Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_18s0001g15350.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:18:13493089:13494429:1 gene:VIT_18s0001g15350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATTGGAACTTCGTTGGTTTGTATGTATGCAAAATGTGGGAATGTTGTTGATTCTCGT AAAGTATTTGATTATATGCCTGAGAGGAATGCGGTGACATGGAATGCGATGATATGTGGA TACTTGGGGAATGGAGATAGCAAGTCCGCGGTTTTATTATTTGAAAAGATGTCTATACGA ACTGCAGTGACATGGATTGAAATGATTGATGGGTTTGCAAGGAGCGGGGATACTGAGACT GCTAGGCGTTTCTTTGATGATGTTCCATCTGAGTTGAGGAATGTAGTAACTTGGACTGTG ATGGTTGATGGGTATGCTAGAAATGCGGAGATGGAGGCTGCAAGGGAAGTTTTTGAGGGG ATGCCTCAGAGGAATTTCTTTGCTTGGTCATCTATGATTTCTGGGTACTGCAAGAAGGGT AATGTTAAGGAGGCAAGGTCTATTTTTGATCGAATTCCAGTAAGGAATCTGGTGAATTGG AATTCCCTAATTTCTGGGTATGCACAAAATGGGTTTTCTGAGGAAGCTTTGGAAGCATTT GGAAAAATGCAAGCTGAAGGATTTGAGCCAGATGAGGTCACGATAGCCAGTGTTTTATCT GCTTGTTCTCAGTTGGGCCTGTTGGATGCTGGTAAGAAAATCCATCACATGATGAATCAT AAGGGCATAAAGCTAAATCAGTTTGTTCTGAATGGACTGGTTGACATGTATGCAAAATGT GGAGATTTAGCTAATGCAAGACTGATCTTTGAAGGGATGGCTCATAGGAACAGGGCCTGT TGGAATTCCATGATCTCAGGTTTTGCCATTCATGGACAAAGTAAGGAGGCTCTTGAGTTT TTCGGCAGAATGGAGGACTCCCATGAGGGGCCAGATGAGATAACTTTCCTCTCAGTGCTC TCAGCATGTGCACACGGGGGGTTTGTGAATGCAGGTTTAGAAATTTTCTCTAGGATGGAA AAATATGGCTTGACAACGGGCATCAAACATTATGGTTGTTTGATTGACCTTTTGGGGCGC GCAGGGAGAATAAAAGAGGCTTATGATTTGATCAAAAGAATGCCAGTGAAACCAAATGAT GTAGTTTGGGGTGCCCTTCTTGGAGCTTGCCGGGTTCATTTGGACATGGAGATGGCAGAC CGGGTGGTGGAAGAGATTGTTAAAGTGGATTCTAACATTAGCTCTGGATGTGATTCACAT TATGTGCTGCTGTCAAATATTTATGCTGCTTCTGATAGATGGGAGAAGGCTGAAAAGATG AGGATGGAAATGGCGAATAAAGGGTTTCAAAAGACATCAGGGTGCAGTTCAATTATGCCA GGCAACAACACCCATGAGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_18s0001g15350.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:18:13493089:13494429:1 gene:VIT_18s0001g15350 transcript:VIT_18s0001g15350.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MIGTSLVCMYAKCGNVVDSRKVFDYMPERNAVTWNAMICGYLGNGDSKSAVLLFEKMSIR TAVTWIEMIDGFARSGDTETARRFFDDVPSELRNVVTWTVMVDGYARNAEMEAAREVFEG MPQRNFFAWSSMISGYCKKGNVKEARSIFDRIPVRNLVNWNSLISGYAQNGFSEEALEAF GKMQAEGFEPDEVTIASVLSACSQLGLLDAGKKIHHMMNHKGIKLNQFVLNGLVDMYAKC GDLANARLIFEGMAHRNRACWNSMISGFAIHGQSKEALEFFGRMEDSHEGPDEITFLSVL SACAHGGFVNAGLEIFSRMEKYGLTTGIKHYGCLIDLLGRAGRIKEAYDLIKRMPVKPND VVWGALLGACRVHLDMEMADRVVEEIVKVDSNISSGCDSHYVLLSNIYAASDRWEKAEKM RMEMANKGFQKTSGCSSIMPGNNTHE

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_18s0001g15350.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:18:13493089:13494429:1 gene:VIT_18s0001g15350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATTGGAACTTCGTTGGTTTGTATGTATGCAAAATGTGGGAATGTTGTTGATTCTCGT AAAGTATTTGATTATATGCCTGAGAGGAATGCGGTGACATGGAATGCGATGATATGTGGA TACTTGGGGAATGGAGATAGCAAGTCCGCGGTTTTATTATTTGAAAAGATGTCTATACGA ACTGCAGTGACATGGATTGAAATGATTGATGGGTTTGCAAGGAGCGGGGATACTGAGACT GCTAGGCGTTTCTTTGATGATGTTCCATCTGAGTTGAGGAATGTAGTAACTTGGACTGTG ATGGTTGATGGGTATGCTAGAAATGCGGAGATGGAGGCTGCAAGGGAAGTTTTTGAGGGG ATGCCTCAGAGGAATTTCTTTGCTTGGTCATCTATGATTTCTGGGTACTGCAAGAAGGGT AATGTTAAGGAGGCAAGGTCTATTTTTGATCGAATTCCAGTAAGGAATCTGGTGAATTGG AATTCCCTAATTTCTGGGTATGCACAAAATGGGTTTTCTGAGGAAGCTTTGGAAGCATTT GGAAAAATGCAAGCTGAAGGATTTGAGCCAGATGAGGTCACGATAGCCAGTGTTTTATCT GCTTGTTCTCAGTTGGGCCTGTTGGATGCTGGTAAGAAAATCCATCACATGATGAATCAT AAGGGCATAAAGCTAAATCAGTTTGTTCTGAATGGACTGGTTGACATGTATGCAAAATGT GGAGATTTAGCTAATGCAAGACTGATCTTTGAAGGGATGGCTCATAGGAACAGGGCCTGT TGGAATTCCATGATCTCAGGTTTTGCCATTCATGGACAAAGTAAGGAGGCTCTTGAGTTT TTCGGCAGAATGGAGGACTCCCATGAGGGGCCAGATGAGATAACTTTCCTCTCAGTGCTC TCAGCATGTGCACACGGGGGGTTTGTGAATGCAGGTTTAGAAATTTTCTCTAGGATGGAA AAATATGGCTTGACAACGGGCATCAAACATTATGGTTGTTTGATTGACCTTTTGGGGCGC GCAGGGAGAATAAAAGAGGCTTATGATTTGATCAAAAGAATGCCAGTGAAACCAAATGAT GTAGTTTGGGGTGCCCTTCTTGGAGCTTGCCGGGTTCATTTGGACATGGAGATGGCAGAC CGGGTGGTGGAAGAGATTGTTAAAGTGGATTCTAACATTAGCTCTGGATGTGATTCACAT TATGTGCTGCTGTCAAATATTTATGCTGCTTCTGATAGATGGGAGAAGGCTGAAAAGATG AGGATGGAAATGGCGAATAAAGGGTTTCAAAAGACATCAGGGTGCAGTTCAATTATGCCA GGCAACAACACCCATGAGTAA