Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_18s0001g00570.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:18:1431364:1433524:1 gene:VIT_18s0001g00570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACTCTACCTTCAAATCGCTCATTCTTTACAGCACTTCTGCAATACACCCACAACAGA AGTCTCCAAAAGGGCAAGGCCCTCCACGCCCAAATCATCAAATCCAGTTCTTCCTGCGTT TACATCGCTAACAGCCTTGTCAACTTGTACGCCAAGTGCCAACGCTTACGCGAAGCCAAG TTTGTTTTCGAGCGTATACAAAACAAGGACGTCGTCTCATGGAACTGCATCATCAATGGC TACTCTCAACATGGCCCCAGTGGCTCTTCCCATGTCATGGAACTCTTCCAGCGGATGAGG GCCGAGAACACTGCCCCGAATGCCCATACTTTTGCTGGCGTTTTCACCGCCGCCTCCACC TTGGTGGACGCAGCCGGTGGCAGACTAGCTCACGCGGTGGCAATAAAAATGGATAGTTGT CGTGACGTATTTGTGGGTAGTTCTTTGATGAATATGTATTGTAAGGCTGGTCTTACCCCG GAGGCTCGCAAGGTGTTTGATACAATGCCGGAGAGGAATTCGGTTTCTTGGGCGACGATG ATTTCTGGGTATGCATCACAGAAGCTTGCTGCTGAAGCATTGGGGCTGTTTAGGTTGATG AGGAGGGAAGAGGAGGGCGAGAATGAGTTTGTGTTCACTAGCGTTCTTAGTGCATTGACG CTGCCTGAGTTGGTCAATAATGGTAAGCAAATTCATTGTATTGCGGTTAAAAATGGGCTG TTGTCGATTGTGTCCGTTGGGAATGCTCTCGTTACAATGTATGCAAAATGTGGGAGTTTG GATGATGCACTTCAAACGTTCGAGACGTCAAGTGATAAGAATTCTATTACATGGTCAGCG ATGATCACTGGTTATGCACAATCTGGGGATTCTGACAAGGCCTTGAAGCTGTTTTCAAGT ATGCATCTTTCGGGAATTAGGCCTAGTGAGTTCACATTCGTTGGGGTTATTAATGCTTGC AGTGATCTTGGTGCTGCTTGGGAAGGAAAGCAAGTGCATGATTATTTGCTGAAGCTTGGA TTTGAATCCCAAATATATGTAATGACAGCTCTTGTTGATATGTACGCGAAATGCAGCAGC ATAGTTGATGCTAGGAAGGGTTTTGATTATTTGCAAGAGCCTGATATTGTTTTGTGGACT TCCATGATTGGAGGGTATGTACAAAATGGTGAGAATGAAGACGCTCTGAGTTTATATGGT AGAATGGAGATGGAGGGTATTTTGCCCAATGAGCTAACTATGGCTAGTGTTCTAAAAGCC TGTTCAAGCCTTGCTGCCTTGGAACAAGGAAAGCAAATTCATGCCCGTACTGTTAAGTAT GGATTTGGTCTAGAAGTTCCAATTGGAAGTGCTCTTTCGACCATGTATGCCAAGTGTGGG TGTCTCAAAGATGGCACGCTTGTCTTTAGGAGGATGCCTGCAAGGGATGTAATATCATGG AATGCAATGATATCTGGGCTCTCCCAAAATGGATGTGGTAAGGAAGCTCTAGAACTCTTC GAGGAGATGCAATTAGAGGGCACAAAGCCAGACTATGTTACCTTTGTTAACATTCTCTCT GCGTGTAGCCACATGGGATTGGTGGAAAGAGGATGGGGTTATTTCAGGATGATGTTTGAT GAATTTGGTATGGACCCCAGAGTAGAGCACTATGCTTGCATGGTTGATATTCTGAGCCGT GCAGGAAAGCTCAAAGAAGCAATAGAGTTCACTGAATCGGCTACCATTGATCATGGAATG TGTTTGTGGCGTATTATATTAGGTGCTTGTCGGAACTACCGTAATTATGAGTTGGGAGCC TATGCAGGGGAGAAACTGATGGAGTTGGGCTCCCAAGAGTCATCTGCTTATGTGTTGCTG TCTAGTATCTATTCTGCCTTGGGCAGGTGGGAAGATGTGGAAAGGGTCAGGAGGATGATG AAACTCCGGGGAGTGAGTAAGGAGCCTGGTTGTAGCTGGATTGAGCTCAAGAGTGGGGTT CATGTTTTTGTTGTCAAAGACCAGATGCATCCACAGATTGGAGATATACATGTTGAGCTA CGACAGTTAAGCAAACAAATGAAGGATGAAGGTTATGAACCTGCCACTGATTCATTTTCT GCTGCTTTATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_18s0001g00570.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:18:1431364:1433524:1 gene:VIT_18s0001g00570 transcript:VIT_18s0001g00570.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MTLPSNRSFFTALLQYTHNRSLQKGKALHAQIIKSSSSCVYIANSLVNLYAKCQRLREAK FVFERIQNKDVVSWNCIINGYSQHGPSGSSHVMELFQRMRAENTAPNAHTFAGVFTAAST LVDAAGGRLAHAVAIKMDSCRDVFVGSSLMNMYCKAGLTPEARKVFDTMPERNSVSWATM ISGYASQKLAAEALGLFRLMRREEEGENEFVFTSVLSALTLPELVNNGKQIHCIAVKNGL LSIVSVGNALVTMYAKCGSLDDALQTFETSSDKNSITWSAMITGYAQSGDSDKALKLFSS MHLSGIRPSEFTFVGVINACSDLGAAWEGKQVHDYLLKLGFESQIYVMTALVDMYAKCSS IVDARKGFDYLQEPDIVLWTSMIGGYVQNGENEDALSLYGRMEMEGILPNELTMASVLKA CSSLAALEQGKQIHARTVKYGFGLEVPIGSALSTMYAKCGCLKDGTLVFRRMPARDVISW NAMISGLSQNGCGKEALELFEEMQLEGTKPDYVTFVNILSACSHMGLVERGWGYFRMMFD EFGMDPRVEHYACMVDILSRAGKLKEAIEFTESATIDHGMCLWRIILGACRNYRNYELGA YAGEKLMELGSQESSAYVLLSSIYSALGRWEDVERVRRMMKLRGVSKEPGCSWIELKSGV HVFVVKDQMHPQIGDIHVELRQLSKQMKDEGYEPATDSFSAAL

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_18s0001g00570.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:18:1431364:1433524:1 gene:VIT_18s0001g00570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGACTCTACCTTCAAATCGCTCATTCTTTACAGCACTTCTGCAATACACCCACAACAGA AGTCTCCAAAAGGGCAAGGCCCTCCACGCCCAAATCATCAAATCCAGTTCTTCCTGCGTT TACATCGCTAACAGCCTTGTCAACTTGTACGCCAAGTGCCAACGCTTACGCGAAGCCAAG TTTGTTTTCGAGCGTATACAAAACAAGGACGTCGTCTCATGGAACTGCATCATCAATGGC TACTCTCAACATGGCCCCAGTGGCTCTTCCCATGTCATGGAACTCTTCCAGCGGATGAGG GCCGAGAACACTGCCCCGAATGCCCATACTTTTGCTGGCGTTTTCACCGCCGCCTCCACC TTGGTGGACGCAGCCGGTGGCAGACTAGCTCACGCGGTGGCAATAAAAATGGATAGTTGT CGTGACGTATTTGTGGGTAGTTCTTTGATGAATATGTATTGTAAGGCTGGTCTTACCCCG GAGGCTCGCAAGGTGTTTGATACAATGCCGGAGAGGAATTCGGTTTCTTGGGCGACGATG ATTTCTGGGTATGCATCACAGAAGCTTGCTGCTGAAGCATTGGGGCTGTTTAGGTTGATG AGGAGGGAAGAGGAGGGCGAGAATGAGTTTGTGTTCACTAGCGTTCTTAGTGCATTGACG CTGCCTGAGTTGGTCAATAATGGTAAGCAAATTCATTGTATTGCGGTTAAAAATGGGCTG TTGTCGATTGTGTCCGTTGGGAATGCTCTCGTTACAATGTATGCAAAATGTGGGAGTTTG GATGATGCACTTCAAACGTTCGAGACGTCAAGTGATAAGAATTCTATTACATGGTCAGCG ATGATCACTGGTTATGCACAATCTGGGGATTCTGACAAGGCCTTGAAGCTGTTTTCAAGT ATGCATCTTTCGGGAATTAGGCCTAGTGAGTTCACATTCGTTGGGGTTATTAATGCTTGC AGTGATCTTGGTGCTGCTTGGGAAGGAAAGCAAGTGCATGATTATTTGCTGAAGCTTGGA TTTGAATCCCAAATATATGTAATGACAGCTCTTGTTGATATGTACGCGAAATGCAGCAGC ATAGTTGATGCTAGGAAGGGTTTTGATTATTTGCAAGAGCCTGATATTGTTTTGTGGACT TCCATGATTGGAGGGTATGTACAAAATGGTGAGAATGAAGACGCTCTGAGTTTATATGGT AGAATGGAGATGGAGGGTATTTTGCCCAATGAGCTAACTATGGCTAGTGTTCTAAAAGCC TGTTCAAGCCTTGCTGCCTTGGAACAAGGAAAGCAAATTCATGCCCGTACTGTTAAGTAT GGATTTGGTCTAGAAGTTCCAATTGGAAGTGCTCTTTCGACCATGTATGCCAAGTGTGGG TGTCTCAAAGATGGCACGCTTGTCTTTAGGAGGATGCCTGCAAGGGATGTAATATCATGG AATGCAATGATATCTGGGCTCTCCCAAAATGGATGTGGTAAGGAAGCTCTAGAACTCTTC GAGGAGATGCAATTAGAGGGCACAAAGCCAGACTATGTTACCTTTGTTAACATTCTCTCT GCGTGTAGCCACATGGGATTGGTGGAAAGAGGATGGGGTTATTTCAGGATGATGTTTGAT GAATTTGGTATGGACCCCAGAGTAGAGCACTATGCTTGCATGGTTGATATTCTGAGCCGT GCAGGAAAGCTCAAAGAAGCAATAGAGTTCACTGAATCGGCTACCATTGATCATGGAATG TGTTTGTGGCGTATTATATTAGGTGCTTGTCGGAACTACCGTAATTATGAGTTGGGAGCC TATGCAGGGGAGAAACTGATGGAGTTGGGCTCCCAAGAGTCATCTGCTTATGTGTTGCTG TCTAGTATCTATTCTGCCTTGGGCAGGTGGGAAGATGTGGAAAGGGTCAGGAGGATGATG AAACTCCGGGGAGTGAGTAAGGAGCCTGGTTGTAGCTGGATTGAGCTCAAGAGTGGGGTT CATGTTTTTGTTGTCAAAGACCAGATGCATCCACAGATTGGAGATATACATGTTGAGCTA CGACAGTTAAGCAAACAAATGAAGGATGAAGGTTATGAACCTGCCACTGATTCATTTTCT GCTGCTTTATGATATTGAGATGACAAAGAAATTATTATCAGGAGTATGTGTTTATTTATT T