Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_18s0089g00410.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:18:28209036:28216160:1 gene:VIT_18s0089g00410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGCTGGAAATGAATGGATTAACGGGTACTTGGAAGCGATATTGGATGCCGGAAGTAGC
AGAAATGGGCTGAGAGTTGTTGAAGATGGTGATGAGAAGAGCAACAGCAAGAATAATGGT
AGTAGGAGGAGAAGATTTGTGTTTAATCCCACCAAGTACTTTGTAGAAGAAGTTGTTAAT
AGCTTTGATGAATCTGATCTCCATAGGACATGGATTAAGGTGATAGCAACAAGGAACTCA
CGTGATAGGAGCAACAGGCTTGAGAATATGTGCTGGCGCATTTGGCATCTTGCTCGCAAA
AAGAAGCAGATTGCATGGGATGATGCACAGAGGCTTACAAAGCGGCGTCTTGAGCGGGAG
CAAGGTCGCCATGATGCTGCTGATGACCTTTCAGAGCTCTCTGAAGGGGAAAAGGAGAAA
GGAGATCCCAACCAAATAGAACCTGTCAAGGAGCAAATGACCAGAATCAATTCTGATATG
CATATATGGTCAGATGATGACAAGTCCAGACACTTATATATTATCTTAATCAGTATTCAT
GGGTTAGTACGTGGAGAAAACATGGAACTTGGAAGAGATTCAGATACAGGTGGTCAAGTG
AAATATGTTGTAGAACTAGCGAGGGCTCTGGCAAATACGAAGGGAGTGTATCGGGTGGAC
CTCCTCACTAGACAAATTACCTCAACAGAGGTTGACTCAAGCTATGGTGAGCCCATTGAG
ATGTTGTCATGCCCTTCAGATGGTGGGGGCAGTTGTGGAGCATATATTATCCGGATCCCG
TGTGGTCCTCGTGATAGGTACATACCAAAAGAGTCACTATGGCCATACATACCTGAATTT
GTGGATGGGGCTCTAGGCCACATTGTCAACATGGCAAGAGCTTTGGGTGAACAAGTGGAT
GCAGGGAAGCCGATATGGCCTTATGTTATTCATGGTCACTATGCTGATGCTGGGGAGGTA
GCAGCACACTTGTCCGGGGCCTTGAATGTGCCAATGGTGCTAACTGGACATTCACTGGGT
AGGAACAAATTTGAGCAATTACTCAAACAAGGGAGGCTATCCAGGGAGGACATAAATTCA
ACTTACAAGATAATGAGGAGAATTGAGGCTGAGGAGCTGGGGTTGGATGCAGCTGAAATG
GTGGTGACTAGCACAAGGCAAGAGATTGAAGAGCAATGGGGACTGTATGATGGGTTTGAT
CTCAAGTTGGAGAGGAAGCTTCGGGTTAGGAGACGTCGAGGAGTGAGTTGCTTTGGAAGG
AACATGCCTAGGATGGTGGTTATTCCACCGGGGATGGACTTCAGCTATGTTAAAATCCAA
GATTCAGAAGGTGACAGTGACCTCAAGTCCTTAATCGGCTCTGACAAAACTCAAAACAAA
AGGCATCTACCTCCAATCTGGTCTGAGATTATGCGGTTTTTCACAAATCCACACAAGCCC
ATGATACTTGCACTGTCCCGGCCAGATCCTAAGAAAAATGTCACCACTCTGCTCAAGGCT
TTTGGAGAGTGTCGACAGCTCCGAGAGCTAGCCAACTTGACTTTGATTCTAGGTAACAGA
GATGACATAGAAGAAATGTCAAACAGCAGCTCAGTTGTTCTTACAACAGCGCTCAAGTTC
ATAGACAAGTATGACTTGTATGGTCAAGTGGCCTATCCCAAGCATCACAAACAGTCTGAA
GTTCCTGAGATATATAGGTTGGCTGCTAAAACCAAGGGAGTTTTTATCAACCCTGCTCTT
GTGGAGCCATTTGGTCTCACACTTATAGAGGCAGCTGCTTATGGTTTACCTGTTGTTGCT
ACAAAAAACGGTGGGCCTGTGGATATTATCAAGGCACTCAACAATGGCCTCCTTGTTGAC
CCACATGACCAGAAAGGCATAGCAGATGCCCTTCTAAAGCTCCTTGCTGATAAGAACTTA
TGGTTAGAGTGCCGTAAAAATGGGCTAAAGAACATCCACCGGTTTTCATGGCCGGAACAC
TGTCGTAACTACTTGTCCCATGTTGAGCATTGCCGGAACCGGCACCCCAACACCCATCTT
GGGATCATACCTAGTATTGAAGAACCCATGAGCGACTCCCTAAGGGATTTAGAAGACCTT
TCTCTAAAGTTTTCTGTTGATGGAGACTTCAAGCTTAATGGAGAGCTTGATGCAGCAACT
AGACAGAAAGAACTCATTGAAGCTCTAACCCGCATGGCTTCCTCTAATGGAAATTCTAGT
GTTAGCTATCATTCAGGAAGAAGGCAAGGGCTATTTGTAATAGCAGCAGATTGTTATGAT
AGCAATGGAGATTGCACTGAGAGATTACCAGCAATTATAAAAAATGTGATGAAATCTACA
AGCTCTGGTTTAAACCTAATAGGATTTGTATTGTTGACTGGTTTGAGTTTACAGGAGATA
TTAGAGAAGTTAAGGTGTTGCCAAGTGAACTTAGAAGAAATTGATGCATTGGTTTGCAAT
AGTGGGAGTGAAATTTACTATCCATGGAGGGATTTGATAGCTGATTTGGAGTATGAAGCC
CACGTGGAGTATCGGTGGCCTGGTGAGAATGTTAGATCAGTAGTGACGAGGCTTGCTCAG
GGAGAAGGGGGGGCTGAGGATGACATTGTGGAGTATGCAGGTGTGTGTAGTACTAGGTGC
TACTCTTATGGAGTGAAACCAGGAGCTAAGACTCGGAGAATTGATGACTTGCACCAAAGG
ATGCGGATGAGAGGCTTCCGTTGCAACCTTGTCTATACGCATGCTACATCAAGGTTGAAT
GTGGTACCCTTATTTGCATCAAGGGCCCAAGCACTAAGGTATCTTTCAGTTAGATGGGGA
ATTGACCTTTCTAAAATGGTGGTGTTTGTTGGGGAAAAAGGGGATACAGATTATGAAGAC
CTGCTTGTTGGCCTGCACAAGACCATCATTCTCAGAGGTTTAGTGGAGTATGGCAGTGAG
AAGCTTCTTCGCAATGAAGAGAGTTTCAAAAGGGAGGACATGATCCCACAAGATAGTCCT
AACATTGCCTTTGTGGAGGAGGGTTATGAGGCTCTTAATATCTCAGCAGCTCTACTGACT
CTCGGGATCAAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_18s0089g00410.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:18:28209036:28216160:1 gene:VIT_18s0089g00410 transcript:VIT_18s0089g00410.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MAGNEWINGYLEAILDAGSSRNGLRVVEDGDEKSNSKNNGSRRRRFVFNPTKYFVEEVVN
SFDESDLHRTWIKVIATRNSRDRSNRLENMCWRIWHLARKKKQIAWDDAQRLTKRRLERE
QGRHDAADDLSELSEGEKEKGDPNQIEPVKEQMTRINSDMHIWSDDDKSRHLYIILISIH
GLVRGENMELGRDSDTGGQVKYVVELARALANTKGVYRVDLLTRQITSTEVDSSYGEPIE
MLSCPSDGGGSCGAYIIRIPCGPRDRYIPKESLWPYIPEFVDGALGHIVNMARALGEQVD
AGKPIWPYVIHGHYADAGEVAAHLSGALNVPMVLTGHSLGRNKFEQLLKQGRLSREDINS
TYKIMRRIEAEELGLDAAEMVVTSTRQEIEEQWGLYDGFDLKLERKLRVRRRRGVSCFGR
NMPRMVVIPPGMDFSYVKIQDSEGDSDLKSLIGSDKTQNKRHLPPIWSEIMRFFTNPHKP
MILALSRPDPKKNVTTLLKAFGECRQLRELANLTLILGNRDDIEEMSNSSSVVLTTALKF
IDKYDLYGQVAYPKHHKQSEVPEIYRLAAKTKGVFINPALVEPFGLTLIEAAAYGLPVVA
TKNGGPVDIIKALNNGLLVDPHDQKGIADALLKLLADKNLWLECRKNGLKNIHRFSWPEH
CRNYLSHVEHCRNRHPNTHLGIIPSIEEPMSDSLRDLEDLSLKFSVDGDFKLNGELDAAT
RQKELIEALTRMASSNGNSSVSYHSGRRQGLFVIAADCYDSNGDCTERLPAIIKNVMKST
SSGLNLIGFVLLTGLSLQEILEKLRCCQVNLEEIDALVCNSGSEIYYPWRDLIADLEYEA
HVEYRWPGENVRSVVTRLAQGEGGAEDDIVEYAGVCSTRCYSYGVKPGAKTRRIDDLHQR
MRMRGFRCNLVYTHATSRLNVVPLFASRAQALRYLSVRWGIDLSKMVVFVGEKGDTDYED
LLVGLHKTIILRGLVEYGSEKLLRNEESFKREDMIPQDSPNIAFVEEGYEALNISAALLT
LGIK

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_18s0089g00410.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:18:28209036:28216160:1 gene:VIT_18s0089g00410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ACTCTCAAAGCCACTCTTTCTCACCAAGAAGCAGAACTCTCAAAGCCACTGTTTCTCACC
AAGAAGCAGAGAAGGGGTGGGAAAATGGCTGGAAATGAATGGATTAACGGGTACTTGGAA
GCGATATTGGATGCCGGAAGTAGCAGAAATGGGCTGAGAGTTGTTGAAGATGGTGATGAG
AAGAGCAACAGCAAGAATAATGGTAGTAGGAGGAGAAGATTTGTGTTTAATCCCACCAAG
TACTTTGTAGAAGAAGTTGTTAATAGCTTTGATGAATCTGATCTCCATAGGACATGGATT
AAGGTGATAGCAACAAGGAACTCACGTGATAGGAGCAACAGGCTTGAGAATATGTGCTGG
CGCATTTGGCATCTTGCTCGCAAAAAGAAGCAGATTGCATGGGATGATGCACAGAGGCTT
ACAAAGCGGCGTCTTGAGCGGGAGCAAGGTCGCCATGATGCTGCTGATGACCTTTCAGAG
CTCTCTGAAGGGGAAAAGGAGAAAGGAGATCCCAACCAAATAGAACCTGTCAAGGAGCAA
ATGACCAGAATCAATTCTGATATGCATATATGGTCAGATGATGACAAGTCCAGACACTTA
TATATTATCTTAATCAGTATTCATGGGTTAGTACGTGGAGAAAACATGGAACTTGGAAGA
GATTCAGATACAGGTGGTCAAGTGAAATATGTTGTAGAACTAGCGAGGGCTCTGGCAAAT
ACGAAGGGAGTGTATCGGGTGGACCTCCTCACTAGACAAATTACCTCAACAGAGGTTGAC
TCAAGCTATGGTGAGCCCATTGAGATGTTGTCATGCCCTTCAGATGGTGGGGGCAGTTGT
GGAGCATATATTATCCGGATCCCGTGTGGTCCTCGTGATAGGTACATACCAAAAGAGTCA
CTATGGCCATACATACCTGAATTTGTGGATGGGGCTCTAGGCCACATTGTCAACATGGCA
AGAGCTTTGGGTGAACAAGTGGATGCAGGGAAGCCGATATGGCCTTATGTTATTCATGGT
CACTATGCTGATGCTGGGGAGGTAGCAGCACACTTGTCCGGGGCCTTGAATGTGCCAATG
GTGCTAACTGGACATTCACTGGGTAGGAACAAATTTGAGCAATTACTCAAACAAGGGAGG
CTATCCAGGGAGGACATAAATTCAACTTACAAGATAATGAGGAGAATTGAGGCTGAGGAG
CTGGGGTTGGATGCAGCTGAAATGGTGGTGACTAGCACAAGGCAAGAGATTGAAGAGCAA
TGGGGACTGTATGATGGGTTTGATCTCAAGTTGGAGAGGAAGCTTCGGGTTAGGAGACGT
CGAGGAGTGAGTTGCTTTGGAAGGAACATGCCTAGGATGGTGGTTATTCCACCGGGGATG
GACTTCAGCTATGTTAAAATCCAAGATTCAGAAGGTGACAGTGACCTCAAGTCCTTAATC
GGCTCTGACAAAACTCAAAACAAAAGGCATCTACCTCCAATCTGGTCTGAGATTATGCGG
TTTTTCACAAATCCACACAAGCCCATGATACTTGCACTGTCCCGGCCAGATCCTAAGAAA
AATGTCACCACTCTGCTCAAGGCTTTTGGAGAGTGTCGACAGCTCCGAGAGCTAGCCAAC
TTGACTTTGATTCTAGGTAACAGAGATGACATAGAAGAAATGTCAAACAGCAGCTCAGTT
GTTCTTACAACAGCGCTCAAGTTCATAGACAAGTATGACTTGTATGGTCAAGTGGCCTAT
CCCAAGCATCACAAACAGTCTGAAGTTCCTGAGATATATAGGTTGGCTGCTAAAACCAAG
GGAGTTTTTATCAACCCTGCTCTTGTGGAGCCATTTGGTCTCACACTTATAGAGGCAGCT
GCTTATGGTTTACCTGTTGTTGCTACAAAAAACGGTGGGCCTGTGGATATTATCAAGGCA
CTCAACAATGGCCTCCTTGTTGACCCACATGACCAGAAAGGCATAGCAGATGCCCTTCTA
AAGCTCCTTGCTGATAAGAACTTATGGTTAGAGTGCCGTAAAAATGGGCTAAAGAACATC
CACCGGTTTTCATGGCCGGAACACTGTCGTAACTACTTGTCCCATGTTGAGCATTGCCGG
AACCGGCACCCCAACACCCATCTTGGGATCATACCTAGTATTGAAGAACCCATGAGCGAC
TCCCTAAGGGATTTAGAAGACCTTTCTCTAAAGTTTTCTGTTGATGGAGACTTCAAGCTT
AATGGAGAGCTTGATGCAGCAACTAGACAGAAAGAACTCATTGAAGCTCTAACCCGCATG
GCTTCCTCTAATGGAAATTCTAGTGTTAGCTATCATTCAGGAAGAAGGCAAGGGCTATTT
GTAATAGCAGCAGATTGTTATGATAGCAATGGAGATTGCACTGAGAGATTACCAGCAATT
ATAAAAAATGTGATGAAATCTACAAGCTCTGGTTTAAACCTAATAGGATTTGTATTGTTG
ACTGGTTTGAGTTTACAGGAGATATTAGAGAAGTTAAGGTGTTGCCAAGTGAACTTAGAA
GAAATTGATGCATTGGTTTGCAATAGTGGGAGTGAAATTTACTATCCATGGAGGGATTTG
ATAGCTGATTTGGAGTATGAAGCCCACGTGGAGTATCGGTGGCCTGGTGAGAATGTTAGA
TCAGTAGTGACGAGGCTTGCTCAGGGAGAAGGGGGGGCTGAGGATGACATTGTGGAGTAT
GCAGGTGTGTGTAGTACTAGGTGCTACTCTTATGGAGTGAAACCAGGAGCTAAGACTCGG
AGAATTGATGACTTGCACCAAAGGATGCGGATGAGAGGCTTCCGTTGCAACCTTGTCTAT
ACGCATGCTACATCAAGGTTGAATGTGGTACCCTTATTTGCATCAAGGGCCCAAGCACTA
AGGTATCTTTCAGTTAGATGGGGAATTGACCTTTCTAAAATGGTGGTGTTTGTTGGGGAA
AAAGGGGATACAGATTATGAAGACCTGCTTGTTGGCCTGCACAAGACCATCATTCTCAGA
GGTTTAGTGGAGTATGGCAGTGAGAAGCTTCTTCGCAATGAAGAGAGTTTCAAAAGGGAG
GACATGATCCCACAAGATAGTCCTAACATTGCCTTTGTGGAGGAGGGTTATGAGGCTCTT
AATATCTCAGCAGCTCTACTGACTCTCGGGATCAAGTGATCTGTTTTCCCCTTTATACTA
TATTTTTTCCTTTTTCATGTTTTGATGCATGTAGATTTCATATATATTGTAAAAGCCTAA
ATCTGAATACCTGATATAAGAAGAATATATATATATATCTAAA