Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G09960.1
CDS Infomation	\| sucrose transporter 4 \| Chr1:3244258-3246718 FORWARD LENGTH=1533 \| 201606
Sequence	ATGGCTACTTCCGATCAAGATCGCCGTCACAGAGTCACTCGCAACCGTCCACCAATAGCT CGACCCTCTACTTCTTCATCTCGTCCCGTTGTATCTCCTCCTAGATCAAAAGTTTCGAAG CGTGTGCTTCTCCGTGTAGCTTCCGTCGCATGCGGGATTCAATTCGGATGGGCTCTTCAG CTTTCTCTCCTCACACCTTACGTTCAAGAGCTGGGGATCCCACACGCTTGGGCTAGTGTG ATTTGGCTTTGCGGTCCTCTCTCTGGTTTGTTCGTGCAACCGCTCGTTGGGCATAGTAGC GATAGGTGTACTAGTAAGTACGGTCGTCGGAGACCGTTTATTGTCGCCGGAGCTGTGGCG ATTTCTATCTCTGTTATGGTTATTGGTCATGCGGCGGATATTGGATGGGCATTTGGGGAT AGAGAAGGGAAGATTAAGCCGAGGGCGATTGTTGCTTTTGTTTTAGGGTTTTGGATTCTT GATGTTGCTAATAATATGACTCAAGGTCCTTGTAGAGCTCTCCTTGCTGATCTTACTGAG AATGATAATCGCAGAACCCGAGTTGCAAATGGCTACTTCTCTCTCTTTATGGCTGTTGGC AATGTTCTTGGCTATGCTACTGGATCATACAATGGTTGGTACAAGATCTTCACTTTTACG AAGACAGTTGCATGTAATGTGGAATGTGCCAATCTCAAGTCTGCCTTCTACATAGATGTT GTCTTTATTGCAATAACTACGATCCTAAGCGTCTCAGCGGCTCATGAGGTGCCACTTGCT TCATTGGCTTCTGAAGCACATGGGCAAACCAGTGGAACAGACGAAGCTTTTCTTTCTGAG ATATTTGGAACTTTCAGATATTTTCCAGGAAATGTTTGGATAATCTTGCTTGTTACAGCA TTGACATGGATTGGTTGGTTTCCATTTATTCTGTTTGATACTGATTGGATGGGTCGAGAG ATCTATGGCGGTGAACCGAACATAGGGACTTCATATAGTGCTGGGGTCAGTATGGGTGCA CTTGGTTTGATGTTGAATTCTGTTTTTCTTGGAATCACTTCTGTGCTCATGGAGAAACTT TGCAGAAAGTGGGGGGCTGGTTTTGTTTGGGGAATATCAAATATCTTAATGGCTATTTGC TTTCTTGGAATGATAATCACCTCATTTGTTGCGTCTCACCTTGGCTACATTGGCCATGAA CAACCTCCTGCCAGCATCGTGTTTGCTGCTGTGTTAATCTTTACAATTCTGGGCATTCCA TTGGCGATAACTTACAGCGTCCCATATGCGTTGATTTCCATACGTATTGAATCCCTGGGC TTAGGTCAAGGCTTATCTTTGGGTGTGCTAAATTTGGCGATAGTCATCCCACAGGTAATT GTGTCTGTTGGCAGTGGCCCATGGGATCAACTGTTTGGAGGTGGGAATTCACCGGCACTT GCAGTAGGAGCAGCTACAGGCTTCATTGGCGGAATTGTAGCTATCTTGGCTCTTCCACGG ACAAGGATTCAGAAGCCCATCCCTCTCCCATGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G09960.1
PEP Infomation	\| sucrose transporter 4 \| Chr1:3244258-3246718 FORWARD LENGTH=510 \| 201606
Sequence	MATSDQDRRHRVTRNRPPIARPSTSSSRPVVSPPRSKVSKRVLLRVASVACGIQFGWALQ LSLLTPYVQELGIPHAWASVIWLCGPLSGLFVQPLVGHSSDRCTSKYGRRRPFIVAGAVA ISISVMVIGHAADIGWAFGDREGKIKPRAIVAFVLGFWILDVANNMTQGPCRALLADLTE NDNRRTRVANGYFSLFMAVGNVLGYATGSYNGWYKIFTFTKTVACNVECANLKSAFYIDV VFIAITTILSVSAAHEVPLASLASEAHGQTSGTDEAFLSEIFGTFRYFPGNVWIILLVTA LTWIGWFPFILFDTDWMGREIYGGEPNIGTSYSAGVSMGALGLMLNSVFLGITSVLMEKL CRKWGAGFVWGISNILMAICFLGMIITSFVASHLGYIGHEQPPASIVFAAVLIFTILGIP LAITYSVPYALISIRIESLGLGQGLSLGVLNLAIVIPQVIVSVGSGPWDQLFGGGNSPAL AVGAATGFIGGIVAILALPRTRIQKPIPLP

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G09960.1
Transcript Infomation	\| sucrose transporter 4 \| Chr1:3243986-3247216 FORWARD LENGTH=2217 \| 201606
Sequence	TCAAAATCATTTCGTTTCAACAAAAATATGTATTTTATCCATAGAGAAACAACAAACCTT ACACTATATACCCTCTTTTAACGTGCCCACTTTTCATTATTTACACAATTTCCCCAACAA ATTTAAAACAATTTACAAAAAGCACTCAACTTTCCTAAAGTAGATTCCTTTAGTCCAATG GAATTCTTACAACATCTTCTTCTTCGCCACCTTTTTCTCTCCACTTTAAGCTTTTTCACT CTCTCTACGCCACGACGACTGTGAAGCGAGAAATGGCTACTTCCGATCAAGATCGCCGTC ACAGAGTCACTCGCAACCGTCCACCAATAGCTCGACCCTCTACTTCTTCATCTCGTCCCG TTGTATCTCCTCCTAGATCAAAAGTTTCGAAGCGTGTGCTTCTCCGTGTAGCTTCCGTCG CATGCGGGATTCAATTCGGATGGGCTCTTCAGCTTTCTCTCCTCACACCTTACGTTCAAG AGCTGGGGATCCCACACGCTTGGGCTAGTGTGATTTGGCTTTGCGGTCCTCTCTCTGGTT TGTTCGTGCAACCGCTCGTTGGGCATAGTAGCGATAGGTGTACTAGTAAGTACGGTCGTC GGAGACCGTTTATTGTCGCCGGAGCTGTGGCGATTTCTATCTCTGTTATGGTTATTGGTC ATGCGGCGGATATTGGATGGGCATTTGGGGATAGAGAAGGGAAGATTAAGCCGAGGGCGA TTGTTGCTTTTGTTTTAGGGTTTTGGATTCTTGATGTTGCTAATAATATGACTCAAGGTC CTTGTAGAGCTCTCCTTGCTGATCTTACTGAGAATGATAATCGCAGAACCCGAGTTGCAA ATGGCTACTTCTCTCTCTTTATGGCTGTTGGCAATGTTCTTGGCTATGCTACTGGATCAT ACAATGGTTGGTACAAGATCTTCACTTTTACGAAGACAGTTGCATGTAATGTGGAATGTG CCAATCTCAAGTCTGCCTTCTACATAGATGTTGTCTTTATTGCAATAACTACGATCCTAA GCGTCTCAGCGGCTCATGAGGTGCCACTTGCTTCATTGGCTTCTGAAGCACATGGGCAAA CCAGTGGAACAGACGAAGCTTTTCTTTCTGAGATATTTGGAACTTTCAGATATTTTCCAG GAAATGTTTGGATAATCTTGCTTGTTACAGCATTGACATGGATTGGTTGGTTTCCATTTA TTCTGTTTGATACTGATTGGATGGGTCGAGAGATCTATGGCGGTGAACCGAACATAGGGA CTTCATATAGTGCTGGGGTCAGTATGGGTGCACTTGGTTTGATGTTGAATTCTGTTTTTC TTGGAATCACTTCTGTGCTCATGGAGAAACTTTGCAGAAAGTGGGGGGCTGGTTTTGTTT GGGGAATATCAAATATCTTAATGGCTATTTGCTTTCTTGGAATGATAATCACCTCATTTG TTGCGTCTCACCTTGGCTACATTGGCCATGAACAACCTCCTGCCAGCATCGTGTTTGCTG CTGTGTTAATCTTTACAATTCTGGGCATTCCATTGGCGATAACTTACAGCGTCCCATATG CGTTGATTTCCATACGTATTGAATCCCTGGGCTTAGGTCAAGGCTTATCTTTGGGTGTGC TAAATTTGGCGATAGTCATCCCACAGGTAATTGTGTCTGTTGGCAGTGGCCCATGGGATC AACTGTTTGGAGGTGGGAATTCACCGGCACTTGCAGTAGGAGCAGCTACAGGCTTCATTG GCGGAATTGTAGCTATCTTGGCTCTTCCACGGACAAGGATTCAGAAGCCCATCCCTCTCC CATGAGATTCTCTCTTTTGTTATATAAGATGAGTGTCAAGCGAGGAACGCATAAGGGGAG TGCTTGGAAATGGCAAGGAGATGGAACACTTAATGTGATCCTTGTCGAAAATTCGTGCAA TGGCTTCTCGTGTGACTAACTTATTTGCAGCTACTAGGACTTAATCCCCTCTACTTTGGG GACTATGATCCTTGTATACACGAGGCACCATAGAACCAATGAAAATAATACATCATTCAG TTTGTGAGGTATATGCATCTCTCCTTTATTGGAAGTTCCAGTTCGGGATCTTCTCTGTTT TTTTTGTTGTTGTTGTAAATTAATGTAAAAACCTGTGTACAACAGAGTGTTTGTAAGGGC CCCTGAGTTCTGTAACTGTTTATAAAGTTCATTTTCTTTAGAATTAGTTTGATAAAG