Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_19s0085g00880.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:19:23353981:23383765:1 gene:VIT_19s0085g00880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGGATATCGCAGATGGGTCTGTTGCGGAGCAGCTGCTCAGCGCTGTGTCACGGCCCC CGGACTGCTTCCGTTCTCCGACCCTCCGCTGTCCTCACTCGCCAGATAAGCATGGACACA CAAAATCTTGTGGCTCGGCTGAATAGTTCAGGTCTACTTCGGAGCCAGTGCCTTATTGGA GGAAAATGGACTGAAGCTTATGATGGGAAGACCATACCGGTCCACAACCCTGCTACTGGT GATGTTTTAGTAAATGTTCCATGCATGGGAGGGCAGGAGACGAATGATGCGATATCTGTA GCTTATGAGGCATTCCTTTCTTGGAGCAAACTTACTGCTGCTGAAAGGAGCAAACGTCTG CGGAAATGGTATGATTTACTAATTGCCAATAAAGAAGAGCTTGGTCAAATCATAACACTA GAGCAAGGAAAACCCCTAAAAGAAGCCATTGGTGAGGTTAACTATGGGGCTGCCTTTATT GAGTTCTCTGCAGAGGAGGCAAAACGTATATATGGTGATATAATTCCATCACCACTAGCT GATCGTCGGCTGCTTGTTTTAAAGCAGCCTGTAGGTGTTGTTGGTGCAATTACTCCTTGG AACTTTCCATTGGCTATGATCACACGGAAGGTTGGTCCTGCCCTTGCTTGTGGCTGCACA GTGGTTATAAAACCTTCTGAACTTACACCATTGACAGCCTTAGCAGCAGCTGAGCTTGCC CTTCAAGCTGGAATACCACCGGGTGCTGTGAATGTGGTCTTTGGAAATGCTCCTGAAATT GGGGATGCTTTACTTGCAAGTCGGCAGGTAAGGAAGATCACATTTACAGGCTCAACAGCT GTCGGAAAGAAGTTGATGGCTGGTGCAGCTCAGACTGTTAAAAAGGTATCTCTGGAACTT GGTGGTAATGCACCTTGCATAATCTTTGACGATGCAGACCTGGAGGTGGCAGTAAAAGGG GCTCTTGGTACAAAGTTCCGTAACAGTGGACAAACATGTGTTTGTGCAAATAGAATACTT GTGCAGGAAGGTATTTATGAGAAATTTGCAATTGCTTTTTCACAAGCTGTCCAAAGTATG CAAGTTGGTGAAGGTTTTACTGAAGGTGTGGTCCAGGGTCCACTGATTAATGAGGCTGCA GTGCAGAAGGTTGAATCATTTGTTAAAGATGCTGTCTCAAAGGGAGCAAAAGTCCTTCTT GGGGGTAAAAGACACAGTCTGGGAATGACCTTCTATGAGCCAACGGTAATTGGTGACATC AAGAATGACATGCTTATTGCGAGGAATGAAGTGTTTGGACCTGTTGCACCCCTCTTGCGC TTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGGTTTAGCTGCT TATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCACTGAAGCCCTTGAATATGGA CTGGTTGGTGTCAATGAAGGATTGGTTTCAACAGAGGTGGCTCCATTTGGAGGAGTCAAG GAGTCTGGTCTTGGTAGGGAAGGTTCCAAATATGGGATGGATGAATTTCTGGAAATGAAA TATGTGTGCTTCGGAAATATAAGCAGTAACTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_19s0085g00880.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:19:23353981:23383765:1 gene:VIT_19s0085g00880 transcript:VIT_19s0085g00880.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MGISQMGLLRSSCSALCHGPRTASVLRPSAVLTRQISMDTQNLVARLNSSGLLRSQCLIG GKWTEAYDGKTIPVHNPATGDVLVNVPCMGGQETNDAISVAYEAFLSWSKLTAAERSKRL RKWYDLLIANKEELGQIITLEQGKPLKEAIGEVNYGAAFIEFSAEEAKRIYGDIIPSPLA DRRLLVLKQPVGVVGAITPWNFPLAMITRKVGPALACGCTVVIKPSELTPLTALAAAELA LQAGIPPGAVNVVFGNAPEIGDALLASRQVRKITFTGSTAVGKKLMAGAAQTVKKVSLEL GGNAPCIIFDDADLEVAVKGALGTKFRNSGQTCVCANRILVQEGIYEKFAIAFSQAVQSM QVGEGFTEGVVQGPLINEAAVQKVESFVKDAVSKGAKVLLGGKRHSLGMTFYEPTVIGDI KNDMLIARNEVFGPVAPLLRFKTEEEAIRIANDTNAGLAAYVFTENVQRMWRVTEALEYG LVGVNEGLVSTEVAPFGGVKESGLGREGSKYGMDEFLEMKYVCFGNISSN

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_19s0085g00880.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:19:23353981:23383765:1 gene:VIT_19s0085g00880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	AAAACGACGCGATTTAGGGTCACGAGGCTGGGGCACCTGGCTATAAAAGGAGAGGGTTGC ATCAGTGGTCGGTGAGAAGCGTTTCGTTGAAATGGGGATATCGCAGATGGGTCTGTTGCG GAGCAGCTGCTCAGCGCTGTGTCACGGCCCCCGGACTGCTTCCGTTCTCCGACCCTCCGC TGTCCTCACTCGCCAGATAAGCATGGACACACAAAATCTTGTGGCTCGGCTGAATAGTTC AGGTCTACTTCGGAGCCAGTGCCTTATTGGAGGAAAATGGACTGAAGCTTATGATGGGAA GACCATACCGGTCCACAACCCTGCTACTGGTGATGTTTTAGTAAATGTTCCATGCATGGG AGGGCAGGAGACGAATGATGCGATATCTGTAGCTTATGAGGCATTCCTTTCTTGGAGCAA ACTTACTGCTGCTGAAAGGAGCAAACGTCTGCGGAAATGGTATGATTTACTAATTGCCAA TAAAGAAGAGCTTGGTCAAATCATAACACTAGAGCAAGGAAAACCCCTAAAAGAAGCCAT TGGTGAGGTTAACTATGGGGCTGCCTTTATTGAGTTCTCTGCAGAGGAGGCAAAACGTAT ATATGGTGATATAATTCCATCACCACTAGCTGATCGTCGGCTGCTTGTTTTAAAGCAGCC TGTAGGTGTTGTTGGTGCAATTACTCCTTGGAACTTTCCATTGGCTATGATCACACGGAA GGTTGGTCCTGCCCTTGCTTGTGGCTGCACAGTGGTTATAAAACCTTCTGAACTTACACC ATTGACAGCCTTAGCAGCAGCTGAGCTTGCCCTTCAAGCTGGAATACCACCGGGTGCTGT GAATGTGGTCTTTGGAAATGCTCCTGAAATTGGGGATGCTTTACTTGCAAGTCGGCAGGT AAGGAAGATCACATTTACAGGCTCAACAGCTGTCGGAAAGAAGTTGATGGCTGGTGCAGC TCAGACTGTTAAAAAGGTATCTCTGGAACTTGGTGGTAATGCACCTTGCATAATCTTTGA CGATGCAGACCTGGAGGTGGCAGTAAAAGGGGCTCTTGGTACAAAGTTCCGTAACAGTGG ACAAACATGTGTTTGTGCAAATAGAATACTTGTGCAGGAAGGTATTTATGAGAAATTTGC AATTGCTTTTTCACAAGCTGTCCAAAGTATGCAAGTTGGTGAAGGTTTTACTGAAGGTGT GGTCCAGGGTCCACTGATTAATGAGGCTGCAGTGCAGAAGGTTGAATCATTTGTTAAAGA TGCTGTCTCAAAGGGAGCAAAAGTCCTTCTTGGGGGTAAAAGACACAGTCTGGGAATGAC CTTCTATGAGCCAACGGTAATTGGTGACATCAAGAATGACATGCTTATTGCGAGGAATGA AGTGTTTGGACCTGTTGCACCCCTCTTGCGCTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCAT TGCAAATGACACCAATGCTGGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTAT GTGGCGTGTCACTGAAGCCCTTGAATATGGACTGGTTGGTGTCAATGAAGGATTGGTTTC AACAGAGGTGGCTCCATTTGGAGGAGTCAAGGAGTCTGGTCTTGGTAGGGAAGGTTCCAA ATATGGGATGGATGAATTTCTGGAAATGAAATATGTGTGCTTCGGAAATATAAGCAGTAA CTGATGGGGCCAAGGTCATCACTTGGGCGGGAGAGTGAGGAATAAGCGGCTGGTAGTTCC GTCTTGTGTTTGTGTGATTAAATAAAGTGCAGACTTGCACCTGAATGTTTCCTTTTTTGT TGTACTCCTTGTTCTTTTAATGCTTCTCTTTGTTGTAGAGGCTTGTGCTTGGATTTTTGT TTTCTGCTGAATGCTTCTCCTGCTTATTTGTTGTTGCGGGGTTGCGTTGTGGCTATATGC ACTTACGCATATCCATCAACACCTAAACTTGAAACCTAAATGTTTTTGTAGAGGCTCC