Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_19s0015g00160.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:19:8128453:8133797:-1 gene:VIT_19s0015g00160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTCTGCAAATGGTCAATGTTTTGTGGAGTGGAAAGAGCAATTTGTCTCCCAAGAGCGT GGCCACCGTGTGGTTCACTATTTCTTGAAGGATTCTGCTGGGAATTTCATCCTTGCAGTT GTGGGCACTGAGAGGAGTGTCAGACACATGTTCTACGTTGTTGCTGATGAGTTCTTGAAT GCATACGGGTCGGAAAATTCTGTTCATGCTGGCTTCAAATGGAGATCCAGGCGGGAAGTT GTGGATTGGCTCACATCTATGCTATCAAAGCAGCATTTGCCTGGAGATGGATCGGAATCA CCATCAAATGATCTGACACAAGGTTTAGGATCTTCCCAATTTGCAATGACTGGATTTGGT GCTCGACGGGCCCATATGCCAGATTACACGGGTCGGTTTGCTAGGAACCTGGAAGGACAT GATTCAGACATTGTATGGTCAGGTGTTGCATGGACATGCGGTAAACAGCTCAAGCATTAC CCGTCATTTTGCAGGAATGGGACTACAATAGTGATACAATCCTTTGTGTTTGTCATGGCC AAAGAGGAGGATCACTATCTTGCATATCTGGAAGATATGTATGAAGACCGGAAGGGACAG AAAAAGGTCAGAGTGAGGTGGTTTCACCATAATCAGGAAGTCAAGGGTGTAATTCCTTTA CGAAATCCTCACCCAAAAGAAGTGTTCATCACGCCTTATGCACAGGTTATCAGTGCTGAG TGTGTCGACGGTCCTGCCATAGTCTTAACTCCTGAACATTATGAGAAATGCTTAGCGGCT TTTCCACACGCCTTCTTATCCAGAGTTCATCTTTGTTTTAGACAGTTTAGAAGCCATAGG GTGAAACCCTTTGATTTGAGTAAATTACGTGGCTATTTTGATCAAGCAATTCTCTCTTGT TTGGATCTCAATCCTCTCCAGAAGCCCAATTCTGATTGCTATGGTCCAACTGCAGAAGAG GATGAAGAATTAAGCCCCGGTGACAATGTAAAGCAGGGAGCTAAGAGGACTAGAAGTTGT AGAGGGCGTCAAAGGTTTGTGAATGATCGTTCATGTGCCAGAATACCTCGTCGAGGGAGC CAGATGATGATGTATGAATCTCCACACATGAACTTAAAATATGATTTGTTAAGTCGGCGG CTACTTTCCCAGAAACATGTTGAGCCCCACCCTTGGCCTAACCCACTATTTAAGGTTGAT GAAAAGATAGAATTGTTGTGTCAAGATAGTGGCATTCGAGGTTGCTGGTTCAGGTGCACA GTGTTACGGATATGTCGTAAACAAATGAAAGTTAGATATGTTGATGTGCAGGATGAAGAT GGGTGTGGCAATCTTGAGGAATGGACCTCAATTTTCAAGCTAGCTGCCCCTGATAAACTT GGCATGAGATGCTTGGGCCGCCCAACAATTCGACCAGCCCCTTCTAGCACTCAAACAGAT GTTGCTTTGAAGGTTGGGACTCCAGTGGATGCATGGTGGAGTGATGGCTGGTGGGAGGGC GTTATAACTGAAGCCAACAACTTAGGAGATGGTCCTCTGCAAGTTTACATCCCTGGTGAA AACTTGTTCTTGAATATGCACAGCAAGGATTTAAGAATTTCTAGAGATTGGGTAGGAAAC CAGTGGGTTGATATTGAGGCAAAGCCTGATATACTGTCAGCCATATATGCAGCTATTAGC CCAGATGCAAAGATTTCCACCTCCTTGATCAGTAGTAAGGATGCTGCTGTCTTGTGTCCT ATAGCTCCCATTAGTACCATGCAAAATGTTGTTGAAGATAAGTTGGACTTAGCTGCTCCA GTCAGTTCCTATGGCTTCCCTGAAGACATGGACTGTGTTAATGAAATGAAGCAGCCATCA CGGGAAGATGGAGGGGGTGGAAATGATGCTGATCATGTCAATGATAGTCATAATAATGAC AATTTAGATGAAGCCCATGGTGATGACAATGACGAGAACAATAACAATGATGAAGATGAC CACAATGATGGTGATGACAATGATTGTGAGTTAGACCTGGAGGATTTTGAAACTGCTCGA CAGAAATGTGTAGCAGTGGAGCTCATGGAAGTGGTGGCATAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_19s0015g00160.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:19:8128453:8133797:-1 gene:VIT_19s0015g00160 transcript:VIT_19s0015g00160.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MSANGQCFVEWKEQFVSQERGHRVVHYFLKDSAGNFILAVVGTERSVRHMFYVVADEFLN AYGSENSVHAGFKWRSRREVVDWLTSMLSKQHLPGDGSESPSNDLTQGLGSSQFAMTGFG ARRAHMPDYTGRFARNLEGHDSDIVWSGVAWTCGKQLKHYPSFCRNGTTIVIQSFVFVMA KEEDHYLAYLEDMYEDRKGQKKVRVRWFHHNQEVKGVIPLRNPHPKEVFITPYAQVISAE CVDGPAIVLTPEHYEKCLAAFPHAFLSRVHLCFRQFRSHRVKPFDLSKLRGYFDQAILSC LDLNPLQKPNSDCYGPTAEEDEELSPGDNVKQGAKRTRSCRGRQRFVNDRSCARIPRRGS QMMMYESPHMNLKYDLLSRRLLSQKHVEPHPWPNPLFKVDEKIELLCQDSGIRGCWFRCT VLRICRKQMKVRYVDVQDEDGCGNLEEWTSIFKLAAPDKLGMRCLGRPTIRPAPSSTQTD VALKVGTPVDAWWSDGWWEGVITEANNLGDGPLQVYIPGENLFLNMHSKDLRISRDWVGN QWVDIEAKPDILSAIYAAISPDAKISTSLISSKDAAVLCPIAPISTMQNVVEDKLDLAAP VSSYGFPEDMDCVNEMKQPSREDGGGGNDADHVNDSHNNDNLDEAHGDDNDENNNNDEDD HNDGDDNDCELDLEDFETARQKCVAVELMEVVA

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_19s0015g00160.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:19:8128453:8133797:-1 gene:VIT_19s0015g00160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATTGTTAGCGATTTAGACAACAAAATCGGTTGAGTTTGATCCCCTTTGACAGATTTTATG GGACATCTTCAGCTAGCTAATTTGGGTTTCTTTTAGGGTTTGATGTTTTGTTAAGCACTC TGGTGACTTCTGTTAAAAAAAATGTCTGCAAATGGTCAATGTTTTGTGGAGTGGAAAGAG CAATTTGTCTCCCAAGAGCGTGGCCACCGTGTGGTTCACTATTTCTTGAAGGATTCTGCT GGGAATTTCATCCTTGCAGTTGTGGGCACTGAGAGGAGTGTCAGACACATGTTCTACGTT GTTGCTGATGAGTTCTTGAATGCATACGGGTCGGAAAATTCTGTTCATGCTGGCTTCAAA TGGAGATCCAGGCGGGAAGTTGTGGATTGGCTCACATCTATGCTATCAAAGCAGCATTTG CCTGGAGATGGATCGGAATCACCATCAAATGATCTGACACAAGGTTTAGGATCTTCCCAA TTTGCAATGACTGGATTTGGTGCTCGACGGGCCCATATGCCAGATTACACGGGTCGGTTT GCTAGGAACCTGGAAGGACATGATTCAGACATTGTATGGTCAGGTGTTGCATGGACATGC GGTAAACAGCTCAAGCATTACCCGTCATTTTGCAGGAATGGGACTACAATAGTGATACAA TCCTTTGTGTTTGTCATGGCCAAAGAGGAGGATCACTATCTTGCATATCTGGAAGATATG TATGAAGACCGGAAGGGACAGAAAAAGGTCAGAGTGAGGTGGTTTCACCATAATCAGGAA GTCAAGGGTGTAATTCCTTTACGAAATCCTCACCCAAAAGAAGTGTTCATCACGCCTTAT GCACAGGTTATCAGTGCTGAGTGTGTCGACGGTCCTGCCATAGTCTTAACTCCTGAACAT TATGAGAAATGCTTAGCGGCTTTTCCACACGCCTTCTTATCCAGAGTTCATCTTTGTTTT AGACAGTTTAGAAGCCATAGGGTGAAACCCTTTGATTTGAGTAAATTACGTGGCTATTTT GATCAAGCAATTCTCTCTTGTTTGGATCTCAATCCTCTCCAGAAGCCCAATTCTGATTGC TATGGTCCAACTGCAGAAGAGGATGAAGAATTAAGCCCCGGTGACAATGTAAAGCAGGGA GCTAAGAGGACTAGAAGTTGTAGAGGGCGTCAAAGGTTTGTGAATGATCGTTCATGTGCC AGAATACCTCGTCGAGGGAGCCAGATGATGATGTATGAATCTCCACACATGAACTTAAAA TATGATTTGTTAAGTCGGCGGCTACTTTCCCAGAAACATGTTGAGCCCCACCCTTGGCCT AACCCACTATTTAAGGTTGATGAAAAGATAGAATTGTTGTGTCAAGATAGTGGCATTCGA GGTTGCTGGTTCAGGTGCACAGTGTTACGGATATGTCGTAAACAAATGAAAGTTAGATAT GTTGATGTGCAGGATGAAGATGGGTGTGGCAATCTTGAGGAATGGACCTCAATTTTCAAG CTAGCTGCCCCTGATAAACTTGGCATGAGATGCTTGGGCCGCCCAACAATTCGACCAGCC CCTTCTAGCACTCAAACAGATGTTGCTTTGAAGGTTGGGACTCCAGTGGATGCATGGTGG AGTGATGGCTGGTGGGAGGGCGTTATAACTGAAGCCAACAACTTAGGAGATGGTCCTCTG CAAGTTTACATCCCTGGTGAAAACTTGTTCTTGAATATGCACAGCAAGGATTTAAGAATT TCTAGAGATTGGGTAGGAAACCAGTGGGTTGATATTGAGGCAAAGCCTGATATACTGTCA GCCATATATGCAGCTATTAGCCCAGATGCAAAGATTTCCACCTCCTTGATCAGTAGTAAG GATGCTGCTGTCTTGTGTCCTATAGCTCCCATTAGTACCATGCAAAATGTTGTTGAAGAT AAGTTGGACTTAGCTGCTCCAGTCAGTTCCTATGGCTTCCCTGAAGACATGGACTGTGTT AATGAAATGAAGCAGCCATCACGGGAAGATGGAGGGGGTGGAAATGATGCTGATCATGTC AATGATAGTCATAATAATGACAATTTAGATGAAGCCCATGGTGATGACAATGACGAGAAC AATAACAATGATGAAGATGACCACAATGATGGTGATGACAATGATTGTGAGTTAGACCTG GAGGATTTTGAAACTGCTCGACAGAAATGTGTAGCAGTGGAGCTCATGGAAGTGGTGGCA TAGCCCAACAACTTATGGAAGTGGTGGTGGTGGTTGATATTGGGAAGGAGCTTCATATTT TGGAGGTTTGGATTTTTGTAAATAGCAATAGTTGGTTGATGGCGCTGGAGGGGAGTTTAT TTCATTTTGATATGACTTAGGGGACTTTGTAGGTGTACAGAAGCCATTTAGAATTTTATT TGTGATGTTTCTGTTGTTATGTTACCTAGAAGCCCATTGATGAGTAAAAATCTCACTCAA GGCTTTCATTTAGTGACTGGCTAATGTTCTTCTTGATTGTTTCCTTGTACCAACAAATTT AAATTACATTCTACAGTGCT