Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G11290.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:3791454-3793883 REVERSE LENGTH=2430 \| 201606
Sequence	ATGAGCTCACAATTGGTGCAGTTCTCTACCGTTCCTCAAATCCCTAATCCCCCGTCTCGC CATCGTCACTTTCTCTCCGAGAGAAATTACATTCCGGCTAATGTCTATGAGCATCCAGCG GCTCTTCTTCTTGAGAGATGTTCTTCTCTGAAAGAACTTCGTCAAATTCTTCCTCTCGTC TTCAAAAATGGGCTTTATCAGGAGCATTTTTTCCAGACAAAGCTTGTCAGCTTGTTCTGT CGCTATGGCAGTGTCGACGAGGCTGCTCGTGTTTTCGAACCCATTGATAGTAAACTCAAT GTTCTTTATCACACCATGCTTAAAGGGTTTGCTAAAGTTTCAGACTTGGATAAAGCTTTG CAATTTTTTGTTCGGATGAGGTATGATGATGTAGAGCCTGTTGTGTATAACTTCACTTAT CTCCTCAAAGTTTGTGGAGACGAAGCAGAGCTTAGGGTTGGAAAGGAAATTCATGGGTTG TTGGTGAAGAGTGGGTTCTCGTTGGATTTGTTTGCCATGACTGGGCTTGAGAATATGTAT GCCAAGTGTAGGCAGGTAAATGAGGCCCGCAAGGTGTTTGATAGAATGCCTGAGAGAGAT TTGGTTTCTTGGAATACAATTGTGGCTGGGTATTCACAGAATGGGATGGCGAGAATGGCT TTGGAAATGGTTAAGTCAATGTGTGAGGAGAATCTGAAGCCTAGTTTTATCACTATTGTT TCTGTTTTGCCTGCTGTCTCTGCTTTGAGGTTGATTAGTGTTGGCAAGGAGATTCATGGG TATGCTATGCGGTCGGGATTTGATTCTCTTGTCAATATCTCCACTGCTTTGGTTGATATG TATGCGAAATGTGGATCTCTGGAAACTGCTCGGCAGCTCTTTGATGGGATGTTAGAAAGG AATGTTGTTTCATGGAATTCAATGATTGATGCCTATGTGCAGAATGAGAATCCTAAAGAG GCAATGTTAATTTTTCAAAAGATGTTGGACGAAGGAGTCAAACCCACTGATGTATCTGTC ATGGGTGCTTTGCATGCTTGTGCTGACCTGGGTGACCTTGAGAGAGGAAGATTCATTCAT AAGTTATCTGTTGAATTGGGTCTTGATAGAAATGTTTCTGTAGTGAACTCTTTGATCTCC ATGTATTGCAAGTGCAAGGAAGTTGATACTGCTGCTTCTATGTTTGGGAAATTGCAGAGC AGAACCCTTGTCTCTTGGAATGCAATGATATTAGGATTTGCACAGAATGGACGTCCCATC GATGCTTTGAATTACTTCAGCCAGATGCGGTCTCGGACAGTGAAACCAGACACATTTACT TATGTGAGTGTGATAACTGCTATCGCAGAGCTGTCAATTACACATCATGCGAAGTGGATT CATGGGGTGGTTATGCGAAGTTGTCTGGATAAGAACGTGTTTGTCACAACGGCTCTAGTC GACATGTATGCGAAATGTGGTGCTATTATGATTGCAAGATTGATTTTTGACATGATGAGT GAGCGTCATGTGACAACATGGAATGCTATGATTGATGGATACGGGACACATGGATTTGGG AAAGCTGCTCTGGAGTTGTTTGAAGAAATGCAAAAAGGCACCATCAAACCAAATGGTGTC ACATTTCTTTCTGTCATCTCTGCTTGCAGCCACTCGGGTTTGGTGGAGGCAGGACTCAAG TGCTTCTATATGATGAAGGAAAACTACAGCATAGAACTGTCAATGGACCACTATGGAGCC ATGGTCGATCTTTTAGGTCGAGCTGGACGGTTGAATGAAGCATGGGACTTTATTATGCAG ATGCCCGTTAAGCCGGCTGTAAATGTATATGGTGCCATGTTAGGTGCTTGCCAGATTCAT AAAAATGTGAATTTCGCTGAGAAAGCAGCAGAGAGATTGTTTGAGTTGAACCCGGATGAT GGTGGGTATCATGTGCTTCTTGCAAACATATATCGTGCAGCTTCAATGTGGGAAAAAGTG GGACAAGTGAGAGTTTCAATGTTGAGACAGGGTCTGCGCAAAACTCCTGGCTGCAGTATG GTGGAGATAAAGAACGAGGTGCATAGCTTCTTCTCTGGAAGCACAGCCCATCCCGATTCC AAGAAGATTTATGCGTTTCTTGAGAAGCTGATATGCCACATCAAAGAAGCTGGTTATGTT CCTGACACGAATTTAGTCCTCGGTGTGGAAAATGATGTTAAGGAGCAACTGCTGAGTACC CACAGTGAGAAGCTGGCTATATCTTTTGGATTGCTGAATACAACTGCAGGTACAACTATT CACGTAAGAAAGAACCTGCGGGTTTGTGCTGACTGTCACAATGCTACAAAGTACATTTCC CTTGTGACCGGACGGGAAATTGTAGTACGAGACATGCAACGGTTTCACCATTTCAAAAAC GGTGCCTGTTCGTGCGGAGATTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G11290.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:3791454-3793883 REVERSE LENGTH=809 \| 201606
Sequence	MSSQLVQFSTVPQIPNPPSRHRHFLSERNYIPANVYEHPAALLLERCSSLKELRQILPLV FKNGLYQEHFFQTKLVSLFCRYGSVDEAARVFEPIDSKLNVLYHTMLKGFAKVSDLDKAL QFFVRMRYDDVEPVVYNFTYLLKVCGDEAELRVGKEIHGLLVKSGFSLDLFAMTGLENMY AKCRQVNEARKVFDRMPERDLVSWNTIVAGYSQNGMARMALEMVKSMCEENLKPSFITIV SVLPAVSALRLISVGKEIHGYAMRSGFDSLVNISTALVDMYAKCGSLETARQLFDGMLER NVVSWNSMIDAYVQNENPKEAMLIFQKMLDEGVKPTDVSVMGALHACADLGDLERGRFIH KLSVELGLDRNVSVVNSLISMYCKCKEVDTAASMFGKLQSRTLVSWNAMILGFAQNGRPI DALNYFSQMRSRTVKPDTFTYVSVITAIAELSITHHAKWIHGVVMRSCLDKNVFVTTALV DMYAKCGAIMIARLIFDMMSERHVTTWNAMIDGYGTHGFGKAALELFEEMQKGTIKPNGV TFLSVISACSHSGLVEAGLKCFYMMKENYSIELSMDHYGAMVDLLGRAGRLNEAWDFIMQ MPVKPAVNVYGAMLGACQIHKNVNFAEKAAERLFELNPDDGGYHVLLANIYRAASMWEKV GQVRVSMLRQGLRKTPGCSMVEIKNEVHSFFSGSTAHPDSKKIYAFLEKLICHIKEAGYV PDTNLVLGVENDVKEQLLSTHSEKLAISFGLLNTTAGTTIHVRKNLRVCADCHNATKYIS LVTGREIVVRDMQRFHHFKNGACSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G11290.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr1:3791168-3794088 REVERSE LENGTH=2921 \| 201606
Sequence	GCGGTCTTTCTACGGTTTGATTGACCAAAGTTGGCCCGTCTATTACGACTTGGTCTTAAT TCACCTGAGAAGAGTGACTCACTTCACCTTCTTCTCCGGAATAAGCTCACGTCACTGTCA ATTCAATCAAGTCCAGACATTGTGGATAAAGTATATACTTCGAAGAAGGAATTGTCTAAA GGATTGATTTTTGCAGAACAAAAGCATGAGCTCACAATTGGTGCAGTTCTCTACCGTTCC TCAAATCCCTAATCCCCCGTCTCGCCATCGTCACTTTCTCTCCGAGAGAAATTACATTCC GGCTAATGTCTATGAGCATCCAGCGGCTCTTCTTCTTGAGAGATGTTCTTCTCTGAAAGA ACTTCGTCAAATTCTTCCTCTCGTCTTCAAAAATGGGCTTTATCAGGAGCATTTTTTCCA GACAAAGCTTGTCAGCTTGTTCTGTCGCTATGGCAGTGTCGACGAGGCTGCTCGTGTTTT CGAACCCATTGATAGTAAACTCAATGTTCTTTATCACACCATGCTTAAAGGGTTTGCTAA AGTTTCAGACTTGGATAAAGCTTTGCAATTTTTTGTTCGGATGAGGTATGATGATGTAGA GCCTGTTGTGTATAACTTCACTTATCTCCTCAAAGTTTGTGGAGACGAAGCAGAGCTTAG GGTTGGAAAGGAAATTCATGGGTTGTTGGTGAAGAGTGGGTTCTCGTTGGATTTGTTTGC CATGACTGGGCTTGAGAATATGTATGCCAAGTGTAGGCAGGTAAATGAGGCCCGCAAGGT GTTTGATAGAATGCCTGAGAGAGATTTGGTTTCTTGGAATACAATTGTGGCTGGGTATTC ACAGAATGGGATGGCGAGAATGGCTTTGGAAATGGTTAAGTCAATGTGTGAGGAGAATCT GAAGCCTAGTTTTATCACTATTGTTTCTGTTTTGCCTGCTGTCTCTGCTTTGAGGTTGAT TAGTGTTGGCAAGGAGATTCATGGGTATGCTATGCGGTCGGGATTTGATTCTCTTGTCAA TATCTCCACTGCTTTGGTTGATATGTATGCGAAATGTGGATCTCTGGAAACTGCTCGGCA GCTCTTTGATGGGATGTTAGAAAGGAATGTTGTTTCATGGAATTCAATGATTGATGCCTA TGTGCAGAATGAGAATCCTAAAGAGGCAATGTTAATTTTTCAAAAGATGTTGGACGAAGG AGTCAAACCCACTGATGTATCTGTCATGGGTGCTTTGCATGCTTGTGCTGACCTGGGTGA CCTTGAGAGAGGAAGATTCATTCATAAGTTATCTGTTGAATTGGGTCTTGATAGAAATGT TTCTGTAGTGAACTCTTTGATCTCCATGTATTGCAAGTGCAAGGAAGTTGATACTGCTGC TTCTATGTTTGGGAAATTGCAGAGCAGAACCCTTGTCTCTTGGAATGCAATGATATTAGG ATTTGCACAGAATGGACGTCCCATCGATGCTTTGAATTACTTCAGCCAGATGCGGTCTCG GACAGTGAAACCAGACACATTTACTTATGTGAGTGTGATAACTGCTATCGCAGAGCTGTC AATTACACATCATGCGAAGTGGATTCATGGGGTGGTTATGCGAAGTTGTCTGGATAAGAA CGTGTTTGTCACAACGGCTCTAGTCGACATGTATGCGAAATGTGGTGCTATTATGATTGC AAGATTGATTTTTGACATGATGAGTGAGCGTCATGTGACAACATGGAATGCTATGATTGA TGGATACGGGACACATGGATTTGGGAAAGCTGCTCTGGAGTTGTTTGAAGAAATGCAAAA AGGCACCATCAAACCAAATGGTGTCACATTTCTTTCTGTCATCTCTGCTTGCAGCCACTC GGGTTTGGTGGAGGCAGGACTCAAGTGCTTCTATATGATGAAGGAAAACTACAGCATAGA ACTGTCAATGGACCACTATGGAGCCATGGTCGATCTTTTAGGTCGAGCTGGACGGTTGAA TGAAGCATGGGACTTTATTATGCAGATGCCCGTTAAGCCGGCTGTAAATGTATATGGTGC CATGTTAGGTGCTTGCCAGATTCATAAAAATGTGAATTTCGCTGAGAAAGCAGCAGAGAG ATTGTTTGAGTTGAACCCGGATGATGGTGGGTATCATGTGCTTCTTGCAAACATATATCG TGCAGCTTCAATGTGGGAAAAAGTGGGACAAGTGAGAGTTTCAATGTTGAGACAGGGTCT GCGCAAAACTCCTGGCTGCAGTATGGTGGAGATAAAGAACGAGGTGCATAGCTTCTTCTC TGGAAGCACAGCCCATCCCGATTCCAAGAAGATTTATGCGTTTCTTGAGAAGCTGATATG CCACATCAAAGAAGCTGGTTATGTTCCTGACACGAATTTAGTCCTCGGTGTGGAAAATGA TGTTAAGGAGCAACTGCTGAGTACCCACAGTGAGAAGCTGGCTATATCTTTTGGATTGCT GAATACAACTGCAGGTACAACTATTCACGTAAGAAAGAACCTGCGGGTTTGTGCTGACTG TCACAATGCTACAAAGTACATTTCCCTTGTGACCGGACGGGAAATTGTAGTACGAGACAT GCAACGGTTTCACCATTTCAAAAACGGTGCCTGTTCGTGCGGAGATTACTGGTGACATGA CCCTCCACCGAAAACATTGATGAGCATTATATATCCGGGAGAGAAAACTAATTTGAGGAA TAACAAGACCTGGTCTGAAGTAGAAGCCTTTGTAGAGAGCTACAATTTGCTGTATCATAA ACAAGGTTTAAGCTGATCACTACGAATAGAGAGCTACAATATGTGAGCGAAGTCTCGTTT GCAAGCGTCCAAGTAAAAATTTATTCATTTTTGCAGCTCTGTTTTTCCTTTCTTTCCCAG TACATATGAAAGCTGAAAAGTGTTGTTGTGGAATTGGTAGC