Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_18s0117g00250.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:18:23461970:23465483:1 gene:VIT_18s0117g00250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTCTTGGTGTTTGAGTTCTTCGACTGGACAAAAAATATCTCTGCTTTCTCACAAACTC TTGAAACTCAGAGCATTCTCTCATCTGGGTTTTTCTGAATACGTAAAAGAACGATTGGGT GTTGATGATGCTAAGAGCAGAGCTTGGAATACTACTCAAACATCTGGTTCAGATGTGGAG AGCAGCATCTATACAATTCTGACAATTGACCGTTGGGAGTCTCTGAATCACATGGCATAT GGGTTGAAGCAACTTAGGCCAGTTCATGGAAGACTAGCTTTGAAATTTCTCAAGTGGGTC ATCAAACAACCTGGTTTGGAACTCAAACACCTCACCCATATGTATTGTCTCACTGCCCAT ATACTTGTTAAAGCTAGAATGTATGACTCTGCCAAATCAATTTTGAGACATTTATGCCAA ATGGGTATTGGCTCAAAATCCATTTTTGGTGCCCTCATGGACACATACCCGCTTTGCAAT TCAATTCCTTCAGTTTTTGACCTTCTAATTCGGGTTTATTTAAAAGAGGGTATGATTGAT TATGCCGTGGAGACATTTGAATTGGTGGGTCTTGTGGGATTTAAGCCTTCGGTATATACT TGTAACATGATCCTAGCTTCAATGGTGAAGGACAAGAGGACAGAATTGGTTTGGTCATTG TTTAGGGAAATGTCGGATAAGGGAATTTGCCCAAACGTTGGTACTTTTAATATACTGATA AATGGTTTATGTGTTGAAGGGAATCTTAAGAAAGCTGGCAATCTCTTGAAACAGATGGAA GAGAATGGTTTCGTTCCCACCATAGTTACTTATAATACTTTGCTCAATTGGTATTGCAAG AAGGGAAGGTATAAAGCGGCTATTGAGTTGATTGATTATATGATTTGTAAAGGTATTGAA GCTGATGTCTGTACGTATAATGTGTTTATCGATAATTTGTGTACAAACCACAGGAGTGCA AAAGCTTATTTATTGTTGAAAAAGATGAGGAAGGAGATGATATCCCCAAATGAAGTCACA TATAATACTCTTATTAATGGGTTTGTTAAAGAGGGAAAGATTGGAGTTGCTGCTCAAGTT TTTAATGAGATGTCAAAGTTTGATCTTTCACCAAACTGTGTTACTTATAATGCTTTGATT GGTGGCCATTGTCATGTGGGTGATTTTGAGGAAGCTCTGAGGCTTTTAGATCATATGGAA GCAGCTGGACTCAGACTTAATGAAGTTACCTATGGGACTCTTTTGAATGGGTTATGCAAA CATGAAAAGTTTGAGTTGGCAAAAAGACTTCTGGAGAGGATGAGGGTGAATGATATGGTT GTTGGTCATATTGCTTATACAGTGTTGATTGATGGGCTATGCAAAAATGGGATGCTTGAT GAAGCTGTACAGTTGGTGGGTAACATGTACAAGGATGGAGTAAATCCTGATGTTATCACA TATTCATCACTCATAAATGGATTTTGCAGAGTGGGAAACATAAAGAGTGCTAAAGAGATA ATTTGTAGGATGTATAGATCTGGGCTTGTACTGAACAAGATCATATACTCAACCTTAATT TACAATTTTTGCCAGCATGGAAATGTTACAGAAGCAATGAAAGTTTATGCTGTCATGAAC TGCAATGGCCATGGTGCTGACCATTTCACGTGTAATGTGTTGGTTTCTTCTCTCTGTAGA GATGGAAAGTTAGGGGAGGCAGAAAAATTTCTTTGTCATATGAGTAGGATTGGCCTAGTT CCTAACTCCATCACTTATGACTGTATTATAAATGGCTATGGCAGTATTGGGGATCCTTTA AATGCTTTTTCCTTCTTTGATGACATGATCAAATGTGGTCAGCATCCAAGTTTTTTCACA TATGGAAGTCTACTAAAAGGATTATGCAAGGGGGGAAATTTGGTGGAAGCAAAAAAGTTC TTGAATAGACTACATTACATTCCTGGTGCTGTAGACTCTGTTATGTACAATACATTACTA GCTGAGACATGTAAATCAGGCAATTTGCATGAGGCAGTGGCCCTCTTTGATAAGATGGTC CAGAATAATGTGCTGCCTGATAGCTACACATACTCTAGTCTTTTGACTGGGTTATGTAGG AAGGGCAAGGCAGTTACTGCAGTTTGTCTATTTGGAACAGCCATGGGAAGGGGAACCTTG TTTCCTAACCATGTTATGTACACATGTTTGGTTGACGGTCTTTCCAAGGCAGGCCATCCA AAGGCTGCTTTCTATTTCTTTGAAGAGATGATGAAGAAAGGTACATGCCCTGATACAGTT GCATTCAATGCAATTATAGACAGTTGCTCAAGAAGAGGTCAAATGATGAAGGCAAATGAT TTTTTCTCCACAATGAGGTGGTGGGGTGTGTGTCCTAATCTGGCTACTTATAATATTCTT TTGCACGGGTTTTCAAAAAAACAGGCTTTGTTAAGGTACTTATCATTATACAGTACCATG ATGAGGGAGGGTATTTTCCCTGATAAGTTGACATTCCATTCTCTCATTCTTGGACTTTCA AAGTCAGGTATACCGGACCTTGGGGTTAAGCTTTTGGGAAAGATGATAATGGAAGGTACT TTAGCTGATCAGTTTACATTTAATATACTTATCAATAAGTATAGTGAGAGTGGAAAGATG AGAAAGGCCTTTGATCTGGTCAATTTTATGAATACCTTGGGGGTTTTTCCTGATCGAGAT ACCTACAACCATATTTTTAATGGACTCAATAAAAAATCTGCTTTCCGAGAATCTACTGTG GTTTTACATGAAATGTTGGAAAATGGTGTTATTCCAAAACATGCCCAATATATTACTTTG ATTAATGGCATGTGTAGAGTTGGAGATATACAAGGAGCATTCAAGCTAAAAGATGAGATG GAGGCACTTGGTTTTGGCTCCCATGAAGTAGCTGAGAGTGCTATGGTTAGAGGGCTTCTG CACTGTGGAAAGACTGAAGATGCAATGCTTGTTTTGGATCATATGCTTAGGATGCGACTT CTTCCCACTATTGCCACATTCACAACTCTAATGCATAGATTCTGTAGAGATGCTAAGATT GCAGAGGCTTTAAAGTTGAAGGGTGTAATGGAGCTTTGTGGTCTGAAGCTTGATGTTGTT GCTTACAATGTTCTCATTATGGGCATGTGTGCTAATGGGGATTCTGCAGCTGCATTTGAG CTATATGAGGAAATGAGACATAGGGATCTTTGTCCGAATATTACCACCTATGCTGTTCTT GTTGATGCCATTTCCGCTGCAAATAATCTTATTCAGGGTGAAAAGCTTTTGACTGATCTA CAGGAGCGGGGATTGATATCTTGGGGTGGTAGCACCCAACATTTGGACAAGGAATTGACA GTTGCCATGGGAAAATTAAATTATATAAGGTTCAAAAGAAGAAATAGTGTCAATAACAAG ACAAATTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_18s0117g00250.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:18:23461970:23465483:1 gene:VIT_18s0117g00250 transcript:VIT_18s0117g00250.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MSWCLSSSTGQKISLLSHKLLKLRAFSHLGFSEYVKERLGVDDAKSRAWNTTQTSGSDVE SSIYTILTIDRWESLNHMAYGLKQLRPVHGRLALKFLKWVIKQPGLELKHLTHMYCLTAH ILVKARMYDSAKSILRHLCQMGIGSKSIFGALMDTYPLCNSIPSVFDLLIRVYLKEGMID YAVETFELVGLVGFKPSVYTCNMILASMVKDKRTELVWSLFREMSDKGICPNVGTFNILI NGLCVEGNLKKAGNLLKQMEENGFVPTIVTYNTLLNWYCKKGRYKAAIELIDYMICKGIE ADVCTYNVFIDNLCTNHRSAKAYLLLKKMRKEMISPNEVTYNTLINGFVKEGKIGVAAQV FNEMSKFDLSPNCVTYNALIGGHCHVGDFEEALRLLDHMEAAGLRLNEVTYGTLLNGLCK HEKFELAKRLLERMRVNDMVVGHIAYTVLIDGLCKNGMLDEAVQLVGNMYKDGVNPDVIT YSSLINGFCRVGNIKSAKEIICRMYRSGLVLNKIIYSTLIYNFCQHGNVTEAMKVYAVMN CNGHGADHFTCNVLVSSLCRDGKLGEAEKFLCHMSRIGLVPNSITYDCIINGYGSIGDPL NAFSFFDDMIKCGQHPSFFTYGSLLKGLCKGGNLVEAKKFLNRLHYIPGAVDSVMYNTLL AETCKSGNLHEAVALFDKMVQNNVLPDSYTYSSLLTGLCRKGKAVTAVCLFGTAMGRGTL FPNHVMYTCLVDGLSKAGHPKAAFYFFEEMMKKGTCPDTVAFNAIIDSCSRRGQMMKAND FFSTMRWWGVCPNLATYNILLHGFSKKQALLRYLSLYSTMMREGIFPDKLTFHSLILGLS KSGIPDLGVKLLGKMIMEGTLADQFTFNILINKYSESGKMRKAFDLVNFMNTLGVFPDRD TYNHIFNGLNKKSAFRESTVVLHEMLENGVIPKHAQYITLINGMCRVGDIQGAFKLKDEM EALGFGSHEVAESAMVRGLLHCGKTEDAMLVLDHMLRMRLLPTIATFTTLMHRFCRDAKI AEALKLKGVMELCGLKLDVVAYNVLIMGMCANGDSAAAFELYEEMRHRDLCPNITTYAVL VDAISAANNLIQGEKLLTDLQERGLISWGGSTQHLDKELTVAMGKLNYIRFKRRNSVNNK TN

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_18s0117g00250.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:18:23461970:23465483:1 gene:VIT_18s0117g00250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTCTTGGTGTTTGAGTTCTTCGACTGGACAAAAAATATCTCTGCTTTCTCACAAACTC TTGAAACTCAGAGCATTCTCTCATCTGGGTTTTTCTGAATACGTAAAAGAACGATTGGGT GTTGATGATGCTAAGAGCAGAGCTTGGAATACTACTCAAACATCTGGTTCAGATGTGGAG AGCAGCATCTATACAATTCTGACAATTGACCGTTGGGAGTCTCTGAATCACATGGCATAT GGGTTGAAGCAACTTAGGCCAGTTCATGGAAGACTAGCTTTGAAATTTCTCAAGTGGGTC ATCAAACAACCTGGTTTGGAACTCAAACACCTCACCCATATGTATTGTCTCACTGCCCAT ATACTTGTTAAAGCTAGAATGTATGACTCTGCCAAATCAATTTTGAGACATTTATGCCAA ATGGGTATTGGCTCAAAATCCATTTTTGGTGCCCTCATGGACACATACCCGCTTTGCAAT TCAATTCCTTCAGTTTTTGACCTTCTAATTCGGGTTTATTTAAAAGAGGGTATGATTGAT TATGCCGTGGAGACATTTGAATTGGTGGGTCTTGTGGGATTTAAGCCTTCGGTATATACT TGTAACATGATCCTAGCTTCAATGGTGAAGGACAAGAGGACAGAATTGGTTTGGTCATTG TTTAGGGAAATGTCGGATAAGGGAATTTGCCCAAACGTTGGTACTTTTAATATACTGATA AATGGTTTATGTGTTGAAGGGAATCTTAAGAAAGCTGGCAATCTCTTGAAACAGATGGAA GAGAATGGTTTCGTTCCCACCATAGTTACTTATAATACTTTGCTCAATTGGTATTGCAAG AAGGGAAGGTATAAAGCGGCTATTGAGTTGATTGATTATATGATTTGTAAAGGTATTGAA GCTGATGTCTGTACGTATAATGTGTTTATCGATAATTTGTGTACAAACCACAGGAGTGCA AAAGCTTATTTATTGTTGAAAAAGATGAGGAAGGAGATGATATCCCCAAATGAAGTCACA TATAATACTCTTATTAATGGGTTTGTTAAAGAGGGAAAGATTGGAGTTGCTGCTCAAGTT TTTAATGAGATGTCAAAGTTTGATCTTTCACCAAACTGTGTTACTTATAATGCTTTGATT GGTGGCCATTGTCATGTGGGTGATTTTGAGGAAGCTCTGAGGCTTTTAGATCATATGGAA GCAGCTGGACTCAGACTTAATGAAGTTACCTATGGGACTCTTTTGAATGGGTTATGCAAA CATGAAAAGTTTGAGTTGGCAAAAAGACTTCTGGAGAGGATGAGGGTGAATGATATGGTT GTTGGTCATATTGCTTATACAGTGTTGATTGATGGGCTATGCAAAAATGGGATGCTTGAT GAAGCTGTACAGTTGGTGGGTAACATGTACAAGGATGGAGTAAATCCTGATGTTATCACA TATTCATCACTCATAAATGGATTTTGCAGAGTGGGAAACATAAAGAGTGCTAAAGAGATA ATTTGTAGGATGTATAGATCTGGGCTTGTACTGAACAAGATCATATACTCAACCTTAATT TACAATTTTTGCCAGCATGGAAATGTTACAGAAGCAATGAAAGTTTATGCTGTCATGAAC TGCAATGGCCATGGTGCTGACCATTTCACGTGTAATGTGTTGGTTTCTTCTCTCTGTAGA GATGGAAAGTTAGGGGAGGCAGAAAAATTTCTTTGTCATATGAGTAGGATTGGCCTAGTT CCTAACTCCATCACTTATGACTGTATTATAAATGGCTATGGCAGTATTGGGGATCCTTTA AATGCTTTTTCCTTCTTTGATGACATGATCAAATGTGGTCAGCATCCAAGTTTTTTCACA TATGGAAGTCTACTAAAAGGATTATGCAAGGGGGGAAATTTGGTGGAAGCAAAAAAGTTC TTGAATAGACTACATTACATTCCTGGTGCTGTAGACTCTGTTATGTACAATACATTACTA GCTGAGACATGTAAATCAGGCAATTTGCATGAGGCAGTGGCCCTCTTTGATAAGATGGTC CAGAATAATGTGCTGCCTGATAGCTACACATACTCTAGTCTTTTGACTGGGTTATGTAGG AAGGGCAAGGCAGTTACTGCAGTTTGTCTATTTGGAACAGCCATGGGAAGGGGAACCTTG TTTCCTAACCATGTTATGTACACATGTTTGGTTGACGGTCTTTCCAAGGCAGGCCATCCA AAGGCTGCTTTCTATTTCTTTGAAGAGATGATGAAGAAAGGTACATGCCCTGATACAGTT GCATTCAATGCAATTATAGACAGTTGCTCAAGAAGAGGTCAAATGATGAAGGCAAATGAT TTTTTCTCCACAATGAGGTGGTGGGGTGTGTGTCCTAATCTGGCTACTTATAATATTCTT TTGCACGGGTTTTCAAAAAAACAGGCTTTGTTAAGGTACTTATCATTATACAGTACCATG ATGAGGGAGGGTATTTTCCCTGATAAGTTGACATTCCATTCTCTCATTCTTGGACTTTCA AAGTCAGGTATACCGGACCTTGGGGTTAAGCTTTTGGGAAAGATGATAATGGAAGGTACT TTAGCTGATCAGTTTACATTTAATATACTTATCAATAAGTATAGTGAGAGTGGAAAGATG AGAAAGGCCTTTGATCTGGTCAATTTTATGAATACCTTGGGGGTTTTTCCTGATCGAGAT ACCTACAACCATATTTTTAATGGACTCAATAAAAAATCTGCTTTCCGAGAATCTACTGTG GTTTTACATGAAATGTTGGAAAATGGTGTTATTCCAAAACATGCCCAATATATTACTTTG ATTAATGGCATGTGTAGAGTTGGAGATATACAAGGAGCATTCAAGCTAAAAGATGAGATG GAGGCACTTGGTTTTGGCTCCCATGAAGTAGCTGAGAGTGCTATGGTTAGAGGGCTTCTG CACTGTGGAAAGACTGAAGATGCAATGCTTGTTTTGGATCATATGCTTAGGATGCGACTT CTTCCCACTATTGCCACATTCACAACTCTAATGCATAGATTCTGTAGAGATGCTAAGATT GCAGAGGCTTTAAAGTTGAAGGGTGTAATGGAGCTTTGTGGTCTGAAGCTTGATGTTGTT GCTTACAATGTTCTCATTATGGGCATGTGTGCTAATGGGGATTCTGCAGCTGCATTTGAG CTATATGAGGAAATGAGACATAGGGATCTTTGTCCGAATATTACCACCTATGCTGTTCTT GTTGATGCCATTTCCGCTGCAAATAATCTTATTCAGGGTGAAAAGCTTTTGACTGATCTA CAGGAGCGGGGATTGATATCTTGGGGTGGTAGCACCCAACATTTGGACAAGGAATTGACA GTTGCCATGGGAAAATTAAATTATATAAGGTTCAAAAGAAGAAATAGTGTCAATAACAAG ACAAATTAG