Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_18s0001g15340.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:18:13488810:13490580:-1 gene:VIT_18s0001g15340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGAAGGCGTTGATGGTTGAGGCCAATAGTTTTACCTTTACCTTCCTTCTTAAATGTTTT
GAAACCTCACAAGCCTTGGAAGATGGTAGAGTGATACATGGTGAAATTTTGAAGTTGGGT
TTTGGTTCTAGTGTGTTTGTTCAGAATTCCCTTTTGGGTTTCTATGCAAACTGCAGTGAG
AATTTAGGTTCTGCTTACCGGGTATTTGAGGAAATGCCTGAACGAGATGTTATTTCATGG
AATTCTATGATTAGTGCTTATATGACTCGTGGGGAGATACAATCTGCAATAGGGTTGTTG
GATAAGATGCCAGAGCGGAACATTGTGACGTGGAATTCTGTTGTTTGTGGGCTGTCTAAG
GCTGGGAACATGGAGTTAGCTCATTCTGTCTTTGAGCAGATGCCACTGAGAAATGAGGTT
TCTTGGAATTCAATGATTTCTGGATATGTAAGGATTGGTGATGTGAGGGCTGCACAGTCT
ATTTTTTATCAGATGCCTGAGAAAACTGTGGTTTCCTGGACGGCCATGATTTCAGGATAT
GCAACAAATGGAGATCTTAAATCTGCAGAAAACATTTTCAATCATATGCCAGTTAAAAAT
GTGGTCTCATGGAATGCTATGATTTCAGGTTATGTTCACAACCATGAGTTTGATCAAGCT
CTGTGTGTATTTCATCATATGTTAATCAATGGTGAGTGCAGGCCTGACCAGACTACTTTG
ATCAGTATACTGTCTGCCTGTGCTCATTTGGGGTCTCTTGAACATGGGAAGTGGATCAAT
TCATATATTAAGAAAAACAAGCTTCACTTGTCAATTCCATTAGGCAATGCTTTGATAGAC
ATGTTTGCAAAATGTGGAGATGTAGAAAATGCAAAAGAAGTGTTTCATCATATGTCTAAA
AGATGTATAATCACATGGACAACAATGGTTTCAGGGCTTGCGGTTAATGGGAAATGTAGA
GAAGCCATAAATCTCTTTGATAAGATGTGTCTAGAAGGAACAAAACCAGATGATGTTATC
TTCATTGCTGTTCTGTCAGCTTGCACTCATGGAGGTCTGGTGGAAGAAGGTAAAAGGGTA
TTTGATCAAATGGTGCAAGAATTTGGTATTAAACCCCGAATTGAGCATTATGGTTGCATG
GTTGATCTTCTTGGTCGAGCAGGGAAGTTAGAAGAAGCAGTCAGATTCACAGCAAGAATG
CATTTGAAGCCAAATGCTGTCATTTGGGCCACTTTGTTATTTTGTTGTAAGATTCATGGA
AATGGAGATTTGTTAAAATCCGTGACTGAGAAAATTATGGATCAGGAGCCTTCAAATCCC
AGCTATTTAACTTTGGTTTCAAATTTGAGTGCTTCATTTGGACGGTGGGAAGATGTCTTG
AGCTTTCGGGTAGCAATGAGACAGCAAAGAATGGAAAAAGTACCTGGTTGTAGCTCAATC
CAAGTAGGGAACAGGGTCCATGAATTTCTAGCTAAGGATACACGGCATGTGCAAAGGAAG
GAAATTTATAGAGCTTTGGTTTGTTTAAATGGACAGTTGAAAGTTGAATGTGATTGTGCT
ATAAGAATATCACAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_18s0001g15340.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:18:13488810:13490580:-1 gene:VIT_18s0001g15340 transcript:VIT_18s0001g15340.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MKALMVEANSFTFTFLLKCFETSQALEDGRVIHGEILKLGFGSSVFVQNSLLGFYANCSE
NLGSAYRVFEEMPERDVISWNSMISAYMTRGEIQSAIGLLDKMPERNIVTWNSVVCGLSK
AGNMELAHSVFEQMPLRNEVSWNSMISGYVRIGDVRAAQSIFYQMPEKTVVSWTAMISGY
ATNGDLKSAENIFNHMPVKNVVSWNAMISGYVHNHEFDQALCVFHHMLINGECRPDQTTL
ISILSACAHLGSLEHGKWINSYIKKNKLHLSIPLGNALIDMFAKCGDVENAKEVFHHMSK
RCIITWTTMVSGLAVNGKCREAINLFDKMCLEGTKPDDVIFIAVLSACTHGGLVEEGKRV
FDQMVQEFGIKPRIEHYGCMVDLLGRAGKLEEAVRFTARMHLKPNAVIWATLLFCCKIHG
NGDLLKSVTEKIMDQEPSNPSYLTLVSNLSASFGRWEDVLSFRVAMRQQRMEKVPGCSSI
QVGNRVHEFLAKDTRHVQRKEIYRALVCLNGQLKVECDCAIRISQ

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_18s0001g15340.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:18:13488810:13490580:-1 gene:VIT_18s0001g15340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGAAGGCGTTGATGGTTGAGGCCAATAGTTTTACCTTTACCTTCCTTCTTAAATGTTTT
GAAACCTCACAAGCCTTGGAAGATGGTAGAGTGATACATGGTGAAATTTTGAAGTTGGGT
TTTGGTTCTAGTGTGTTTGTTCAGAATTCCCTTTTGGGTTTCTATGCAAACTGCAGTGAG
AATTTAGGTTCTGCTTACCGGGTATTTGAGGAAATGCCTGAACGAGATGTTATTTCATGG
AATTCTATGATTAGTGCTTATATGACTCGTGGGGAGATACAATCTGCAATAGGGTTGTTG
GATAAGATGCCAGAGCGGAACATTGTGACGTGGAATTCTGTTGTTTGTGGGCTGTCTAAG
GCTGGGAACATGGAGTTAGCTCATTCTGTCTTTGAGCAGATGCCACTGAGAAATGAGGTT
TCTTGGAATTCAATGATTTCTGGATATGTAAGGATTGGTGATGTGAGGGCTGCACAGTCT
ATTTTTTATCAGATGCCTGAGAAAACTGTGGTTTCCTGGACGGCCATGATTTCAGGATAT
GCAACAAATGGAGATCTTAAATCTGCAGAAAACATTTTCAATCATATGCCAGTTAAAAAT
GTGGTCTCATGGAATGCTATGATTTCAGGTTATGTTCACAACCATGAGTTTGATCAAGCT
CTGTGTGTATTTCATCATATGTTAATCAATGGTGAGTGCAGGCCTGACCAGACTACTTTG
ATCAGTATACTGTCTGCCTGTGCTCATTTGGGGTCTCTTGAACATGGGAAGTGGATCAAT
TCATATATTAAGAAAAACAAGCTTCACTTGTCAATTCCATTAGGCAATGCTTTGATAGAC
ATGTTTGCAAAATGTGGAGATGTAGAAAATGCAAAAGAAGTGTTTCATCATATGTCTAAA
AGATGTATAATCACATGGACAACAATGGTTTCAGGGCTTGCGGTTAATGGGAAATGTAGA
GAAGCCATAAATCTCTTTGATAAGATGTGTCTAGAAGGAACAAAACCAGATGATGTTATC
TTCATTGCTGTTCTGTCAGCTTGCACTCATGGAGGTCTGGTGGAAGAAGGTAAAAGGGTA
TTTGATCAAATGGTGCAAGAATTTGGTATTAAACCCCGAATTGAGCATTATGGTTGCATG
GTTGATCTTCTTGGTCGAGCAGGGAAGTTAGAAGAAGCAGTCAGATTCACAGCAAGAATG
CATTTGAAGCCAAATGCTGTCATTTGGGCCACTTTGTTATTTTGTTGTAAGATTCATGGA
AATGGAGATTTGTTAAAATCCGTGACTGAGAAAATTATGGATCAGGAGCCTTCAAATCCC
AGCTATTTAACTTTGGTTTCAAATTTGAGTGCTTCATTTGGACGGTGGGAAGATGTCTTG
AGCTTTCGGGTAGCAATGAGACAGCAAAGAATGGAAAAAGTACCTGGTTGTAGCTCAATC
CAAGTAGGGAACAGGGTCCATGAATTTCTAGCTAAGGATACACGGCATGTGCAAAGGAAG
GAAATTTATAGAGCTTTGGTTTGTTTAAATGGACAGTTGAAAGTTGAATGTGATTGTGCT
ATAAGAATATCACAATGACTATTGCAGTAAGGATGTTTACCCCATGGTGGATGATTTAAA
GAGTGGCAAATAAGAAGGATGAATAATGAAATTATATATCACCTTTTGAGCAAATTGCCA
TGTGAAAGCAGGCACTTTTTGGCTGCTTTCAAGAATGGGAAAACTTATATTGCAGTATAG
TAAAATGAGAAGGTATTTCACGAGATGGGTG