Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_19s0085g00860.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:19:23325968:23339448:1 gene:VIT_19s0085g00860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATCCACAAAGTGCTATAGCTCAAGTTAAGAGGGCTGGTCTTTTTCGGACCCAGGGC CTTATTGGAGGAAAATGGATGGATGCTTATGATGGGAAGACTTTTGAGGTCTACAATCCC GCAACCGGTGAAGTTCTAGCTAATGTCGCGTGCATGGGTAAGAAGGAGGCCAATGATGCG ATAGCTTCAGCTCATGCTGCATTCACTTCTTGGAGCAAACTTACTACTGCTGAAAGGAGT AAACTTATGAGGAAATGGTACGATTTACTAATTGCCCATCAAACCGAGCTTGGTCAACTT ATAACACTGGAGCAAGGAAAACCTGTAGCGGAAGGCTATAATGAGGTCTTGATTGGGGCT AGTTGTTTGGAGTTCTTTCTTGAGGAAGTGAAGCATTGTTATGGTGATATAATTCCACAA ACACAAGCAGATCGCCGAATGTTTGTTTTAAAGCAGCCTGTAGGTGTTGTTGGTGCAATT ACTCCCTGGAACCTTCCATTGGCTATGGCTCTTCGGAAGGTTAGTCCTGCCATGGCTTGT GGCTGCACAGTGGTTATAAAGCCCTCTGAATTAACTCCATTGTCAGCCTTAGCAGTAGCT GAACTTGCTCTTCAAGCTGGAATTCCACCGGGTGTTTTCAACATGGTCATGGGATTTGCC CCTGAGATTGGGGATGCCTTCCTTGCAAGTCCAAAGGTTAGGGCGATCACTTTTACGGGC TCAACAGCTGTTGGGAAGATGTTGCTGGCTGGTGCTGCTCAGACTGTTAAAAAGACATCT ATGGAACTTGGCGGTAATGCACCTAGCATGATATTTGATGATGCAGACTTGGAGGTGACC GTGAAAGGACTTATGATTGTGAAATTCTTTAATTGTGGACAAACATGTATTTCTCCGAAT AGAATATTGGTACAAGAAGGTATTCACGATAAATTTGCAGCTGCCCTTACAAAAGCTGTC CAGACTCTGCGAGTTGGGCATGGCTTTGATGAAGGTGTGACCCAGGGCCCACTGATTAAT CAAGCTGCATTGCACAAGGGGGCAAAAGTCCTCGTTGGGGGTAAAAGACACAGTTTGGGA TTGACTTTTTATGAGCCCACAGTACTTGTCGATGTCACTAGTGATATGCTTATATCAAGT ACCGAAATATTTGGACCTGTTCTAGCCCTGCAGCGATTTAAGACTGAGGAGGAAGCTATC CACCTTGCAAATGACAGTAATGCAGGTTTAGCAGGCTACATTTACACAGAGAACTTGCGT CGCTGTTGGCGTGTCGCTGAAGCTATCGAATTTGGAATTGTTGGTGTCAATGATGGATTA ATTCCAGCAGCGAGTGCTCCATTTGGTGGGTTTAAGCAGTCTGGTCTTGGACGTGAAGGA TCCAAGTATGGGTTGGATGATTTTCTAGAAATCAAATATCTGTGCTTGGGAAATATGGTG TAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_19s0085g00860.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:19:23325968:23339448:1 gene:VIT_19s0085g00860 transcript:VIT_19s0085g00860.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MDPQSAIAQVKRAGLFRTQGLIGGKWMDAYDGKTFEVYNPATGEVLANVACMGKKEANDA IASAHAAFTSWSKLTTAERSKLMRKWYDLLIAHQTELGQLITLEQGKPVAEGYNEVLIGA SCLEFFLEEVKHCYGDIIPQTQADRRMFVLKQPVGVVGAITPWNLPLAMALRKVSPAMAC GCTVVIKPSELTPLSALAVAELALQAGIPPGVFNMVMGFAPEIGDAFLASPKVRAITFTG STAVGKMLLAGAAQTVKKTSMELGGNAPSMIFDDADLEVTVKGLMIVKFFNCGQTCISPN RILVQEGIHDKFAAALTKAVQTLRVGHGFDEGVTQGPLINQAALHKGAKVLVGGKRHSLG LTFYEPTVLVDVTSDMLISSTEIFGPVLALQRFKTEEEAIHLANDSNAGLAGYIYTENLR RCWRVAEAIEFGIVGVNDGLIPAASAPFGGFKQSGLGREGSKYGLDDFLEIKYLCLGNMV

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_19s0085g00860.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:19:23325968:23339448:1 gene:VIT_19s0085g00860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATTGTTTATTGTTTCTGAAGGTTTTTCTCGATTTGGGTTTCATAATTTGCTGCTCATCTG CCATTTTTATAGGCAGAATTTCTTGATTCAGGTGTGATTTATATAAGCATGGATCCACAA AGTGCTATAGCTCAAGTTAAGAGGGCTGGTCTTTTTCGGACCCAGGGCCTTATTGGAGGA AAATGGATGGATGCTTATGATGGGAAGACTTTTGAGGTCTACAATCCCGCAACCGGTGAA GTTCTAGCTAATGTCGCGTGCATGGGTAAGAAGGAGGCCAATGATGCGATAGCTTCAGCT CATGCTGCATTCACTTCTTGGAGCAAACTTACTACTGCTGAAAGGAGTAAACTTATGAGG AAATGGTACGATTTACTAATTGCCCATCAAACCGAGCTTGGTCAACTTATAACACTGGAG CAAGGAAAACCTGTAGCGGAAGGCTATAATGAGGTCTTGATTGGGGCTAGTTGTTTGGAG TTCTTTCTTGAGGAAGTGAAGCATTGTTATGGTGATATAATTCCACAAACACAAGCAGAT CGCCGAATGTTTGTTTTAAAGCAGCCTGTAGGTGTTGTTGGTGCAATTACTCCCTGGAAC CTTCCATTGGCTATGGCTCTTCGGAAGGTTAGTCCTGCCATGGCTTGTGGCTGCACAGTG GTTATAAAGCCCTCTGAATTAACTCCATTGTCAGCCTTAGCAGTAGCTGAACTTGCTCTT CAAGCTGGAATTCCACCGGGTGTTTTCAACATGGTCATGGGATTTGCCCCTGAGATTGGG GATGCCTTCCTTGCAAGTCCAAAGGTTAGGGCGATCACTTTTACGGGCTCAACAGCTGTT GGGAAGATGTTGCTGGCTGGTGCTGCTCAGACTGTTAAAAAGACATCTATGGAACTTGGC GGTAATGCACCTAGCATGATATTTGATGATGCAGACTTGGAGGTGACCGTGAAAGGACTT ATGATTGTGAAATTCTTTAATTGTGGACAAACATGTATTTCTCCGAATAGAATATTGGTA CAAGAAGGTATTCACGATAAATTTGCAGCTGCCCTTACAAAAGCTGTCCAGACTCTGCGA GTTGGGCATGGCTTTGATGAAGGTGTGACCCAGGGCCCACTGATTAATCAAGCTGCATTG CACAAGGGGGCAAAAGTCCTCGTTGGGGGTAAAAGACACAGTTTGGGATTGACTTTTTAT GAGCCCACAGTACTTGTCGATGTCACTAGTGATATGCTTATATCAAGTACCGAAATATTT GGACCTGTTCTAGCCCTGCAGCGATTTAAGACTGAGGAGGAAGCTATCCACCTTGCAAAT GACAGTAATGCAGGTTTAGCAGGCTACATTTACACAGAGAACTTGCGTCGCTGTTGGCGT GTCGCTGAAGCTATCGAATTTGGAATTGTTGGTGTCAATGATGGATTAATTCCAGCAGCG AGTGCTCCATTTGGTGGGTTTAAGCAGTCTGGTCTTGGACGTGAAGGATCCAAGTATGGG TTGGATGATTTTCTAGAAATCAAATATCTGTGCTTGGGAAATATGGTGTAATTTTACTGG AGCAGGTCTCAACTTGATGGAAGAATGAGGAATAAGCTGCTGATGGTTTCCTCCCACATG AAGTATTCGAATAAATCCATGCAGACTAGCATTGGGTGTCTTCATTTTTGTTGCACAACT TTGAGCTTTTGATG