Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_18s0001g14960.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:18:12980373:12984313:1 gene:VIT_18s0001g14960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAGTTCAGACACAAAATTTTGGATTTTGATCCATATACCAAAGTGGGTTTGGTGAAT ATTGAAAGACAAGTAACACTCCAAAATCACCCTTTTGTGTGCAATGAGATGGTGGATCTT GATCTGCATTCCTTGGCCCGCCAACTGGGATCGTGCAACAACTACGGCTCCATCTACCGA GGAAGACTGCTTCACATCCTTTTCCTCAAATCTGGCGTTCTCCATTCTGTTCTTTCAATT GGAAACCGTCTTCTACAGATGTATTCTAGGTGCAACAGCATGAGGGAGGCGCAGCAACTG TTTGAAGAAATGCCGAAAAGAAATTGTTTCTCTTGGAACACTATGATTGAAGGGTATTTG AAATCAGGGAGCAAAGGGAAGTCACTAGAGTTGTTTGATTCAATGCCCCACAAGGATGCT TTTTCATGGAACGTGGTCATTTCGGGTTTTGCAAAAGAGGGTAATTTGGAGGTTGCCCGG CGTTTGTTCAATGAGATGCCTTGGAAGAATGGGATTGCTTGGAATTCGATGATTCATGGT TATGCCTGCAACGGTCGCCCAAAAGAAGCTGTTGGGTTGTTTAAGGATTTGAGTTTGAAT CCGCTGGAACGGTTTTGTGGGGATACGTTTGTTCTGGCTACAGTTGTTGGTGCTTGTACC AATTTGGGGGCTCTTGATTGTGGGAAGCAAATACATGCTCGCATTGTTGTTGATGAAGTG GAATTTGACTCAGTCTTGGGGAGTTCCCTTGTTAACTTGTATGGGAAATGTGGGGATATC GACAGTGCAAATCATGTTTTGAATTTGATGAAGGAGCCAGATGCATTCTCTTTATCTGCA TTGATATCAGGATATGCAAGTTGTGGTAGAATGAATGATGCAAGAAGAATTTTTTGTTTG AAAAGTAACGCATGTGTGGTGTTGTGGAACTCCATGATTTCTGGATATGTAGCCAATAAT GAAGCATTAGAAGCACTAGAGCTCTTTAATAATATGCGAAGAAAAGGAGTTCAGGAAGAC TACTCTACTTTTGCCAGTGTTTTGAGTGCATGCAGTACCTTAGGTATTATTGATCAGGGT ATACAAGTGCATGCTCATGTTTATAAAGTTGGGTTCACTAATGATATTATCATCGATAGT GCTCTTGTTGACATGTATTCTAAGTGCAGAAGGCCTGATGATGCTTGCAAATTATTTAGT GATCTTCAAGCCTATGACACCATCTTGCTCAATTCTATGATAACCGTGTATTCCAATTGT GGAAGAATTGATGATGCAAGGCAGATCTTTGATACCATGCCAAGTAAAAGCTTGATCTCA TGGAATTCAATGATAGTGGGTTTCAGTCAAAATGCTTGTCCAATTGAAGCATTAGACCTT TTCTGTGAGATGAATAAACTGGGCCTGAGGATGGACAAGTTTAGCCTGGCTGGTGTGATC AGTGCCTGTGCTAGCATCTCTTCACTTGAGCTTGGTGAACAGATTTTTGCTAGGGCTACT ATCATCGGACTTGAATTTGATCAGATCATTTCCACCTCCCTTGTGGATTTCTATTGTAAG TGTGGCTTAGTTGAACATGGGCGAAAACTGTTTGACAGAATGATGAAATCTGATGAAGTC CCATGGAACTCTATGTTGATGGGTTATGCTACAAATGGCCATGGAATTGAAGCCTTGAAT GTATTTGATCAAATGAGAAGTGTGGGTGTACAACCCACTGATATTACATTTGTTGGGGTT CTGTCTGCCTGTGATCATTGTGGGCTGGTTGAAGAGGGTCGAAAATGGTTTTATGCAATG AAACTTGACTATCATATTAACCCAGGGATTGAGCACTACTCTTGCATGGTTGATCTATAT GCTCGTGCAGGTTTGCTTGAGGATGCAATGAATCTTATTGAACAAATGCCATTAAAGGCA GACACAAGCATGTGGTCATCAGTATTGAGGGGCTGTGTAGCTCATGGGAATAACATTCTT GGTAAGAAAGTTGCAAAACGAATTATTGACCTTGACCCTGAGAATTCAGGTGCTTATGTG CAGCTGTCTGGCATATATGCCACTTTTGAGGACTGGGGAAGATCAGCACAGGTTAGAAAG TTGATGTATGATAAGAAAATACCAAAGGTACCTGGTTGCAGTTGGGCAGATAGTTTAACT TCGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_18s0001g14960.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:18:12980373:12984313:1 gene:VIT_18s0001g14960 transcript:VIT_18s0001g14960.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MEFRHKILDFDPYTKVGLVNIERQVTLQNHPFVCNEMVDLDLHSLARQLGSCNNYGSIYR GRLLHILFLKSGVLHSVLSIGNRLLQMYSRCNSMREAQQLFEEMPKRNCFSWNTMIEGYL KSGSKGKSLELFDSMPHKDAFSWNVVISGFAKEGNLEVARRLFNEMPWKNGIAWNSMIHG YACNGRPKEAVGLFKDLSLNPLERFCGDTFVLATVVGACTNLGALDCGKQIHARIVVDEV EFDSVLGSSLVNLYGKCGDIDSANHVLNLMKEPDAFSLSALISGYASCGRMNDARRIFCL KSNACVVLWNSMISGYVANNEALEALELFNNMRRKGVQEDYSTFASVLSACSTLGIIDQG IQVHAHVYKVGFTNDIIIDSALVDMYSKCRRPDDACKLFSDLQAYDTILLNSMITVYSNC GRIDDARQIFDTMPSKSLISWNSMIVGFSQNACPIEALDLFCEMNKLGLRMDKFSLAGVI SACASISSLELGEQIFARATIIGLEFDQIISTSLVDFYCKCGLVEHGRKLFDRMMKSDEV PWNSMLMGYATNGHGIEALNVFDQMRSVGVQPTDITFVGVLSACDHCGLVEEGRKWFYAM KLDYHINPGIEHYSCMVDLYARAGLLEDAMNLIEQMPLKADTSMWSSVLRGCVAHGNNIL GKKVAKRIIDLDPENSGAYVQLSGIYATFEDWGRSAQVRKLMYDKKIPKVPGCSWADSLT S

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_18s0001g14960.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:18:12980373:12984313:1 gene:VIT_18s0001g14960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAGTTCAGACACAAAATTTTGGATTTTGATCCATATACCAAAGTGGGTTTGGTGAAT ATTGAAAGACAAGTAACACTCCAAAATCACCCTTTTGTGTGCAATGAGATGGTGGATCTT GATCTGCATTCCTTGGCCCGCCAACTGGGATCGTGCAACAACTACGGCTCCATCTACCGA GGAAGACTGCTTCACATCCTTTTCCTCAAATCTGGCGTTCTCCATTCTGTTCTTTCAATT GGAAACCGTCTTCTACAGATGTATTCTAGGTGCAACAGCATGAGGGAGGCGCAGCAACTG TTTGAAGAAATGCCGAAAAGAAATTGTTTCTCTTGGAACACTATGATTGAAGGGTATTTG AAATCAGGGAGCAAAGGGAAGTCACTAGAGTTGTTTGATTCAATGCCCCACAAGGATGCT TTTTCATGGAACGTGGTCATTTCGGGTTTTGCAAAAGAGGGTAATTTGGAGGTTGCCCGG CGTTTGTTCAATGAGATGCCTTGGAAGAATGGGATTGCTTGGAATTCGATGATTCATGGT TATGCCTGCAACGGTCGCCCAAAAGAAGCTGTTGGGTTGTTTAAGGATTTGAGTTTGAAT CCGCTGGAACGGTTTTGTGGGGATACGTTTGTTCTGGCTACAGTTGTTGGTGCTTGTACC AATTTGGGGGCTCTTGATTGTGGGAAGCAAATACATGCTCGCATTGTTGTTGATGAAGTG GAATTTGACTCAGTCTTGGGGAGTTCCCTTGTTAACTTGTATGGGAAATGTGGGGATATC GACAGTGCAAATCATGTTTTGAATTTGATGAAGGAGCCAGATGCATTCTCTTTATCTGCA TTGATATCAGGATATGCAAGTTGTGGTAGAATGAATGATGCAAGAAGAATTTTTTGTTTG AAAAGTAACGCATGTGTGGTGTTGTGGAACTCCATGATTTCTGGATATGTAGCCAATAAT GAAGCATTAGAAGCACTAGAGCTCTTTAATAATATGCGAAGAAAAGGAGTTCAGGAAGAC TACTCTACTTTTGCCAGTGTTTTGAGTGCATGCAGTACCTTAGGTATTATTGATCAGGGT ATACAAGTGCATGCTCATGTTTATAAAGTTGGGTTCACTAATGATATTATCATCGATAGT GCTCTTGTTGACATGTATTCTAAGTGCAGAAGGCCTGATGATGCTTGCAAATTATTTAGT GATCTTCAAGCCTATGACACCATCTTGCTCAATTCTATGATAACCGTGTATTCCAATTGT GGAAGAATTGATGATGCAAGGCAGATCTTTGATACCATGCCAAGTAAAAGCTTGATCTCA TGGAATTCAATGATAGTGGGTTTCAGTCAAAATGCTTGTCCAATTGAAGCATTAGACCTT TTCTGTGAGATGAATAAACTGGGCCTGAGGATGGACAAGTTTAGCCTGGCTGGTGTGATC AGTGCCTGTGCTAGCATCTCTTCACTTGAGCTTGGTGAACAGATTTTTGCTAGGGCTACT ATCATCGGACTTGAATTTGATCAGATCATTTCCACCTCCCTTGTGGATTTCTATTGTAAG TGTGGCTTAGTTGAACATGGGCGAAAACTGTTTGACAGAATGATGAAATCTGATGAAGTC CCATGGAACTCTATGTTGATGGGTTATGCTACAAATGGCCATGGAATTGAAGCCTTGAAT GTATTTGATCAAATGAGAAGTGTGGGTGTACAACCCACTGATATTACATTTGTTGGGGTT CTGTCTGCCTGTGATCATTGTGGGCTGGTTGAAGAGGGTCGAAAATGGTTTTATGCAATG AAACTTGACTATCATATTAACCCAGGGATTGAGCACTACTCTTGCATGGTTGATCTATAT GCTCGTGCAGGTTTGCTTGAGGATGCAATGAATCTTATTGAACAAATGCCATTAAAGGCA GACACAAGCATGTGGTCATCAGTATTGAGGGGCTGTGTAGCTCATGGGAATAACATTCTT GGTAAGAAAGTTGCAAAACGAATTATTGACCTTGACCCTGAGAATTCAGGTGCTTATGTG CAGCTGTCTGGCATATATGCCACTTTTGAGGACTGGGGAAGATCAGCACAGGTTAGAAAG TTGATGTATGATAAGAAAATACCAAAGGTACCTGGTTGCAGTTGGGCAGATAGTTTAACT TCGTGATGACTGACTTGTCTTCTTGAAGGGAGATACTTTATTCCCGAAAGGAGGAAACAG TATATTTTTGCAGGGTGG