Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_18s0001g15530.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:18:13662369:13665624:-1 gene:VIT_18s0001g15530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCCATTGAGAGCTCGGCAACCGACCGACGTCACCGATTTAATCACTCAGGGACTCGA CTGAGTCATGAGTCAATGCGTCACGGTAGAGCTCCGTTCACAACACTACACAGATCCAAT TCCCTCTCCTTCCATCACCAATCCAACTTTTCAACAATTCAGCGCCAAGTGAATCAAACT TCAGAGCACAAAATATTTACTCATCTTTTGAAAATTTGCCTACAACAATGCCAGCGAATC AAAATCCGCCACCCGTTCGACGAAACGCCTCAAAGGCTAGCCCAAGCTTCAAGAACCAGC AAAACTATCCACGCCCAGACCCTGAAATTTGGGTTTGGATCAAAAGGGCGGCTGGGTAGT GCCATTGTTGATTTGTATGCTAAATGTGGCAATGTGGAATTTGCTGCGAAGGCATTTAAC CAGCTTGAGAAACGAGATATACTGGCATGGAACTCGGTTCTTTCCATGTATTCGAGGCAG GGATCGTTGGAGCAGGTTATTTGGTGTTTTGGGTCATTGCAGAATTGTGGCGTGTCGCCC AATCAGTTCACTTATGCTATTGTTTTGTCCTCTTGTGCAAGATTGGTGGATATTGATCTG GGCAAACAAGTCCATTGTGGTGTTATTAAGATGGGTTTTGAGTTTAATTCCTTTTGTGAA GGGTCTTTAATTGATATGTATTCAAAATGTGGTTCTCTGGTTGATGCTCGGAAAATATTT GATGCAGTGGTGGATCCTGATACAGTTTCCTGGACAGCAATGATTGCAGGGTATGTTCAA GTTGGTTTACCTGAGGAGGCACTTAAGGTGTTTGAGGATATGCAGAAACTAGGCCTTGTT CCAGACCAGGTTGCATTTGTGACTGTCATAACTGCATGTGTTGGTTTGGGAAGGCTTGAT GATGCATGTGATTTATTTGTCCAAATGCCCAACACAAATGTTGTAGCATGGAATGTGATG ATTTCTGGGCATGTGAAGAGAGGTTGTGATATAGAAGCTATTGATTTTTTCAAAAACATG TGGAAAACTGGTGTTAAGTCGACGCGATCCACATTAGGAAGTGTGTTGAGTGCCATTGCT AGTTTAGAAGCTCTCAACTATGGCCTGCTGGTTCATGCTCAGGCAATCAAACAGGGTTTA AATTCTAATGTTTATGTTGGAAGTTCTTTGATCAATATGTATGCCAAGTGTGAGAAAATG GAAGCTGCCAAGAAAGTTTTTGATGCTTTGGATGAGAGAAATCTTGTGCTATGGAATGCA ATGCTAGGAGGTTATGCACAGAATGGGTATGCCAGTAAAGTCATGAAGTTATTCTCTGAA ATGAGGGGTTGTGGTTTCTGGCCTGATGAATTTACCTACACTAGCATTCTGAGTGCATGT GCCTGCTTGGAATGTTTAGAAATGGGGCGCCAGTTGCATTCATTTATTATCAAACATAAT TTTGAATACAACTTATTTGTGGAAAACACATTAGTAGATATGTATGCTAAATGTGGGGCT CTAGAGGAAGCAAGACAACAATTTGAATTCATAAGGAATAGAGACAATGTTTCTTGGAAT GCAATTATTGTTGGGTATGTGCAGGAAGAAGACGAGGATGAGGCTTTCAACATGTTTCGA AGGATGATCTTGGATGGGATTGCACCTGATGAAGTGTCTTTGGCTAGTATACTTAGTGGA TGTGCAAATCTTCAAGCTCTTGAACAAGGAGAGCAGGTGCATTGCTTTTTGGTCAAATCT GGTTTACAAACTTGCCTTTATGCAGGAAGCTCCCTTATTGACATGTATGTCAAATGTGGT GCCATTGAAGCCGCTCGATATGTTTTCTCTTGCATGCCTAGCCGAAGTGTTGTCTCCATG AATGCTATTATTGCAGGGTATGCTCAAAATGATCTAGTTGAAGCAATAGATCTGTTCCAA GAGATGCAGAACGAGGGATTGAACCCATCTGAAATCACCTTTGCAAGCCTTTTGGATGCA TGTACTGGACCTTATAAATTGAATCTGGGAAGGCAAATCCACTGTCTAATACAAAAGAGG GGCCTTTTGTATGATGGTGATTTCTTAGGCGTCTCTCTCTTGGTCATGTATATGAACTCC CAAAGGAAAACAGATGCAGATATTCTTTTCTCAGAGTTTCAATATCCAAAGAGTACAATC TTATGGACAGCAATAATATCAGGACACACTCAAAATGGTTGCAGCGAGGAGGCTTTGCAG TTGTATCAAGAAATGCATAGAAACAATGCCAGACCGGACCAAGCCACATTTGCTAGTGTC CTTAGAGCATGTTCCATCTTAGCTTCTTTGGGAGATGGTAGAATGATCCATTCTCTCATT TTCCATGTTGGTTTGGACTCAGACGAGTTAACAGGCAGCGCCGTTGTAGACATGTATGCT AAATGTGGGGATATGAAAAGTTCTGTTCAAGTTTTTGAAGAAATGGGTAGTAAAAATGAT GTTATCTCTTGGAACTCGATGATAGTTGGATTTGCTAAAAATGGGTATGCAGAAAATGCA CTGAAAATCTTTGATGAGATGAAGCACACACGAATAAGGCCTGATGATGTTACATTCCTT GGTGTTCTCACTGCATGTAGTCATGCAGGCAGGGTATCTGAAGGCCGTGAAATCTTTGAC ATCATGGTCCATTCCTATAAGATTGTGCCAAGATTAGATCATTGCGCTTGTATGATTGAT CTTCTGGGCAGATGGGGCTTTCTCAAAGAAGCTGAGGAGTTCATTGACAAGCTAAATTTT GAGCCCAATGCTATGATTTGGGCAACACTACTTGGTGCTTGCAGAATACATGGAGATGAT ATAAGGGGGCGACGAGCAGCTGAGAAGCTGATTGAATTGGAACCTGAAAATTCTTCTCCT TATGTGCTACTTTCTAATATATATGCTGCATCAGGAAACTGGGATGAGGTTAACTCAGTG AGGAGGGCAATGAGAGAAAAAGGACTGAGAAAGTTGCCTGGATGTAGCTGGATAGTAGTA GGACAGAAGACAAACTTATTTGTAGCAGGGGATAAATTTCATCCCAGTGCTGGTGAAATC CATGCACTTTTGAAGGATTTGATAGCACTAATGAAAGAAGATGGTTATATTGCTGAAACT GATTCTCTGTTGGAAGATGAAGACTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_18s0001g15530.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:18:13662369:13665624:-1 gene:VIT_18s0001g15530 transcript:VIT_18s0001g15530.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAIESSATDRRHRFNHSGTRLSHESMRHGRAPFTTLHRSNSLSFHHQSNFSTIQRQVNQT SEHKIFTHLLKICLQQCQRIKIRHPFDETPQRLAQASRTSKTIHAQTLKFGFGSKGRLGS AIVDLYAKCGNVEFAAKAFNQLEKRDILAWNSVLSMYSRQGSLEQVIWCFGSLQNCGVSP NQFTYAIVLSSCARLVDIDLGKQVHCGVIKMGFEFNSFCEGSLIDMYSKCGSLVDARKIF DAVVDPDTVSWTAMIAGYVQVGLPEEALKVFEDMQKLGLVPDQVAFVTVITACVGLGRLD DACDLFVQMPNTNVVAWNVMISGHVKRGCDIEAIDFFKNMWKTGVKSTRSTLGSVLSAIA SLEALNYGLLVHAQAIKQGLNSNVYVGSSLINMYAKCEKMEAAKKVFDALDERNLVLWNA MLGGYAQNGYASKVMKLFSEMRGCGFWPDEFTYTSILSACACLECLEMGRQLHSFIIKHN FEYNLFVENTLVDMYAKCGALEEARQQFEFIRNRDNVSWNAIIVGYVQEEDEDEAFNMFR RMILDGIAPDEVSLASILSGCANLQALEQGEQVHCFLVKSGLQTCLYAGSSLIDMYVKCG AIEAARYVFSCMPSRSVVSMNAIIAGYAQNDLVEAIDLFQEMQNEGLNPSEITFASLLDA CTGPYKLNLGRQIHCLIQKRGLLYDGDFLGVSLLVMYMNSQRKTDADILFSEFQYPKSTI LWTAIISGHTQNGCSEEALQLYQEMHRNNARPDQATFASVLRACSILASLGDGRMIHSLI FHVGLDSDELTGSAVVDMYAKCGDMKSSVQVFEEMGSKNDVISWNSMIVGFAKNGYAENA LKIFDEMKHTRIRPDDVTFLGVLTACSHAGRVSEGREIFDIMVHSYKIVPRLDHCACMID LLGRWGFLKEAEEFIDKLNFEPNAMIWATLLGACRIHGDDIRGRRAAEKLIELEPENSSP YVLLSNIYAASGNWDEVNSVRRAMREKGLRKLPGCSWIVVGQKTNLFVAGDKFHPSAGEI HALLKDLIALMKEDGYIAETDSLLEDED

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_18s0001g15530.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:18:13662369:13665624:-1 gene:VIT_18s0001g15530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCCATTGAGAGCTCGGCAACCGACCGACGTCACCGATTTAATCACTCAGGGACTCGA CTGAGTCATGAGTCAATGCGTCACGGTAGAGCTCCGTTCACAACACTACACAGATCCAAT TCCCTCTCCTTCCATCACCAATCCAACTTTTCAACAATTCAGCGCCAAGTGAATCAAACT TCAGAGCACAAAATATTTACTCATCTTTTGAAAATTTGCCTACAACAATGCCAGCGAATC AAAATCCGCCACCCGTTCGACGAAACGCCTCAAAGGCTAGCCCAAGCTTCAAGAACCAGC AAAACTATCCACGCCCAGACCCTGAAATTTGGGTTTGGATCAAAAGGGCGGCTGGGTAGT GCCATTGTTGATTTGTATGCTAAATGTGGCAATGTGGAATTTGCTGCGAAGGCATTTAAC CAGCTTGAGAAACGAGATATACTGGCATGGAACTCGGTTCTTTCCATGTATTCGAGGCAG GGATCGTTGGAGCAGGTTATTTGGTGTTTTGGGTCATTGCAGAATTGTGGCGTGTCGCCC AATCAGTTCACTTATGCTATTGTTTTGTCCTCTTGTGCAAGATTGGTGGATATTGATCTG GGCAAACAAGTCCATTGTGGTGTTATTAAGATGGGTTTTGAGTTTAATTCCTTTTGTGAA GGGTCTTTAATTGATATGTATTCAAAATGTGGTTCTCTGGTTGATGCTCGGAAAATATTT GATGCAGTGGTGGATCCTGATACAGTTTCCTGGACAGCAATGATTGCAGGGTATGTTCAA GTTGGTTTACCTGAGGAGGCACTTAAGGTGTTTGAGGATATGCAGAAACTAGGCCTTGTT CCAGACCAGGTTGCATTTGTGACTGTCATAACTGCATGTGTTGGTTTGGGAAGGCTTGAT GATGCATGTGATTTATTTGTCCAAATGCCCAACACAAATGTTGTAGCATGGAATGTGATG ATTTCTGGGCATGTGAAGAGAGGTTGTGATATAGAAGCTATTGATTTTTTCAAAAACATG TGGAAAACTGGTGTTAAGTCGACGCGATCCACATTAGGAAGTGTGTTGAGTGCCATTGCT AGTTTAGAAGCTCTCAACTATGGCCTGCTGGTTCATGCTCAGGCAATCAAACAGGGTTTA AATTCTAATGTTTATGTTGGAAGTTCTTTGATCAATATGTATGCCAAGTGTGAGAAAATG GAAGCTGCCAAGAAAGTTTTTGATGCTTTGGATGAGAGAAATCTTGTGCTATGGAATGCA ATGCTAGGAGGTTATGCACAGAATGGGTATGCCAGTAAAGTCATGAAGTTATTCTCTGAA ATGAGGGGTTGTGGTTTCTGGCCTGATGAATTTACCTACACTAGCATTCTGAGTGCATGT GCCTGCTTGGAATGTTTAGAAATGGGGCGCCAGTTGCATTCATTTATTATCAAACATAAT TTTGAATACAACTTATTTGTGGAAAACACATTAGTAGATATGTATGCTAAATGTGGGGCT CTAGAGGAAGCAAGACAACAATTTGAATTCATAAGGAATAGAGACAATGTTTCTTGGAAT GCAATTATTGTTGGGTATGTGCAGGAAGAAGACGAGGATGAGGCTTTCAACATGTTTCGA AGGATGATCTTGGATGGGATTGCACCTGATGAAGTGTCTTTGGCTAGTATACTTAGTGGA TGTGCAAATCTTCAAGCTCTTGAACAAGGAGAGCAGGTGCATTGCTTTTTGGTCAAATCT GGTTTACAAACTTGCCTTTATGCAGGAAGCTCCCTTATTGACATGTATGTCAAATGTGGT GCCATTGAAGCCGCTCGATATGTTTTCTCTTGCATGCCTAGCCGAAGTGTTGTCTCCATG AATGCTATTATTGCAGGGTATGCTCAAAATGATCTAGTTGAAGCAATAGATCTGTTCCAA GAGATGCAGAACGAGGGATTGAACCCATCTGAAATCACCTTTGCAAGCCTTTTGGATGCA TGTACTGGACCTTATAAATTGAATCTGGGAAGGCAAATCCACTGTCTAATACAAAAGAGG GGCCTTTTGTATGATGGTGATTTCTTAGGCGTCTCTCTCTTGGTCATGTATATGAACTCC CAAAGGAAAACAGATGCAGATATTCTTTTCTCAGAGTTTCAATATCCAAAGAGTACAATC TTATGGACAGCAATAATATCAGGACACACTCAAAATGGTTGCAGCGAGGAGGCTTTGCAG TTGTATCAAGAAATGCATAGAAACAATGCCAGACCGGACCAAGCCACATTTGCTAGTGTC CTTAGAGCATGTTCCATCTTAGCTTCTTTGGGAGATGGTAGAATGATCCATTCTCTCATT TTCCATGTTGGTTTGGACTCAGACGAGTTAACAGGCAGCGCCGTTGTAGACATGTATGCT AAATGTGGGGATATGAAAAGTTCTGTTCAAGTTTTTGAAGAAATGGGTAGTAAAAATGAT GTTATCTCTTGGAACTCGATGATAGTTGGATTTGCTAAAAATGGGTATGCAGAAAATGCA CTGAAAATCTTTGATGAGATGAAGCACACACGAATAAGGCCTGATGATGTTACATTCCTT GGTGTTCTCACTGCATGTAGTCATGCAGGCAGGGTATCTGAAGGCCGTGAAATCTTTGAC ATCATGGTCCATTCCTATAAGATTGTGCCAAGATTAGATCATTGCGCTTGTATGATTGAT CTTCTGGGCAGATGGGGCTTTCTCAAAGAAGCTGAGGAGTTCATTGACAAGCTAAATTTT GAGCCCAATGCTATGATTTGGGCAACACTACTTGGTGCTTGCAGAATACATGGAGATGAT ATAAGGGGGCGACGAGCAGCTGAGAAGCTGATTGAATTGGAACCTGAAAATTCTTCTCCT TATGTGCTACTTTCTAATATATATGCTGCATCAGGAAACTGGGATGAGGTTAACTCAGTG AGGAGGGCAATGAGAGAAAAAGGACTGAGAAAGTTGCCTGGATGTAGCTGGATAGTAGTA GGACAGAAGACAAACTTATTTGTAGCAGGGGATAAATTTCATCCCAGTGCTGGTGAAATC CATGCACTTTTGAAGGATTTGATAGCACTAATGAAAGAAGATGGTTATATTGCTGAAACT GATTCTCTGTTGGAAGATGAAGACTGAAGGAGGCATTCCTTTTATCATTTTTGTCTTTGT TTGAAGCAGAGATGAAATCATTATCCAGTTAATGTGAAAGCAAGAGGTATATTATGGGTT CATTTTGCTAAGAAGC