Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_18s0001g04590.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:18:3906073:3907918:1 gene:VIT_18s0001g04590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCTCGCACCGCAAATTACTCTCTTTCAACCGCCTTCCCTGTTCACCATTCGAAGGTCT CAATCACCGGAGCCGAGAAAGAACTCGAAAACATGGAAGAGTAACTGCAAAAGTCCCACA AATTTTCTTTGCTTTTCTTTGAAAACTTCTTCTTCCACGACCGAATTTTCTAATTCTTGC AAGTTTTTGAGCTCCCATAAAAATCCAGATGCCGGTTTTTTAAATGTTCAACCAATTGTT GGACATGTCAATGCCAATTTGCTCGCGTTTTGGCTTCAGTCGTGTTGTACAGTAAGAGAA GTTAGAAGGGTACATGCAGTTGTTTTCAAGTGTCTGGATAACTCTGTGACATATGTCAAT AATAATTTGATTAGTGCTTATTCGAGATTCGGGAAGTTAGTGGAGGCTCGCAAGGTGTTT GACAAAATGCCGGAGCGAAATGTTGTTTCTTGGACTGCTGTTGTTAATGGGTATTCGAGA TATGGTTTTGATGATGAAGCATTGAGGTTATTCGATGATTGTATTGAGAATGGCGTTCGA GCAAACGGTAAGACTTTTGTTTGTGTTCTGAATTTGTGTAGTAAGAGATTGGATTTTGAG CTTGGAAGGCAAATTCATGCTTGTATTGTGAAAGATAACTGGAGGAACTTGATTGTTGAT AGTGCTCTTGTTTGCTTCTATGCACAATGTGGTGATCTGTCTGGGGCTTTTCATGCGTTT GATCAAATGCCTGAGCGGGATGTAGTTTGCTGGACAACCATGATTACTGCTTGCTCCCAA CAAGGGCGTGGAACAGAGGCTTTGTCTATGTTCTCACAAATGATGTTCAACACATCTTCT CCTAATGAGTTTACAGTGTGTAGCGTTTTGAAGGCTTGTGGAGAGGAGAAGGCTTTAGAA TTTGGAAAGCAGTTACATGGTGCCATAATTAAGAAGATGTTTAAGGAAGATGTTTTCATA GGGACTTCCTTAGTGGGCATGTATGCAAAGTGTGGGGAAATATTAGATTCAAGAAAAGTG TTTGATGGAATGAAGAAGAGAAACACGGTTACGTGGACTTCTATCATAGCTGGATATGCT CGTAATGGGCAGGGGGAGGAGGCCATTAGCCTCTTTCGAGTGATGAAAAGACGGAAGATA TTTGCTAACAACTTGACTGTCGTAAGCATCCTCAGAGCATGTGGCTCAACTAGGAATTTA CTGATGGGAAAGGAAGTTCATGCACAGATCATGAAGAATTCCATGCAAAGCAACATCTAC ATAGGAAGCACTCTAGTATGGTTCTACTGCAAATGTGAAGAGCACCCTTTTGCCTCGAAG GTCCTCCAAAACATGCCTCTTAGAGACGTGGTCTCATGGACTGCTATAATTTCTGGTTAT ACCAGTCTTGGGCATGAACCTGAGGCTCTTGAATTCTTGAAAGAAATGTTGGAGGAAGGT GTGGAGCCAAACCCTTTCACTTATTCATCGGCTTTGAAAGCATGTGCTCACTTAGAAGCT ATTCTGCAAGGGAAATTGATTCACTCTTCTGTGAACAAAACACTTGCGCTGTCCAATGTT TTTGTGGGTAGTGCTTTAATTAATATGTATGCAAAATGTGGATATGTTTCTGAGGCAATC CAGGTTTTTGATAGCATGCCACAACGGAATTTGGTTTCTTGGAAGGCAATGATTGTGGGT TATGCGAGGAATGGGCTCTGCGGAGAAGCTTTGAAGCTCATGTACCGTATGCAAGCAGAA GGTATCGAGGTGGATGATTATATCCTTACGACAGTCCTTAGTGCATGTGGAGATGTTGAG TGGAATATGGAGTCTTCATCTGACCATTGCTTGCAGTCAAGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_18s0001g04590.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:18:3906073:3907918:1 gene:VIT_18s0001g04590 transcript:VIT_18s0001g04590.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MLAPQITLFQPPSLFTIRRSQSPEPRKNSKTWKSNCKSPTNFLCFSLKTSSSTTEFSNSC KFLSSHKNPDAGFLNVQPIVGHVNANLLAFWLQSCCTVREVRRVHAVVFKCLDNSVTYVN NNLISAYSRFGKLVEARKVFDKMPERNVVSWTAVVNGYSRYGFDDEALRLFDDCIENGVR ANGKTFVCVLNLCSKRLDFELGRQIHACIVKDNWRNLIVDSALVCFYAQCGDLSGAFHAF DQMPERDVVCWTTMITACSQQGRGTEALSMFSQMMFNTSSPNEFTVCSVLKACGEEKALE FGKQLHGAIIKKMFKEDVFIGTSLVGMYAKCGEILDSRKVFDGMKKRNTVTWTSIIAGYA RNGQGEEAISLFRVMKRRKIFANNLTVVSILRACGSTRNLLMGKEVHAQIMKNSMQSNIY IGSTLVWFYCKCEEHPFASKVLQNMPLRDVVSWTAIISGYTSLGHEPEALEFLKEMLEEG VEPNPFTYSSALKACAHLEAILQGKLIHSSVNKTLALSNVFVGSALINMYAKCGYVSEAI QVFDSMPQRNLVSWKAMIVGYARNGLCGEALKLMYRMQAEGIEVDDYILTTVLSACGDVE WNMESSSDHCLQSS

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_18s0001g04590.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:18:3906073:3907918:1 gene:VIT_18s0001g04590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCTCGCACCGCAAATTACTCTCTTTCAACCGCCTTCCCTGTTCACCATTCGAAGGTCT CAATCACCGGAGCCGAGAAAGAACTCGAAAACATGGAAGAGTAACTGCAAAAGTCCCACA AATTTTCTTTGCTTTTCTTTGAAAACTTCTTCTTCCACGACCGAATTTTCTAATTCTTGC AAGTTTTTGAGCTCCCATAAAAATCCAGATGCCGGTTTTTTAAATGTTCAACCAATTGTT GGACATGTCAATGCCAATTTGCTCGCGTTTTGGCTTCAGTCGTGTTGTACAGTAAGAGAA GTTAGAAGGGTACATGCAGTTGTTTTCAAGTGTCTGGATAACTCTGTGACATATGTCAAT AATAATTTGATTAGTGCTTATTCGAGATTCGGGAAGTTAGTGGAGGCTCGCAAGGTGTTT GACAAAATGCCGGAGCGAAATGTTGTTTCTTGGACTGCTGTTGTTAATGGGTATTCGAGA TATGGTTTTGATGATGAAGCATTGAGGTTATTCGATGATTGTATTGAGAATGGCGTTCGA GCAAACGGTAAGACTTTTGTTTGTGTTCTGAATTTGTGTAGTAAGAGATTGGATTTTGAG CTTGGAAGGCAAATTCATGCTTGTATTGTGAAAGATAACTGGAGGAACTTGATTGTTGAT AGTGCTCTTGTTTGCTTCTATGCACAATGTGGTGATCTGTCTGGGGCTTTTCATGCGTTT GATCAAATGCCTGAGCGGGATGTAGTTTGCTGGACAACCATGATTACTGCTTGCTCCCAA CAAGGGCGTGGAACAGAGGCTTTGTCTATGTTCTCACAAATGATGTTCAACACATCTTCT CCTAATGAGTTTACAGTGTGTAGCGTTTTGAAGGCTTGTGGAGAGGAGAAGGCTTTAGAA TTTGGAAAGCAGTTACATGGTGCCATAATTAAGAAGATGTTTAAGGAAGATGTTTTCATA GGGACTTCCTTAGTGGGCATGTATGCAAAGTGTGGGGAAATATTAGATTCAAGAAAAGTG TTTGATGGAATGAAGAAGAGAAACACGGTTACGTGGACTTCTATCATAGCTGGATATGCT CGTAATGGGCAGGGGGAGGAGGCCATTAGCCTCTTTCGAGTGATGAAAAGACGGAAGATA TTTGCTAACAACTTGACTGTCGTAAGCATCCTCAGAGCATGTGGCTCAACTAGGAATTTA CTGATGGGAAAGGAAGTTCATGCACAGATCATGAAGAATTCCATGCAAAGCAACATCTAC ATAGGAAGCACTCTAGTATGGTTCTACTGCAAATGTGAAGAGCACCCTTTTGCCTCGAAG GTCCTCCAAAACATGCCTCTTAGAGACGTGGTCTCATGGACTGCTATAATTTCTGGTTAT ACCAGTCTTGGGCATGAACCTGAGGCTCTTGAATTCTTGAAAGAAATGTTGGAGGAAGGT GTGGAGCCAAACCCTTTCACTTATTCATCGGCTTTGAAAGCATGTGCTCACTTAGAAGCT ATTCTGCAAGGGAAATTGATTCACTCTTCTGTGAACAAAACACTTGCGCTGTCCAATGTT TTTGTGGGTAGTGCTTTAATTAATATGTATGCAAAATGTGGATATGTTTCTGAGGCAATC CAGGTTTTTGATAGCATGCCACAACGGAATTTGGTTTCTTGGAAGGCAATGATTGTGGGT TATGCGAGGAATGGGCTCTGCGGAGAAGCTTTGAAGCTCATGTACCGTATGCAAGCAGAA GGTATCGAGGTGGATGATTATATCCTTACGACAGTCCTTAGTGCATGTGGAGATGTTGAG TGGAATATGGAGTCTTCATCTGACCATTGCTTGCAGTCAAGTTGAT