Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT1G03000.1
CDS Infomation	\| peroxin 6 \| Chr1:688057-692453 REVERSE LENGTH=2826 \| 201606
Sequence	ATGGTGGAGAGACGGAATCCTCTGGTTCTATCATCCACAAGAAGTACTCTCCGTTCAGTG CTCAATTCGTCACAACCCAGCTCTGCCGACGGCGACCGAGTTCTGAATAAAGACGGTGAC TTGTTACGAGGGAACGCTAGGTTGTCTGCGGGCATTCTCCGGTGGCGGAAGGACGGAGAA AATGTTTCCGATGCAAAATTGGATTCTTTAGATGACTCTGCATTGGTTGGACTCTCCACT CAATTGCTTAAGAGACTATCTATCAACTCTGGTTCTTTGGTTGTTGTCAAGAACATTGAG ATAGGCATTCAAAGGGTTGCGCAAGTTGTTGTACTTGATCCTCCCAAGACGACGCTGGAA GATGCATCTCTCACTCAAGTACCTGTTTCGGACTCTCTTCATACGATGCTTGTCTTTCCC ACTTATGATTTGATGGGCCAGCAGTTATTAGATCAAGAGGTTGCTTACTTGTCCCCAATG TTAGCTTTTAATCTTAGCTTGCACATATCTTGCCTGAAATCCCTCGTACATCGAGGGAAC GGGGTCTTAGAGAAGTATTTTGAAGCTAAGTGTGATGAGGAGTTTATCGGAAAATCTGCA GAAGATGGGTCGAAGATTGGTTTGGATTTGGAACCCGTGTCCCAAGTTCCAGGCTATGCA TCACATCTGAGAGTTTCTTTTGTTAAAATCCCAGAGTGTGGTACCATCCCATCCCTGAAA GTCAATTCGTCATTTGAAGCTGAAGAGCGACAAGGGTTAATAGATTCTGCATTACAGAAG TATTTTGGAACTGATAGACAGCTATCAAGAGGCGATATATTTCGCATTTACATTGACTGG AATTGTGGTTCAAGCATTTGTAATCCATGTAGTCAAAGGTTGTGCTCCGAAAGCGACGAC TATATATATTTTAAGGTTATTGCGATGGAACCTTCTAATGAGAGGTTTCTTCGAGTGAAT CACTCCCAAACCGCCCTTGTCCTTGGAGGAACTGTATCTTCTGGTCTTCCACCAGATTTA CTGGTGTATAGATCAAAGGTTCCTATGCCATTGCAGGAGGAGACAGTAAATATTTTGGCA TCGGTGCTTTCACCACCTCTCTGCCCATCAGCACTCGCCTCAAAACTCAGGGTTGCTGTT TTACTGCATGGTATACCAGGGTGTGGGAAGAGAACTGTTGTTAAATATGTTGCTAGGAGG TTGGGGCTGCATGTAGTTGAATTTAGCTGCCACAGTTTATTAGCATCATCTGAGAGGAAA ACATCTACTGCTTTGGCCCAGACTTTTAATATGGCACGAAGGTATTCACCAACGATACTT TTGCTTCGCCATTTCGATGTTTTTAAAAATCTGGGCTCTCAGGATGGTTCACTGGGTGAC CGAGTTGGTGTGTCCTTTGAGATTGCATCGGTTATTAGGGAACTCACTGAGCCAGTTTCT AATGGGGACAGTTCCATGGAAGAAAAATCGAATAGCAATTTCTCTGAAAATGAAGTTGGA AAGTTTAGGGGACATCAAGTGCTGCTAATCGCATCTGCTGAAAGTACTGAGGGTATCTCT CCAACAATCAGGCGTTGCTTTAGCCATGAAATACGTATGGGTTCTTTGAATGACGAACAG AGATCTGAAATGCTGTCTCAGTCCCTCCAAGGCGTTTCTCAATTCCTTAATATTAGCTCA GATGAATTTATGAAAGGATTGGTGGGACAGACTTCTGGCTTCCTTCCCCGGGACTTGCAA GCTCTTGTAGCTGATGCTGGTGCCAACTTATACATCAGTCAAGAGTCCGAGACCAAGAAA ATTAACTCTCTGTCAGATGATCTTCATGGAGTTGATATACACCAGGCAAGCCAAATAGAT AACAGCACTGAGAAATTAACAGCTAAGGAAGACTTTACCAAAGCTTTGGATCGATCAAAG AAGAGAAATGCATCAGCCCTTGGTGCTCCTAAGGTTCCAAATGTGAAATGGGATGATGTT GGTGGGCTTGAGGATGTGAAGACATCGATATTGGACACAGTTCAACTACCTCTCCTGCAT AAAGATTTATTTTCGTCCGGATTGCGTAAACGTTCTGGTGTACTTCTCTATGGCCCTCCA GGAACAGGGAAAACTTTACTGGCAAAAGCTGTGGCGACAGAGTGCTCCTTAAATTTCCTC AGTGTAAAGGGTCCAGAATTAATCAACATGTATATTGGAGAGTCAGAGAAAAATGTTCGA GATATATTTGAAAAGGCAAGGTCAGCGCGACCTTGTGTGATCTTCTTTGATGAGCTTGAT TCTCTTGCTCCAGCTCGAGGTGCTTCTGGTGATTCTGGAGGAGTCATGGATCGAGTGGTA TCTCAGATGCTTGCAGAGATCGATGGACTCAGCGACTCTTCCCAGGATCTGTTTATTATA GGAGCAAGCAACAGACCTGACTTGATTGATCCAGCTCTTTTACGGCCTGGCAGATTCGAC AAACTTCTATATGTTGGAGTCAACGCTGATGCGTCTTACAGGGAAAGGGTACTTAAAGCA CTGACTCGGAAATTTAAGTTAAGCGAAGATGTATCTCTTTATTCAGTAGCAAAGAAGTGT CCCTCTACATTCACCGGCGCTGATATGTACGCCTTGTGTGCTGATGCTTGGTTTCAGGCA GCTAAGCGAAAGGTGTCAAAATCGGATTCAGGGGATATGCCTACAGAAGAAGATGATCCC GATTCAGTCGTTGTAGAGTATGTGGATTTTATAAAGGCAATGGATCAGCTCTCGCCATCA CTCTCCATAACTGAGCTTAAGAAGTATGAGATGCTTCGAGATCAATTTCAAGGCCGTTCG AGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT1G03000.1
PEP Infomation	\| peroxin 6 \| Chr1:688057-692453 REVERSE LENGTH=941 \| 201606
Sequence	MVERRNPLVLSSTRSTLRSVLNSSQPSSADGDRVLNKDGDLLRGNARLSAGILRWRKDGE NVSDAKLDSLDDSALVGLSTQLLKRLSINSGSLVVVKNIEIGIQRVAQVVVLDPPKTTLE DASLTQVPVSDSLHTMLVFPTYDLMGQQLLDQEVAYLSPMLAFNLSLHISCLKSLVHRGN GVLEKYFEAKCDEEFIGKSAEDGSKIGLDLEPVSQVPGYASHLRVSFVKIPECGTIPSLK VNSSFEAEERQGLIDSALQKYFGTDRQLSRGDIFRIYIDWNCGSSICNPCSQRLCSESDD YIYFKVIAMEPSNERFLRVNHSQTALVLGGTVSSGLPPDLLVYRSKVPMPLQEETVNILA SVLSPPLCPSALASKLRVAVLLHGIPGCGKRTVVKYVARRLGLHVVEFSCHSLLASSERK TSTALAQTFNMARRYSPTILLLRHFDVFKNLGSQDGSLGDRVGVSFEIASVIRELTEPVS NGDSSMEEKSNSNFSENEVGKFRGHQVLLIASAESTEGISPTIRRCFSHEIRMGSLNDEQ RSEMLSQSLQGVSQFLNISSDEFMKGLVGQTSGFLPRDLQALVADAGANLYISQESETKK INSLSDDLHGVDIHQASQIDNSTEKLTAKEDFTKALDRSKKRNASALGAPKVPNVKWDDV GGLEDVKTSILDTVQLPLLHKDLFSSGLRKRSGVLLYGPPGTGKTLLAKAVATECSLNFL SVKGPELINMYIGESEKNVRDIFEKARSARPCVIFFDELDSLAPARGASGDSGGVMDRVV SQMLAEIDGLSDSSQDLFIIGASNRPDLIDPALLRPGRFDKLLYVGVNADASYRERVLKA LTRKFKLSEDVSLYSVAKKCPSTFTGADMYALCADAWFQAAKRKVSKSDSGDMPTEEDDP DSVVVEYVDFIKAMDQLSPSLSITELKKYEMLRDQFQGRSS

Transcript Sequence

Transcript ID	AT1G03000.1
Transcript Infomation	\| peroxin 6 \| Chr1:687795-692660 REVERSE LENGTH=3295 \| 201606
Sequence	AGAAAATATAATAATATAAATACGAAAAAATCCTTAAGTGGGGCCAGTACCATCTGATCC TCTTCAGTCTTCATCGGTTCGCGTACTGTGAATTTTCTTCAACGGAACTTGAATCTTCTG ATGGAAAATTAGGGTTTTTGTTTTTATACTTTTTTTCTGACTCTTTTGAGTTTTGAGTAA TTGGGAATTCGATTTGATTCCGTTGCAATGGTGGAGAGACGGAATCCTCTGGTTCTATCA TCCACAAGAAGTACTCTCCGTTCAGTGCTCAATTCGTCACAACCCAGCTCTGCCGACGGC GACCGAGTTCTGAATAAAGACGGTGACTTGTTACGAGGGAACGCTAGGTTGTCTGCGGGC ATTCTCCGGTGGCGGAAGGACGGAGAAAATGTTTCCGATGCAAAATTGGATTCTTTAGAT GACTCTGCATTGGTTGGACTCTCCACTCAATTGCTTAAGAGACTATCTATCAACTCTGGT TCTTTGGTTGTTGTCAAGAACATTGAGATAGGCATTCAAAGGGTTGCGCAAGTTGTTGTA CTTGATCCTCCCAAGACGACGCTGGAAGATGCATCTCTCACTCAAGTACCTGTTTCGGAC TCTCTTCATACGATGCTTGTCTTTCCCACTTATGATTTGATGGGCCAGCAGTTATTAGAT CAAGAGGTTGCTTACTTGTCCCCAATGTTAGCTTTTAATCTTAGCTTGCACATATCTTGC CTGAAATCCCTCGTACATCGAGGGAACGGGGTCTTAGAGAAGTATTTTGAAGCTAAGTGT GATGAGGAGTTTATCGGAAAATCTGCAGAAGATGGGTCGAAGATTGGTTTGGATTTGGAA CCCGTGTCCCAAGTTCCAGGCTATGCATCACATCTGAGAGTTTCTTTTGTTAAAATCCCA GAGTGTGGTACCATCCCATCCCTGAAAGTCAATTCGTCATTTGAAGCTGAAGAGCGACAA GGGTTAATAGATTCTGCATTACAGAAGTATTTTGGAACTGATAGACAGCTATCAAGAGGC GATATATTTCGCATTTACATTGACTGGAATTGTGGTTCAAGCATTTGTAATCCATGTAGT CAAAGGTTGTGCTCCGAAAGCGACGACTATATATATTTTAAGGTTATTGCGATGGAACCT TCTAATGAGAGGTTTCTTCGAGTGAATCACTCCCAAACCGCCCTTGTCCTTGGAGGAACT GTATCTTCTGGTCTTCCACCAGATTTACTGGTGTATAGATCAAAGGTTCCTATGCCATTG CAGGAGGAGACAGTAAATATTTTGGCATCGGTGCTTTCACCACCTCTCTGCCCATCAGCA CTCGCCTCAAAACTCAGGGTTGCTGTTTTACTGCATGGTATACCAGGGTGTGGGAAGAGA ACTGTTGTTAAATATGTTGCTAGGAGGTTGGGGCTGCATGTAGTTGAATTTAGCTGCCAC AGTTTATTAGCATCATCTGAGAGGAAAACATCTACTGCTTTGGCCCAGACTTTTAATATG GCACGAAGGTATTCACCAACGATACTTTTGCTTCGCCATTTCGATGTTTTTAAAAATCTG GGCTCTCAGGATGGTTCACTGGGTGACCGAGTTGGTGTGTCCTTTGAGATTGCATCGGTT ATTAGGGAACTCACTGAGCCAGTTTCTAATGGGGACAGTTCCATGGAAGAAAAATCGAAT AGCAATTTCTCTGAAAATGAAGTTGGAAAGTTTAGGGGACATCAAGTGCTGCTAATCGCA TCTGCTGAAAGTACTGAGGGTATCTCTCCAACAATCAGGCGTTGCTTTAGCCATGAAATA CGTATGGGTTCTTTGAATGACGAACAGAGATCTGAAATGCTGTCTCAGTCCCTCCAAGGC GTTTCTCAATTCCTTAATATTAGCTCAGATGAATTTATGAAAGGATTGGTGGGACAGACT TCTGGCTTCCTTCCCCGGGACTTGCAAGCTCTTGTAGCTGATGCTGGTGCCAACTTATAC ATCAGTCAAGAGTCCGAGACCAAGAAAATTAACTCTCTGTCAGATGATCTTCATGGAGTT GATATACACCAGGCAAGCCAAATAGATAACAGCACTGAGAAATTAACAGCTAAGGAAGAC TTTACCAAAGCTTTGGATCGATCAAAGAAGAGAAATGCATCAGCCCTTGGTGCTCCTAAG GTTCCAAATGTGAAATGGGATGATGTTGGTGGGCTTGAGGATGTGAAGACATCGATATTG GACACAGTTCAACTACCTCTCCTGCATAAAGATTTATTTTCGTCCGGATTGCGTAAACGT TCTGGTGTACTTCTCTATGGCCCTCCAGGAACAGGGAAAACTTTACTGGCAAAAGCTGTG GCGACAGAGTGCTCCTTAAATTTCCTCAGTGTAAAGGGTCCAGAATTAATCAACATGTAT ATTGGAGAGTCAGAGAAAAATGTTCGAGATATATTTGAAAAGGCAAGGTCAGCGCGACCT TGTGTGATCTTCTTTGATGAGCTTGATTCTCTTGCTCCAGCTCGAGGTGCTTCTGGTGAT TCTGGAGGAGTCATGGATCGAGTGGTATCTCAGATGCTTGCAGAGATCGATGGACTCAGC GACTCTTCCCAGGATCTGTTTATTATAGGAGCAAGCAACAGACCTGACTTGATTGATCCA GCTCTTTTACGGCCTGGCAGATTCGACAAACTTCTATATGTTGGAGTCAACGCTGATGCG TCTTACAGGGAAAGGGTACTTAAAGCACTGACTCGGAAATTTAAGTTAAGCGAAGATGTA TCTCTTTATTCAGTAGCAAAGAAGTGTCCCTCTACATTCACCGGCGCTGATATGTACGCC TTGTGTGCTGATGCTTGGTTTCAGGCAGCTAAGCGAAAGGTGTCAAAATCGGATTCAGGG GATATGCCTACAGAAGAAGATGATCCCGATTCAGTCGTTGTAGAGTATGTGGATTTTATA AAGGCAATGGATCAGCTCTCGCCATCACTCTCCATAACTGAGCTTAAGAAGTATGAGATG CTTCGAGATCAATTTCAAGGCCGTTCGAGCTAAACCCCTCTCAGTACATAAAAATTAGCT TATAATGAAGACATTTCATATTTTTTTCCCAGACTATTTTCTCTGAACAGTTCTGTTGAT TTGGTTAGTCAATTGATAGTAAAATTAAAGAATCAATAATGTAAAATAATTTTCTTGGTT TGAATTACCTTTGATTGGTTACGCACAAGTGATTCTTCGCTTCCATAGTTCCATGTAATA ATATAACACACAAGTGAAGCAGATTATTCAATGGTAAAAGGTTTTCTTAAAAAAA