Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_18s0122g00120.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:18:159746:165435:-1 gene:VIT_18s0122g00120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Cellulose synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6I6Y4]
Sequence	ATGGAGGCCAGTGCCGGTTTAGTGGCTGGCTCTCATAACCGCAATGAGTTGGTCGTCATC CGTCGCGACGGTGAATCTGGACCAAAGCCGTTGCAGCAGCTGAGTGGACAAATCTGCCAG ATATGTGGAGATGATGTTGGGCTAAATGTGGATGGGGAGCTGTTCGTGGCCTGCAATGAA TGTGCCTTCCCGGTTTGCAGAACTTGCTACGAGTACGAGCGCAGAGAAGGAAGCCAAGTG TGCCCCCAGTGCAAGACTAGGTTTAAACGTCTCAAGGGTTGTGCTAGAGTTGAGGGTGAT GAAGAAGAAGACGACATTGACGATGTGGACAACGAGTTCAATTTTGAAGGGAGGGGTAAA GTGGATATGCAGGGTGCTCTTGCTGAAGCAATGCTTCAGGGCCACATGACCTATGGCCGC GCCTATGATTCTGACCTTCCTCATGTCTTTCATACCATGCCCCAAGTTCCTCTCCTTACC AACGGTCAAATGGTTGATGATATTCCTCCTGAGCAACATGCTTTGGTCCCTTCTTTCATG GGTGGTGGAGGCAAAAGAATCCACCCCCTTCCTTTCTCAGATCCTAACCTTCCAGTGCAA CCCAGATCCATGGATCCCTCCAGGGACTTGGCTGCATATGGATACGGAAGTGTAGCTTGG AAGGAAAGGATGGAGAATTGGAAACAGAAACAAGAAAAATTACAGATGATGAAGAATGAA AATGGCGGCAAAGATTGGGACAATGATGGAGATGGGCCAGAGCTGCCACTGATGGATGAA GCAAGACAGCCATTGTCAAGAAAGTTGCCTATTTCGTCTAGCCAAATCAACCCATACCGA ATGATCATCATAATACGATTGGTTGTCCTTGGTTTCTTCTTCCATTATCGAGTAATGCAT CCTGTGAATGATGCTTATGCATTGTGGCTAGTCTCTGTCATCTGTGAGGTCTGGTTTGCT CTTTCATGGATTCTTGATCAGTTCCCGAAGTGGCTCCCAATTGACAGGGAAACTTATCTA GACAGGTTGTCCTTGAGGTATGAGAAGGAAGGTCAACCTTCTCAACTATCTCCGGTGGAT ATATTTGTGAGTACAGTTGATCCACTAAAAGAGCCTCCTCTGGTGACTGCGAATACGGTT TTATCCATTCTTGCTGTGGATTACCCTGTTGACAAGGTCTCTTGTTATGTTTCTGATGAT GGTGCTGCTATGCTGACATTCGAAGCCTTGTCAGAAACATCAGAGTTTGCAAGGAAGTGG GTCCCTTTCTGCAAGAAGTTCAACATTGAGCCACGGGCACCCGAGTTTTATTTTGCTCAG AAGATAGATTACCTCAAAGACAAGGTGCTACCTTCATTTGTGAAGGAACGAAGAGCAATG AAGAGAGAATATGAGGAATTCAAAGTTCGGATCAATGCTTTGGTTGCCAAGGCACAAAAG GTCCCAGAAGAAGGGTGGACAATGCAGGATGGGACTCCATGGCCTGGGAATAACATCCGA GATCATCCTGGAATGATTCAGGTTTTTCTTGGTCAAAGCGGGGGGCATGACACAGATGGT AATGAATTGCCACGATTGGTATATGTCTCTAGAGAAAAGCGACCTGGGTTTAATCACCAC AAAAAGGCTGGTGCGATGAATGCTTTGGTCCGAGTCTCTGCTGTGCTCACAAATGCACCA TATCTGTTGAACTTGGATTGTGATCACTACATCAATAACAGTAAGGCTCTTAGGGAGTCT ATGTGTTTCATGATGGATCCATTGCTTGGAAAGAGAGTCTGCTATGTTCAGTTCCCCCAG AGGTTTGATGGTATTGACAAAAATGATCGATATGCCAACCGAAACACTGTTTTCTTTGAT ATTAACATGAAAGGTTTAGATGGCATTCAAGGACCCATATATGTTGGGACTGGATGTGTG TTCAGAAGGCAAGCGCTATATGGTTATGATGCTCCAAAGACAAAGAAGCCACCGACAAGG ACATGCAACTGCTGGCCAAAATGGTGCTGCTGTGGTGGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGACT AACAAGCCTAAGTCTGAACTAAAGAAGAGAAATTCTAGGAAGGCAGATGCTGGAGGACAT GTTCCTGTGTGTGCTTTAGAGGGTATTGAAGAGGGAATTGAAGGTATTGAAAGTGAAAAT GTGGCTCTCATGTCTGAGCAGAAGCTGGAAAAGAAGTTTGGACAGTCTCCTGTATTTGTT GCCTCTACGCTGCTAGAGAATGGTGGCACACTAAAAAGTGCCAGCCCAGCTTCCTTGCTT AAGGAAGCCATTCATGTGATTAGCTGTGGCTATGAAGATAAAACAGAGTGGGGAAAGGAG GTTGGCTGGATATATGGCTCGGTTACGGAGGATATCTTGACGGGCTTTAAAATGCATTGC CATGGATGGCGATCCATATATTGTATACCTTCAAGACCTGCATTTAAAGGATCTGCACCC ATCAATCTTTCTGATCGTCTTCACCAGGTCCTTCGGTGGGCTCTTGGTTCAATTGAAATT TTCTTGAGCCGGCATTGTCCCCTGTGGTATGGGTATGGAGGTGGTCTGAAATGGTTAGAG CGTCTGTCGTACATAAATGCTACTGTATATCCATGGACTTCAATTCCCCTGCTAGCATAT TGTACCTTACCTGCTGTCTGCTTGCTCACTGGGAAATTTATTACTCCAGAGCTTAGCAAC GTTGCTAGCTTGTGGTTTCTGTCACTTTTCATTTGTATTTTTGCAACTGGTATCCTGGAA ATGAGATGGAGTGGAGTTGGAATTGATGAATGGTGGAGAAATGAACAGTTTTGGGTTATT GGAGGTGTTTCAGCACATCTGTTCGCGGTGTTCCAGGGACTTTTGAAGGTGTTAGCTGGT GTTGACACAAACTTCACTGTGACATCAAAAGCTGGGGATGACGTGGAGTTCTCAGAGCTG TATGCTTTCAAGTGGACCACATTGCTCATCCCACCCACCACACTGCTGATAATAAACCTG ATTGGAGTTGTTGCTGGCATCTCAAATGCAATAAATAATGGGTATGAGTCATGGGGACCT CTGTTTGGTAAACTCTTCTTTGCATTCTGGGTGATAGTTCATCTCTATCCTTTCCTGAAG GGTTTGCTGGGTCGGCAGAACAGAACCCCCACGATCATTATCGTGTGGTCAATTTTGCTT GCCTCCATCTTCTCTCTTTTGTGGGTTCGGATTGATCCTTTTCTGGCCAAGTCAGATGGC CCAGTTCTGGAGGAATGTGGATTGGACTGTAATTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_18s0122g00120.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:18:159746:165435:-1 gene:VIT_18s0122g00120 transcript:VIT_18s0122g00120.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Cellulose synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6I6Y4]
Sequence	MEASAGLVAGSHNRNELVVIRRDGESGPKPLQQLSGQICQICGDDVGLNVDGELFVACNE CAFPVCRTCYEYERREGSQVCPQCKTRFKRLKGCARVEGDEEEDDIDDVDNEFNFEGRGK VDMQGALAEAMLQGHMTYGRAYDSDLPHVFHTMPQVPLLTNGQMVDDIPPEQHALVPSFM GGGGKRIHPLPFSDPNLPVQPRSMDPSRDLAAYGYGSVAWKERMENWKQKQEKLQMMKNE NGGKDWDNDGDGPELPLMDEARQPLSRKLPISSSQINPYRMIIIIRLVVLGFFFHYRVMH PVNDAYALWLVSVICEVWFALSWILDQFPKWLPIDRETYLDRLSLRYEKEGQPSQLSPVD IFVSTVDPLKEPPLVTANTVLSILAVDYPVDKVSCYVSDDGAAMLTFEALSETSEFARKW VPFCKKFNIEPRAPEFYFAQKIDYLKDKVLPSFVKERRAMKREYEEFKVRINALVAKAQK VPEEGWTMQDGTPWPGNNIRDHPGMIQVFLGQSGGHDTDGNELPRLVYVSREKRPGFNHH KKAGAMNALVRVSAVLTNAPYLLNLDCDHYINNSKALRESMCFMMDPLLGKRVCYVQFPQ RFDGIDKNDRYANRNTVFFDINMKGLDGIQGPIYVGTGCVFRRQALYGYDAPKTKKPPTR TCNCWPKWCCCGGRKKKKKTNKPKSELKKRNSRKADAGGHVPVCALEGIEEGIEGIESEN VALMSEQKLEKKFGQSPVFVASTLLENGGTLKSASPASLLKEAIHVISCGYEDKTEWGKE VGWIYGSVTEDILTGFKMHCHGWRSIYCIPSRPAFKGSAPINLSDRLHQVLRWALGSIEI FLSRHCPLWYGYGGGLKWLERLSYINATVYPWTSIPLLAYCTLPAVCLLTGKFITPELSN VASLWFLSLFICIFATGILEMRWSGVGIDEWWRNEQFWVIGGVSAHLFAVFQGLLKVLAG VDTNFTVTSKAGDDVEFSELYAFKWTTLLIPPTTLLIINLIGVVAGISNAINNGYESWGP LFGKLFFAFWVIVHLYPFLKGLLGRQNRTPTIIIVWSILLASIFSLLWVRIDPFLAKSDG PVLEECGLDCN

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_18s0122g00120.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:18:159746:165435:-1 gene:VIT_18s0122g00120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Cellulose synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6I6Y4]
Sequence	TAGGCTTTTAATGGTTGTTGATTGAGTAGAGAAGCAAGGAATGATAAGAGAGAGAAGGAG GCATAAAAGGGAAAAGGGAGGTGCTTTCAATTGGTAAATCAGAAAGAAAGAGAAGCTTCT GGTCTGCCCCAGGCAGAGGGAGACGGAGGAGAAGACGCTGTGTTTTTTGAAGATCGGCTT TGGTTTTGGGGACAGATCTGGGAGCAGAATTGAGTTGTAGTGATCTGTGAAAGGCCAATG GAGGCCAGTGCCGGTTTAGTGGCTGGCTCTCATAACCGCAATGAGTTGGTCGTCATCCGT CGCGACGGTGAATCTGGACCAAAGCCGTTGCAGCAGCTGAGTGGACAAATCTGCCAGATA TGTGGAGATGATGTTGGGCTAAATGTGGATGGGGAGCTGTTCGTGGCCTGCAATGAATGT GCCTTCCCGGTTTGCAGAACTTGCTACGAGTACGAGCGCAGAGAAGGAAGCCAAGTGTGC CCCCAGTGCAAGACTAGGTTTAAACGTCTCAAGGGTTGTGCTAGAGTTGAGGGTGATGAA GAAGAAGACGACATTGACGATGTGGACAACGAGTTCAATTTTGAAGGGAGGGGTAAAGTG GATATGCAGGGTGCTCTTGCTGAAGCAATGCTTCAGGGCCACATGACCTATGGCCGCGCC TATGATTCTGACCTTCCTCATGTCTTTCATACCATGCCCCAAGTTCCTCTCCTTACCAAC GGTCAAATGGTTGATGATATTCCTCCTGAGCAACATGCTTTGGTCCCTTCTTTCATGGGT GGTGGAGGCAAAAGAATCCACCCCCTTCCTTTCTCAGATCCTAACCTTCCAGTGCAACCC AGATCCATGGATCCCTCCAGGGACTTGGCTGCATATGGATACGGAAGTGTAGCTTGGAAG GAAAGGATGGAGAATTGGAAACAGAAACAAGAAAAATTACAGATGATGAAGAATGAAAAT GGCGGCAAAGATTGGGACAATGATGGAGATGGGCCAGAGCTGCCACTGATGGATGAAGCA AGACAGCCATTGTCAAGAAAGTTGCCTATTTCGTCTAGCCAAATCAACCCATACCGAATG ATCATCATAATACGATTGGTTGTCCTTGGTTTCTTCTTCCATTATCGAGTAATGCATCCT GTGAATGATGCTTATGCATTGTGGCTAGTCTCTGTCATCTGTGAGGTCTGGTTTGCTCTT TCATGGATTCTTGATCAGTTCCCGAAGTGGCTCCCAATTGACAGGGAAACTTATCTAGAC AGGTTGTCCTTGAGGTATGAGAAGGAAGGTCAACCTTCTCAACTATCTCCGGTGGATATA TTTGTGAGTACAGTTGATCCACTAAAAGAGCCTCCTCTGGTGACTGCGAATACGGTTTTA TCCATTCTTGCTGTGGATTACCCTGTTGACAAGGTCTCTTGTTATGTTTCTGATGATGGT GCTGCTATGCTGACATTCGAAGCCTTGTCAGAAACATCAGAGTTTGCAAGGAAGTGGGTC CCTTTCTGCAAGAAGTTCAACATTGAGCCACGGGCACCCGAGTTTTATTTTGCTCAGAAG ATAGATTACCTCAAAGACAAGGTGCTACCTTCATTTGTGAAGGAACGAAGAGCAATGAAG AGAGAATATGAGGAATTCAAAGTTCGGATCAATGCTTTGGTTGCCAAGGCACAAAAGGTC CCAGAAGAAGGGTGGACAATGCAGGATGGGACTCCATGGCCTGGGAATAACATCCGAGAT CATCCTGGAATGATTCAGGTTTTTCTTGGTCAAAGCGGGGGGCATGACACAGATGGTAAT GAATTGCCACGATTGGTATATGTCTCTAGAGAAAAGCGACCTGGGTTTAATCACCACAAA AAGGCTGGTGCGATGAATGCTTTGGTCCGAGTCTCTGCTGTGCTCACAAATGCACCATAT CTGTTGAACTTGGATTGTGATCACTACATCAATAACAGTAAGGCTCTTAGGGAGTCTATG TGTTTCATGATGGATCCATTGCTTGGAAAGAGAGTCTGCTATGTTCAGTTCCCCCAGAGG TTTGATGGTATTGACAAAAATGATCGATATGCCAACCGAAACACTGTTTTCTTTGATATT AACATGAAAGGTTTAGATGGCATTCAAGGACCCATATATGTTGGGACTGGATGTGTGTTC AGAAGGCAAGCGCTATATGGTTATGATGCTCCAAAGACAAAGAAGCCACCGACAAGGACA TGCAACTGCTGGCCAAAATGGTGCTGCTGTGGTGGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGACTAAC AAGCCTAAGTCTGAACTAAAGAAGAGAAATTCTAGGAAGGCAGATGCTGGAGGACATGTT CCTGTGTGTGCTTTAGAGGGTATTGAAGAGGGAATTGAAGGTATTGAAAGTGAAAATGTG GCTCTCATGTCTGAGCAGAAGCTGGAAAAGAAGTTTGGACAGTCTCCTGTATTTGTTGCC TCTACGCTGCTAGAGAATGGTGGCACACTAAAAAGTGCCAGCCCAGCTTCCTTGCTTAAG GAAGCCATTCATGTGATTAGCTGTGGCTATGAAGATAAAACAGAGTGGGGAAAGGAGGTT GGCTGGATATATGGCTCGGTTACGGAGGATATCTTGACGGGCTTTAAAATGCATTGCCAT GGATGGCGATCCATATATTGTATACCTTCAAGACCTGCATTTAAAGGATCTGCACCCATC AATCTTTCTGATCGTCTTCACCAGGTCCTTCGGTGGGCTCTTGGTTCAATTGAAATTTTC TTGAGCCGGCATTGTCCCCTGTGGTATGGGTATGGAGGTGGTCTGAAATGGTTAGAGCGT CTGTCGTACATAAATGCTACTGTATATCCATGGACTTCAATTCCCCTGCTAGCATATTGT ACCTTACCTGCTGTCTGCTTGCTCACTGGGAAATTTATTACTCCAGAGCTTAGCAACGTT GCTAGCTTGTGGTTTCTGTCACTTTTCATTTGTATTTTTGCAACTGGTATCCTGGAAATG AGATGGAGTGGAGTTGGAATTGATGAATGGTGGAGAAATGAACAGTTTTGGGTTATTGGA GGTGTTTCAGCACATCTGTTCGCGGTGTTCCAGGGACTTTTGAAGGTGTTAGCTGGTGTT GACACAAACTTCACTGTGACATCAAAAGCTGGGGATGACGTGGAGTTCTCAGAGCTGTAT GCTTTCAAGTGGACCACATTGCTCATCCCACCCACCACACTGCTGATAATAAACCTGATT GGAGTTGTTGCTGGCATCTCAAATGCAATAAATAATGGGTATGAGTCATGGGGACCTCTG TTTGGTAAACTCTTCTTTGCATTCTGGGTGATAGTTCATCTCTATCCTTTCCTGAAGGGT TTGCTGGGTCGGCAGAACAGAACCCCCACGATCATTATCGTGTGGTCAATTTTGCTTGCC TCCATCTTCTCTCTTTTGTGGGTTCGGATTGATCCTTTTCTGGCCAAGTCAGATGGCCCA GTTCTGGAGGAATGTGGATTGGACTGTAATTAGTAGTGCATATTCTGTTGGGCAATTTGT TAGTGGGGTTTTTGACAGATATCTTAAATTATACAAAAGAAATCTTTGGTGTGATGGGGT CCACCATCTGTAGATTTTTAATATGTGTTGGGGTTGGAGGAAATGCTAAGGGGTTCAAGA TTTGAGCTGGCTGGCGGCGGTTGCGGTGGCGGTGGCGGTGGCAGTGGTTGATGGTTAGAA GCTGCTGCTCATTTTTTTATTGGTTTGATATACACGGGGAAAAGGAGGTAGGGTGAACCA CAGTATCACAGTGAATTATTGTTACAACTCGTCTCTCTCTCTATTTTGTTCACAATAAAG AGTGGGCTTTGCCTTGTCCCGCTACGTGTTACATGTATCTACGAAGGCAAAATTCTGTGA CATTAGAAATTTGTTTGGGACTTCTTGTTTGCACTTTATGTTACTATTGCTGCCAGACG