Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G07670.1
CDS Infomation	\| endomembrane-type CA-ATPase 4 \| Chr1:2370305-2374196 REVERSE LENGTH=3186 \| 201606
Sequence	ATGGGGAAAGGAGGTGAAGATTGCGGGAATAAGCAAACTAATAGTTCTGAATTGGTCAAG TCTGATACTTTTCCTGCTTGGGGTAAAGATGTGTCGGAATGCGAAGAGAAGTTTGGTGTT AGTCGTGAGAAAGGTTTGAGCACTGATGAGGTGTTGAAACGGCATCAGATCTATGGTTTG AATGAATTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGCTGATTTTGGAACAGTTTAAT GATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTAGCCTTCTTT GATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTTTT CTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGCATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGGCG TTGGAAGCTTTGAAAGAGATTCAGTCTCAGCAAGCTACCGTCATGCGTGATGGGACTAAG GTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGATATTGTGGAACTGAGGGTTGGT GATAAGGTGCCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGTTCAACTTTGAGAGTCGAG CAGGGGTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCACGTGGATGAG AATGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTCGTGAATGGG AACTGCATATGTTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACTCA CAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACGAG TTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGTGCGTTAGTGTGGCTCATCAAT GTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCTCC TTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTTGCACTGGCGGTTGCTGCAATTCCA GAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTAGGAAGATGGCTCAG AAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGTGATA TGCTCTGACAAAACTGGAACTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTCGTTGCT ATGGGTTCGAGGATCGGAACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATCCT CGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAACGGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGATT GCAAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAATGTTGAGAAATCTGATCAGCAATTTGTG TCTAGGGGCATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTTCCC GAAGGATTGAATGAAGCTTCATCCGATGGCAATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTATGGAGT GAACTAGAACAACGGATTGCCACCCTTGAGTTTGACCGTGACCGGAAATCAATGGGAGTT ATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCCGTAGAAAATGTA TTGGAAAGGAGTACCCATATTCAGCTACTTGATGGTTCCACTCGAGAGCTTGACCAATAC TCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATGTCTC GGATTTGCATACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGATGGCAGTGAAGACCAT CCTGCTCATCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCTAGTA TTTGTTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCATTGCA GACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCACAGCG GAAGCAATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAGAAGC TTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTTAAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACAGGA GGGCTCCTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTGAAA GAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTCCTGCCCTGAAG TTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGGACAGAGGTAGCAAAGGAGGCATCT GACTTGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGCAGG TCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGTGAG GTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGATACCCGTTCAA CTTCTGTGGGTGAATCTCGTAACAGATGGTCCTCCAGCTACTGCTTTGGGATTCAACCCC CCTGACAAGGATATTATGAAAAAGCCTCCTCGTAGGAGCGATGACTCTCTTATCACTGCG TGGATCCTCTTCCGCTATATGGTGATTGGTTTGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGGAGTA TTCATCATATGGTACACACACAACAGCTTTATGGGCATAGACCTGAGCCAAGACGGTCAC AGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTCGCACATTGGGGCCAATGCTCTTCATGGGAAGGCTTC AAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCGTTCGACTCAAACCCTTGCGAC TATTTTCAGCAGGGTAAAATCAAGGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGCCATT GAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCCACCC TGGGTTAACCCGTGGCTGCTCCTGGCAATGGCTGTCTCATTTGGACTCCACTTTGTGATA TTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAGGTGTTTGGTATTGTGCCACTGAGCTTGAACGAGTGG CTGCTAGTGCTGGCTGTGTCGCTGCCGGTAATTTTGATAGACGAAGTGCTCAAGTTTGTA GGAAGGTGCACGAGTGGCTACCGCTACTCACCTCGCACTCCCTCAGCTAAGCAAAAGGAG GAGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G07670.1
PEP Infomation	\| endomembrane-type CA-ATPase 4 \| Chr1:2370305-2374196 REVERSE LENGTH=1061 \| 201606
Sequence	MGKGGEDCGNKQTNSSELVKSDTFPAWGKDVSECEEKFGVSREKGLSTDEVLKRHQIYGL NELEKPEGTSIFKLILEQFNDTLVRILLAAAVISFVLAFFDGDEGGEMGITAFVEPLVIF LILIVNAIVGIWQETNAEKALEALKEIQSQQATVMRDGTKVSSLPAKELVPGDIVELRVG DKVPADMRVVALISSTLRVEQGSLTGESEAVSKTTKHVDENADIQGKKCMVFAGTTVVNG NCICLVTDTGMNTEIGRVHSQIQEAAQHEEDTPLKKKLNEFGEVLTMIIGLICALVWLIN VKYFLSWEYVDGWPRNFKFSFEKCTYYFEIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRKMAQ KNALVRKLPSVETLGCTTVICSDKTGTLTTNQMAVSKLVAMGSRIGTLRSFNVEGTSFDP RDGKIEDWPTGRMDANLQMIAKIAAICNDANVEKSDQQFVSRGMPTEAALKVLVEKMGFP EGLNEASSDGNVLRCCRLWSELEQRIATLEFDRDRKSMGVMVDSSSGKKLLLVKGAVENV LERSTHIQLLDGSTRELDQYSRDLILQSLHDMSLSALRCLGFAYSDVPSDFATYDGSEDH PAHQQLLNPSNYSSIESNLVFVGFVGLRDPPRKEVRQAIADCRTAGIRVMVITGDNKSTA EAICREIGVFEADEDISSRSLTGKEFMDVKDQKNHLRQTGGLLFSRAEPKHKQEIVRLLK EDGEVVAMTGDGVNDAPALKLADIGVAMGISGTEVAKEASDLVLADDNFSTIVAAVGEGR SIYNNMKAFIRYMISSNIGEVASIFLTAALGIPEGMIPVQLLWVNLVTDGPPATALGFNP PDKDIMKKPPRRSDDSLITAWILFRYMVIGLYVGVATVGVFIIWYTHNSFMGIDLSQDGH SLVSYSQLAHWGQCSSWEGFKVSPFTAGSQTFSFDSNPCDYFQQGKIKASTLSLSVLVAI EMFNSLNALSEDGSLVTMPPWVNPWLLLAMAVSFGLHFVILYVPFLAQVFGIVPLSLNEW LLVLAVSLPVILIDEVLKFVGRCTSGYRYSPRTPSAKQKEE

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G07670.1
Transcript Infomation	\| endomembrane-type CA-ATPase 4 \| Chr1:2370020-2374607 REVERSE LENGTH=3632 \| 201606
Sequence	ACAAAAACAAATATATTATTCAACATTGGAATATATATACTGTATGTAAAGGCTTCCTTA GAGAAGTAGAAGAAGAGAAGTATCTGGAGAGAGAGAGGCGTGCGATTTCCGCATCGAAGA AACAGTACGGAGTTTTATCCGCTCCGATTCTGTGGAAGATAATGGGGAAAGGAGGTGAAG ATTGCGGGAATAAGCAAACTAATAGTTCTGAATTGGTCAAGTCTGATACTTTTCCTGCTT GGGGTAAAGATGTGTCGGAATGCGAAGAGAAGTTTGGTGTTAGTCGTGAGAAAGGTTTGA GCACTGATGAGGTGTTGAAACGGCATCAGATCTATGGTTTGAATGAATTAGAGAAGCCTG AGGGTACTTCTATTTTTAAGCTGATTTTGGAACAGTTTAATGATACATTGGTTCGTATTC TTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTAGCCTTCTTTGATGGCGACGAAGGTGGTG AGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTTTTCTCATCTTGATTGTTAATG CCATTGTTGGCATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGGCGTTGGAAGCTTTGAAAGAGA TTCAGTCTCAGCAAGCTACCGTCATGCGTGATGGGACTAAGGTTTCCAGTTTGCCTGCAA AGGAGCTTGTTCCTGGTGATATTGTGGAACTGAGGGTTGGTGATAAGGTGCCTGCTGATA TGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGTTCAACTTTGAGAGTCGAGCAGGGGTCCTTAACAGGAG AGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCACGTGGATGAGAATGCTGATATTCAAGGAA AGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTCGTGAATGGGAACTGCATATGTTTAGTTA CAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACTCACAGATCCAGGAAGCTGCAC AACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACGAGTTTGGGGAAGTTCTGACTA TGATCATTGGGTTAATTTGTGCGTTAGTGTGGCTCATCAATGTCAAATACTTTCTGTCAT GGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCTCCTTCGAGAAGTGCACATATT ACTTTGAGATTGCTGTTGCACTGGCGGTTGCTGCAATTCCAGAAGGTCTGCCAGCAGTTA TTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTAGGAAGATGGCTCAGAAGAATGCTCTGGTTAGGA AGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGTGATATGCTCTGACAAAACTGGAA CTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTCGTTGCTATGGGTTCGAGGATCGGAA CTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATCCTCGAGATGGAAAGATTGAAG ATTGGCCAACGGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGATTGCAAAAATTGCTGCCATTT GCAACGATGCTAATGTTGAGAAATCTGATCAGCAATTTGTGTCTAGGGGCATGCCTACTG AGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTTCCCGAAGGATTGAATGAAGCTT CATCCGATGGCAATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTATGGAGTGAACTAGAACAACGGATTG CCACCCTTGAGTTTGACCGTGACCGGAAATCAATGGGAGTTATGGTGGATTCCAGCTCAG GAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCCGTAGAAAATGTATTGGAAAGGAGTACCCATA TTCAGCTACTTGATGGTTCCACTCGAGAGCTTGACCAATACTCAAGGGATCTTATTTTAC AAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATGTCTCGGATTTGCATACTCAGATG TTCCATCAGATTTTGCCACTTATGATGGCAGTGAAGACCATCCTGCTCATCAGCAACTTC TCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCTAGTATTTGTTGGATTTGTTGGTT TAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCATTGCAGACTGCAGAACAGCAGGTA TTCGGGTCATGGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCACAGCGGAAGCAATCTGCCGTGAAA TTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAGAAGCTTGACAGGAAAAGAATTTA TGGATGTTAAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACAGGAGGGCTCCTGTTCTCAAGGG CTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTGAAAGAAGATGGAGAAGTGGTTG CCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTCCTGCCCTGAAGTTGGCTGATATTGGTGTGG CTATGGGCATTTCCGGGACAGAGGTAGCAAAGGAGGCATCTGACTTGGTGTTGGCAGATG ATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGCAGGTCCATCTATAACAACATGA AGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGTGAGGTTGCATCGATATTCTTGA CAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGATACCCGTTCAACTTCTGTGGGTGAATCTCG TAACAGATGGTCCTCCAGCTACTGCTTTGGGATTCAACCCCCCTGACAAGGATATTATGA AAAAGCCTCCTCGTAGGAGCGATGACTCTCTTATCACTGCGTGGATCCTCTTCCGCTATA TGGTGATTGGTTTGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGGAGTATTCATCATATGGTACACAC ACAACAGCTTTATGGGCATAGACCTGAGCCAAGACGGTCACAGCCTTGTGAGCTATTCAC AGCTCGCACATTGGGGCCAATGCTCTTCATGGGAAGGCTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAG CAGGCTCTCAGACTTTCTCGTTCGACTCAAACCCTTGCGACTATTTTCAGCAGGGTAAAA TCAAGGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGCCATTGAAATGTTCAACTCTCTGA ATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCCACCCTGGGTTAACCCGTGGCTGC TCCTGGCAATGGCTGTCTCATTTGGACTCCACTTTGTGATATTGTACGTCCCATTCTTGG CTCAGGTGTTTGGTATTGTGCCACTGAGCTTGAACGAGTGGCTGCTAGTGCTGGCTGTGT CGCTGCCGGTAATTTTGATAGACGAAGTGCTCAAGTTTGTAGGAAGGTGCACGAGTGGCT ACCGCTACTCACCTCGCACTCCCTCAGCTAAGCAAAAGGAGGAGTAAGAAAATAATTCAA AAGGCATTATTATTAGACTCTTAGTTTTAGCTGAAATTAACTTTGTTGCTTTACTCATCC TTGCTATATTTAATTCTCCAAACGATAATTTTTGGTTTGAAAAAGAAAAGTTTCTAACTT TGGTTCATGGACACAGCCCGTGATAGAAAGATGAATGTTTCAACCAAACCTTGATTCTTT ATGTAAACTTTTATGGTCGACCAAATTGGTTTTTAAGACTGATGGTAATTTATTTTGGGC ACAACCTTAAGAGATCAGAGATTCAATCTCTT