Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_17s0000g08280.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:17:9353062:9355485:-1 gene:VIT_17s0000g08280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGTACTTGTCAGACCCCTGAACTCGCCTTTACTCCCACTGTATCCCGACCAATTCAAC
CTCCAGACACCATCTAAGACACCTCACCACATCTCCAACCTTGTCATAGTAACATCCCCA
GTTTCATGCAGCTTGAGGTTTCAAAAGTTCAATTATAACCCAATTCAGAAATGGAGTTCT
AAACCTCTTTCGACAAAAATTCAGACTTTTGTCAGCGTTTCGTTCGCTAATAACGTCATT
AGGGAGTATACTGAGGATGGGTTCTTTGATGATGCAATTGGGGTTTATCTTAAAATGCTT
GATGATGGTGTCAAGGTCGAGGAGTTTCGGTATTTTCCGTGTTTGATTAAGGCGTTTGGT
GGACTTTGTGATGTATACAAGGGCAGGCAGATTCATGGGCATGTGTTGAAATTAGGGGTT
TTAGACGATGTTTCGGTTGTGAATTCGCTTTTGACCATGTACTGGAAATGTGGGGTGGTT
GAGGACGCAGTTCAAATGTTTGAGAAAATGCCTGAGGTGGATTTAGTTTCATGGAATACA
ATGATATCTGGGTTTCAGAAATCAATGGACTACACTCGTTCACTGATGTTTTTTAGGTCG
ATGGTGTGGGAATTTGGCATATATCCAAATCGAGTAGCCTGTGTTTCGTCTATATTATCG
TGTTCCTCTCTTCAGTCGTTAACTCATGGGCGAGAGATTCATGGTGTTGTGGTAAAGAGC
GGGTTGGATGTTGAAGAATATTTGGTTAGTTCACTGATTGAAATGTACATGAAATGTGGA
AGTATTAAGAATGCAGAAAACATTTTTAATAGCATTCTTGATAAAGATTCAGTGAGACGG
AATGCAGTGATATGGAACGTGATGATTTCTGGTTATGTTTCTAATGGTTGTTTTTCCCAG
GCACTGTTGTTGTTTATAAAGATGATGGTGTGGGGAATAAAACCAGATTATTCAACAATG
GTTTCTCTATTTTCTCTCTGCTCTGAGTCACTGGATATAGCATTTGGAAAGCAAATCCAT
GGCTTGATTTTCAAATTTGGACTCAAGAATAATATAAGAGTTGAAACAGCCCTTTTGGAC
ATGTACTTAAAATGTGGTGATATGGGAACGGGTTTAAAAATATTCAGAAGGTCTCAAAAT
CATAACCTCATTATGTGGAGTGCTGTCATTTCTAATTGTGCTCAGAGTGGTTGTCCAACC
AAGGCATTGGAATTGTTCTATGAATTTAAAATGGAAGATGGCCTTGCAGATTCTGGCATA
CTTGTGGCAGTACTACGGGCATGTTCCTCCTTGACTCTTAAGCCTGAAGGTATGCAAATT
CATGGATTGGCAACAAAAATGGGGTTTGTTTCTGATGTTTTTGTTGGCAGTGCATTAGTT
GATCTGTATGCAAAGTGCAGAGATATGGGGTATTCTAAAAAAGTTTTTCTTAGATTATCC
CAAAAGGATCTGGTTTCGTGGAATGCTCTTATAAGTGGGTATGCTCAAGATGAGTGTGCG
GATGAAGCTTTAAAGGCGTTCCGTGATATGCAATTAGAAGAAATTAGACCCAATACTGTA
ACAATTGCATGCATTCTTTCAGTTTGTGCTCACCTGTCTGTCATGACCCTTTGTAAAGAG
GTTCATGGTTACCTTATACGACAAGGGCTTGGGAGCACTGTTCTTGTAAGCAATTCCCTA
ATAGCTACCTATGCCAAATGTGGGGACATAAATAGTTCTTTGTATACATTTGAGAAAATG
CCTGAAAGAAATGATGTTTCATGGAATTCAATTATATTGGGGATGGGGATGCATAGCCGC
ACGGATGAAATGATTGTTTTATTTGATAAAATGGTAGCATCAGGCATCAAGCCTGACCAT
GTGACATTTACAGCTATTCTTTCTGCATGCAGCCATGCAGGGAGGGTAGATGAGGGCTGT
AAATATTTTAAAAGCATGGTTGAAGACTTCAATCTCAAACCTCAACTTGAACAGTATACT
TGCATGGTTGATCTTCTTGGCCGAGCTGGCCATCTAAACCAAGCATATGACCTGATAATG
GCCATGCCTTGTACACCAGATGATCGGATATGGGGATCTTTGCTTGGATCTTGCAAAAAT
CATGGTGATGAAATTTTGGCTGAAATTGTAGCGAATCACATATTCAAACTTGTTCCTTCT
AGTGTTGGTTATCGTGTCCTCCTTGCAAATTTATATGAAAATCTTGGGAAGGGAAGGGAA
GGTTCTAAGGTTAGATCAGAAATAAAAGATATGGGACTTAAAAAGAAGCCAGGATGTAGT
TGGATTGAAGTTGACAACAATTTTCACATATTTATTGCAGGTGATCGGTCACATTCTCAG
TCAGATGAGATTTATGCTGCTGTAGAAAGTTTGACAACAGAGATCAAGAGAGCAGGATAT
ATTCCTCAGATATATAGTTATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_17s0000g08280.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:17:9353062:9355485:-1 gene:VIT_17s0000g08280 transcript:VIT_17s0000g08280.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MVLVRPLNSPLLPLYPDQFNLQTPSKTPHHISNLVIVTSPVSCSLRFQKFNYNPIQKWSS
KPLSTKIQTFVSVSFANNVIREYTEDGFFDDAIGVYLKMLDDGVKVEEFRYFPCLIKAFG
GLCDVYKGRQIHGHVLKLGVLDDVSVVNSLLTMYWKCGVVEDAVQMFEKMPEVDLVSWNT
MISGFQKSMDYTRSLMFFRSMVWEFGIYPNRVACVSSILSCSSLQSLTHGREIHGVVVKS
GLDVEEYLVSSLIEMYMKCGSIKNAENIFNSILDKDSVRRNAVIWNVMISGYVSNGCFSQ
ALLLFIKMMVWGIKPDYSTMVSLFSLCSESLDIAFGKQIHGLIFKFGLKNNIRVETALLD
MYLKCGDMGTGLKIFRRSQNHNLIMWSAVISNCAQSGCPTKALELFYEFKMEDGLADSGI
LVAVLRACSSLTLKPEGMQIHGLATKMGFVSDVFVGSALVDLYAKCRDMGYSKKVFLRLS
QKDLVSWNALISGYAQDECADEALKAFRDMQLEEIRPNTVTIACILSVCAHLSVMTLCKE
VHGYLIRQGLGSTVLVSNSLIATYAKCGDINSSLYTFEKMPERNDVSWNSIILGMGMHSR
TDEMIVLFDKMVASGIKPDHVTFTAILSACSHAGRVDEGCKYFKSMVEDFNLKPQLEQYT
CMVDLLGRAGHLNQAYDLIMAMPCTPDDRIWGSLLGSCKNHGDEILAEIVANHIFKLVPS
SVGYRVLLANLYENLGKGREGSKVRSEIKDMGLKKKPGCSWIEVDNNFHIFIAGDRSHSQ
SDEIYAAVESLTTEIKRAGYIPQIYSY

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_17s0000g08280.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:17:9353062:9355485:-1 gene:VIT_17s0000g08280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGTACTTGTCAGACCCCTGAACTCGCCTTTACTCCCACTGTATCCCGACCAATTCAAC
CTCCAGACACCATCTAAGACACCTCACCACATCTCCAACCTTGTCATAGTAACATCCCCA
GTTTCATGCAGCTTGAGGTTTCAAAAGTTCAATTATAACCCAATTCAGAAATGGAGTTCT
AAACCTCTTTCGACAAAAATTCAGACTTTTGTCAGCGTTTCGTTCGCTAATAACGTCATT
AGGGAGTATACTGAGGATGGGTTCTTTGATGATGCAATTGGGGTTTATCTTAAAATGCTT
GATGATGGTGTCAAGGTCGAGGAGTTTCGGTATTTTCCGTGTTTGATTAAGGCGTTTGGT
GGACTTTGTGATGTATACAAGGGCAGGCAGATTCATGGGCATGTGTTGAAATTAGGGGTT
TTAGACGATGTTTCGGTTGTGAATTCGCTTTTGACCATGTACTGGAAATGTGGGGTGGTT
GAGGACGCAGTTCAAATGTTTGAGAAAATGCCTGAGGTGGATTTAGTTTCATGGAATACA
ATGATATCTGGGTTTCAGAAATCAATGGACTACACTCGTTCACTGATGTTTTTTAGGTCG
ATGGTGTGGGAATTTGGCATATATCCAAATCGAGTAGCCTGTGTTTCGTCTATATTATCG
TGTTCCTCTCTTCAGTCGTTAACTCATGGGCGAGAGATTCATGGTGTTGTGGTAAAGAGC
GGGTTGGATGTTGAAGAATATTTGGTTAGTTCACTGATTGAAATGTACATGAAATGTGGA
AGTATTAAGAATGCAGAAAACATTTTTAATAGCATTCTTGATAAAGATTCAGTGAGACGG
AATGCAGTGATATGGAACGTGATGATTTCTGGTTATGTTTCTAATGGTTGTTTTTCCCAG
GCACTGTTGTTGTTTATAAAGATGATGGTGTGGGGAATAAAACCAGATTATTCAACAATG
GTTTCTCTATTTTCTCTCTGCTCTGAGTCACTGGATATAGCATTTGGAAAGCAAATCCAT
GGCTTGATTTTCAAATTTGGACTCAAGAATAATATAAGAGTTGAAACAGCCCTTTTGGAC
ATGTACTTAAAATGTGGTGATATGGGAACGGGTTTAAAAATATTCAGAAGGTCTCAAAAT
CATAACCTCATTATGTGGAGTGCTGTCATTTCTAATTGTGCTCAGAGTGGTTGTCCAACC
AAGGCATTGGAATTGTTCTATGAATTTAAAATGGAAGATGGCCTTGCAGATTCTGGCATA
CTTGTGGCAGTACTACGGGCATGTTCCTCCTTGACTCTTAAGCCTGAAGGTATGCAAATT
CATGGATTGGCAACAAAAATGGGGTTTGTTTCTGATGTTTTTGTTGGCAGTGCATTAGTT
GATCTGTATGCAAAGTGCAGAGATATGGGGTATTCTAAAAAAGTTTTTCTTAGATTATCC
CAAAAGGATCTGGTTTCGTGGAATGCTCTTATAAGTGGGTATGCTCAAGATGAGTGTGCG
GATGAAGCTTTAAAGGCGTTCCGTGATATGCAATTAGAAGAAATTAGACCCAATACTGTA
ACAATTGCATGCATTCTTTCAGTTTGTGCTCACCTGTCTGTCATGACCCTTTGTAAAGAG
GTTCATGGTTACCTTATACGACAAGGGCTTGGGAGCACTGTTCTTGTAAGCAATTCCCTA
ATAGCTACCTATGCCAAATGTGGGGACATAAATAGTTCTTTGTATACATTTGAGAAAATG
CCTGAAAGAAATGATGTTTCATGGAATTCAATTATATTGGGGATGGGGATGCATAGCCGC
ACGGATGAAATGATTGTTTTATTTGATAAAATGGTAGCATCAGGCATCAAGCCTGACCAT
GTGACATTTACAGCTATTCTTTCTGCATGCAGCCATGCAGGGAGGGTAGATGAGGGCTGT
AAATATTTTAAAAGCATGGTTGAAGACTTCAATCTCAAACCTCAACTTGAACAGTATACT
TGCATGGTTGATCTTCTTGGCCGAGCTGGCCATCTAAACCAAGCATATGACCTGATAATG
GCCATGCCTTGTACACCAGATGATCGGATATGGGGATCTTTGCTTGGATCTTGCAAAAAT
CATGGTGATGAAATTTTGGCTGAAATTGTAGCGAATCACATATTCAAACTTGTTCCTTCT
AGTGTTGGTTATCGTGTCCTCCTTGCAAATTTATATGAAAATCTTGGGAAGGGAAGGGAA
GGTTCTAAGGTTAGATCAGAAATAAAAGATATGGGACTTAAAAAGAAGCCAGGATGTAGT
TGGATTGAAGTTGACAACAATTTTCACATATTTATTGCAGGTGATCGGTCACATTCTCAG
TCAGATGAGATTTATGCTGCTGTAGAAAGTTTGACAACAGAGATCAAGAGAGCAGGATAT
ATTCCTCAGATATATAGTTATTGA