Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_17s0000g06500.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:17:7057922:7059527:1 gene:VIT_17s0000g06500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGATCCGAGGGCATTCTCAGAGCGAAACGCCCCATAAGTTGGTTGAGCTTTACAATCGA
ATGGTAGAGGCTGAGGCTGAGCCCAATGAGTTCACGTATTCGTTTCTTATTGGTGGTTGT
GCGCGGTCGAGGTTGTTGAGAGAGGGCGAGCAGGTGCATGGAAGAGTTGTGGCAAACGGG
TATTGCACTAATGTGTTTGTTCGGACGAGTTTGGTTAATTTGTATGCGATCGCTGGGGGA
TATGATGGGGTAAGGAAGGCACGCCGGGTGTTTGATGAAATAGTTGATAGAAATATAGTG
AGTTGGAATTCGTTGCTTGCAGGGTATGTTAGGTGTGGGGATGTTGATGGGGCACGGAGG
ATTTTTGATGAGATGCCGGAAAGGAATGTTGTCTCGTGGACAACCATGATTGCAGGATGT
GCGCAAATTGGGAGGTGTAAGCAAGCGTTACATTTGTTTCATGAGATGAGAAGGGCCGGT
GTAAAATTAGACCAGGTGGCATTGGTGGCAGCTTTGTCAGCCTGTGCTGAATTGGGGGAC
TTGAAGTTGGGGACATGGATCCACTCTTACATTGATGAGAGACTGCATGCTGGAAATCAG
CCATTGCTTGTGTCTTTGAACAATTCGCTCATACACATGTATGCCAGCTGTGGTGTAATT
GATAAAGCTTATAAAGTATTCATAGGGATGCAACAGAGAAGCACTATTTCTTGGACAAGC
ATGATCACAGGTTTTGCAAAACAAGGCCATGCAGAAGAAGCTCTTGGTGTGTTTCAGTGG
ATGCAGAGGTTGGGAACGGATGAAGGGAGACCCGATGGGATAACCTTCATTGGAGTTCTG
TGTGCCTGCAGCCATGCTGGATTTGTCGACCAAGGCCGTCATTTTTTTGAATGCATGAAT
AAAAAATGGGGCATTGTACCAAGGATTGAGCACTATGGATGCATGGTTGATCTCCTGAGC
CGTGCTGGCTTCTTGGATGAAGCACATAGACTCATTGAGTCTATGCCTATGAAGCCAAAT
GATGCTGTATGGGGTGCTCTTCTTGGTGGATGCAGGATTCACAAGAATGCCGAGCTTGCT
TCCCATGTTGCTCAAAAATTGGCACTTGAGCTTAAACCTGATCAAGCTGCAGGCTATCTT
GTGCTACTGTCAAATGTTTATGCTACTGCTAAAAGGTGGCAGGACGTTGCTTTAGTGAGA
CAGAAGATGGTTGAGATAGGTGTAAGAAAGCCTGCAGGCCGAAGTTGGGTCCAAATAAAT
GGAGTTGTCCATGACTTTGTGGCAGGTGACTGGACTCACAAGCATGCATCTTCAGTATAT
GAGATGCTTAGCAAGATTACAAGGCAAGCCAAATTGGAAGGCTACAAACTGGACATTTCA
GAGGTGCTTTTGGACGTTGAATAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_17s0000g06500.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:17:7057922:7059527:1 gene:VIT_17s0000g06500 transcript:VIT_17s0000g06500.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MIRGHSQSETPHKLVELYNRMVEAEAEPNEFTYSFLIGGCARSRLLREGEQVHGRVVANG
YCTNVFVRTSLVNLYAIAGGYDGVRKARRVFDEIVDRNIVSWNSLLAGYVRCGDVDGARR
IFDEMPERNVVSWTTMIAGCAQIGRCKQALHLFHEMRRAGVKLDQVALVAALSACAELGD
LKLGTWIHSYIDERLHAGNQPLLVSLNNSLIHMYASCGVIDKAYKVFIGMQQRSTISWTS
MITGFAKQGHAEEALGVFQWMQRLGTDEGRPDGITFIGVLCACSHAGFVDQGRHFFECMN
KKWGIVPRIEHYGCMVDLLSRAGFLDEAHRLIESMPMKPNDAVWGALLGGCRIHKNAELA
SHVAQKLALELKPDQAAGYLVLLSNVYATAKRWQDVALVRQKMVEIGVRKPAGRSWVQIN
GVVHDFVAGDWTHKHASSVYEMLSKITRQAKLEGYKLDISEVLLDVE

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_17s0000g06500.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:17:7057922:7059527:1 gene:VIT_17s0000g06500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ACACTTCTTCTCTCTATTACAGACCTGCGACACCATAAAGAAACTCAAGCAAATTCACAC
CCAGATAATCGTCAATGGCTTTTCCCAAAAAAATTTCCTTCTCGTTAAGCTCTTGTCTTT
CTACATAACTTCTGGTAATCTCCTAAATGCACATAAAGTTTTTGAACGTATTGAAAACCC
AAGTACTACTGTTTGGAATCAAATGATCCGAGGGCATTCTCAGAGCGAAACGCCCCATAA
GTTGGTTGAGCTTTACAATCGAATGGTAGAGGCTGAGGCTGAGCCCAATGAGTTCACGTA
TTCGTTTCTTATTGGTGGTTGTGCGCGGTCGAGGTTGTTGAGAGAGGGCGAGCAGGTGCA
TGGAAGAGTTGTGGCAAACGGGTATTGCACTAATGTGTTTGTTCGGACGAGTTTGGTTAA
TTTGTATGCGATCGCTGGGGGATATGATGGGGTAAGGAAGGCACGCCGGGTGTTTGATGA
AATAGTTGATAGAAATATAGTGAGTTGGAATTCGTTGCTTGCAGGGTATGTTAGGTGTGG
GGATGTTGATGGGGCACGGAGGATTTTTGATGAGATGCCGGAAAGGAATGTTGTCTCGTG
GACAACCATGATTGCAGGATGTGCGCAAATTGGGAGGTGTAAGCAAGCGTTACATTTGTT
TCATGAGATGAGAAGGGCCGGTGTAAAATTAGACCAGGTGGCATTGGTGGCAGCTTTGTC
AGCCTGTGCTGAATTGGGGGACTTGAAGTTGGGGACATGGATCCACTCTTACATTGATGA
GAGACTGCATGCTGGAAATCAGCCATTGCTTGTGTCTTTGAACAATTCGCTCATACACAT
GTATGCCAGCTGTGGTGTAATTGATAAAGCTTATAAAGTATTCATAGGGATGCAACAGAG
AAGCACTATTTCTTGGACAAGCATGATCACAGGTTTTGCAAAACAAGGCCATGCAGAAGA
AGCTCTTGGTGTGTTTCAGTGGATGCAGAGGTTGGGAACGGATGAAGGGAGACCCGATGG
GATAACCTTCATTGGAGTTCTGTGTGCCTGCAGCCATGCTGGATTTGTCGACCAAGGCCG
TCATTTTTTTGAATGCATGAATAAAAAATGGGGCATTGTACCAAGGATTGAGCACTATGG
ATGCATGGTTGATCTCCTGAGCCGTGCTGGCTTCTTGGATGAAGCACATAGACTCATTGA
GTCTATGCCTATGAAGCCAAATGATGCTGTATGGGGTGCTCTTCTTGGTGGATGCAGGAT
TCACAAGAATGCCGAGCTTGCTTCCCATGTTGCTCAAAAATTGGCACTTGAGCTTAAACC
TGATCAAGCTGCAGGCTATCTTGTGCTACTGTCAAATGTTTATGCTACTGCTAAAAGGTG
GCAGGACGTTGCTTTAGTGAGACAGAAGATGGTTGAGATAGGTGTAAGAAAGCCTGCAGG
CCGAAGTTGGGTCCAAATAAATGGAGTTGTCCATGACTTTGTGGCAGGTGACTGGACTCA
CAAGCATGCATCTTCAGTATATGAGATGCTTAGCAAGATTACAAGGCAAGCCAAATTGGA
AGGCTACAAACTGGACATTTCAGAGGTGCTTTTGGACGTTGAATAG