Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_19s0027g00760.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:19:19970711:19975371:-1 gene:VIT_19s0027g00760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATTTTAATCGAATCTGTTTGCCTCTTTGGGTCAAGTTTACAGTTGAGGAGCTTCGT AGGATTATGGACTACAAGCATAACATTCGTAATATGTCTGTTATTGCTCATGTTGATCAT GGAAAGTCAACCCTCACAGATTCTTTAGTGGCTGCTGCTGGTATTATTGCTCAAGAAGTT GCTGGTGATGTTCGGATGACAGATACCCGCCAGGATGAAGCTGAGCGTGGTATCACAATT AAGTCTACTGGTATCTCTCTCTACTATGAGATGAGTGATGAGTCTCTCAAGAACTACAGG GGAGAGAGACAAGGGAACGAATACCTTATCAATCTTATTGATTCCCCTGGGCACGTGGAC TTCTCATCTGAGGTTACTGCTGCTCTTCGTATTACTGATGGTGCACTTGTGGTTGTGGAT TGTGTTGAGGGTGTTTGTGTCCAGACCGAAACTGTTCTGCGGCAGGCCCTGGGTGAAAGG ATCCGTCCTGTCTTAACTGTCAATAAGATGGACAGGTGCTTCCTTGAGCTTCAGGTTGAT GGAGAGGAGGCTTACCAGACATTCTCAAGGGTTATTGAGAATGCAAATGTTATCATGGCT ACTTATGAAGATCCACTTCTTGGTGATGTTCAAGTTTACCCTGAAAAGGGAACAGTTGCG TTCTCTGCTGGTTTGCATGGTTGGGCTTTTACTCTAACCAACTTTGCCAAAATGTATGCT TCCAAATTTGGAGTTGATGAGTCTAAGATGATGGAAAGGCTTTGGGGTGAGAATTTCTTT GACCCTAGTACCAGAAAATGGACCACCAAGAACACTGGTGCTCCCAACTGCAAGCGTGGT TTTGTTCAGTTCTGTTATGAACCCATCAAGCAGATCATCAACACTTGTATGAACGATCAG AAGGATAAACTGTGGCCTATGTTGCAGAAGCTTGGTGTGACCATGAAGTCTGATGAGAAG GATTTGATGGGAAAGGCACTGATGAAGCGTGTGATGCAGACATGGCTCCCAGCAAGTACT GCCCTCCTAGAAATGATGATTTTCCACCTTCCCTCACCTTCCACAGCTCAAAAATACCGT GTAGAGAACTTGTATGAGGGACCCTTGGATGATATCTATGCCACTGCTATTAGAAACTGT GATCCTGAAGGCCCTCTCATGCTCTATGTCTCAAAGATGATTCCTGCTTCTGACAAAGGC AGATTCTTTGCTTTTGGACGTGTTTTCTCTGGCAAGGTTTCAACTGGTTTGAAGGTAAGA ATCATGGGTCCAAACTATGTCCCTGGTGAGAAGAAGGATCTGTATGTCAAGAGTGTGCAG AGAACTGTTATTTGGATGGGAAAGAGGCAGGAAACTGTTGAGGATGTGCCCTGTGGAAAC ACTGTAGCTATGGTTGGTTTGGATCAGTTCATCACTAAGAATGCTACATTGACCAATGAG AAGGAGTCTGATGCCCATCCAATCAGAGCAATGAAGTTCTCTGTCTCACCTGTTGTTCGT GTTGCAGTGCAGTGCAAAGTTGCATCTGACCTTCCTAAACTTGTTGAAGGTTTGAAGCGT TTGGCTAAGTCAGATCCTATGGTGGTCTGTAGTATTGAGGAATCTGGGGAGCACATCATT GCTGGTGCTGGTGAACTCCACCTGGAGATCTGTTTGAAGGATCTGCAGGATGATTTCATG GGTGGTGCTGAGATTGTTAAGTCTGACCCTGTTGTGTCCTTCCGTGAGACTGTTCTTGAG AAGTCTTGCAGAACTGTGATGAGCAAGTCCCCTAACAAGCACAACCGTCTCTACATGGAG GCCCGACCTTTGGAGGAAGGTCTTGCAGAGGCCATTGACGATGGTCGTGTTGGTCCAAGG GATGATCCCAAAGCTCGTTCCAAGATCTTGTCTGAGGAGTTTGGTTGGGACAAGGATCTT GCAAAGAAAATCTGGTGTTTTGGACCTGAGACCACTGGCCCTAACATGGTGGTTGATATG TGTAAGGGAGTTCAGTATCTTAATGAAATTAAGGATTCTGTTGTTGCTGGGTTCCAGTGG GCATCAAAGGAAGGTGCATTGGCTGAAGAAAACATGAGGGGTATTTGCTTTGAAGTCTGT GATGTGGTCCTCCATGCTGATGCAATTCACAGAGGTGGTGGTCAAGTCATTCCCACTGCT AGGAGGGTCATCTATGCTTCCCAGCTGACAGCTAAACCCCGACTCCTTGAGCCAGTCTAC TTGGTGGAGATCCAAGCCCCAGAGCAGGCACTTGGTGGAATCTATAGTGTTCTGAACCAA AAGCGTGGGCATGTATTCGAGGAAATGCAGAGGCCGGGTACCCCACTCTACAACATCAAG GCATACCTCCCTGTCGTCGAATCCTTTGGATTTTCAGGCACTTTGAGAGCTGCAACCTCA GGACAGGCGTTCCCACAGTGTGTGTTTGATCACTGGGACGTAATGTCAGCTGACCCGCTT GAAGCTGGTTCAACTGCTGCTCAACTTGTAGCAGATATCAGAAAAAGGAAGGGCTTGAAG GAGCAGATGACCCCGCTATCTGAGTTCGAGGACAAGCTATAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_19s0027g00760.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:19:19970711:19975371:-1 gene:VIT_19s0027g00760 transcript:VIT_19s0027g00760.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MDFNRICLPLWVKFTVEELRRIMDYKHNIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVAAAGIIAQEV AGDVRMTDTRQDEAERGITIKSTGISLYYEMSDESLKNYRGERQGNEYLINLIDSPGHVD FSSEVTAALRITDGALVVVDCVEGVCVQTETVLRQALGERIRPVLTVNKMDRCFLELQVD GEEAYQTFSRVIENANVIMATYEDPLLGDVQVYPEKGTVAFSAGLHGWAFTLTNFAKMYA SKFGVDESKMMERLWGENFFDPSTRKWTTKNTGAPNCKRGFVQFCYEPIKQIINTCMNDQ KDKLWPMLQKLGVTMKSDEKDLMGKALMKRVMQTWLPASTALLEMMIFHLPSPSTAQKYR VENLYEGPLDDIYATAIRNCDPEGPLMLYVSKMIPASDKGRFFAFGRVFSGKVSTGLKVR IMGPNYVPGEKKDLYVKSVQRTVIWMGKRQETVEDVPCGNTVAMVGLDQFITKNATLTNE KESDAHPIRAMKFSVSPVVRVAVQCKVASDLPKLVEGLKRLAKSDPMVVCSIEESGEHII AGAGELHLEICLKDLQDDFMGGAEIVKSDPVVSFRETVLEKSCRTVMSKSPNKHNRLYME ARPLEEGLAEAIDDGRVGPRDDPKARSKILSEEFGWDKDLAKKIWCFGPETTGPNMVVDM CKGVQYLNEIKDSVVAGFQWASKEGALAEENMRGICFEVCDVVLHADAIHRGGGQVIPTA RRVIYASQLTAKPRLLEPVYLVEIQAPEQALGGIYSVLNQKRGHVFEEMQRPGTPLYNIK AYLPVVESFGFSGTLRAATSGQAFPQCVFDHWDVMSADPLEAGSTAAQLVADIRKRKGLK EQMTPLSEFEDKL

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_19s0027g00760.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:19:19970711:19975371:-1 gene:VIT_19s0027g00760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATTTTAATCGAATCTGTTTGCCTCTTTGGGTCAAGTTTACAGTTGAGGAGCTTCGT AGGATTATGGACTACAAGCATAACATTCGTAATATGTCTGTTATTGCTCATGTTGATCAT GGAAAGTCAACCCTCACAGATTCTTTAGTGGCTGCTGCTGGTATTATTGCTCAAGAAGTT GCTGGTGATGTTCGGATGACAGATACCCGCCAGGATGAAGCTGAGCGTGGTATCACAATT AAGTCTACTGGTATCTCTCTCTACTATGAGATGAGTGATGAGTCTCTCAAGAACTACAGG GGAGAGAGACAAGGGAACGAATACCTTATCAATCTTATTGATTCCCCTGGGCACGTGGAC TTCTCATCTGAGGTTACTGCTGCTCTTCGTATTACTGATGGTGCACTTGTGGTTGTGGAT TGTGTTGAGGGTGTTTGTGTCCAGACCGAAACTGTTCTGCGGCAGGCCCTGGGTGAAAGG ATCCGTCCTGTCTTAACTGTCAATAAGATGGACAGGTGCTTCCTTGAGCTTCAGGTTGAT GGAGAGGAGGCTTACCAGACATTCTCAAGGGTTATTGAGAATGCAAATGTTATCATGGCT ACTTATGAAGATCCACTTCTTGGTGATGTTCAAGTTTACCCTGAAAAGGGAACAGTTGCG TTCTCTGCTGGTTTGCATGGTTGGGCTTTTACTCTAACCAACTTTGCCAAAATGTATGCT TCCAAATTTGGAGTTGATGAGTCTAAGATGATGGAAAGGCTTTGGGGTGAGAATTTCTTT GACCCTAGTACCAGAAAATGGACCACCAAGAACACTGGTGCTCCCAACTGCAAGCGTGGT TTTGTTCAGTTCTGTTATGAACCCATCAAGCAGATCATCAACACTTGTATGAACGATCAG AAGGATAAACTGTGGCCTATGTTGCAGAAGCTTGGTGTGACCATGAAGTCTGATGAGAAG GATTTGATGGGAAAGGCACTGATGAAGCGTGTGATGCAGACATGGCTCCCAGCAAGTACT GCCCTCCTAGAAATGATGATTTTCCACCTTCCCTCACCTTCCACAGCTCAAAAATACCGT GTAGAGAACTTGTATGAGGGACCCTTGGATGATATCTATGCCACTGCTATTAGAAACTGT GATCCTGAAGGCCCTCTCATGCTCTATGTCTCAAAGATGATTCCTGCTTCTGACAAAGGC AGATTCTTTGCTTTTGGACGTGTTTTCTCTGGCAAGGTTTCAACTGGTTTGAAGGTAAGA ATCATGGGTCCAAACTATGTCCCTGGTGAGAAGAAGGATCTGTATGTCAAGAGTGTGCAG AGAACTGTTATTTGGATGGGAAAGAGGCAGGAAACTGTTGAGGATGTGCCCTGTGGAAAC ACTGTAGCTATGGTTGGTTTGGATCAGTTCATCACTAAGAATGCTACATTGACCAATGAG AAGGAGTCTGATGCCCATCCAATCAGAGCAATGAAGTTCTCTGTCTCACCTGTTGTTCGT GTTGCAGTGCAGTGCAAAGTTGCATCTGACCTTCCTAAACTTGTTGAAGGTTTGAAGCGT TTGGCTAAGTCAGATCCTATGGTGGTCTGTAGTATTGAGGAATCTGGGGAGCACATCATT GCTGGTGCTGGTGAACTCCACCTGGAGATCTGTTTGAAGGATCTGCAGGATGATTTCATG GGTGGTGCTGAGATTGTTAAGTCTGACCCTGTTGTGTCCTTCCGTGAGACTGTTCTTGAG AAGTCTTGCAGAACTGTGATGAGCAAGTCCCCTAACAAGCACAACCGTCTCTACATGGAG GCCCGACCTTTGGAGGAAGGTCTTGCAGAGGCCATTGACGATGGTCGTGTTGGTCCAAGG GATGATCCCAAAGCTCGTTCCAAGATCTTGTCTGAGGAGTTTGGTTGGGACAAGGATCTT GCAAAGAAAATCTGGTGTTTTGGACCTGAGACCACTGGCCCTAACATGGTGGTTGATATG TGTAAGGGAGTTCAGTATCTTAATGAAATTAAGGATTCTGTTGTTGCTGGGTTCCAGTGG GCATCAAAGGAAGGTGCATTGGCTGAAGAAAACATGAGGGGTATTTGCTTTGAAGTCTGT GATGTGGTCCTCCATGCTGATGCAATTCACAGAGGTGGTGGTCAAGTCATTCCCACTGCT AGGAGGGTCATCTATGCTTCCCAGCTGACAGCTAAACCCCGACTCCTTGAGCCAGTCTAC TTGGTGGAGATCCAAGCCCCAGAGCAGGCACTTGGTGGAATCTATAGTGTTCTGAACCAA AAGCGTGGGCATGTATTCGAGGAAATGCAGAGGCCGGGTACCCCACTCTACAACATCAAG GCATACCTCCCTGTCGTCGAATCCTTTGGATTTTCAGGCACTTTGAGAGCTGCAACCTCA GGACAGGCGTTCCCACAGTGTGTGTTTGATCACTGGGACGTAATGTCAGCTGACCCGCTT GAAGCTGGTTCAACTGCTGCTCAACTTGTAGCAGATATCAGAAAAAGGAAGGGCTTGAAG GAGCAGATGACCCCGCTATCTGAGTTCGAGGACAAGCTATAAGTGGTCCGTGATCATTGT CAAATAAAGCAAAAGAGGACCATATTGGTGGAATGTGACGATGATACTCAAGGTGAGCAT AATTTTGTTTTGTTTTCATTAATATTTTTACCGTGGAGTAGTAGTACTTTAGTGGTGTTG AAGTTGTAACGGGGGATGTTTCCCGTTTTTTCAAATTATGTTTTCAATTTAGTCATGGTT GACAAGAACAGCAAAGTTAATGTTATCTCGTCTATATGGTTTTGTCGTGGAACTATTTCA ACCAACATTGGTTTGGAGAGATGATACTATTTTTTTTCTTAAA