Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_18s0001g05930.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:18_random:4556533:4558751:-1 gene:VIT_18s0001g05930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGTCCTTGCCACTACATACTAAGAACCCACATGCAATTTTCAGTGACATTCAGAGATTT
GCCAGGCAGGGTAAGCTCAAAGAGGCTCTCACCATCTTGGACTACTGTGACCAACAAGGT
ATCCCTGTTAACCCCACTACATTCTCCTCCCTTCTCCGTGCCTGTGTTGAATCAAAGTCT
TTGACACATGGTAAGCAAATTCATGTGCATATTAGAATAAATGGGCTTGAAAACAATGAA
TTTTTGCGAACAAAACTTGTTCACATGTACACATCTTGTGGTTCTTTGGAGGACGCTAGA
GGGGTTTTTGATGGGGTTAGCTCTAAGAGTGTGTATACTTGGAATGCATTGCTGAGAGGC
AATGTGATTTCAGGTCGAAGACATTACAGGGAGGCACTTTCGACTTATTCAGAAATGAGG
GAATTGGGGGTTGAGTTGAATGTTTATAGTTTTTCTTGTATGATCAAGAGCTTTGCCGGT
GCCACGGCATTCAGGCAAGGTTTAAAGGCTCATGCCCTTTTGATAAAGAATGGTTTGGTG
GATAGTTCGATTCTGAGGACTAGTTTGATTGATATGTACTTCAAATGTGGTAAAATTAAA
CTTGCACGCCTTATGTTTGAAGAAATTGTTGAGAGAGATGTTGTGGTGTGGGGGGCTATG
ATTGCAGGGTTTGGGCATAATAGGTTGCAGAGAGAAGCATTGGAGTATCTGAGGTGGATG
AGGAGAGAAGGGATATGTCCAAATTCTGTTATAATGACTACAATACTTCCAGTGATAGGG
GAAGTGGGTGCCTGGAAATTGGGGAGGGAGGTTCATGCTTATGTGGTCAAGACAAAGAGT
TATTCAAAGCAGGTGTTTATTCAGTCTGCATTGATTGATATGTATTGCAAGTGTGGGGAT
ATGGCTTCAGGGAGACAAGTGTTTTATGCCTCTACAGAGAGGAATGCTGTTTCCTGGACT
GCTTTGATGTCAGGTTATGTCTCAAATGGGAGGCTTGACCAGGCACTGAGATCGATAGCT
TGGATGCAGCAAGAAGGGTTCAGGCCTGATGTTGTCACAGTTGCCACTGTTCTCCCGGTT
TGTGCAGAGTTAAGGGCTTTGAGGCAGGGGAAGGAGATTCACAGTTATGCTGTGAAGAAT
GGGTTTCTGCCCAATGTATCTATAGCTACTTCTCTGATGGTTATGTACTCAAAGTGTGGA
AACTTGGATTACTCTTTTAAGCTCTTTGATGGAATGGACGCAAGGAATGTGATCTCATGG
ACAGCCATGATTGATTCATATGTGGAAAATGGGTGTCTACATGAGGCAGTTGGTGTGTTT
AGGTCTATGCAGTTGTCAAAGCACAGGCCAGACTCTGTTGCAATGGCGAGGATTTTGAGC
ATTTGTGGTGAACTTCGAGTTTTGAAGCTTGGGAAGGAGATTCATGGACAGATCTTGAAG
AAAGATTTTGAATCGATACCTTTTGTTTCTGCAGAAATAATTAAGATGTATGGAAAATTT
GGAGCAATCAGTAAAGCAAAGTTGGCATTTAAGGCCATCCCTGCCAAGGGTTCTATGGCA
TGGACTGCCATTATAGAAGCTTATGGATATAACGATTTGTATCAGGATGCAATTAATCTT
TTTCATCAGATGCAATCTGATGGTTTCATTCCAAATCATTACACTTTCAAAGCAGTTCTA
TCTATTTGTGAACGAGCTGAATTAGCAGATGATGCCTGCCTCATCTTCAATCTAATGTCC
CGAAGATATAGAATTAAGGCATCCAATGAACACTACTCTAGTATCATTGAACTTCTCAAC
CGTGTTGGTCGCACTGAAGACGCCCAAAGATTCATTCAAATGAGATCTGCCTCACCATAA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_18s0001g05930.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:18_random:4556533:4558751:-1 gene:VIT_18s0001g05930 transcript:VIT_18s0001g05930.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MSLPLHTKNPHAIFSDIQRFARQGKLKEALTILDYCDQQGIPVNPTTFSSLLRACVESKS
LTHGKQIHVHIRINGLENNEFLRTKLVHMYTSCGSLEDARGVFDGVSSKSVYTWNALLRG
NVISGRRHYREALSTYSEMRELGVELNVYSFSCMIKSFAGATAFRQGLKAHALLIKNGLV
DSSILRTSLIDMYFKCGKIKLARLMFEEIVERDVVVWGAMIAGFGHNRLQREALEYLRWM
RREGICPNSVIMTTILPVIGEVGAWKLGREVHAYVVKTKSYSKQVFIQSALIDMYCKCGD
MASGRQVFYASTERNAVSWTALMSGYVSNGRLDQALRSIAWMQQEGFRPDVVTVATVLPV
CAELRALRQGKEIHSYAVKNGFLPNVSIATSLMVMYSKCGNLDYSFKLFDGMDARNVISW
TAMIDSYVENGCLHEAVGVFRSMQLSKHRPDSVAMARILSICGELRVLKLGKEIHGQILK
KDFESIPFVSAEIIKMYGKFGAISKAKLAFKAIPAKGSMAWTAIIEAYGYNDLYQDAINL
FHQMQSDGFIPNHYTFKAVLSICERAELADDACLIFNLMSRRYRIKASNEHYSSIIELLN
RVGRTEDAQRFIQMRSASP

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_18s0001g05930.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:18_random:4556533:4558751:-1 gene:VIT_18s0001g05930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

GAAACCGTTCTCGGAAAAAGATGCATTTCCGATGTCCTTGCCACTACATACTAAGAACCC
ACATGCAATTTTCAGTGACATTCAGAGATTTGCCAGGCAGGGTAAGCTCAAAGAGGCTCT
CACCATCTTGGACTACTGTGACCAACAAGGTATCCCTGTTAACCCCACTACATTCTCCTC
CCTTCTCCGTGCCTGTGTTGAATCAAAGTCTTTGACACATGGTAAGCAAATTCATGTGCA
TATTAGAATAAATGGGCTTGAAAACAATGAATTTTTGCGAACAAAACTTGTTCACATGTA
CACATCTTGTGGTTCTTTGGAGGACGCTAGAGGGGTTTTTGATGGGGTTAGCTCTAAGAG
TGTGTATACTTGGAATGCATTGCTGAGAGGCAATGTGATTTCAGGTCGAAGACATTACAG
GGAGGCACTTTCGACTTATTCAGAAATGAGGGAATTGGGGGTTGAGTTGAATGTTTATAG
TTTTTCTTGTATGATCAAGAGCTTTGCCGGTGCCACGGCATTCAGGCAAGGTTTAAAGGC
TCATGCCCTTTTGATAAAGAATGGTTTGGTGGATAGTTCGATTCTGAGGACTAGTTTGAT
TGATATGTACTTCAAATGTGGTAAAATTAAACTTGCACGCCTTATGTTTGAAGAAATTGT
TGAGAGAGATGTTGTGGTGTGGGGGGCTATGATTGCAGGGTTTGGGCATAATAGGTTGCA
GAGAGAAGCATTGGAGTATCTGAGGTGGATGAGGAGAGAAGGGATATGTCCAAATTCTGT
TATAATGACTACAATACTTCCAGTGATAGGGGAAGTGGGTGCCTGGAAATTGGGGAGGGA
GGTTCATGCTTATGTGGTCAAGACAAAGAGTTATTCAAAGCAGGTGTTTATTCAGTCTGC
ATTGATTGATATGTATTGCAAGTGTGGGGATATGGCTTCAGGGAGACAAGTGTTTTATGC
CTCTACAGAGAGGAATGCTGTTTCCTGGACTGCTTTGATGTCAGGTTATGTCTCAAATGG
GAGGCTTGACCAGGCACTGAGATCGATAGCTTGGATGCAGCAAGAAGGGTTCAGGCCTGA
TGTTGTCACAGTTGCCACTGTTCTCCCGGTTTGTGCAGAGTTAAGGGCTTTGAGGCAGGG
GAAGGAGATTCACAGTTATGCTGTGAAGAATGGGTTTCTGCCCAATGTATCTATAGCTAC
TTCTCTGATGGTTATGTACTCAAAGTGTGGAAACTTGGATTACTCTTTTAAGCTCTTTGA
TGGAATGGACGCAAGGAATGTGATCTCATGGACAGCCATGATTGATTCATATGTGGAAAA
TGGGTGTCTACATGAGGCAGTTGGTGTGTTTAGGTCTATGCAGTTGTCAAAGCACAGGCC
AGACTCTGTTGCAATGGCGAGGATTTTGAGCATTTGTGGTGAACTTCGAGTTTTGAAGCT
TGGGAAGGAGATTCATGGACAGATCTTGAAGAAAGATTTTGAATCGATACCTTTTGTTTC
TGCAGAAATAATTAAGATGTATGGAAAATTTGGAGCAATCAGTAAAGCAAAGTTGGCATT
TAAGGCCATCCCTGCCAAGGGTTCTATGGCATGGACTGCCATTATAGAAGCTTATGGATA
TAACGATTTGTATCAGGATGCAATTAATCTTTTTCATCAGATGCAATCTGATGGTTTCAT
TCCAAATCATTACACTTTCAAAGCAGTTCTATCTATTTGTGAACGAGCTGAATTAGCAGA
TGATGCCTGCCTCATCTTCAATCTAATGTCCCGAAGATATAGAATTAAGGCATCCAATGA
ACACTACTCTAGTATCATTGAACTTCTCAACCGTGTTGGTCGCACTGAAGACGCCCAAAG
ATTCATTCAAATGAGATCTGCCTCACCATAACAAAAAGAGGAAATGGAGTATGCTAATTG
CATGTTTACTTTCACTAAGTGAGCTCTTGGAACCTCCTTAGGGATCACAGATACTGATTC
ATCTGCCAGTCCAAAGATATATTTTAACTTTTTTATACACTGTAATTTTCTAGAAATTCT
TTAAAATATGGTAGGGTATTCTTGAAAGATCCTGTTTTGAGATTTCATATAATTTGTGCA
GGTACTTTATAGTGTTTCAAGTTATTACTTATTAGAATTTGTCTGTATGGGGTTTCCTAG
AGTAGCCCTGTACTTGCACATGATTTTTTTCATTTGTATGATAGATTTCCTGGTTCTGC