Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_19s0085g00540.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:19:22922082:22923674:1 gene:VIT_19s0085g00540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGCAGCCATGAATGCTTGGCTCTCCTTCCCCTCCAATACTGAGAGTTTCAACCATGAA
CTCGCCATTCGGAGGTTTTGCCCGGCTCGAATCGAGCAAGAACAAGGAGGAGGAGAGTGG
GAAGATGGTATGAATGAGATTGATCAGCCTTGGTCTCCTTACAATGCTGTCAGCCCCCCT
TGCTTGGCTGCCTCTGAGGAAGATGAATTCGTCGATAGCTTCATTAATATGGATGGCTAC
AACGACTACGGCAATGATGATAACAAGGCCCTCGAAAGCCAACAAGGGTTTGATCATAAT
TTTCAAGGGGATGAAGCCATTGAAATGTTTGAGATGGTGGATGAGGGCTATGAAGATGCA
GGGATGGTGGTTGAGGGGGAGGATCTTGGAGGTGGCACAGACCTGATGCCAAGCATGGAA
GAGGTGAGCCATGGGGTGGACCAAGGGCTCCAGCTGGTGCACTCATTGCTGGCATGTGCT
GAGGCGGTAGGCTGCCGGGACACCCAGCTTGCAGACTCCATGCTCAGCCGGATATGGAGG
TCTGCTAATTGTTATGGTGATTCCTTGCAGAGAGTCTCCTACTGCTTCGCCATGGGGCTG
AAGTCCCGGCTTTTGCATCTCCGGAATGTGAATGCAAATGGGACATTCGCCAATGGCAGA
ATGGCAGTGTCCTCCATCAACAAAGAGGAGAAAATGGAAGCCTTTCAACTCCTTCACCAG
ACCACTCCCTACATTGCTTTCGGTTTCATGGCTGCGAATGAAGCTATACTTAAAACTGGA
AAAGGGAATGACTCACTTCATATCATTGATCTGGGAATGGAGCATTGCCTTCAATGGCCT
TCCCTGATAAGGACTCTAGCTCAAGAACCAGAAGGGCCCCCAAAGCTCCGAATCACCGGA
CTGGTTAAAGATGGTGACAGCCTCTCAGGGCTCAAAGCCAGCTTGAAAGAACTGGCAGAG
TATGCCGCCACAATGGGGGTTCCCTTGCAGCTTAACACGGTATCAGATCCTGCAACCCCG
GCCTTTCTAACAAAAGAAAGCCTTGATGTAAGGGAAGGAGAGGTTTTATTTGTGAACAGC
ATAATGCACCTTCACAAGTATGTGAAAGAGAGCAGAGGCTCCCTCAAGGCGGTCCTCCAA
GCGATAAAGAAGCTCGGGCCGACACTGGTGACGGTGGTGGAGCAGGACGCCAACCACAAC
GGGCCCTTCTTCCTGGGGAGATTCCTGGAGTCATTACACTACTATTCAGCCATATTCGAC
TCCCTGGAGGCCAGTCTTCCAAGGAGCAGCCCACAGAGGATGAAGATAGAGAGGGGTCAC
TTTGGGGAGGAGATAAGAAACATAGTTGCATTTGAGGGATCAGAGAGGATTGAGAGGCAT
GAGAGGGCAGACCAGTGGAGAAGGCAACTGGGGCGAGCTGGGTTTCAAGTGGTGGGGATG
AAGTCGATGAGTCAGGCCCGGATGATGCTGTCTGTTTATGGGTGTGATGGCTACAGTCTG
GCTTGTGAGAAGGGATGCCTCCTTCTTGGGTGGAAAGGGAAGCCGATCATGCTCGCTTCT
GCATGGCAAGTAGCTAAAGCTTCATCGTCATAA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_19s0085g00540.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:19:22922082:22923674:1 gene:VIT_19s0085g00540 transcript:VIT_19s0085g00540.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MAAMNAWLSFPSNTESFNHELAIRRFCPARIEQEQGGGEWEDGMNEIDQPWSPYNAVSPP
CLAASEEDEFVDSFINMDGYNDYGNDDNKALESQQGFDHNFQGDEAIEMFEMVDEGYEDA
GMVVEGEDLGGGTDLMPSMEEVSHGVDQGLQLVHSLLACAEAVGCRDTQLADSMLSRIWR
SANCYGDSLQRVSYCFAMGLKSRLLHLRNVNANGTFANGRMAVSSINKEEKMEAFQLLHQ
TTPYIAFGFMAANEAILKTGKGNDSLHIIDLGMEHCLQWPSLIRTLAQEPEGPPKLRITG
LVKDGDSLSGLKASLKELAEYAATMGVPLQLNTVSDPATPAFLTKESLDVREGEVLFVNS
IMHLHKYVKESRGSLKAVLQAIKKLGPTLVTVVEQDANHNGPFFLGRFLESLHYYSAIFD
SLEASLPRSSPQRMKIERGHFGEEIRNIVAFEGSERIERHERADQWRRQLGRAGFQVVGM
KSMSQARMMLSVYGCDGYSLACEKGCLLLGWKGKPIMLASAWQVAKASSS

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_19s0085g00540.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:19:22922082:22923674:1 gene:VIT_19s0085g00540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGCAGCCATGAATGCTTGGCTCTCCTTCCCCTCCAATACTGAGAGTTTCAACCATGAA
CTCGCCATTCGGAGGTTTTGCCCGGCTCGAATCGAGCAAGAACAAGGAGGAGGAGAGTGG
GAAGATGGTATGAATGAGATTGATCAGCCTTGGTCTCCTTACAATGCTGTCAGCCCCCCT
TGCTTGGCTGCCTCTGAGGAAGATGAATTCGTCGATAGCTTCATTAATATGGATGGCTAC
AACGACTACGGCAATGATGATAACAAGGCCCTCGAAAGCCAACAAGGGTTTGATCATAAT
TTTCAAGGGGATGAAGCCATTGAAATGTTTGAGATGGTGGATGAGGGCTATGAAGATGCA
GGGATGGTGGTTGAGGGGGAGGATCTTGGAGGTGGCACAGACCTGATGCCAAGCATGGAA
GAGGTGAGCCATGGGGTGGACCAAGGGCTCCAGCTGGTGCACTCATTGCTGGCATGTGCT
GAGGCGGTAGGCTGCCGGGACACCCAGCTTGCAGACTCCATGCTCAGCCGGATATGGAGG
TCTGCTAATTGTTATGGTGATTCCTTGCAGAGAGTCTCCTACTGCTTCGCCATGGGGCTG
AAGTCCCGGCTTTTGCATCTCCGGAATGTGAATGCAAATGGGACATTCGCCAATGGCAGA
ATGGCAGTGTCCTCCATCAACAAAGAGGAGAAAATGGAAGCCTTTCAACTCCTTCACCAG
ACCACTCCCTACATTGCTTTCGGTTTCATGGCTGCGAATGAAGCTATACTTAAAACTGGA
AAAGGGAATGACTCACTTCATATCATTGATCTGGGAATGGAGCATTGCCTTCAATGGCCT
TCCCTGATAAGGACTCTAGCTCAAGAACCAGAAGGGCCCCCAAAGCTCCGAATCACCGGA
CTGGTTAAAGATGGTGACAGCCTCTCAGGGCTCAAAGCCAGCTTGAAAGAACTGGCAGAG
TATGCCGCCACAATGGGGGTTCCCTTGCAGCTTAACACGGTATCAGATCCTGCAACCCCG
GCCTTTCTAACAAAAGAAAGCCTTGATGTAAGGGAAGGAGAGGTTTTATTTGTGAACAGC
ATAATGCACCTTCACAAGTATGTGAAAGAGAGCAGAGGCTCCCTCAAGGCGGTCCTCCAA
GCGATAAAGAAGCTCGGGCCGACACTGGTGACGGTGGTGGAGCAGGACGCCAACCACAAC
GGGCCCTTCTTCCTGGGGAGATTCCTGGAGTCATTACACTACTATTCAGCCATATTCGAC
TCCCTGGAGGCCAGTCTTCCAAGGAGCAGCCCACAGAGGATGAAGATAGAGAGGGGTCAC
TTTGGGGAGGAGATAAGAAACATAGTTGCATTTGAGGGATCAGAGAGGATTGAGAGGCAT
GAGAGGGCAGACCAGTGGAGAAGGCAACTGGGGCGAGCTGGGTTTCAAGTGGTGGGGATG
AAGTCGATGAGTCAGGCCCGGATGATGCTGTCTGTTTATGGGTGTGATGGCTACAGTCTG
GCTTGTGAGAAGGGATGCCTCCTTCTTGGGTGGAAAGGGAAGCCGATCATGCTCGCTTCT
GCATGGCAAGTAGCTAAAGCTTCATCGTCATAA