Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_17s0000g06100.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:17:6668795:6671065:-1 gene:VIT_17s0000g06100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCGTTTTTCAGGATTTGATCCCAACCAGTTCACCTATGGGAGTGTTCTTTCGGCTTGT
ACTGCCTTAGGGTCTCCTTTGTATGGTGAACTGGTATATTCACTTGCACTGAAAAATGGG
TTCTTCTCAAATGGGTATGTTCGGGCTGGAATGATTGATTTGTTTGCGAAGCTTTGTAGC
TTTGAGGATGCTTTAAGGGTGTTTCAAGACGTTTTATGTGAGAACGTGGTTTGCTGGAAT
GCTATCATTTCTGGGGCTGTTAAAAATAGGGAAAATTGGGTTGCTTTAGATCTTTTCTGC
CAAATGTGCTGCAGATTTTTTATGCCAAATAGTTTTACGTTTTCAAGCATTTTAACAGCT
TGTGCTGCACTTGAGGAACTTGAGTTTGGAAGAGGGGTTCAAGGATGGGTGATTAAATGT
GGTGCAGGAGAAGATGTTTTTGTGGGGACTGCCATCATTGATTTGTATGCCAAATGCAGG
GATATGGATCAAGCTGTGAAGGAATTTTTGCGAATGCCAATCCGCAATGTAGTTTCCTGG
ACTACCATCATTTCTGGTTTTGTTCAGAAGGATGACAGTATTTCTGCTTTCCACTTCTTC
AAAGAAATGAGAAAAGTAGGAGAGAAAATAAACAACTACACCATAACTAGTGTACTTACT
GCTTGTACTGAGCCAGTTATGATCAAAGAGGCAGTCCAACTACATTCCTGGATTTTCAAA
ACTGGGTTCTATTTGGATTCCAATGTAAGTTCTGCTTTGATCAATATGTATTCAAAAATA
GGAGTGGTTGACTTATCTGAGAGGGTGTTCAGAGAGATGGAAAGTACAAAGAACCTAGCC
ATGTGGGCTGTTATGATATCTGCCTTTGCTCAAAGTGGGAGTACTGGAAGGGCAGTTGAA
TTGTTTCAGAGGATGCTTCAGGAGGGTCTGAGACCTGATAAGTTTTGTAGTTCTAGTGTC
TTGAGCATAATAGACAGTCTAAGTTTGGGGAGACTGATCCATTGCTACATTCTTAAAATT
GGTTTGTTCACTGATATTTCTGTGGGCAGTTCTCTTTTCACAATGTACTCAAAATGTGGT
AGTTTAGAGGAATCTTACACAGTTTTTGAGCAAATGCCTGACAAAGACAATGTTTCATGG
GCCTCCATGATCACTGGGTTTTCAGAACATGACCATGCAGAACAAGCTGTTCAGTTGTTC
AGAGAGATGCTGTTAGAAGAAATTAGACCAGATCAAATGACTTTAACTGCAGCTCTAACT
GCATGTTCTGCTCTTCATTCCTTAGAAAAAGGAAAGGAAGTTCATGGGTATGCTCTTCGA
GCACGAGTTGGCAAAGAGGTACTTGTGGGTGGTGCACTTGTAAATATGTACTCAAAATGT
GGTGCCATAGTCTTGGCAAGGAGGGTATTTGACATGCTCCCCCAAAAGGATCAGTTTTCA
TGCTCCTCCTTGGTTTCAGGATATGCTCAAAATGGGTATATTGAAGATGCACTTCTGCTG
TTCCATGAAATACGGATGGCTGATTTGTGGATTGACTCCTTCACAGTTTCATCTGTCATT
GGGGCTGTAGCAATTTTAAACAGCTTAGACATTGGTACCCAACTGCATGCTTGTGTTACA
AAAATGGGCTTAAATGCAGAAGTTTCTGTTGGCAGCTCTCTAGTTACAATGTATTCAAAA
TGTGGAAGCATTGACGAATGTCATAAGGTGTTTGAACAGATTGAAAAACCTGATTTGATC
AGTTGGACGGCTATGATAGTGAGCTATGCTCAGCATGGAAAAGGTGCAGAGGCTTTAAAA
GTGTATGACCTCATGAGGAAAGAAGGAACTAAACCTGATTCAGTAACATTTGTTGGTGTC
TTATCTGCATGTAGTCATAATGGTATGGTTGAAGAAGGCTATTCCCATCTAAATTCAATG
GCCAAAGAGTATGGAATTGAACCTGGTTACTACCATTATGCCTGTATGGTTGATCTTCTT
GGGCGATCTGGAAGGCTGAAAGAGGCTGAAAGGTTCATTAACAATATGCCCATTGAACCT
GATGCTTTGCTATGGGGAATATTGCTTGCTGCTTGCAAGGTACATGGGGATATTGAGCTT
GGAAGGCTAGCGGCAAAAAGAGTCATTGAGTTGGAGCCCTGTGAAGCTGGAGCTTATGTC
ACCTTGTCAAACATCTGTGCAGATATGGGCTGGTGGGAAGATGTCATGAAGATCAGAAGC
CTGATGGAGGGAACTGGGGTGAAGAAGGAACCTGGATGGAGTTCTGTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_17s0000g06100.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:17:6668795:6671065:-1 gene:VIT_17s0000g06100 transcript:VIT_17s0000g06100.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MRFSGFDPNQFTYGSVLSACTALGSPLYGELVYSLALKNGFFSNGYVRAGMIDLFAKLCS
FEDALRVFQDVLCENVVCWNAIISGAVKNRENWVALDLFCQMCCRFFMPNSFTFSSILTA
CAALEELEFGRGVQGWVIKCGAGEDVFVGTAIIDLYAKCRDMDQAVKEFLRMPIRNVVSW
TTIISGFVQKDDSISAFHFFKEMRKVGEKINNYTITSVLTACTEPVMIKEAVQLHSWIFK
TGFYLDSNVSSALINMYSKIGVVDLSERVFREMESTKNLAMWAVMISAFAQSGSTGRAVE
LFQRMLQEGLRPDKFCSSSVLSIIDSLSLGRLIHCYILKIGLFTDISVGSSLFTMYSKCG
SLEESYTVFEQMPDKDNVSWASMITGFSEHDHAEQAVQLFREMLLEEIRPDQMTLTAALT
ACSALHSLEKGKEVHGYALRARVGKEVLVGGALVNMYSKCGAIVLARRVFDMLPQKDQFS
CSSLVSGYAQNGYIEDALLLFHEIRMADLWIDSFTVSSVIGAVAILNSLDIGTQLHACVT
KMGLNAEVSVGSSLVTMYSKCGSIDECHKVFEQIEKPDLISWTAMIVSYAQHGKGAEALK
VYDLMRKEGTKPDSVTFVGVLSACSHNGMVEEGYSHLNSMAKEYGIEPGYYHYACMVDLL
GRSGRLKEAERFINNMPIEPDALLWGILLAACKVHGDIELGRLAAKRVIELEPCEAGAYV
TLSNICADMGWWEDVMKIRSLMEGTGVKKEPGWSSV

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_17s0000g06100.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:17:6668795:6671065:-1 gene:VIT_17s0000g06100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCGTTTTTCAGGATTTGATCCCAACCAGTTCACCTATGGGAGTGTTCTTTCGGCTTGT
ACTGCCTTAGGGTCTCCTTTGTATGGTGAACTGGTATATTCACTTGCACTGAAAAATGGG
TTCTTCTCAAATGGGTATGTTCGGGCTGGAATGATTGATTTGTTTGCGAAGCTTTGTAGC
TTTGAGGATGCTTTAAGGGTGTTTCAAGACGTTTTATGTGAGAACGTGGTTTGCTGGAAT
GCTATCATTTCTGGGGCTGTTAAAAATAGGGAAAATTGGGTTGCTTTAGATCTTTTCTGC
CAAATGTGCTGCAGATTTTTTATGCCAAATAGTTTTACGTTTTCAAGCATTTTAACAGCT
TGTGCTGCACTTGAGGAACTTGAGTTTGGAAGAGGGGTTCAAGGATGGGTGATTAAATGT
GGTGCAGGAGAAGATGTTTTTGTGGGGACTGCCATCATTGATTTGTATGCCAAATGCAGG
GATATGGATCAAGCTGTGAAGGAATTTTTGCGAATGCCAATCCGCAATGTAGTTTCCTGG
ACTACCATCATTTCTGGTTTTGTTCAGAAGGATGACAGTATTTCTGCTTTCCACTTCTTC
AAAGAAATGAGAAAAGTAGGAGAGAAAATAAACAACTACACCATAACTAGTGTACTTACT
GCTTGTACTGAGCCAGTTATGATCAAAGAGGCAGTCCAACTACATTCCTGGATTTTCAAA
ACTGGGTTCTATTTGGATTCCAATGTAAGTTCTGCTTTGATCAATATGTATTCAAAAATA
GGAGTGGTTGACTTATCTGAGAGGGTGTTCAGAGAGATGGAAAGTACAAAGAACCTAGCC
ATGTGGGCTGTTATGATATCTGCCTTTGCTCAAAGTGGGAGTACTGGAAGGGCAGTTGAA
TTGTTTCAGAGGATGCTTCAGGAGGGTCTGAGACCTGATAAGTTTTGTAGTTCTAGTGTC
TTGAGCATAATAGACAGTCTAAGTTTGGGGAGACTGATCCATTGCTACATTCTTAAAATT
GGTTTGTTCACTGATATTTCTGTGGGCAGTTCTCTTTTCACAATGTACTCAAAATGTGGT
AGTTTAGAGGAATCTTACACAGTTTTTGAGCAAATGCCTGACAAAGACAATGTTTCATGG
GCCTCCATGATCACTGGGTTTTCAGAACATGACCATGCAGAACAAGCTGTTCAGTTGTTC
AGAGAGATGCTGTTAGAAGAAATTAGACCAGATCAAATGACTTTAACTGCAGCTCTAACT
GCATGTTCTGCTCTTCATTCCTTAGAAAAAGGAAAGGAAGTTCATGGGTATGCTCTTCGA
GCACGAGTTGGCAAAGAGGTACTTGTGGGTGGTGCACTTGTAAATATGTACTCAAAATGT
GGTGCCATAGTCTTGGCAAGGAGGGTATTTGACATGCTCCCCCAAAAGGATCAGTTTTCA
TGCTCCTCCTTGGTTTCAGGATATGCTCAAAATGGGTATATTGAAGATGCACTTCTGCTG
TTCCATGAAATACGGATGGCTGATTTGTGGATTGACTCCTTCACAGTTTCATCTGTCATT
GGGGCTGTAGCAATTTTAAACAGCTTAGACATTGGTACCCAACTGCATGCTTGTGTTACA
AAAATGGGCTTAAATGCAGAAGTTTCTGTTGGCAGCTCTCTAGTTACAATGTATTCAAAA
TGTGGAAGCATTGACGAATGTCATAAGGTGTTTGAACAGATTGAAAAACCTGATTTGATC
AGTTGGACGGCTATGATAGTGAGCTATGCTCAGCATGGAAAAGGTGCAGAGGCTTTAAAA
GTGTATGACCTCATGAGGAAAGAAGGAACTAAACCTGATTCAGTAACATTTGTTGGTGTC
TTATCTGCATGTAGTCATAATGGTATGGTTGAAGAAGGCTATTCCCATCTAAATTCAATG
GCCAAAGAGTATGGAATTGAACCTGGTTACTACCATTATGCCTGTATGGTTGATCTTCTT
GGGCGATCTGGAAGGCTGAAAGAGGCTGAAAGGTTCATTAACAATATGCCCATTGAACCT
GATGCTTTGCTATGGGGAATATTGCTTGCTGCTTGCAAGGTACATGGGGATATTGAGCTT
GGAAGGCTAGCGGCAAAAAGAGTCATTGAGTTGGAGCCCTGTGAAGCTGGAGCTTATGTC
ACCTTGTCAAACATCTGTGCAGATATGGGCTGGTGGGAAGATGTCATGAAGATCAGAAGC
CTGATGGAGGGAACTGGGGTGAAGAAGGAACCTGGATGGAGTTCTGTGTGA