATAATCAGCCTCAACCACCAGCT CAGGTCAATACGAGTAATGCAAGTCTTCAAGCTCAGAATAGTCATGTTGCTGCTGAACCG AGGATGGGAATTGTATCTGGAGGTACAGTTGAAGGGAAGTATCGAAATGATGGGGGGCAT AATGGAATCAGTGGACCAGACACAAGATCAGATGTTTATCCACAAGCATCTTCTTTTGGA GCAAAAGGGTTGAATATTGATATCCAATCCAACAAAATCGCTCAACAAGGATCAACGACT GTTGTGTTAAACAATCATGGTTTTTCGGGGAATGCGGTAAATGTGCCTGAGATGCCTGTC CATAACTCCTATGGTGCTCCTCCTCAAGGTGCTCAGCAGATTCCTGTTAGCCAGATGAGT GTGAATCCAAATGTTATGATGAACAAAAGCCCTACGCAGTCATTTGTTGTGGACAATGGA AACACCATGCTTTTTGTTGGAGAGTTACACTGGTGGACGACGGATGCAGAGATTGAGAGT GTTCTTTCTCAGTATGGAAGAGTCAAAGAGATCAAGTTTTTCGATGAGAGAGTTAGTGGC AAGTCTAAAGGGTATTGTCAGGTTGAATTCTATGATTCAGCTGCTGCAGCCGCTTGCAAA GAAGGAATGAATGGTTTCATTTTCAATGGTAAAGCATGTGTTGTAGCCTTTGCCTCTCCT GAAACACTGAAGCAGATGGGAGCTAATTTCACAGGGAGGAACCAAGGACAAAACCAAATT CAAAATAGAAGGCCTCTGAATGAAGGAATGGGAAGAGGTAACAACAACAACAACAACATG AATACACAAAATGGAGATGGTGGAAGAAATTACGGTAGAGGGGGATTTGCGCGTGGTGGC CAAGGAATGGGCAACCGTGGAGGTGCTTGGGGTGGTGCAATGAGAGGTAGAGGGGTAAAC AACATGGCTAGTGGTTCTGGTGCTGGACCGTATGGGCCTGGACTAGCGGGTCCTGCATTT GGTGGTATGATGCATCCACAGGGTATGATGGGAGCTGGTGGGTTTGATCCAACGTTCATG GGTCGGGGTGCTGGTTATGGAGGGTATTCAGGTATTGCCTACCCTGGGATGCCTCATTCT TATCCAGGTGTTAATGCAATGGGAATGGTTGGGATTGCTCCTCATGTCAATCCAGCCTTT TTTGGCACGGGAATGGGAACAATGGGTAGCTCAGGGATGAATGGAGTTCATGCAGCAGCG ATGTGGAGTGAGGCTAATGGAGGTGGTGGTGAAGAGGGTGGTTCTGAATATGGTGGGTAT GAAGATGAAACCCAAGAGAAAGAAGAAAAGCCATCACGAGATAAAGAACGGGCTACCACA GAACGTGACTGGTCTGAGAACAGTGGTGACAGAAGACACAAGAGTCACCGTGAAGAGAAA GATAGTCACCGTGAGTATAAGCAGCAGAGAGACCGTGATTCTGATGAGTTTGATAGAGGA CAATCTAGCTTGAAATCTCGAAGCAGATCAAGAATGTCCGAAGATGATCATAGATCCAGG TCAAGAGATGCAGACTATGGAAAGAGGAGACGAGGTGACTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G13190.1
PEP Infomation	\| RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein \| Chr1:4499633-4501354 FORWARD LENGTH=573 \| 201606
Sequence	MTEENDYGGNQKILHQGSGTIPALADEELMGDDDEYDDLYSDVNVGESFFQAHNQPQPPA QVNTSNASLQAQNSHVAAEPRMGIVSGGTVEGKYRNDGGHNGISGPDTRSDVYPQASSFG AKGLNIDIQSNKIAQQGSTTVVLNNHGFSGNAVNVPEMPVHNSYGAPPQGAQQIPVSQMS VNPNVMMNKSPTQSFVVDNGNTMLFVGELHWWTTDAEIESVLSQYGRVKEIKFFDERVSG KSKGYCQVEFYDSAAAAACKEGMNGFIFNGKACVVAFASPETLKQMGANFTGRNQGQNQI QNRRPLNEGMGRGNNNNNNMNTQNGDGGRNYGRGGFARGGQGMGNRGGAWGGAMRGRGVN NMASGSGAGPYGPGLAGPAFGGMMHPQGMMGAGGFDPTFMGRGAGYGGYSGIAYPGMPHS YPGVNAMGMVGIAPHVNPAFFGTGMGTMGSSGMNGVHAAAMWSEANGGGGEEGGSEYGGY EDETQEKEEKPSRDKERATTERDWSENSGDRRHKSHREEKDSHREYKQQRDRDSDEFDRG QSSLKSRSRSRMSEDDHRSRSRDADYGKRRRGD

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G13190.1
Transcript Infomation	\| RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein \| Chr1:4498764-4501624 FORWARD LENGTH=2307 \| 201606
Sequence	GTTCTACAAAATACATTATTACATTTATAGCTTGTTGTATAAACGCACTAAAAAAACATG TAAAAGAAAAAAGTTTGTTAAGACAAACTGTTGACATCACGGTGAAGCTCTTCTTTCATT TTTTCTTCTTCTATCGGATAAGAAAGAGAACATCCCGAGTCTCGACGAATACGACTCTCT TCCTCCGATCTCATCAAAAACTCTTTCGCTAAAGCTCTGTTTCTGGGCGTTCAAACAATT CCGGAGTTTGTCGGATTCTCAACTTCCGTATACGGAGAAGGTCGAGCAACAAGTAGTCAA ATTTGTATAAATTCAATGACTGAAGAAAACGATTATGGAGGTAATCAGAAGATACTTCAT CAAGGAAGTGGAACTATACCTGCTCTAGCGGATGAAGAACTGATGGGAGACGATGATGAG TATGATGATTTGTATAGCGATGTTAATGTTGGTGAGAGTTTCTTCCAAGCTCATAATCAG CCTCAACCACCAGCTCAGGTCAATACGAGTAATGCAAGTCTTCAAGCTCAGAATAGTCAT GTTGCTGCTGAACCGAGGATGGGAATTGTATCTGGAGGTACAGTTGAAGGGAAGTATCGA AATGATGGGGGGCATAATGGAATCAGTGGACCAGACACAAGATCAGATGTTTATCCACAA GCATCTTCTTTTGGAGCAAAAGGGTTGAATATTGATATCCAATCCAACAAAATCGCTCAA CAAGGATCAACGACTGTTGTGTTAAACAATCATGGTTTTTCGGGGAATGCGGTAAATGTG CCTGAGATGCCTGTCCATAACTCCTATGGTGCTCCTCCTCAAGGTGCTCAGCAGATTCCT GTTAGCCAGATGAGTGTGAATCCAAATGTTATGATGAACAAAAGCCCTACGCAGTCATTT GTTGTGGACAATGGAAACACCATGCTTTTTGTTGGAGAGTTACACTGGTGGACGACGGAT GCAGAGATTGAGAGTGTTCTTTCTCAGTATGGAAGAGTCAAAGAGATCAAGTTTTTCGAT GAGAGAGTTAGTGGCAAGTCTAAAGGGTATTGTCAGGTTGAATTCTATGATTCAGCTGCT GCAGCCGCTTGCAAAGAAGGAATGAATGGTTTCATTTTCAATGGTAAAGCATGTGTTGTA GCCTTTGCCTCTCCTGAAACACTGAAGCAGATGGGAGCTAATTTCACAGGGAGGAACCAA GGACAAAACCAAATTCAAAATAGAAGGCCTCTGAATGAAGGAATGGGAAGAGGTAACAAC AACAACAACAACATGAATACACAAAATGGAGATGGTGGAAGAAATTACGGTAGAGGGGGA TTTGCGCGTGGTGGCCAAGGAATGGGCAACCGTGGAGGTGCTTGGGGTGGTGCAATGAGA GGTAGAGGGGTAAACAACATGGCTAGTGGTTCTGGTGCTGGACCGTATGGGCCTGGACTA GCGGGTCCTGCATTTGGTGGTATGATGCATCCACAGGGTATGATGGGAGCTGGTGGGTTT GATCCAACGTTCATGGGTCGGGGTGCTGGTTATGGAGGGTATTCAGGTATTGCCTACCCT GGGATGCCTCATTCTTATCCAGGTGTTAATGCAATGGGAATGGTTGGGATTGCTCCTCAT GTCAATCCAGCCTTTTTTGGCACGGGAATGGGAACAATGGGTAGCTCAGGGATGAATGGA GTTCATGCAGCAGCGATGTGGAGTGAGGCTAATGGAGGTGGTGGTGAAGAGGGTGGTTCT GAATATGGTGGGTATGAAGATGAAACCCAAGAGAAAGAAGAAAAGCCATCACGAGATAAA GAACGGGCTACCACAGAACGTGACTGGTCTGAGAACAGTGGTGACAGAAGACACAAGAGT CACCGTGAAGAGAAAGATAGTCACCGTGAGTATAAGCAGCAGAGAGACCGTGATTCTGAT GAGTTTGATAGAGGACAATCTAGCTTGAAATCTCGAAGCAGATCAAGAATGTCCGAAGAT GATCATAGATCCAGGTCAAGAGATGCAGACTATGGAAAGAGGAGACGAGGTGACTGAGAA AGAACCTCCCATGTTCTTCGTCTCTTTAGATGCCATTTTAAGTTACTCTCTACTATATCT ATCTCTTTATATCATCAAAATATTGGATACAATGTTTCTCTATACTTTATTTACTGATAG TCAGTCTTTGGAGACTAGCATATATATATGTAAACTATGTTTTGTTTTATTGATGGTTCT ATTTGTTATTGTCAATCATTACAGCTTCTAGAATGTCGTTTGGTTAAGATGAAATGAGAT CTTTATTCTTTGCTGCATTCAAGCTTT