Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_18s0001g09690.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:18:8069331:8072228:1 gene:VIT_18s0001g09690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGAGACTGTTTATCCAGTTGCCACATTCAAAGTGCCTCCTCGCCCCCTTCTCCCAAGT
ATCAAAAGTAACGTCACTAGTTTCCGATTTTTACACTCCCACCTACGAAATAAACAACTT
GAGTTTCAGAATCACGGCTTTTCTTCTCAATTTATATTCAGATGTAGTGCCTGTAGCAAA
TTCTTGGTTTCTCAATCTGAACACGAAAGATTAAAGTGCGCACAGCAACTGTTTGATAAT
TTTCCCAATAGGGATGTGATCTCTTGGTCCGCTCTCATTGCTGCTTATTCTCGATGTGGG
AATTTTGCCCAAGCATTTGGTTTGTTCCAGAAAATGATGGGTGAAGGATTGCAGCCCAAT
GGATTTTCATTAGCCAGCTTGCTCAAGGTGAGTTGTAGTACGGGGGAAATTGGACTTTGC
AGACAGCTCCATGGCTGGTCTATCCGAACCGGTTTTGGATTAGATTCTGGAATAAGGGCT
GCCTGGATAACCATGTATTCCCGTTGTGGTGTGTTGGAAGATGCCCAGAGGGTTTTTGAC
GAGACCTCTCTTCTTGCTCTCGATATCCTCTTGTGGAATTCAATTATAGCAGCCTATATC
TTCCATGGGTGTTGGGTTGAGGTGCTTCGTCTGTTTTGCAAAATGGTGTCAGTTGGGGTT
GTTGCACCAACAGAGCTCACCTATGCTAGTGTTGTCAATGCTTGTGGTTCTTCAGGTGAG
GAGAAGTATGGAGCAATGGTTCATGGAAGGATCATCAAAGCTGGACTTGAAGCAACTAAT
CTATGGAATTCTCTTGTTACATTTTATGGCAAATGTGGGAACTTACAACATGCAAGCCAA
TTATTTGAGAGGATTTCTAGGAAGGATGTTGTTTCATGGAATGCAATGATTGCAGCCAAT
GAACAAAGAGGAGAAGGGGAGAATGCTCTAGGTTTATTCCGTAGGATGCTCAAAGTTGAA
CCGCCTGTTCAACCAAATCGTGTCACTTTTCTTAGTTTGCTTAGTGCTGTTTCTGGGCTT
TCAGCTTTAAGGTGTGGAAGAGAAATTCATGCTCATATCTTTAGACTCAGCCTTGAAGTT
GATACCAGCATCACCAATTCTCTCATCACCTTTTATTCAAAATGCAGGGAAGTTGGCAAA
GCAAGAGAGATTTTTGAGAGGTTGTTGTTAAGGGATATCATTTCATGGAATTCAATGCTT
GCTGGATATGAGCAGAATGAGCAGCAAGGAAGATGTTTTGATATCTTTAAGAGAATGATG
CTTTCAGGGATTGAGCCAGATTCACACAGTCTCACTATTATTTTCAATGCAGCTTCTCGT
GATTCATCCGGGTTAATATATTTTCGAAGGGGTAAAGAAATTCATGGGTATATTTTGAGG
AGAATTACCCCAGGAGGTGTGAGTTTGTCAGTCTCTAATGCAATTCTTAAAATGTATGCA
AAATTCAACCGTATAGCAGATGCTGAGAAGATTTTCAAGGGGATGAAGAATAGGGATTCA
TACTCCTGGAATGCAATGATGGATGGGTATTCAAGAAATGCCAAGTTTGAGGATGTCCTA
ATGATTTTTCTAGATATTCTTAAGCAAGGTTTCCCATTAGATCATGTGAGCCTCTCAATT
CTCCTTACGTCCTGTGGCAGATTGGTTTCCCTCCAACTGGGTAAGCAGTTTCATGCTGTT
GTTGCCAAACTCTTCAATGGCCAGGATTGTCCTCACCAGGATTCTCTTTTGTCAATCAAC
AATGCATTGATTTCCATGTATTCAAAATGTGGAAGTATTAAAGATGCTGCCCAAGTATTT
TTAAAGATGGAAAGGAAGGACGTCTTTTCTTGGACAGCTATGATCACAGGCTGCGCACAC
CATGGACTGGCTGTTGAAGCCCTTCAGCTATTTGAGAGAATGAAAACAGATGGCATCAAG
CCCAACCAGGTAACTTTCCTCGCACTACTCATGGCTTGCGCTCATGGGGGTCTTGTTCAA
GAGGGGAGCTATTATTTTGACTCCATGTACAATGATTATGGTCTAAGCCCAAGTATTGAA
CACTATGCATGCATGATTGATTTGTTTGGCCGATCAGGTCAGTTTGATCGTGCAAAAAGC
CTGGTTGAGTTTGGAATCACTCTCTTTAAGCCCTATCATGATGATATCTTGAACCTGTGG
AAGGTTTTACTTGGGGCATGTCATGCGTCTAAGCAGTTAGATCTTGGGGTAGAGGCTGCA
ACAAAGATTCTTGAATTGGAACCTGAAGATGAGGCTACCTACATTCTTCTAGCGAACCTT
TATGCCTCTTCAGGCTTATGGGAGGATGCAATCAAGGTTAGGAAGGCAATGAGAGATAAA
GGGCTAAGGAAGGAAGTTGGGTGCAGCTGGATAGATACTGGAAACAGGAGACACGTCTTT
GTGGCAGGAGATGTATATCATCCTCAGAGAAAAGAGATATATGAGAAGCTGGCACAGTTG
AATTATAGTTGTAGAAGGATGGGCTATGTCCCCATGACAGAGCTTGTGCTTCATGATGTG
GATGAGACAGAGAAGGAAGCAATTCTGGGATGTCATAGTGAGAAATTGGCGGTGTCTTTT
GGTCTTTTGAATTGTGGGGTTGGCAATGGTGTAATTAGAGTGATGAAGAACTTGCGGGTG
TGTGAGGATTGTCATAGCTGGATGAAATTTGCTTCCCTACTGGAGAAGAGGGAAATACTA
CTTAGGGATTCACAGCGATTCCATTTGTTTAGGGATGGCAGCTGTTCTTGTGGAGATTAT
TGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_18s0001g09690.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:18:8069331:8072228:1 gene:VIT_18s0001g09690 transcript:VIT_18s0001g09690.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

METVYPVATFKVPPRPLLPSIKSNVTSFRFLHSHLRNKQLEFQNHGFSSQFIFRCSACSK
FLVSQSEHERLKCAQQLFDNFPNRDVISWSALIAAYSRCGNFAQAFGLFQKMMGEGLQPN
GFSLASLLKVSCSTGEIGLCRQLHGWSIRTGFGLDSGIRAAWITMYSRCGVLEDAQRVFD
ETSLLALDILLWNSIIAAYIFHGCWVEVLRLFCKMVSVGVVAPTELTYASVVNACGSSGE
EKYGAMVHGRIIKAGLEATNLWNSLVTFYGKCGNLQHASQLFERISRKDVVSWNAMIAAN
EQRGEGENALGLFRRMLKVEPPVQPNRVTFLSLLSAVSGLSALRCGREIHAHIFRLSLEV
DTSITNSLITFYSKCREVGKAREIFERLLLRDIISWNSMLAGYEQNEQQGRCFDIFKRMM
LSGIEPDSHSLTIIFNAASRDSSGLIYFRRGKEIHGYILRRITPGGVSLSVSNAILKMYA
KFNRIADAEKIFKGMKNRDSYSWNAMMDGYSRNAKFEDVLMIFLDILKQGFPLDHVSLSI
LLTSCGRLVSLQLGKQFHAVVAKLFNGQDCPHQDSLLSINNALISMYSKCGSIKDAAQVF
LKMERKDVFSWTAMITGCAHHGLAVEALQLFERMKTDGIKPNQVTFLALLMACAHGGLVQ
EGSYYFDSMYNDYGLSPSIEHYACMIDLFGRSGQFDRAKSLVEFGITLFKPYHDDILNLW
KVLLGACHASKQLDLGVEAATKILELEPEDEATYILLANLYASSGLWEDAIKVRKAMRDK
GLRKEVGCSWIDTGNRRHVFVAGDVYHPQRKEIYEKLAQLNYSCRRMGYVPMTELVLHDV
DETEKEAILGCHSEKLAVSFGLLNCGVGNGVIRVMKNLRVCEDCHSWMKFASLLEKREIL
LRDSQRFHLFRDGSCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_18s0001g09690.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:18:8069331:8072228:1 gene:VIT_18s0001g09690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGAGACTGTTTATCCAGTTGCCACATTCAAAGTGCCTCCTCGCCCCCTTCTCCCAAGT
ATCAAAAGTAACGTCACTAGTTTCCGATTTTTACACTCCCACCTACGAAATAAACAACTT
GAGTTTCAGAATCACGGCTTTTCTTCTCAATTTATATTCAGATGTAGTGCCTGTAGCAAA
TTCTTGGTTTCTCAATCTGAACACGAAAGATTAAAGTGCGCACAGCAACTGTTTGATAAT
TTTCCCAATAGGGATGTGATCTCTTGGTCCGCTCTCATTGCTGCTTATTCTCGATGTGGG
AATTTTGCCCAAGCATTTGGTTTGTTCCAGAAAATGATGGGTGAAGGATTGCAGCCCAAT
GGATTTTCATTAGCCAGCTTGCTCAAGGTGAGTTGTAGTACGGGGGAAATTGGACTTTGC
AGACAGCTCCATGGCTGGTCTATCCGAACCGGTTTTGGATTAGATTCTGGAATAAGGGCT
GCCTGGATAACCATGTATTCCCGTTGTGGTGTGTTGGAAGATGCCCAGAGGGTTTTTGAC
GAGACCTCTCTTCTTGCTCTCGATATCCTCTTGTGGAATTCAATTATAGCAGCCTATATC
TTCCATGGGTGTTGGGTTGAGGTGCTTCGTCTGTTTTGCAAAATGGTGTCAGTTGGGGTT
GTTGCACCAACAGAGCTCACCTATGCTAGTGTTGTCAATGCTTGTGGTTCTTCAGGTGAG
GAGAAGTATGGAGCAATGGTTCATGGAAGGATCATCAAAGCTGGACTTGAAGCAACTAAT
CTATGGAATTCTCTTGTTACATTTTATGGCAAATGTGGGAACTTACAACATGCAAGCCAA
TTATTTGAGAGGATTTCTAGGAAGGATGTTGTTTCATGGAATGCAATGATTGCAGCCAAT
GAACAAAGAGGAGAAGGGGAGAATGCTCTAGGTTTATTCCGTAGGATGCTCAAAGTTGAA
CCGCCTGTTCAACCAAATCGTGTCACTTTTCTTAGTTTGCTTAGTGCTGTTTCTGGGCTT
TCAGCTTTAAGGTGTGGAAGAGAAATTCATGCTCATATCTTTAGACTCAGCCTTGAAGTT
GATACCAGCATCACCAATTCTCTCATCACCTTTTATTCAAAATGCAGGGAAGTTGGCAAA
GCAAGAGAGATTTTTGAGAGGTTGTTGTTAAGGGATATCATTTCATGGAATTCAATGCTT
GCTGGATATGAGCAGAATGAGCAGCAAGGAAGATGTTTTGATATCTTTAAGAGAATGATG
CTTTCAGGGATTGAGCCAGATTCACACAGTCTCACTATTATTTTCAATGCAGCTTCTCGT
GATTCATCCGGGTTAATATATTTTCGAAGGGGTAAAGAAATTCATGGGTATATTTTGAGG
AGAATTACCCCAGGAGGTGTGAGTTTGTCAGTCTCTAATGCAATTCTTAAAATGTATGCA
AAATTCAACCGTATAGCAGATGCTGAGAAGATTTTCAAGGGGATGAAGAATAGGGATTCA
TACTCCTGGAATGCAATGATGGATGGGTATTCAAGAAATGCCAAGTTTGAGGATGTCCTA
ATGATTTTTCTAGATATTCTTAAGCAAGGTTTCCCATTAGATCATGTGAGCCTCTCAATT
CTCCTTACGTCCTGTGGCAGATTGGTTTCCCTCCAACTGGGTAAGCAGTTTCATGCTGTT
GTTGCCAAACTCTTCAATGGCCAGGATTGTCCTCACCAGGATTCTCTTTTGTCAATCAAC
AATGCATTGATTTCCATGTATTCAAAATGTGGAAGTATTAAAGATGCTGCCCAAGTATTT
TTAAAGATGGAAAGGAAGGACGTCTTTTCTTGGACAGCTATGATCACAGGCTGCGCACAC
CATGGACTGGCTGTTGAAGCCCTTCAGCTATTTGAGAGAATGAAAACAGATGGCATCAAG
CCCAACCAGGTAACTTTCCTCGCACTACTCATGGCTTGCGCTCATGGGGGTCTTGTTCAA
GAGGGGAGCTATTATTTTGACTCCATGTACAATGATTATGGTCTAAGCCCAAGTATTGAA
CACTATGCATGCATGATTGATTTGTTTGGCCGATCAGGTCAGTTTGATCGTGCAAAAAGC
CTGGTTGAGTTTGGAATCACTCTCTTTAAGCCCTATCATGATGATATCTTGAACCTGTGG
AAGGTTTTACTTGGGGCATGTCATGCGTCTAAGCAGTTAGATCTTGGGGTAGAGGCTGCA
ACAAAGATTCTTGAATTGGAACCTGAAGATGAGGCTACCTACATTCTTCTAGCGAACCTT
TATGCCTCTTCAGGCTTATGGGAGGATGCAATCAAGGTTAGGAAGGCAATGAGAGATAAA
GGGCTAAGGAAGGAAGTTGGGTGCAGCTGGATAGATACTGGAAACAGGAGACACGTCTTT
GTGGCAGGAGATGTATATCATCCTCAGAGAAAAGAGATATATGAGAAGCTGGCACAGTTG
AATTATAGTTGTAGAAGGATGGGCTATGTCCCCATGACAGAGCTTGTGCTTCATGATGTG
GATGAGACAGAGAAGGAAGCAATTCTGGGATGTCATAGTGAGAAATTGGCGGTGTCTTTT
GGTCTTTTGAATTGTGGGGTTGGCAATGGTGTAATTAGAGTGATGAAGAACTTGCGGGTG
TGTGAGGATTGTCATAGCTGGATGAAATTTGCTTCCCTACTGGAGAAGAGGGAAATACTA
CTTAGGGATTCACAGCGATTCCATTTGTTTAGGGATGGCAGCTGTTCTTGTGGAGATTAT
TGGTAGTGCAAAAAACCCAATAATTAGAAGATAAAAGGAAATGTATGTGACACACAGTAG
TAAATTCATTTAGACAACACAAGGTAGGCCCTGTATATCTCATTTTGTGTATCAATTTAT
GTATGATACTTTTCTTCT