Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_17s0053g00670.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:17:15915218:15917742:-1 gene:VIT_17s0053g00670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCCTCTCAGATTTGAGGTCAAGAACAACTACCTTCACCTTCTTGAAGCTTGCATACAA
TCCAAATCCCTCACTGAAGCCAAGAAAATCCACCAGCATTTCCTCAAGAACACCAGCAAC
GCCGACAGCTCTGTGCTTCACAAGCTCACCCGCCTGTACCTCTCATGCAATCAGGTTGTA
CTCGCCCGCCGCCTGTTCGATGAAATTCCCAACCCAAGTGTGATTCTTTGGAACCAAATC
ATCAGAGCTTACGCTTGGAATGGACCTTTTGATGGGGCTATTGATTTGTACCACAGTATG
CTCCACCTGGGTGTCAGACCCAATAAGTATACCTATCCGTTTGTGCTCAAAGCTTGTTCG
GGTTTGCTGGCCATAGAAGACGGTGTTGAAATTCACAGCCACGCTAAGATGTTTGGGCTT
GAGTCTGATGTGTTTGTCTGCACTGCTTTGGTTGATTTTTATGCTAAGTGTGGGATTTTG
GTGGAGGCACAAAGATTGTTTAGTAGCATGTCACATAGAGATGTTGTCGCATGGAATGCG
ATGATTGCTGGATGCTCTCTATATGGTCTTTGTGATGATGCCGTACAGTTGATTATGCAA
ATGCAGGAAGAGGGCATATGTCCCAACTCTTCGACAATTGTAGGGGTTTTGCCAACTGTT
GGTGAAGCCAAAGCCTTAGGCCATGGGAAGGCATTGCATGGTTACTGTGTGAGGCGGAGT
TTTGATAATGGTGTGGTGGTTGGCACCGGCCTTTTGGATATGTATGCAAAGTGTCAGTGT
TTGTTGTATGCCAGGAAGATTTTCGATGTAATGGGAGTCAGGAATGAGGTAAGTTGGAGT
GCAATGATTGGAGGGTATGTTGCAAGTGATTGTATGAAAGAAGCATTAGAGTTATTTGAT
CAAATGATACTCAAGGATGCTATGGATCCAACACCAGTTACTCTTGGGAGTGTGCTTCGG
GCATGTGCAAAGCTGACTGATCTCAGCAGAGGGAGAAAGTTACACTGTTACATTATTAAA
TTGGGGTCTGTTTTAGATATACTGTTAGGCAACACACTTCTTTCGATGTATGCAAAGTGT
GGGGTTATAGATGATGCAATCAGGTTCTTTGATGAGATGAATCCAAAAGACTCGGTTTCT
TTCAGTGCCATTGTCTCTGGCTGTGTGCAGAATGGTAATGCAGCAGTGGCATTGAGTATT
TTCCGAATGATGCAGTTGTCTGGTATTGATCCAGATTTGACAACCATGTTAGGTGTTCTT
CCTGCTTGTTCCCACTTGGCTGCTCTGCAACATGGCTTTTGTAGCCATGGTTACTTAATT
GTTCGAGGCTTTGCAACAGATACCCTAATTTGTAATGCTCTTATTGACATGTACTCCAAG
TGTGGGAAGATCAGTTTCGCTAGGGAAGTTTTCAATAGGATGGATAGGCATGATATTGTC
TCTTGGAATGCAATGATAATTGGATATGGAATTCATGGGCTTGGAATGGAAGCACTTGGC
CTGTTCCATGACTTACTGGCCTTGGGTTTAAAGCCAGATGATATAACATTCATTTGTCTC
TTATCTTCTTGCAGCCATTCAGGGCTTGTCATGGAAGGGAGACTCTGGTTTGATGCCATG
AGTCGAGATTTCAGCATTGTCCCAAGGATGGAACATTGCATTTGCATGGTTGATATTCTT
GGCCGTGCTGGACTTATAGACGAGGCTCACCATTTCATACGAAATATGCCATTTGAGCCT
GATGTTCGCATATGGAGTGCTCTGCTTTCTGCCTGCAGGATCCATAAGAATATTGAACTT
GGGGAAGAAGTATCTAAGAAGATCCAGAGTCTAGGACCTGAAAGTACCGGAAATTTTGTT
CTTTTATCTAATATATACAGCGCTGCTGGAAGATGGGATGATGCAGCACATATTAGAATC
ACACAGAAAGATTGGGGTCTCAAGAAAATCCCAGGATGCAGTTGGATTGAGATAAATGGG
ATTGTTCATGCATTCGTTGGGGGCGACCAGTCCCATCTGCAGTTGTCACAGATAAACAGG
AAACTAGAGGAACTGTTAGTGGAGATGAAAAGGTTGGGCTACCAAGCAGAGTGTAGCTTT
GTCTTCCAAGATGTTGAAGAGGAGGAGAAGGAACAGATCCTCCTTTATCATAGTGAGAAG
CTAGCTATTGCATTTGGAATTCTTAATCTGAAGGCTGGCAGGCCCATTCTTGTTACTAAG
AATTTGCGGGTATGTGGTGATTGCCATACAGCAATAAAATTTATGACTCTCATTACAAAG
AGAGAGATAACCGTAAGAGATGCGAATCGGTTTCATCATTTCAAGAATGGGACTTGCAAC
TGTGGAGATTTCTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_17s0053g00670.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:17:15915218:15917742:-1 gene:VIT_17s0053g00670 transcript:VIT_17s0053g00670.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MPLRFEVKNNYLHLLEACIQSKSLTEAKKIHQHFLKNTSNADSSVLHKLTRLYLSCNQVV
LARRLFDEIPNPSVILWNQIIRAYAWNGPFDGAIDLYHSMLHLGVRPNKYTYPFVLKACS
GLLAIEDGVEIHSHAKMFGLESDVFVCTALVDFYAKCGILVEAQRLFSSMSHRDVVAWNA
MIAGCSLYGLCDDAVQLIMQMQEEGICPNSSTIVGVLPTVGEAKALGHGKALHGYCVRRS
FDNGVVVGTGLLDMYAKCQCLLYARKIFDVMGVRNEVSWSAMIGGYVASDCMKEALELFD
QMILKDAMDPTPVTLGSVLRACAKLTDLSRGRKLHCYIIKLGSVLDILLGNTLLSMYAKC
GVIDDAIRFFDEMNPKDSVSFSAIVSGCVQNGNAAVALSIFRMMQLSGIDPDLTTMLGVL
PACSHLAALQHGFCSHGYLIVRGFATDTLICNALIDMYSKCGKISFAREVFNRMDRHDIV
SWNAMIIGYGIHGLGMEALGLFHDLLALGLKPDDITFICLLSSCSHSGLVMEGRLWFDAM
SRDFSIVPRMEHCICMVDILGRAGLIDEAHHFIRNMPFEPDVRIWSALLSACRIHKNIEL
GEEVSKKIQSLGPESTGNFVLLSNIYSAAGRWDDAAHIRITQKDWGLKKIPGCSWIEING
IVHAFVGGDQSHLQLSQINRKLEELLVEMKRLGYQAECSFVFQDVEEEEKEQILLYHSEK
LAIAFGILNLKAGRPILVTKNLRVCGDCHTAIKFMTLITKREITVRDANRFHHFKNGTCN
CGDFW

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_17s0053g00670.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:17:15915218:15917742:-1 gene:VIT_17s0053g00670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCCTCTCAGATTTGAGGTCAAGAACAACTACCTTCACCTTCTTGAAGCTTGCATACAA
TCCAAATCCCTCACTGAAGCCAAGAAAATCCACCAGCATTTCCTCAAGAACACCAGCAAC
GCCGACAGCTCTGTGCTTCACAAGCTCACCCGCCTGTACCTCTCATGCAATCAGGTTGTA
CTCGCCCGCCGCCTGTTCGATGAAATTCCCAACCCAAGTGTGATTCTTTGGAACCAAATC
ATCAGAGCTTACGCTTGGAATGGACCTTTTGATGGGGCTATTGATTTGTACCACAGTATG
CTCCACCTGGGTGTCAGACCCAATAAGTATACCTATCCGTTTGTGCTCAAAGCTTGTTCG
GGTTTGCTGGCCATAGAAGACGGTGTTGAAATTCACAGCCACGCTAAGATGTTTGGGCTT
GAGTCTGATGTGTTTGTCTGCACTGCTTTGGTTGATTTTTATGCTAAGTGTGGGATTTTG
GTGGAGGCACAAAGATTGTTTAGTAGCATGTCACATAGAGATGTTGTCGCATGGAATGCG
ATGATTGCTGGATGCTCTCTATATGGTCTTTGTGATGATGCCGTACAGTTGATTATGCAA
ATGCAGGAAGAGGGCATATGTCCCAACTCTTCGACAATTGTAGGGGTTTTGCCAACTGTT
GGTGAAGCCAAAGCCTTAGGCCATGGGAAGGCATTGCATGGTTACTGTGTGAGGCGGAGT
TTTGATAATGGTGTGGTGGTTGGCACCGGCCTTTTGGATATGTATGCAAAGTGTCAGTGT
TTGTTGTATGCCAGGAAGATTTTCGATGTAATGGGAGTCAGGAATGAGGTAAGTTGGAGT
GCAATGATTGGAGGGTATGTTGCAAGTGATTGTATGAAAGAAGCATTAGAGTTATTTGAT
CAAATGATACTCAAGGATGCTATGGATCCAACACCAGTTACTCTTGGGAGTGTGCTTCGG
GCATGTGCAAAGCTGACTGATCTCAGCAGAGGGAGAAAGTTACACTGTTACATTATTAAA
TTGGGGTCTGTTTTAGATATACTGTTAGGCAACACACTTCTTTCGATGTATGCAAAGTGT
GGGGTTATAGATGATGCAATCAGGTTCTTTGATGAGATGAATCCAAAAGACTCGGTTTCT
TTCAGTGCCATTGTCTCTGGCTGTGTGCAGAATGGTAATGCAGCAGTGGCATTGAGTATT
TTCCGAATGATGCAGTTGTCTGGTATTGATCCAGATTTGACAACCATGTTAGGTGTTCTT
CCTGCTTGTTCCCACTTGGCTGCTCTGCAACATGGCTTTTGTAGCCATGGTTACTTAATT
GTTCGAGGCTTTGCAACAGATACCCTAATTTGTAATGCTCTTATTGACATGTACTCCAAG
TGTGGGAAGATCAGTTTCGCTAGGGAAGTTTTCAATAGGATGGATAGGCATGATATTGTC
TCTTGGAATGCAATGATAATTGGATATGGAATTCATGGGCTTGGAATGGAAGCACTTGGC
CTGTTCCATGACTTACTGGCCTTGGGTTTAAAGCCAGATGATATAACATTCATTTGTCTC
TTATCTTCTTGCAGCCATTCAGGGCTTGTCATGGAAGGGAGACTCTGGTTTGATGCCATG
AGTCGAGATTTCAGCATTGTCCCAAGGATGGAACATTGCATTTGCATGGTTGATATTCTT
GGCCGTGCTGGACTTATAGACGAGGCTCACCATTTCATACGAAATATGCCATTTGAGCCT
GATGTTCGCATATGGAGTGCTCTGCTTTCTGCCTGCAGGATCCATAAGAATATTGAACTT
GGGGAAGAAGTATCTAAGAAGATCCAGAGTCTAGGACCTGAAAGTACCGGAAATTTTGTT
CTTTTATCTAATATATACAGCGCTGCTGGAAGATGGGATGATGCAGCACATATTAGAATC
ACACAGAAAGATTGGGGTCTCAAGAAAATCCCAGGATGCAGTTGGATTGAGATAAATGGG
ATTGTTCATGCATTCGTTGGGGGCGACCAGTCCCATCTGCAGTTGTCACAGATAAACAGG
AAACTAGAGGAACTGTTAGTGGAGATGAAAAGGTTGGGCTACCAAGCAGAGTGTAGCTTT
GTCTTCCAAGATGTTGAAGAGGAGGAGAAGGAACAGATCCTCCTTTATCATAGTGAGAAG
CTAGCTATTGCATTTGGAATTCTTAATCTGAAGGCTGGCAGGCCCATTCTTGTTACTAAG
AATTTGCGGGTATGTGGTGATTGCCATACAGCAATAAAATTTATGACTCTCATTACAAAG
AGAGAGATAACCGTAAGAGATGCGAATCGGTTTCATCATTTCAAGAATGGGACTTGCAAC
TGTGGAGATTTCTGGTGAGAAATGTTTTCATACTACCTTCCTTCTTTTCAACAAAGAGAG
TAAGCTACCTGTTCGGTAGAGAAAGAAAGGACCAGTTGGGATCGAAAGTAAGATACCAGT
TTGATCAGCTGGCCAAAGAGCATTCTGCTGGATTCGTAGCACATTCTTCTTTACTGCAGA
AACCA