Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_18s0001g04270.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:18:3791368:3794765:-1 gene:VIT_18s0001g04270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAAATTCTACACAGTGGTTCTCTTCCTCCTCATCCTTTTCCTTCGAGTCCCTTTCCC GACACTTGTTTCCTTCACCTATCACCACATAACCGCAACTTCTTCCCATTGCCCAAATCT AAATTTCGAGTTTCTACGCCTAGGATTATTGGTTTCAAACACTCAACTGTCTCAAATCAC ATACACCCACAAACCCTTCTCCCTTCATTTGTTGATACTCTGACCAATTCTTCTCCTACT GAGATTGGTGACTCTATTTCTCTACTGAACCGATGCAGCACACTGTCTGAATTCCGGCAA ATCCATGGCCGGATTGTGAAATTAAATGCTTTAAAATGGAAGAGTTCTATTGGAAATAAG CTGGTAGTACTCTATTGCAAGAATCAGTGGTCGCTGGAAGATGCTCGAAAGTTGCTTGAT GAAATTCCCAACAGAACAGTACCTGCTTATGCTGCATTGATCAGATCATATTGTCGGTCT GAACAGTGGGATGAACTTTTTTCCTTGTTTCGGTTGATGGTTTATGAGGGGATGCTCCCT GATAAATATCTTGTGCCCACGATTCTAAAAGCATGCTCAGCTATGCTGTTATTGAGGATT GGTAAAATGGTTCATGGGTTTGTGATAAGGAAGAGTGTAGAGTCAGATGTTTTTGTTGGG AATGCACTCATTCACTTTTATTCAAATTGTGGGGATTTGGGATCTTCAAGAAGTGTTTTT CACTCCATGCAGGAAAGAGATGTAGTTTCATGGACTGCCCTAATTTCTGCTTACATGGAG GAAGGTCTTCTGGATGAGGCAAAACATATTTTTCATTTGATGCAGTTGGATGGAGTTAAG CCTGATTTAATTTCTTGGAGTGCACTTTTATCGGGCTTTGCTCGGAATGGAGAGATTGAT TTGGCTCTTGAAACTTTGGAGGAAATGCCAGAGAGGGGGCTGCAGCCAACCGTTAATTCT TGGAATGGGATTATCTCAGGTTGTGTTCAAAATGGATATCTGGAAGATGCTTTGGATATG TTTTCTAGGATGCTATGGTATCCCGAGGATCCAAACATCATAACGATTGCAAGCATCTTA CCAGCTTGTACAGGTTTGAAAGCTTTGCGTTTAGGAAAGGCAATTCATGCAATTGCCCTT AAACATGGAATTGTTGGGAATGTTTATGTGGAGGGATCGGTAATTGATATGTATTCAAAA TGTGGGAGCTATGATTATGCAGAGAAGGTTTTTGTTAAGGCAGAGAACAAAAATACAGCC ATGTGGAACGAGATGATTGCAGCTTATGTAAATGAGGGAAAGGTGGAGGATGCATTAGGC CTTCTTAGATCAATGCAAAAGGATGGATGGAAACCTGATGTAATTACCTACAACACTATA CTTTCTGGGCATGCAAGAAATGGGCTTAAGACACAGGCATTTGAGTTATTGTCTGAGATG GTCCAGATGGGTTTAAAGCCAAATGTCGTTTCGTTTAACGTCCTAATATCTGGTTTTCAA CAATCTGGGCTAAGTTACGAAGCTTTGAAGGTGTTCCGGATCATGCAATCACCTTCTGAT GGTTGCAATCCTAATGAAGTTCTAAATTTGTCAATGAGACCTAACCCCATCACTATTACT GGTGCTCTTCCAGCTTGTGCTGACTTAAACTTATGGTGCCAAGGGAAAGAAATCCATGGA TACACTTTGAGGAATGGTTTTGAGCCCAATATCTTTGTTTCAAGTGCATTGGTTGACATG TATGCAAAGTGCCATGACATGGATTCAGCAAATAAGGTATTCTTCAGAATTGACGGTAGA AACACAGTTTCCTGGAATGCTTTAATGGCGGGCTATATTTACAATAAGCAGCCAGAAGAG GCTCTTAAACTCTTTCTTGAAATGTTGGGAGAAGGCCTTCAGCCTAGCTCAATTACCTTC ATGATACTTTTCCCTGCTTGTGGTGATATAGCAGCCATAAGGTTTGGGCGAGGATTACAT GGCTATGCTGCTAAGTGTCAATTGGACGAGTTGAAAAATGCCATTGCAAGTGCTTTAATA GACATGTATGCAAAGTGTGGTAGCATTTTGGATGCGAAATCAGTGTTTGACTCTGAAGTT GAAAAAGATGTGCCTCTATGGAATGCCATGATCTCTGCCTTTTCAGTTCATGGGATGGCC AGGAATGCTTTTGCCGTGTTTGTACAAATGGAATTATTGGGAATTCTACCTGACCATATT ACCTTTGTTTCACTTCTTTCAGCTTGTGCTCGAGATGGGTTGGTAGAGGAAGGGTGGAAA TATTTCAATTCAATGGAGATATCCTATGGGGTTGCTGCTACTTTGGAACACTATACATGC ATGGTTGGCATTTTAGGTGGTGCCGGTTTACTAGATGAGGCTCTTGACTTCATTAGACAA ATGCCATATCCTCCTGATGCTTGTATGTGGGCTACTCTTTTACAAGCTTGCAGAGTTCAT TCAAATCCAGAAATAGGTGAAAGAGCTGCAAAAGCTCTTTTTGAGCTTGAACCAGATAAT GCTACTAACTATATGCTCCTGTCCAATATCTATGTCTCATCAGGGATGTGGGACTTCGCA AAGAACTTGAGGAGTTTTATGAGGGGCCGTAAGTTGTTAACTATAAAGGAGTGCAGCTAT TTAACCGTTGGTTCACATATATGCACATTTAAAGGGGGAGAAAGCTCTCATCCAGAGTTG GAGGAAATTCTAGAGGCATGGGACAAATTGGCCAGGAAAATGGAGCTTTCTGGGTATTTT CCTCTTGATCCTGTTTTTGATGATGAAGAAAAAGAGCTGGATCCATTCTCTTGCCTACAC ACTGAAAAGTTGGCTATATGTTTTGGCATCATCTCATCAAATACTTACCGTCCCGTCCAT GTCTCAAAGAATATAAGGATGTGTATCGACTGTCATACATCAGCTAAACTCATATCTAAA ATTGATGGAAGGGAAATCTTTGTGAAGGATGTGTGCTTTTATCACCATATGAAGGACGGG ATATGCAGCTGCCAGGATAGGTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_18s0001g04270.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:18:3791368:3794765:-1 gene:VIT_18s0001g04270 transcript:VIT_18s0001g04270.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MEILHSGSLPPHPFPSSPFPDTCFLHLSPHNRNFFPLPKSKFRVSTPRIIGFKHSTVSNH IHPQTLLPSFVDTLTNSSPTEIGDSISLLNRCSTLSEFRQIHGRIVKLNALKWKSSIGNK LVVLYCKNQWSLEDARKLLDEIPNRTVPAYAALIRSYCRSEQWDELFSLFRLMVYEGMLP DKYLVPTILKACSAMLLLRIGKMVHGFVIRKSVESDVFVGNALIHFYSNCGDLGSSRSVF HSMQERDVVSWTALISAYMEEGLLDEAKHIFHLMQLDGVKPDLISWSALLSGFARNGEID LALETLEEMPERGLQPTVNSWNGIISGCVQNGYLEDALDMFSRMLWYPEDPNIITIASIL PACTGLKALRLGKAIHAIALKHGIVGNVYVEGSVIDMYSKCGSYDYAEKVFVKAENKNTA MWNEMIAAYVNEGKVEDALGLLRSMQKDGWKPDVITYNTILSGHARNGLKTQAFELLSEM VQMGLKPNVVSFNVLISGFQQSGLSYEALKVFRIMQSPSDGCNPNEVLNLSMRPNPITIT GALPACADLNLWCQGKEIHGYTLRNGFEPNIFVSSALVDMYAKCHDMDSANKVFFRIDGR NTVSWNALMAGYIYNKQPEEALKLFLEMLGEGLQPSSITFMILFPACGDIAAIRFGRGLH GYAAKCQLDELKNAIASALIDMYAKCGSILDAKSVFDSEVEKDVPLWNAMISAFSVHGMA RNAFAVFVQMELLGILPDHITFVSLLSACARDGLVEEGWKYFNSMEISYGVAATLEHYTC MVGILGGAGLLDEALDFIRQMPYPPDACMWATLLQACRVHSNPEIGERAAKALFELEPDN ATNYMLLSNIYVSSGMWDFAKNLRSFMRGRKLLTIKECSYLTVGSHICTFKGGESSHPEL EEILEAWDKLARKMELSGYFPLDPVFDDEEKELDPFSCLHTEKLAICFGIISSNTYRPVH VSKNIRMCIDCHTSAKLISKIDGREIFVKDVCFYHHMKDGICSCQDRW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_18s0001g04270.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:18:3791368:3794765:-1 gene:VIT_18s0001g04270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAAATTCTACACAGTGGTTCTCTTCCTCCTCATCCTTTTCCTTCGAGTCCCTTTCCC GACACTTGTTTCCTTCACCTATCACCACATAACCGCAACTTCTTCCCATTGCCCAAATCT AAATTTCGAGTTTCTACGCCTAGGATTATTGGTTTCAAACACTCAACTGTCTCAAATCAC ATACACCCACAAACCCTTCTCCCTTCATTTGTTGATACTCTGACCAATTCTTCTCCTACT GAGATTGGTGACTCTATTTCTCTACTGAACCGATGCAGCACACTGTCTGAATTCCGGCAA ATCCATGGCCGGATTGTGAAATTAAATGCTTTAAAATGGAAGAGTTCTATTGGAAATAAG CTGGTAGTACTCTATTGCAAGAATCAGTGGTCGCTGGAAGATGCTCGAAAGTTGCTTGAT GAAATTCCCAACAGAACAGTACCTGCTTATGCTGCATTGATCAGATCATATTGTCGGTCT GAACAGTGGGATGAACTTTTTTCCTTGTTTCGGTTGATGGTTTATGAGGGGATGCTCCCT GATAAATATCTTGTGCCCACGATTCTAAAAGCATGCTCAGCTATGCTGTTATTGAGGATT GGTAAAATGGTTCATGGGTTTGTGATAAGGAAGAGTGTAGAGTCAGATGTTTTTGTTGGG AATGCACTCATTCACTTTTATTCAAATTGTGGGGATTTGGGATCTTCAAGAAGTGTTTTT CACTCCATGCAGGAAAGAGATGTAGTTTCATGGACTGCCCTAATTTCTGCTTACATGGAG GAAGGTCTTCTGGATGAGGCAAAACATATTTTTCATTTGATGCAGTTGGATGGAGTTAAG CCTGATTTAATTTCTTGGAGTGCACTTTTATCGGGCTTTGCTCGGAATGGAGAGATTGAT TTGGCTCTTGAAACTTTGGAGGAAATGCCAGAGAGGGGGCTGCAGCCAACCGTTAATTCT TGGAATGGGATTATCTCAGGTTGTGTTCAAAATGGATATCTGGAAGATGCTTTGGATATG TTTTCTAGGATGCTATGGTATCCCGAGGATCCAAACATCATAACGATTGCAAGCATCTTA CCAGCTTGTACAGGTTTGAAAGCTTTGCGTTTAGGAAAGGCAATTCATGCAATTGCCCTT AAACATGGAATTGTTGGGAATGTTTATGTGGAGGGATCGGTAATTGATATGTATTCAAAA TGTGGGAGCTATGATTATGCAGAGAAGGTTTTTGTTAAGGCAGAGAACAAAAATACAGCC ATGTGGAACGAGATGATTGCAGCTTATGTAAATGAGGGAAAGGTGGAGGATGCATTAGGC CTTCTTAGATCAATGCAAAAGGATGGATGGAAACCTGATGTAATTACCTACAACACTATA CTTTCTGGGCATGCAAGAAATGGGCTTAAGACACAGGCATTTGAGTTATTGTCTGAGATG GTCCAGATGGGTTTAAAGCCAAATGTCGTTTCGTTTAACGTCCTAATATCTGGTTTTCAA CAATCTGGGCTAAGTTACGAAGCTTTGAAGGTGTTCCGGATCATGCAATCACCTTCTGAT GGTTGCAATCCTAATGAAGTTCTAAATTTGTCAATGAGACCTAACCCCATCACTATTACT GGTGCTCTTCCAGCTTGTGCTGACTTAAACTTATGGTGCCAAGGGAAAGAAATCCATGGA TACACTTTGAGGAATGGTTTTGAGCCCAATATCTTTGTTTCAAGTGCATTGGTTGACATG TATGCAAAGTGCCATGACATGGATTCAGCAAATAAGGTATTCTTCAGAATTGACGGTAGA AACACAGTTTCCTGGAATGCTTTAATGGCGGGCTATATTTACAATAAGCAGCCAGAAGAG GCTCTTAAACTCTTTCTTGAAATGTTGGGAGAAGGCCTTCAGCCTAGCTCAATTACCTTC ATGATACTTTTCCCTGCTTGTGGTGATATAGCAGCCATAAGGTTTGGGCGAGGATTACAT GGCTATGCTGCTAAGTGTCAATTGGACGAGTTGAAAAATGCCATTGCAAGTGCTTTAATA GACATGTATGCAAAGTGTGGTAGCATTTTGGATGCGAAATCAGTGTTTGACTCTGAAGTT GAAAAAGATGTGCCTCTATGGAATGCCATGATCTCTGCCTTTTCAGTTCATGGGATGGCC AGGAATGCTTTTGCCGTGTTTGTACAAATGGAATTATTGGGAATTCTACCTGACCATATT ACCTTTGTTTCACTTCTTTCAGCTTGTGCTCGAGATGGGTTGGTAGAGGAAGGGTGGAAA TATTTCAATTCAATGGAGATATCCTATGGGGTTGCTGCTACTTTGGAACACTATACATGC ATGGTTGGCATTTTAGGTGGTGCCGGTTTACTAGATGAGGCTCTTGACTTCATTAGACAA ATGCCATATCCTCCTGATGCTTGTATGTGGGCTACTCTTTTACAAGCTTGCAGAGTTCAT TCAAATCCAGAAATAGGTGAAAGAGCTGCAAAAGCTCTTTTTGAGCTTGAACCAGATAAT GCTACTAACTATATGCTCCTGTCCAATATCTATGTCTCATCAGGGATGTGGGACTTCGCA AAGAACTTGAGGAGTTTTATGAGGGGCCGTAAGTTGTTAACTATAAAGGAGTGCAGCTAT TTAACCGTTGGTTCACATATATGCACATTTAAAGGGGGAGAAAGCTCTCATCCAGAGTTG GAGGAAATTCTAGAGGCATGGGACAAATTGGCCAGGAAAATGGAGCTTTCTGGGTATTTT CCTCTTGATCCTGTTTTTGATGATGAAGAAAAAGAGCTGGATCCATTCTCTTGCCTACAC ACTGAAAAGTTGGCTATATGTTTTGGCATCATCTCATCAAATACTTACCGTCCCGTCCAT GTCTCAAAGAATATAAGGATGTGTATCGACTGTCATACATCAGCTAAACTCATATCTAAA ATTGATGGAAGGGAAATCTTTGTGAAGGATGTGTGCTTTTATCACCATATGAAGGACGGG ATATGCAGCTGCCAGGATAGGTGGTGACTCAAGACTGATCAAATTTGGTGTGCACCCTAA TTTTTTTGTTTGTGACTGGAGATCAATGAAGATAGATGACCCTGTTCAAAGGGAAGCTGA CAGCATACAGTTAATAGGAAGAAAGTCAACTTGGTAGAAAGAGAACTGAATATTGGTTAG GTGCGCAAAGGTGTGTGCTCAGAGCCTTCTTGTTTTAATCATCTGTAGACATTTATTTAG ATGTATATAATATCATTTCACTCCCCAATACTTGGGATAAGCCTCTCTTGAATTCAAGTT TGTCAAATGAGTATAGTAAACATCATCCCCATCTTTGAACTAGGGTGAATATTTACAGAT ATGAAAGCAAATTTCACTTCATGACAGATCTATAAATT