Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_18s0001g14940.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:18:12969264:12971832:-1 gene:VIT_18s0001g14940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGGTGTGAATGCAGCTTCTGTACTCAATCGACTTCTTCAGCGCAACACCCACAAGCCT
AAAGCTCTACCCACCGACTCCAAAGCCTTAACCACAACAACTGTCCTTACTCACCTCAAC
GCCGGTCGCCTCCGAAAAGCCGTATCCATCCTCTTTGCTTCCCCAGTTCCCTTCCCCTTT
TCACTCTATGCTCGCCTTTTCCAGATTTGTTCTTCCAATCTTGCAATCGTTGAGGCCCGT
AAAGTGGAATCCCACTTGATTACCTTCTCGCCTGCACCGCCGATCTTTCTTTTGAACCGT
GCGATTGAAACCTATGGAAAATGCAGTTGTTTGGATGATGCTAGGGAGCTGTTTGAGGAA
ATGCCCCAAAGGGATGGTGGTTCGTGGAATGCGATGATCACGGCCTATGCGCAAGGTGGG
TGTGCGGAGAAGGCGTTGTGGTTGTTCTCGAGGATGAATAGATTGGGGATTTGGGCTAAT
GAGATCACGTTTGCTAGTGTTCTTGGATCTTGTGCTACAGTATTGGCACTGTTTCTTTCG
AAGCAGATTCATGGGCTTATCGTGAAATATGGTTTTTGCTGGAACGTAATTTTGGGGAGT
TCTCTGGTTGATATATATGGGAAATGTCGGGTTATGAGTGATGCACGTAGAATGTTTGAT
GAAATTGAGAATCCAAATGCCATTTCCTGGAATGTGATTGTCAGGCGGTATCTTGAGATG
GGTAATGAAAAGGAAGCAGTTGTTATGTTTTTTAAGATGATCCGAGCAAACATTAGGCCA
TTGAATTTTACATTCTCCAATGCTCTTATTGCTTGTTCTAGTATATCTGCACTCCAGGAG
GGGATTCAGATTCATGGAGTTGCAATTAGGATTGGTTATGACGAGGATGAGGTGGTTTCT
AGCTCTCTTATTGATATGTATGCAAAATGTGGGGATTTGGAGAGCGCTTGTAGGATTTTT
GAACTGCCCAGTTCAAAAAATTTGATCTCCTGGACTTCAATTGTGTCGGGGTATGCAATG
AGTGGGCAAACAAGAGAGGCAAGAGTGCTCTTCGATGAGATGCCAGAAAGGAGTGTAATC
TCATGGAATGCAATGTTAGCAGGGTATACACATTTCTGCCAATGGGAAGAGGCTTTGGAA
TTTGTTTTTCTGATGCGCAAAGCAACTCAAGACATTGACCATGTCACTGTTGGGTTAATC
CTAAATGTGTGTGCTGGTCTTTCAGATGTTGAATCGGGAAAACAGGTTCATGGGTTTATC
TATAGGCATGGTCTCTATTCCAATCTCTTTGTTGGCAATGCACTTCTTCACATGTATGGG
AAATGTGGGAACTTGAGAAGCACAAGACTTTGGTTCTACCAGATGAGTCATTGGCGAGAT
AGGATTTCTTGGAATGCTCTATTGACTAGCCATGCTCGCCATGGCTTGAGTGAAGAAGCT
ATGACAATTTTTGGGGAGATGCAATGGGAGACAACGCCATCTAAATTTACGCTTGGTACA
CTTTTGTCAGCTTGTGCAAATATTTTTGCGCTTGAGCAAGGTAAACAAATCCATGGGTTT
ATGATTAGAAATGGTTATGAGATAGATGTTGTTGCCAGAGGAGCTTTGGTAGACATGTAT
TCCAAATGTCGATGTCTTGAATATGCCCTCAAGGTTTTTAAAGAGGCTCCTTCACGGGAT
TTGATTCTTTGGAACTCCATGATTTTGGGATGTTGTCACAATGGAAGGGGTAGAGATGTA
CTTGGACTGTTTGGATTGATGGAGGAAGAAGGGGTTAAGCCTGACCACATCACCTTTCAG
GGTATTTTGCTTGGTTGTATTTGTGAGGGTCTTGCTGGGTTAGGTACTGAGTATTTTAAT
TCAATGAGCAACAAGTACTGTATCATACCTCGATTGGAGCATTATGAGTCCATGATTGAA
CTGTATGGTAGGCATGGGTTCATGGATGAGCTTGAGGATTTCATTAAGAGGATGCCATTT
GAGCCCACTGTTGCAATGTTGACAAGAGTCTTCAATGCTTGCAGTGAACATGGTCACTCA
AGGTTGGGAAAATGGGCTGCTGAACAACTAAATGAATTGAATCCTTCAACTCCATTTCAT
TTTCAAATTTTGGACAGAAGCAGAGTGGGCAAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_18s0001g14940.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:18:12969264:12971832:-1 gene:VIT_18s0001g14940 transcript:VIT_18s0001g14940.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MGVNAASVLNRLLQRNTHKPKALPTDSKALTTTTVLTHLNAGRLRKAVSILFASPVPFPF
SLYARLFQICSSNLAIVEARKVESHLITFSPAPPIFLLNRAIETYGKCSCLDDARELFEE
MPQRDGGSWNAMITAYAQGGCAEKALWLFSRMNRLGIWANEITFASVLGSCATVLALFLS
KQIHGLIVKYGFCWNVILGSSLVDIYGKCRVMSDARRMFDEIENPNAISWNVIVRRYLEM
GNEKEAVVMFFKMIRANIRPLNFTFSNALIACSSISALQEGIQIHGVAIRIGYDEDEVVS
SSLIDMYAKCGDLESACRIFELPSSKNLISWTSIVSGYAMSGQTREARVLFDEMPERSVI
SWNAMLAGYTHFCQWEEALEFVFLMRKATQDIDHVTVGLILNVCAGLSDVESGKQVHGFI
YRHGLYSNLFVGNALLHMYGKCGNLRSTRLWFYQMSHWRDRISWNALLTSHARHGLSEEA
MTIFGEMQWETTPSKFTLGTLLSACANIFALEQGKQIHGFMIRNGYEIDVVARGALVDMY
SKCRCLEYALKVFKEAPSRDLILWNSMILGCCHNGRGRDVLGLFGLMEEEGVKPDHITFQ
GILLGCICEGLAGLGTEYFNSMSNKYCIIPRLEHYESMIELYGRHGFMDELEDFIKRMPF
EPTVAMLTRVFNACSEHGHSRLGKWAAEQLNELNPSTPFHFQILDRSRVGK

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_18s0001g14940.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:18:12969264:12971832:-1 gene:VIT_18s0001g14940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGGTGTGAATGCAGCTTCTGTACTCAATCGACTTCTTCAGCGCAACACCCACAAGCCT
AAAGCTCTACCCACCGACTCCAAAGCCTTAACCACAACAACTGTCCTTACTCACCTCAAC
GCCGGTCGCCTCCGAAAAGCCGTATCCATCCTCTTTGCTTCCCCAGTTCCCTTCCCCTTT
TCACTCTATGCTCGCCTTTTCCAGATTTGTTCTTCCAATCTTGCAATCGTTGAGGCCCGT
AAAGTGGAATCCCACTTGATTACCTTCTCGCCTGCACCGCCGATCTTTCTTTTGAACCGT
GCGATTGAAACCTATGGAAAATGCAGTTGTTTGGATGATGCTAGGGAGCTGTTTGAGGAA
ATGCCCCAAAGGGATGGTGGTTCGTGGAATGCGATGATCACGGCCTATGCGCAAGGTGGG
TGTGCGGAGAAGGCGTTGTGGTTGTTCTCGAGGATGAATAGATTGGGGATTTGGGCTAAT
GAGATCACGTTTGCTAGTGTTCTTGGATCTTGTGCTACAGTATTGGCACTGTTTCTTTCG
AAGCAGATTCATGGGCTTATCGTGAAATATGGTTTTTGCTGGAACGTAATTTTGGGGAGT
TCTCTGGTTGATATATATGGGAAATGTCGGGTTATGAGTGATGCACGTAGAATGTTTGAT
GAAATTGAGAATCCAAATGCCATTTCCTGGAATGTGATTGTCAGGCGGTATCTTGAGATG
GGTAATGAAAAGGAAGCAGTTGTTATGTTTTTTAAGATGATCCGAGCAAACATTAGGCCA
TTGAATTTTACATTCTCCAATGCTCTTATTGCTTGTTCTAGTATATCTGCACTCCAGGAG
GGGATTCAGATTCATGGAGTTGCAATTAGGATTGGTTATGACGAGGATGAGGTGGTTTCT
AGCTCTCTTATTGATATGTATGCAAAATGTGGGGATTTGGAGAGCGCTTGTAGGATTTTT
GAACTGCCCAGTTCAAAAAATTTGATCTCCTGGACTTCAATTGTGTCGGGGTATGCAATG
AGTGGGCAAACAAGAGAGGCAAGAGTGCTCTTCGATGAGATGCCAGAAAGGAGTGTAATC
TCATGGAATGCAATGTTAGCAGGGTATACACATTTCTGCCAATGGGAAGAGGCTTTGGAA
TTTGTTTTTCTGATGCGCAAAGCAACTCAAGACATTGACCATGTCACTGTTGGGTTAATC
CTAAATGTGTGTGCTGGTCTTTCAGATGTTGAATCGGGAAAACAGGTTCATGGGTTTATC
TATAGGCATGGTCTCTATTCCAATCTCTTTGTTGGCAATGCACTTCTTCACATGTATGGG
AAATGTGGGAACTTGAGAAGCACAAGACTTTGGTTCTACCAGATGAGTCATTGGCGAGAT
AGGATTTCTTGGAATGCTCTATTGACTAGCCATGCTCGCCATGGCTTGAGTGAAGAAGCT
ATGACAATTTTTGGGGAGATGCAATGGGAGACAACGCCATCTAAATTTACGCTTGGTACA
CTTTTGTCAGCTTGTGCAAATATTTTTGCGCTTGAGCAAGGTAAACAAATCCATGGGTTT
ATGATTAGAAATGGTTATGAGATAGATGTTGTTGCCAGAGGAGCTTTGGTAGACATGTAT
TCCAAATGTCGATGTCTTGAATATGCCCTCAAGGTTTTTAAAGAGGCTCCTTCACGGGAT
TTGATTCTTTGGAACTCCATGATTTTGGGATGTTGTCACAATGGAAGGGGTAGAGATGTA
CTTGGACTGTTTGGATTGATGGAGGAAGAAGGGGTTAAGCCTGACCACATCACCTTTCAG
GGTATTTTGCTTGGTTGTATTTGTGAGGGTCTTGCTGGGTTAGGTACTGAGTATTTTAAT
TCAATGAGCAACAAGTACTGTATCATACCTCGATTGGAGCATTATGAGTCCATGATTGAA
CTGTATGGTAGGCATGGGTTCATGGATGAGCTTGAGGATTTCATTAAGAGGATGCCATTT
GAGCCCACTGTTGCAATGTTGACAAGAGTCTTCAATGCTTGCAGTGAACATGGTCACTCA
AGGTTGGGAAAATGGGCTGCTGAACAACTAAATGAATTGAATCCTTCAACTCCATTTCAT
TTTCAAATTTTGGACAGAAGCAGAGTGGGCAAGTAGTAATAATCCGAACCACAAATTGGA
GGGAATTATATTCACAGCTTCCGACCATGCAAGATGACAGAAGCTTGGGTCAAGCTTTGT
ATTCTAATGTCATGTGCTGAGCTGCTTGCTGGATGCCAGTGTTGGTAGTTATTCATGACC
TCGAGAATGGGAGTCTAGATATTTTACTCTAGAAGCGTCTGTCAATTCATGTTGATCTAT
ACATGGGAGGACATTTTGAGTTTTTGATCTGTACATGAAAGGAGTCATCAGATAGAGCTC
CAAAGAAGCATATTGGTTCCTACATCAAATAAGTGCAAGCTAGAGCTCCAACAAAAAAGG
AAGATTTTTTGGAAAAACTTTACTGTACTGTCCCCTGTAAGAGTACTTAAACTGCTACTG
GAGGAAGTTGGCTTCAGACAGTCATAACCAATCCTACAAAGGTGCCCAT