Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_19s0085g00880.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:19:23353981:23383765:1 gene:VIT_19s0085g00880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGGGATATCGCAGATGGGTCTGTTGCGGAGCAGCTGCTCAGCGCTGTGTCACGGCCCC
CGGACTGCTTCCGTTCTCCGACCCTCCGCTGTCCTCACTCGCCAGATAAGCATGGACACA
CAAAATCTTGTGGCTCGGCTGAATAGTTCAGGTCTACTTCGGAGCCAGTGCCTTATTGGA
GGAAAATGGACTGAAGCTTATGATGGGAAGACCATACCGGTCCACAACCCTGCTACTGGT
GATGTTTTAGTAAATGTTCCATGCATGGGAGGGCAGGAGACGAATGATGCGATATCTGTA
GCTTATGAGGCATTCCTTTCTTGGAGCAAACTTACTGCTGCTGAAAGGAGCAAACGTCTG
CGGAAATGGTATGATTTACTAATTGCCAATAAAGAAGAGCTTGGTCAAATCATAACACTA
GAGCAAGGAAAACCCCTAAAAGAAGCCATTGGTGAGGTTAACTATGGGGCTGCCTTTATT
GAGTTCTCTGCAGAGGAGGCAAAACGTATATATGGTGATATAATTCCATCACCACTAGCT
GATCGTCGGCTGCTTGTTTTAAAGCAGCCTGTAGGTGTTGTTGGTGCAATTACTCCTTGG
AACTTTCCATTGGCTATGATCACACGGAAGGTTGGTCCTGCCCTTGCTTGTGGCTGCACA
GTGGTTATAAAACCTTCTGAACTTACACCATTGACAGCCTTAGCAGCAGCTGAGCTTGCC
CTTCAAGCTGGAATACCACCGGGTGCTGTGAATGTGGTCTTTGGAAATGCTCCTGAAATT
GGGGATGCTTTACTTGCAAGTCGGCAGGTAAGGAAGATCACATTTACAGGCTCAACAGCT
GTCGGAAAGAAGTTGATGGCTGGTGCAGCTCAGACTGTTAAAAAGGTATCTCTGGAACTT
GGTGGTAATGCACCTTGCATAATCTTTGACGATGCAGACCTGGAGGTGGCAGTAAAAGGG
GCTCTTGGTACAAAGTTCCGTAACAGTGGACAAACATGTGTTTGTGCAAATAGAATACTT
GTGCAGGAAGGTATTTATGAGAAATTTGCAATTGCTTTTTCACAAGCTGTCCAAAGTATG
CAAGTTGGTGAAGGTTTTACTGAAGGTGTGGTCCAGGGTCCACTGATTAATGAGGCTGCA
GTGCAGAAGGTTGAATCATTTGTTAAAGATGCTGTCTCAAAGGGAGCAAAAGTCCTTCTT
GGGGGTAAAAGACACAGTCTGGGAATGACCTTCTATGAGCCAACGGTAATTGGTGACATC
AAGAATGACATGCTTATTGCGAGGAATGAAGTGTTTGGACCTGTTGCACCCCTCTTGCGC
TTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGGTTTAGCTGCT
TATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCACTGAAGCCCTTGAATATGGA
CTGGTTGGTGTCAATGAAGGATTGGTTTCAACAGAGGTGGCTCCATTTGGAGGAGTCAAG
GAGTCTGGTCTTGGTAGGGAAGGTTCCAAATATGGGATGGATGAATTTCTGGAAATGAAA
TATGTGTGCTTCGGAAATATAAGCAGTAACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_19s0085g00880.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:19:23353981:23383765:1 gene:VIT_19s0085g00880 transcript:VIT_19s0085g00880.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MGISQMGLLRSSCSALCHGPRTASVLRPSAVLTRQISMDTQNLVARLNSSGLLRSQCLIG
GKWTEAYDGKTIPVHNPATGDVLVNVPCMGGQETNDAISVAYEAFLSWSKLTAAERSKRL
RKWYDLLIANKEELGQIITLEQGKPLKEAIGEVNYGAAFIEFSAEEAKRIYGDIIPSPLA
DRRLLVLKQPVGVVGAITPWNFPLAMITRKVGPALACGCTVVIKPSELTPLTALAAAELA
LQAGIPPGAVNVVFGNAPEIGDALLASRQVRKITFTGSTAVGKKLMAGAAQTVKKVSLEL
GGNAPCIIFDDADLEVAVKGALGTKFRNSGQTCVCANRILVQEGIYEKFAIAFSQAVQSM
QVGEGFTEGVVQGPLINEAAVQKVESFVKDAVSKGAKVLLGGKRHSLGMTFYEPTVIGDI
KNDMLIARNEVFGPVAPLLRFKTEEEAIRIANDTNAGLAAYVFTENVQRMWRVTEALEYG
LVGVNEGLVSTEVAPFGGVKESGLGREGSKYGMDEFLEMKYVCFGNISSN

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_19s0085g00880.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:19:23353981:23383765:1 gene:VIT_19s0085g00880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

AAAACGACGCGATTTAGGGTCACGAGGCTGGGGCACCTGGCTATAAAAGGAGAGGGTTGC
ATCAGTGGTCGGTGAGAAGCGTTTCGTTGAAATGGGGATATCGCAGATGGGTCTGTTGCG
GAGCAGCTGCTCAGCGCTGTGTCACGGCCCCCGGACTGCTTCCGTTCTCCGACCCTCCGC
TGTCCTCACTCGCCAGATAAGCATGGACACACAAAATCTTGTGGCTCGGCTGAATAGTTC
AGGTCTACTTCGGAGCCAGTGCCTTATTGGAGGAAAATGGACTGAAGCTTATGATGGGAA
GACCATACCGGTCCACAACCCTGCTACTGGTGATGTTTTAGTAAATGTTCCATGCATGGG
AGGGCAGGAGACGAATGATGCGATATCTGTAGCTTATGAGGCATTCCTTTCTTGGAGCAA
ACTTACTGCTGCTGAAAGGAGCAAACGTCTGCGGAAATGGTATGATTTACTAATTGCCAA
TAAAGAAGAGCTTGGTCAAATCATAACACTAGAGCAAGGAAAACCCCTAAAAGAAGCCAT
TGGTGAGGTTAACTATGGGGCTGCCTTTATTGAGTTCTCTGCAGAGGAGGCAAAACGTAT
ATATGGTGATATAATTCCATCACCACTAGCTGATCGTCGGCTGCTTGTTTTAAAGCAGCC
TGTAGGTGTTGTTGGTGCAATTACTCCTTGGAACTTTCCATTGGCTATGATCACACGGAA
GGTTGGTCCTGCCCTTGCTTGTGGCTGCACAGTGGTTATAAAACCTTCTGAACTTACACC
ATTGACAGCCTTAGCAGCAGCTGAGCTTGCCCTTCAAGCTGGAATACCACCGGGTGCTGT
GAATGTGGTCTTTGGAAATGCTCCTGAAATTGGGGATGCTTTACTTGCAAGTCGGCAGGT
AAGGAAGATCACATTTACAGGCTCAACAGCTGTCGGAAAGAAGTTGATGGCTGGTGCAGC
TCAGACTGTTAAAAAGGTATCTCTGGAACTTGGTGGTAATGCACCTTGCATAATCTTTGA
CGATGCAGACCTGGAGGTGGCAGTAAAAGGGGCTCTTGGTACAAAGTTCCGTAACAGTGG
ACAAACATGTGTTTGTGCAAATAGAATACTTGTGCAGGAAGGTATTTATGAGAAATTTGC
AATTGCTTTTTCACAAGCTGTCCAAAGTATGCAAGTTGGTGAAGGTTTTACTGAAGGTGT
GGTCCAGGGTCCACTGATTAATGAGGCTGCAGTGCAGAAGGTTGAATCATTTGTTAAAGA
TGCTGTCTCAAAGGGAGCAAAAGTCCTTCTTGGGGGTAAAAGACACAGTCTGGGAATGAC
CTTCTATGAGCCAACGGTAATTGGTGACATCAAGAATGACATGCTTATTGCGAGGAATGA
AGTGTTTGGACCTGTTGCACCCCTCTTGCGCTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCAT
TGCAAATGACACCAATGCTGGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTAT
GTGGCGTGTCACTGAAGCCCTTGAATATGGACTGGTTGGTGTCAATGAAGGATTGGTTTC
AACAGAGGTGGCTCCATTTGGAGGAGTCAAGGAGTCTGGTCTTGGTAGGGAAGGTTCCAA
ATATGGGATGGATGAATTTCTGGAAATGAAATATGTGTGCTTCGGAAATATAAGCAGTAA
CTGATGGGGCCAAGGTCATCACTTGGGCGGGAGAGTGAGGAATAAGCGGCTGGTAGTTCC
GTCTTGTGTTTGTGTGATTAAATAAAGTGCAGACTTGCACCTGAATGTTTCCTTTTTTGT
TGTACTCCTTGTTCTTTTAATGCTTCTCTTTGTTGTAGAGGCTTGTGCTTGGATTTTTGT
TTTCTGCTGAATGCTTCTCCTGCTTATTTGTTGTTGCGGGGTTGCGTTGTGGCTATATGC
ACTTACGCATATCCATCAACACCTAAACTTGAAACCTAAATGTTTTTGTAGAGGCTCC