Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_18s0001g13940.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:18:11933806:11936210:1 gene:VIT_18s0001g13940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGAGAAATGCGGCGAACGTCCGAAGACTGGCCAACCAGTACGCAGCTCAACTGCAACAA
TGCTGTCCCCACAATCCCATGTCGTATTCTATCGCCCGTACTGTTCATGCCCACATGATA
GCTTCTGGGTTCAAGCCACGAGGTTATATCCTCAACCGTCTCATTGATGTCTACTGCAAA
TCATCTGATCTCGTCTCCGCACACCACCTGTTCGACGAAATTCGTCAACCTGACATCGTC
GCTAGAACCACGTTAATTGCCGCCCACTCCTCTGCTGGGAATTCCAATCTAGCACGAGAG
ATATTTTTTGCGACCCCCTTGGGAATCCGAGACACTGTTTGCTACAATGCTATGATCACG
GGCTATTCACATAATAACGATGGTTTTGGAGCCATTGAACTGTTTCGTGACTTGTTGCGG
AACGGCTTTAGGCCCGATAATTTCACGTTTACGAGTGTGCTAGGTGCTTTGGCGCTTATA
GTTGAAGATGAAAAGCAGTGCCAGCAGATACATTGTGCTGTAGTGAAGTCAGGATCTGGG
TTCGTTACTTCGGTTTTAAATGCACTACTATCTGTATTTGTTAAGTGTGCGTCTTCCCCA
TTAGTGTCATCGTCATCATTGATGGCTGCGGCCAGGAAGTTGTTTGACGAGATGACCGAG
AGAGATGAGTTGTCGTGGACAACAATGATAGCCGGATATGTAAGGAATGGTGAACTTGAT
GCAGCACGTCAGTTTCTTGATGGGATGACAGAAAAATTGGTGGTTGCGTGGAATGCGATG
ATTTCGGGGTATGTGCATCATGGGTTTTTCCTAGAAGCTCTGGAAATGTTTAGGAAGATG
TATTTATTAGGAATTCAGTGGGATGAATTTACATACACAAGTGTACTTAGTGCTTGTGCA
AATGCAGGATTTTTTCTGCATGGAAAGCAGGTGCATGCTTACATTCTACGCACTGAACCA
AGGCCTTCCCTTGATTTTTCATTGTCTGTAAATAATGCATTGGCAACACTCTATTGGAAA
TGTGGTAAAGTTGATGAGGCACGGCAGGTTTTTAATCAGATGCCTGTAAAAGACCTTGTT
TCATGGAATGCAATCTTATCAGGCTATGTTAATGCAGGGCGGATTGATGAAGCTAAATCA
TTTTTTGAGGAGATGCCAGAGAGGAATCTTTTGACATGGACTGTGATGATATCTGGATTG
GCACAAAATGGTTTTGGTGAAGAAAGTCTGAAGCTATTCAATCGAATGAAGTCAGAGGGC
TTTGAGCCATGTGATTATGCATTTGCAGGGGCAATTATTGCTTGTGCTTGGCTTGCAGCA
TTGATGCATGGACGCCAGCTCCATGCTCAACTTGTCCGGCTAGGTTTTGATTCTAGCCTT
TCAGCAGGAAATGCACTGATAACAATGTATGCAAAATGTGGTGTTGTTGAGGCTGCCCAC
TGTCTTTTCCTAACAATGCCTTATTTGGATTCAGTATCTTGGAATGCCATGATTGCAGCT
CTGGGTCAACATGGACATGGTGCTCAAGCACTAGAACTTTTTGAACTGATGTTGAAGGAA
GACATATTACCAGATCGGATAACTTTCCTCACAGTTCTTTCCACTTGTAGCCATGCCGGT
CTAGTTGAAGAGGGGCATCGCTATTTCAAATCCATGTCAGGCCTTTATGGTATATGCCCA
GGTGAAGATCATTATGCTCGTATGATTGATTTGTTGTGTCGAGCTGGGAAGTTCTCAGAA
GCAAAGGATATGATTGAAACAATGCCTGTTGAGCCAGGTCCACCTATTTGGGAGGCACTT
CTTGCTGGTTGCCGGATTCATGGGAACATGGATTTAGGTATCCAAGCTGCAGAACGACTC
TTTGAGCTAATGCCACAGCATGATGGAACCTATGTGCTCTTGTCAAACATGTACGCCACT
GTGGGCAGGTGGGATGATGTGGCTAAGGTGCGGAAATTAATGAGGGACAAGGGTGTGAAA
AAGGAGCCTGGATGTAGTTGGATTGAGGTTGAAAACAAAGTTCATGTGTTCTTAGTGGAT
GATATTGTGCACCCTGAGGTGCAAGCAGTATACAATTATCTCGAAGAACTGGGATTAAAA
ATGAGGAAATTAGGGTATATCCCTGACACAAAGTTTGTATTGCATGATATGGAATCTGAG
CAGAAGGAATATGTTTTGTCTACTCACAGTGAAAAGCTTGCTGTTGGTTTTGGGCTCCTG
AAGCTCCCTCTTGGAGCCACAGTTAGGGTTTTCAAGAACCTTAGAATTTGTGGGGATTGT
CACAATGCATTCAAGTTTATGTCAAAAGTGGTGGAGAGAGAGATTGTTGTGAGAGATGGT
AAGAGATTTCATCATTTCAAGAATGGCGAATGCTCTTGTGGCAATTACTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_18s0001g13940.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:18:11933806:11936210:1 gene:VIT_18s0001g13940 transcript:VIT_18s0001g13940.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MRNAANVRRLANQYAAQLQQCCPHNPMSYSIARTVHAHMIASGFKPRGYILNRLIDVYCK
SSDLVSAHHLFDEIRQPDIVARTTLIAAHSSAGNSNLAREIFFATPLGIRDTVCYNAMIT
GYSHNNDGFGAIELFRDLLRNGFRPDNFTFTSVLGALALIVEDEKQCQQIHCAVVKSGSG
FVTSVLNALLSVFVKCASSPLVSSSSLMAAARKLFDEMTERDELSWTTMIAGYVRNGELD
AARQFLDGMTEKLVVAWNAMISGYVHHGFFLEALEMFRKMYLLGIQWDEFTYTSVLSACA
NAGFFLHGKQVHAYILRTEPRPSLDFSLSVNNALATLYWKCGKVDEARQVFNQMPVKDLV
SWNAILSGYVNAGRIDEAKSFFEEMPERNLLTWTVMISGLAQNGFGEESLKLFNRMKSEG
FEPCDYAFAGAIIACAWLAALMHGRQLHAQLVRLGFDSSLSAGNALITMYAKCGVVEAAH
CLFLTMPYLDSVSWNAMIAALGQHGHGAQALELFELMLKEDILPDRITFLTVLSTCSHAG
LVEEGHRYFKSMSGLYGICPGEDHYARMIDLLCRAGKFSEAKDMIETMPVEPGPPIWEAL
LAGCRIHGNMDLGIQAAERLFELMPQHDGTYVLLSNMYATVGRWDDVAKVRKLMRDKGVK
KEPGCSWIEVENKVHVFLVDDIVHPEVQAVYNYLEELGLKMRKLGYIPDTKFVLHDMESE
QKEYVLSTHSEKLAVGFGLLKLPLGATVRVFKNLRICGDCHNAFKFMSKVVEREIVVRDG
KRFHHFKNGECSCGNYW

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_18s0001g13940.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:18:11933806:11936210:1 gene:VIT_18s0001g13940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGAGAAATGCGGCGAACGTCCGAAGACTGGCCAACCAGTACGCAGCTCAACTGCAACAA
TGCTGTCCCCACAATCCCATGTCGTATTCTATCGCCCGTACTGTTCATGCCCACATGATA
GCTTCTGGGTTCAAGCCACGAGGTTATATCCTCAACCGTCTCATTGATGTCTACTGCAAA
TCATCTGATCTCGTCTCCGCACACCACCTGTTCGACGAAATTCGTCAACCTGACATCGTC
GCTAGAACCACGTTAATTGCCGCCCACTCCTCTGCTGGGAATTCCAATCTAGCACGAGAG
ATATTTTTTGCGACCCCCTTGGGAATCCGAGACACTGTTTGCTACAATGCTATGATCACG
GGCTATTCACATAATAACGATGGTTTTGGAGCCATTGAACTGTTTCGTGACTTGTTGCGG
AACGGCTTTAGGCCCGATAATTTCACGTTTACGAGTGTGCTAGGTGCTTTGGCGCTTATA
GTTGAAGATGAAAAGCAGTGCCAGCAGATACATTGTGCTGTAGTGAAGTCAGGATCTGGG
TTCGTTACTTCGGTTTTAAATGCACTACTATCTGTATTTGTTAAGTGTGCGTCTTCCCCA
TTAGTGTCATCGTCATCATTGATGGCTGCGGCCAGGAAGTTGTTTGACGAGATGACCGAG
AGAGATGAGTTGTCGTGGACAACAATGATAGCCGGATATGTAAGGAATGGTGAACTTGAT
GCAGCACGTCAGTTTCTTGATGGGATGACAGAAAAATTGGTGGTTGCGTGGAATGCGATG
ATTTCGGGGTATGTGCATCATGGGTTTTTCCTAGAAGCTCTGGAAATGTTTAGGAAGATG
TATTTATTAGGAATTCAGTGGGATGAATTTACATACACAAGTGTACTTAGTGCTTGTGCA
AATGCAGGATTTTTTCTGCATGGAAAGCAGGTGCATGCTTACATTCTACGCACTGAACCA
AGGCCTTCCCTTGATTTTTCATTGTCTGTAAATAATGCATTGGCAACACTCTATTGGAAA
TGTGGTAAAGTTGATGAGGCACGGCAGGTTTTTAATCAGATGCCTGTAAAAGACCTTGTT
TCATGGAATGCAATCTTATCAGGCTATGTTAATGCAGGGCGGATTGATGAAGCTAAATCA
TTTTTTGAGGAGATGCCAGAGAGGAATCTTTTGACATGGACTGTGATGATATCTGGATTG
GCACAAAATGGTTTTGGTGAAGAAAGTCTGAAGCTATTCAATCGAATGAAGTCAGAGGGC
TTTGAGCCATGTGATTATGCATTTGCAGGGGCAATTATTGCTTGTGCTTGGCTTGCAGCA
TTGATGCATGGACGCCAGCTCCATGCTCAACTTGTCCGGCTAGGTTTTGATTCTAGCCTT
TCAGCAGGAAATGCACTGATAACAATGTATGCAAAATGTGGTGTTGTTGAGGCTGCCCAC
TGTCTTTTCCTAACAATGCCTTATTTGGATTCAGTATCTTGGAATGCCATGATTGCAGCT
CTGGGTCAACATGGACATGGTGCTCAAGCACTAGAACTTTTTGAACTGATGTTGAAGGAA
GACATATTACCAGATCGGATAACTTTCCTCACAGTTCTTTCCACTTGTAGCCATGCCGGT
CTAGTTGAAGAGGGGCATCGCTATTTCAAATCCATGTCAGGCCTTTATGGTATATGCCCA
GGTGAAGATCATTATGCTCGTATGATTGATTTGTTGTGTCGAGCTGGGAAGTTCTCAGAA
GCAAAGGATATGATTGAAACAATGCCTGTTGAGCCAGGTCCACCTATTTGGGAGGCACTT
CTTGCTGGTTGCCGGATTCATGGGAACATGGATTTAGGTATCCAAGCTGCAGAACGACTC
TTTGAGCTAATGCCACAGCATGATGGAACCTATGTGCTCTTGTCAAACATGTACGCCACT
GTGGGCAGGTGGGATGATGTGGCTAAGGTGCGGAAATTAATGAGGGACAAGGGTGTGAAA
AAGGAGCCTGGATGTAGTTGGATTGAGGTTGAAAACAAAGTTCATGTGTTCTTAGTGGAT
GATATTGTGCACCCTGAGGTGCAAGCAGTATACAATTATCTCGAAGAACTGGGATTAAAA
ATGAGGAAATTAGGGTATATCCCTGACACAAAGTTTGTATTGCATGATATGGAATCTGAG
CAGAAGGAATATGTTTTGTCTACTCACAGTGAAAAGCTTGCTGTTGGTTTTGGGCTCCTG
AAGCTCCCTCTTGGAGCCACAGTTAGGGTTTTCAAGAACCTTAGAATTTGTGGGGATTGT
CACAATGCATTCAAGTTTATGTCAAAAGTGGTGGAGAGAGAGATTGTTGTGAGAGATGGT
AAGAGATTTCATCATTTCAAGAATGGCGAATGCTCTTGTGGCAATTACTGGTAAGCATAA
TTTTT