Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_19s0090g00800.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:19:6842061:6843222:1 gene:VIT_19s0090g00800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGAAGCCTCTTATTAGGACTAATATGAGAAATGATGAAGCAAACTGTAATTCAAAGGTG
GTTGAGGAGCTTTATGCCATAATGGAAGCTGTTGCGGACAGATCAGAAATGCACAAAAAT
ATTGGTGTGCAGCGCGATAATTGGAACCGTCTTCTCCTCAACTCTGTAAATGGAATGACA
TTCACAGCTGCGACAATGGCTGGACTTGCATCTCTGAGTGGTGGGGGTGCAACACTTTTG
GCCTTGAAGCTCTCTTCCACCCTACTCTACACAGCAGCTACTGGGATTTTGATGGTGATG
AACAAGATTCAGCCATCTCAGCTTGCAGAAGAGCAAAGGAATGCAGCTAGACTGTTTAAG
AACCTTCACCAGCAAATCAAGACTGTTGTTGCAGTTGGAAGCCCCAGTTTGAATGATGTG
AACGCTGCAATGGACAAGGTGTTGGCGCTGGACAAGGCCTATCCCCTTCCCTTGCTAGGG
ACGATGCTCGAGAAGTTCCCAAAAACTGTGGAGCCTGCAGTGTGGTGGCCAAGAGAAGTG
AGGTCTGAACATGAGAAAGTGGGTGGGGGGGTGGAGAGAAATGGGTGGAGTGAGAAGCTT
GAGGAGGAGATGAGGGAGGTTGTTGGGGTGCTGAAGAGGAAGGATGCTGCAGAGTATGTG
AGGCTAAGCAAACTAGTATTGAAAGTGAACAAAATTCTAGCCATATGTGGCCCTCTTTTC
ACTGGCATCGCCGCCATGGGATCGGCGATGGTGGGATCCTCACCTTGGAATGGGTCGTGG
GCTGTGGTGTTGGGTGTGGTGTTTGGAGCTCTGGCCACAGTGGTAAACACATTGGAGCAT
GGTGGGCAGGTGGGTATGGTGTTTGAGATGTATAGAAGCACTGCCGGGTACTTTCAACTC
ATGGAAGAGACCATAGAATCAACTTTGAAGGAGAAAGAAGTAGGGGAAAGGGAAAATGGA
GAATTATTTGAAGTGAAAGTGGCTCTTCAGCTTGGAAGGAGCCTTCCTGGGCTTCAAAAC
CTAGCCACCACTCATTCCCCTTCCTCTTCCACTGAATTTGCAAGCAAGCTCTTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_19s0090g00800.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:19:6842061:6843222:1 gene:VIT_19s0090g00800 transcript:VIT_19s0090g00800.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MKPLIRTNMRNDEANCNSKVVEELYAIMEAVADRSEMHKNIGVQRDNWNRLLLNSVNGMT
FTAATMAGLASLSGGGATLLALKLSSTLLYTAATGILMVMNKIQPSQLAEEQRNAARLFK
NLHQQIKTVVAVGSPSLNDVNAAMDKVLALDKAYPLPLLGTMLEKFPKTVEPAVWWPREV
RSEHEKVGGGVERNGWSEKLEEEMREVVGVLKRKDAAEYVRLSKLVLKVNKILAICGPLF
TGIAAMGSAMVGSSPWNGSWAVVLGVVFGALATVVNTLEHGGQVGMVFEMYRSTAGYFQL
MEETIESTLKEKEVGERENGELFEVKVALQLGRSLPGLQNLATTHSPSSSTEFASKLF

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_19s0090g00800.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:19:6842061:6843222:1 gene:VIT_19s0090g00800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGAAGCCTCTTATTAGGACTAATATGAGAAATGATGAAGCAAACTGTAATTCAAAGGTG
GTTGAGGAGCTTTATGCCATAATGGAAGCTGTTGCGGACAGATCAGAAATGCACAAAAAT
ATTGGTGTGCAGCGCGATAATTGGAACCGTCTTCTCCTCAACTCTGTAAATGGAATGACA
TTCACAGCTGCGACAATGGCTGGACTTGCATCTCTGAGTGGTGGGGGTGCAACACTTTTG
GCCTTGAAGCTCTCTTCCACCCTACTCTACACAGCAGCTACTGGGATTTTGATGGTGATG
AACAAGATTCAGCCATCTCAGCTTGCAGAAGAGCAAAGGAATGCAGCTAGACTGTTTAAG
AACCTTCACCAGCAAATCAAGACTGTTGTTGCAGTTGGAAGCCCCAGTTTGAATGATGTG
AACGCTGCAATGGACAAGGTGTTGGCGCTGGACAAGGCCTATCCCCTTCCCTTGCTAGGG
ACGATGCTCGAGAAGTTCCCAAAAACTGTGGAGCCTGCAGTGTGGTGGCCAAGAGAAGTG
AGGTCTGAACATGAGAAAGTGGGTGGGGGGGTGGAGAGAAATGGGTGGAGTGAGAAGCTT
GAGGAGGAGATGAGGGAGGTTGTTGGGGTGCTGAAGAGGAAGGATGCTGCAGAGTATGTG
AGGCTAAGCAAACTAGTATTGAAAGTGAACAAAATTCTAGCCATATGTGGCCCTCTTTTC
ACTGGCATCGCCGCCATGGGATCGGCGATGGTGGGATCCTCACCTTGGAATGGGTCGTGG
GCTGTGGTGTTGGGTGTGGTGTTTGGAGCTCTGGCCACAGTGGTAAACACATTGGAGCAT
GGTGGGCAGGTGGGTATGGTGTTTGAGATGTATAGAAGCACTGCCGGGTACTTTCAACTC
ATGGAAGAGACCATAGAATCAACTTTGAAGGAGAAAGAAGTAGGGGAAAGGGAAAATGGA
GAATTATTTGAAGTGAAAGTGGCTCTTCAGCTTGGAAGGAGCCTTCCTGGGCTTCAAAAC
CTAGCCACCACTCATTCCCCTTCCTCTTCCACTGAATTTGCAAGCAAGCTCTTCTGATGT
TGATTCGTCTGTACCTAGTTACAGTCTGATTAATCTTTTGTAAACTGTCAGTATATTAAT
TAACAAAAAAATTTGATCACAA