Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_18s0001g05980.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:18_random:4572367:4574436:-1 gene:VIT_18s0001g05980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGATAGATTCCCTTCTCACATCCTTGAAGGAGTTTACAAGCCGAGGCAATCTATTGGAT
GCCTTCAAAACTGTCTCTTTGATTAGACTCCATGCTTCTTCTGCTTCTCAGGACCTCATT
GTACACCCCATATCTTCTCTTTTATCATCATGTACTGATGTCAAATCCCTTGCAGAGGGT
CGACAGCTCCATGGCCACATTATATCTTTGGGTTTTGAACAACATCCCATTTTGGTTCCT
AAGCTTGTCACCTTCTACTCAGCCTTTAATCTCCTGGTTGATGCCCATGTTATAACTGAG
AATTCAAATATTTTGCATCCTTTTCCTTGGAATCTGCTTATCTCTTCCTATGTTAGAAAT
GGGTTTTGTCAGAAGGCTCTGTCTGCCTATAAACAAATGGTGAAGAAAGGGATTAGACCA
GATAATTTCACTTATCCATCTGTTCTCAAGGCTTGTGGTGAAGAACTTGATTTGGGCTTC
GGAAAGGAGGTTCATGAGTCCATCAATGCTAGTCGTATTAAGTGGAGCTTGATTGTGCAT
AATGCATTAATTTCCATGTATGGTAAGTGTGGGAAGGTGGGTATTGCTCGTGACTTGTTT
GATAAAATTCCAGAAAGGGATGCAGTTTCTTGGAACTCAATGATTTCAGTTTACGCCTCC
ATGGGTATGTGGAATGAAGCATTTGAGCTTTTTGGAAGCATGTGGGCAGAGGATATTGAA
TTGAACATTATTATTTGGAATACCATAGCTGGGGGTTACTTGCGGACAGGTAATTATAAG
GGTGCACTAGAATTGCTTTCTCAGATGAGAAAATGTGGCAGTCATTTGGATTCTGTGGCA
TTGATCATTGGTTTGGGTGCATGTTCCCATATTGGGGATGCAAAACTGGGGAAAGAGATC
CACAGTTTTGCAATCCGTAGTTGTTTTGGTGAGGTTGATACTGTAAAAAATGCGTTAATC
ACTATGTATTCTAGGTGTAAGGATCTCAAGCATGCATATTTGTTATTCCAATTGATGGAA
GCTAAGAGTTTAATTACCTGGAACTCCATAATTTCTGGTTGCTGTCATATGGATCGATCC
GAGGAAGCCTCCTTCCTTTTAAGAGAGATGTTGCTTTTTGGCATTGAACCAAATTATGTG
ACAATTGCAAGCGTTCTTCCTCTCTGTGCTCGAGTAGCAAATTTGCAACATGGGAAAGAG
TTCCACTGCTACATGACTAGGCGTGAGGATTTCAAGGATCATCTGTTACTATGGAATGCT
CTTGTGGATATGTATGCAAGATCAGGAAAAGTTTTAGAAGCTAGAAGAGTGTTTGATATG
TTGGGCGAGAGGGATAAGATGACTTATACCTCCATGATTGCTGGATATGGGATGCAAGGA
GAGGGACAGGCTGCATTAAAACTGTTTGAAGAGATGAACAATTTCCAGATCAAACCTGAT
CATATAACCATGATTGCAGTTCTATCAGCATGCAGCCATTCAGGTCTTGTAACTCAAGGT
CAACTGCTTTTTGAAAAAATGAGGAGTCTCTATGGTCTTACTCCACATTTAGAGCACTTT
GCTTGCATGACTGATCTTTTTGGTAGGGCAGGTTTATTAAATAAGGCAAAGGAAATAATT
AGAAATATGCCTTACAAGCCAACTCCTGCTATGTGGGCCACTCTCATAGGAGCCTGTCGG
ATTCATCGAAATACAGAGATAGGGGAATGGGCAGCTGAAAAACTGTTGGAAATGAAGCCT
GAAAATCCAGGATACTATGTGTTGATTGCTAACATGTATGCTGCTGCTGGGTGTTGGAAC
AAGCTTGCAAAGGTGAGAATTTTCATGAGGGATTTGGGTGTGAGAAAGGCTCCTGGATGT
GCTTGGGTTGATGTAGGCACTGGGTTTTCTCCCTTTCTGGTGGATGACACATCAAATGCT
AATGCAGATGAGATTTATCCTTTGTTGGAAGGATTGACCATGGTAATGAAAGAAGCCGGT
TATATTTCCAGTGAAGATTTTGGTTCTGGTGATGAAACTTCCGGGGAATTCAATGAGGAA
ATGAAATTAGTATCAAACAATAGATGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_18s0001g05980.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:18_random:4572367:4574436:-1 gene:VIT_18s0001g05980 transcript:VIT_18s0001g05980.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MIDSLLTSLKEFTSRGNLLDAFKTVSLIRLHASSASQDLIVHPISSLLSSCTDVKSLAEG
RQLHGHIISLGFEQHPILVPKLVTFYSAFNLLVDAHVITENSNILHPFPWNLLISSYVRN
GFCQKALSAYKQMVKKGIRPDNFTYPSVLKACGEELDLGFGKEVHESINASRIKWSLIVH
NALISMYGKCGKVGIARDLFDKIPERDAVSWNSMISVYASMGMWNEAFELFGSMWAEDIE
LNIIIWNTIAGGYLRTGNYKGALELLSQMRKCGSHLDSVALIIGLGACSHIGDAKLGKEI
HSFAIRSCFGEVDTVKNALITMYSRCKDLKHAYLLFQLMEAKSLITWNSIISGCCHMDRS
EEASFLLREMLLFGIEPNYVTIASVLPLCARVANLQHGKEFHCYMTRREDFKDHLLLWNA
LVDMYARSGKVLEARRVFDMLGERDKMTYTSMIAGYGMQGEGQAALKLFEEMNNFQIKPD
HITMIAVLSACSHSGLVTQGQLLFEKMRSLYGLTPHLEHFACMTDLFGRAGLLNKAKEII
RNMPYKPTPAMWATLIGACRIHRNTEIGEWAAEKLLEMKPENPGYYVLIANMYAAAGCWN
KLAKVRIFMRDLGVRKAPGCAWVDVGTGFSPFLVDDTSNANADEIYPLLEGLTMVMKEAG
YISSEDFGSGDETSGEFNEEMKLVSNNRC

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_18s0001g05980.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:18_random:4572367:4574436:-1 gene:VIT_18s0001g05980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGATAGATTCCCTTCTCACATCCTTGAAGGAGTTTACAAGCCGAGGCAATCTATTGGAT
GCCTTCAAAACTGTCTCTTTGATTAGACTCCATGCTTCTTCTGCTTCTCAGGACCTCATT
GTACACCCCATATCTTCTCTTTTATCATCATGTACTGATGTCAAATCCCTTGCAGAGGGT
CGACAGCTCCATGGCCACATTATATCTTTGGGTTTTGAACAACATCCCATTTTGGTTCCT
AAGCTTGTCACCTTCTACTCAGCCTTTAATCTCCTGGTTGATGCCCATGTTATAACTGAG
AATTCAAATATTTTGCATCCTTTTCCTTGGAATCTGCTTATCTCTTCCTATGTTAGAAAT
GGGTTTTGTCAGAAGGCTCTGTCTGCCTATAAACAAATGGTGAAGAAAGGGATTAGACCA
GATAATTTCACTTATCCATCTGTTCTCAAGGCTTGTGGTGAAGAACTTGATTTGGGCTTC
GGAAAGGAGGTTCATGAGTCCATCAATGCTAGTCGTATTAAGTGGAGCTTGATTGTGCAT
AATGCATTAATTTCCATGTATGGTAAGTGTGGGAAGGTGGGTATTGCTCGTGACTTGTTT
GATAAAATTCCAGAAAGGGATGCAGTTTCTTGGAACTCAATGATTTCAGTTTACGCCTCC
ATGGGTATGTGGAATGAAGCATTTGAGCTTTTTGGAAGCATGTGGGCAGAGGATATTGAA
TTGAACATTATTATTTGGAATACCATAGCTGGGGGTTACTTGCGGACAGGTAATTATAAG
GGTGCACTAGAATTGCTTTCTCAGATGAGAAAATGTGGCAGTCATTTGGATTCTGTGGCA
TTGATCATTGGTTTGGGTGCATGTTCCCATATTGGGGATGCAAAACTGGGGAAAGAGATC
CACAGTTTTGCAATCCGTAGTTGTTTTGGTGAGGTTGATACTGTAAAAAATGCGTTAATC
ACTATGTATTCTAGGTGTAAGGATCTCAAGCATGCATATTTGTTATTCCAATTGATGGAA
GCTAAGAGTTTAATTACCTGGAACTCCATAATTTCTGGTTGCTGTCATATGGATCGATCC
GAGGAAGCCTCCTTCCTTTTAAGAGAGATGTTGCTTTTTGGCATTGAACCAAATTATGTG
ACAATTGCAAGCGTTCTTCCTCTCTGTGCTCGAGTAGCAAATTTGCAACATGGGAAAGAG
TTCCACTGCTACATGACTAGGCGTGAGGATTTCAAGGATCATCTGTTACTATGGAATGCT
CTTGTGGATATGTATGCAAGATCAGGAAAAGTTTTAGAAGCTAGAAGAGTGTTTGATATG
TTGGGCGAGAGGGATAAGATGACTTATACCTCCATGATTGCTGGATATGGGATGCAAGGA
GAGGGACAGGCTGCATTAAAACTGTTTGAAGAGATGAACAATTTCCAGATCAAACCTGAT
CATATAACCATGATTGCAGTTCTATCAGCATGCAGCCATTCAGGTCTTGTAACTCAAGGT
CAACTGCTTTTTGAAAAAATGAGGAGTCTCTATGGTCTTACTCCACATTTAGAGCACTTT
GCTTGCATGACTGATCTTTTTGGTAGGGCAGGTTTATTAAATAAGGCAAAGGAAATAATT
AGAAATATGCCTTACAAGCCAACTCCTGCTATGTGGGCCACTCTCATAGGAGCCTGTCGG
ATTCATCGAAATACAGAGATAGGGGAATGGGCAGCTGAAAAACTGTTGGAAATGAAGCCT
GAAAATCCAGGATACTATGTGTTGATTGCTAACATGTATGCTGCTGCTGGGTGTTGGAAC
AAGCTTGCAAAGGTGAGAATTTTCATGAGGGATTTGGGTGTGAGAAAGGCTCCTGGATGT
GCTTGGGTTGATGTAGGCACTGGGTTTTCTCCCTTTCTGGTGGATGACACATCAAATGCT
AATGCAGATGAGATTTATCCTTTGTTGGAAGGATTGACCATGGTAATGAAAGAAGCCGGT
TATATTTCCAGTGAAGATTTTGGTTCTGGTGATGAAACTTCCGGGGAATTCAATGAGGAA
ATGAAATTAGTATCAAACAATAGATGTTGA