Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_18s0041g01110.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:18:25669617:25672223:1 gene:VIT_18s0041g01110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCACATGATCAAAACTTGTTTCAAACCGTGTTTGTTTTTGCTGAACAATCTGCTTTAC ATGTACTGTAAATGTGGTGAAACGGATGTTGCAAAGAAGTTGTTTGATAGAATGCCTAAA CGTAATGTTGTTTCTTGGAACTCCTTGATTTCTGGGTATACACAGATGGGTTTCTATCAT GAGGTTATGAACCTGTTTAAGGAAGCGAGAATGTCCGATTTAAGGCTTGATAAATTCACT TTCTCAAATGCTTTGAGCGTTTGTGGACGAACTCTGGATTTGAGATTGGGTAGGTTGATA CATGCCTTGATTACTGTCAGTGGGTTGGGTGGTCCAGTTCTTTTGACCAATTCACTTATT GATATGTATTGCAAGTGTGGCCGGATTGATTGGGCAAGGCTGGTGTTTGAGAGTGCAGAT GAATTAGATTCTGTCTCCTGGAACTCCTTGATTGCAGGTTATGTTCGAATTGGCTCAAAT GATGAAATGTTGAGACTTCTTGTGAAAATGCTTCGGCATGGACTGAATTTGAATAGTTAT GCATTAGGAAGTGCCCTGAAGGCATGTGGCTCAAACTTTAGTTCTTCAATAGAATGTGGG AAAATGCTTCACGGGTGTGCAGTCAAACTTGGGTTGGATTTGGATGTTGTTGTTGGAACT GCATTGCTTGATACATATGCAAAAATTGGAGATTTAGAAGATGCAACCAAAATTTTCAAG CTCATGCCTGATCCAAATGTTGTCATGTATAATGCCATGATTGCTGGATTCCTGCAAATG GAGACTATGGCTGATGAATTTGCAAATGAAGCCATGTATCTTTTCTTTGAGATGCAAAGT CGAGGAATGAAGCCCTCTGAGTTTACATTCTCGAGCATACTCAAAGCTTGTAGCACCATT GAAGCATTTGAGTGCGGAAAGCAAATTCATGCTCAAATCTTTAAATACAATCTTCAGTCT GATGAGTTCATTGGAAATGCACTTGTTGAGCTGTATTCATTGTCAGGTTCAATTGAGGAT GGCCTAAAATGTTTTCATTCAACTCCCAAGCTAGATGTTGTTTCATGGACATCCCTTATT GTGGGTCATGTTCAAAATGGACAATTTGAGGGTGGACTGACTCTGTTCCATGAATTGCTG TTCTCTGGAAGAAAACCGGATGAGTTCACAATATCAATCATGTTGAGTGCTTGTGCAAAT TTGGCAGCAGTAAAGTCTGGTGAGCAGATCCATGCCTATGCAATAAAAACTGGAATCGGA AACTTCACCATCATTCAAAATTCACAGATTTGCATGTATGCCAAATGTGGAGACATAGAT TCTGCTAATATGACCTTTAAAGAGACAAAGAATCCCGACATAGTGTCATGGTCTGTGATG ATTTCTAGCAATGCACAACATGGATGTGCAAAAGAAGCTGTGGACCTCTTTGAATTGATG AAGGGTTCTGGGATTGCACCTAACCACATTACTTTTCTTGGAGTTCTTGTTGCATGTAGT CATGGGGGACTTGTAGAAGAAGGATTACGATATTTTGAAATCATGAAGAAAGATCATGGC ATAACGCCAAATGTAAAGCATTCTGCCTGCATTGTGGACCTTCTGGGTCGAGCTGGAAGA CTAGCCGAGGCAGAAAGCTTCATTATGGACTCAGGCTTTGAGGGCGATCCAGTAATGTGG CGATCTTTATTGAGTGCTTGCAGGGTCCATAAGGCCACTGACACTGGGAAACGTGTTGCA GAGAGAGTAATTGAGCTTGAACCTGAAGCTGCTGCATCATATGTGCTTCTTTACAACATC TACAATGATGCTGGAATACAAATGCCAGCCACAGAAATCAGGAACTTGATGAAAGATCGA GGAGTTAAAAAAGAACCTGGTCTAAGTTGGATTGAGGTTGGAAACGTGGTTCATTCCTTT GTGGCGGGTGATAGGTCTCACCCTAATAGTCAAGTCATTTATGTGCAATTGGAGGAAATG TTGGAGGAGATAAAGAAATTAGATTATATTGATGAGAAGCTTGTTTCTGATGCCTCAGAA CCAAAGCACAAGGACAACTCAATGGTCAGCTACCATAGTGAAAAGTTAGCTGTGACTTTT GGGATAATTAGTTTACCAAGATCAGCTCCTGTGAGAGTAATGAAGAACTTGAGAAGCTGT TGGCATTGTCATGAAACAATGAAGCTCTTCTCAAGGTTGGAAAATAGGGAGATAATTCTT AGGGATCCAATTCGTTTCCATCGCTTCAGAGATGGTTCTTGTTCTTGTGGAGACTACTGG TAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_18s0041g01110.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:18:25669617:25672223:1 gene:VIT_18s0041g01110 transcript:VIT_18s0041g01110.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MHMIKTCFKPCLFLLNNLLYMYCKCGETDVAKKLFDRMPKRNVVSWNSLISGYTQMGFYH EVMNLFKEARMSDLRLDKFTFSNALSVCGRTLDLRLGRLIHALITVSGLGGPVLLTNSLI DMYCKCGRIDWARLVFESADELDSVSWNSLIAGYVRIGSNDEMLRLLVKMLRHGLNLNSY ALGSALKACGSNFSSSIECGKMLHGCAVKLGLDLDVVVGTALLDTYAKIGDLEDATKIFK LMPDPNVVMYNAMIAGFLQMETMADEFANEAMYLFFEMQSRGMKPSEFTFSSILKACSTI EAFECGKQIHAQIFKYNLQSDEFIGNALVELYSLSGSIEDGLKCFHSTPKLDVVSWTSLI VGHVQNGQFEGGLTLFHELLFSGRKPDEFTISIMLSACANLAAVKSGEQIHAYAIKTGIG NFTIIQNSQICMYAKCGDIDSANMTFKETKNPDIVSWSVMISSNAQHGCAKEAVDLFELM KGSGIAPNHITFLGVLVACSHGGLVEEGLRYFEIMKKDHGITPNVKHSACIVDLLGRAGR LAEAESFIMDSGFEGDPVMWRSLLSACRVHKATDTGKRVAERVIELEPEAAASYVLLYNI YNDAGIQMPATEIRNLMKDRGVKKEPGLSWIEVGNVVHSFVAGDRSHPNSQVIYVQLEEM LEEIKKLDYIDEKLVSDASEPKHKDNSMVSYHSEKLAVTFGIISLPRSAPVRVMKNLRSC WHCHETMKLFSRLENREIILRDPIRFHRFRDGSCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_18s0041g01110.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:18:25669617:25672223:1 gene:VIT_18s0041g01110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCACATGATCAAAACTTGTTTCAAACCGTGTTTGTTTTTGCTGAACAATCTGCTTTAC ATGTACTGTAAATGTGGTGAAACGGATGTTGCAAAGAAGTTGTTTGATAGAATGCCTAAA CGTAATGTTGTTTCTTGGAACTCCTTGATTTCTGGGTATACACAGATGGGTTTCTATCAT GAGGTTATGAACCTGTTTAAGGAAGCGAGAATGTCCGATTTAAGGCTTGATAAATTCACT TTCTCAAATGCTTTGAGCGTTTGTGGACGAACTCTGGATTTGAGATTGGGTAGGTTGATA CATGCCTTGATTACTGTCAGTGGGTTGGGTGGTCCAGTTCTTTTGACCAATTCACTTATT GATATGTATTGCAAGTGTGGCCGGATTGATTGGGCAAGGCTGGTGTTTGAGAGTGCAGAT GAATTAGATTCTGTCTCCTGGAACTCCTTGATTGCAGGTTATGTTCGAATTGGCTCAAAT GATGAAATGTTGAGACTTCTTGTGAAAATGCTTCGGCATGGACTGAATTTGAATAGTTAT GCATTAGGAAGTGCCCTGAAGGCATGTGGCTCAAACTTTAGTTCTTCAATAGAATGTGGG AAAATGCTTCACGGGTGTGCAGTCAAACTTGGGTTGGATTTGGATGTTGTTGTTGGAACT GCATTGCTTGATACATATGCAAAAATTGGAGATTTAGAAGATGCAACCAAAATTTTCAAG CTCATGCCTGATCCAAATGTTGTCATGTATAATGCCATGATTGCTGGATTCCTGCAAATG GAGACTATGGCTGATGAATTTGCAAATGAAGCCATGTATCTTTTCTTTGAGATGCAAAGT CGAGGAATGAAGCCCTCTGAGTTTACATTCTCGAGCATACTCAAAGCTTGTAGCACCATT GAAGCATTTGAGTGCGGAAAGCAAATTCATGCTCAAATCTTTAAATACAATCTTCAGTCT GATGAGTTCATTGGAAATGCACTTGTTGAGCTGTATTCATTGTCAGGTTCAATTGAGGAT GGCCTAAAATGTTTTCATTCAACTCCCAAGCTAGATGTTGTTTCATGGACATCCCTTATT GTGGGTCATGTTCAAAATGGACAATTTGAGGGTGGACTGACTCTGTTCCATGAATTGCTG TTCTCTGGAAGAAAACCGGATGAGTTCACAATATCAATCATGTTGAGTGCTTGTGCAAAT TTGGCAGCAGTAAAGTCTGGTGAGCAGATCCATGCCTATGCAATAAAAACTGGAATCGGA AACTTCACCATCATTCAAAATTCACAGATTTGCATGTATGCCAAATGTGGAGACATAGAT TCTGCTAATATGACCTTTAAAGAGACAAAGAATCCCGACATAGTGTCATGGTCTGTGATG ATTTCTAGCAATGCACAACATGGATGTGCAAAAGAAGCTGTGGACCTCTTTGAATTGATG AAGGGTTCTGGGATTGCACCTAACCACATTACTTTTCTTGGAGTTCTTGTTGCATGTAGT CATGGGGGACTTGTAGAAGAAGGATTACGATATTTTGAAATCATGAAGAAAGATCATGGC ATAACGCCAAATGTAAAGCATTCTGCCTGCATTGTGGACCTTCTGGGTCGAGCTGGAAGA CTAGCCGAGGCAGAAAGCTTCATTATGGACTCAGGCTTTGAGGGCGATCCAGTAATGTGG CGATCTTTATTGAGTGCTTGCAGGGTCCATAAGGCCACTGACACTGGGAAACGTGTTGCA GAGAGAGTAATTGAGCTTGAACCTGAAGCTGCTGCATCATATGTGCTTCTTTACAACATC TACAATGATGCTGGAATACAAATGCCAGCCACAGAAATCAGGAACTTGATGAAAGATCGA GGAGTTAAAAAAGAACCTGGTCTAAGTTGGATTGAGGTTGGAAACGTGGTTCATTCCTTT GTGGCGGGTGATAGGTCTCACCCTAATAGTCAAGTCATTTATGTGCAATTGGAGGAAATG TTGGAGGAGATAAAGAAATTAGATTATATTGATGAGAAGCTTGTTTCTGATGCCTCAGAA CCAAAGCACAAGGACAACTCAATGGTCAGCTACCATAGTGAAAAGTTAGCTGTGACTTTT GGGATAATTAGTTTACCAAGATCAGCTCCTGTGAGAGTAATGAAGAACTTGAGAAGCTGT TGGCATTGTCATGAAACAATGAAGCTCTTCTCAAGGTTGGAAAATAGGGAGATAATTCTT AGGGATCCAATTCGTTTCCATCGCTTCAGAGATGGTTCTTGTTCTTGTGGAGACTACTGG TAA