Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_17s0000g01430.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:17:1017857:1022224:1 gene:VIT_17s0000g01430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATATCCCGCTGTCTCGTAATCAGAACATGTCAATGGATCAGATCCAGAGTAACTGT GGCTTGCCGCATTTGTTCTCAGTTGACGAGATTCTGAGAGAAAAGTCCTTTTCTCAGCGT TTGCTTCCATTCAACAGAAGAAAACGGAGGACCCCATTTTCTCAGATCAGGTGTTCTTCC TTGGAACAAGGTCTGCAACCACGGCCCAAGCCGAAACCTTCGACTATTGAGCTGAATGTG GGAAAAGAAGCTCAAGTAAATGAAACACAACTCAGGAAACCCAGTTCAGAGCTATGTGGT CAGATCGAGAAATTAGTTTTCTTTAAGAGGTACCATGAGGCACTTGAATTATTTGAAATT TTAGAGTTGAATGGTGCTTATGATATGGATAGCGAGACATATGATGCATTAGTGAGTGCG TGTATTGGGTTGAAATCAATTAGAGGGGTGAAAAAGGTGTTCAATTATATGATTAATAGT GGGCTTGATCCGGATGAGTATTTGAGGAACAGGGTTTTGTTAATGCATGTGAAATGTGGG ATGATGATTGATGCACGTAGATTGTTTGATGAAATGCCAGAAAAGAACATTTTGTCCTGG AATACGATAATTGGGGGACTTGTGGATGCTGGAGATTATTTCGAGGCATTCCGGTTGTTT CTAATGATGTGGCAGGATTTTTCTGATGCTGGGTCCCGGATGTTTGTGACAATGATTCGG GCATCTGCTGGACTGGGGCTCATTTTTGCTGGAAGACAATTACACTCTTGTTCTTTGAAG ACAGGTGTAGGTGGAGATGTTTTTGTGGCTTGTGCACTGATTGACATGTACAGTAAGTGT GGGAGCATTGAAGATGCTCAGTGTGTTTTCGATCAGATGCCAGAGAAGACCACAGTAGGA TGGAATTCCATTATTGCGGGTTATGCACTTCATGGTTATAGCGAGGAAGCATTGAGTATG TATTATGAAATGCGGGATTCTGGCGTCAAAATAGACAATTTCACTTTTTCAATTATTATA AGAATATGTGCTAGGTTAGCTTCATTAGAACATGCTAAGCAAGCTCATGCAGGTCTAGTT CGTCATGGTTTTGGTTTAGATATTGTAGCTAACACAGCGCTTGTGGACTTGTATAGCAAA TGGGGAAGGATTGAAGATGCGAAGCATGTTTTTGACATGATGCCTCACAAGAATGTCATA TCTTGGAATGCCTTGATTGCGGGTTATGGTAATCATGGTCGAGGAGTTGAGGCTGTTGAG ATGTTTGAACGGATGCTTCATGAAGGAATGGTGCCTAACCATGTCACTTTTCTTGCTGTT CTGTCTGCTTGTAGCTATTCAGGTTTATCAGATCGTGGTTGGGAGATTTTTGAATCGATG AGTAGGGATCACAAGATTAAGCCCCGAGCAATGCACTATGCTTGTATGATTGAATTATTG GGTCGAGAAGGGCTTTTGGATGAAGCCTTTGCATTGATAAAAGATGCTCCTTTTAAGCCT ACAGTGAATATGTGGGCTGCCTTGCTGACAGCTTGTAGGGTGCACAAGAATTTTGAGCTC GGAAAATTTGCTGCTGAGAAACTTTATGGAATGGGGCCTGAAAAGCTGAGTAATTATGTT GTGCTTTTGAATATATATAACAGGTCTGGCAGGTTGGAGGAAGCTGCTGCTGTCATTCAG ACCCTGAAAAGAAGGGGTTTAAGAATGCTTCCTGCATGTAGTTGGATTGAGATTAAGAAG CAGCCATATGGTTTCATTTCTGGAGATAAATGTCATGCTCAATCAAAAGAGATCTACCAG AAATTAGACGAGTTGATGCTGGAGATCTCAAAACATGGTTATGTTCCCCAGGATAAATTC TTGCTTCCGGATGTCGATGAACAGGAAGAGCGTGTATTGTTGTACCACAGTGAGAAGTTG GCAATTGCTTTTGGGCTTATCAATACTTCAGATTGGACACCATTGCAAATTGTGCAGAGC CATCGGATTTGTGGTGACTGCCATAGTGCAATTAAGTTGATAGCCCTGGTCACTAGACGT GAAATTGTTGTGAGGGATGCTAGCAGATTCCACCATTTCAAAGATGGGAGTTGTTCTTGT GGGGACTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_17s0000g01430.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:17:1017857:1022224:1 gene:VIT_17s0000g01430 transcript:VIT_17s0000g01430.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MDIPLSRNQNMSMDQIQSNCGLPHLFSVDEILREKSFSQRLLPFNRRKRRTPFSQIRCSS LEQGLQPRPKPKPSTIELNVGKEAQVNETQLRKPSSELCGQIEKLVFFKRYHEALELFEI LELNGAYDMDSETYDALVSACIGLKSIRGVKKVFNYMINSGLDPDEYLRNRVLLMHVKCG MMIDARRLFDEMPEKNILSWNTIIGGLVDAGDYFEAFRLFLMMWQDFSDAGSRMFVTMIR ASAGLGLIFAGRQLHSCSLKTGVGGDVFVACALIDMYSKCGSIEDAQCVFDQMPEKTTVG WNSIIAGYALHGYSEEALSMYYEMRDSGVKIDNFTFSIIIRICARLASLEHAKQAHAGLV RHGFGLDIVANTALVDLYSKWGRIEDAKHVFDMMPHKNVISWNALIAGYGNHGRGVEAVE MFERMLHEGMVPNHVTFLAVLSACSYSGLSDRGWEIFESMSRDHKIKPRAMHYACMIELL GREGLLDEAFALIKDAPFKPTVNMWAALLTACRVHKNFELGKFAAEKLYGMGPEKLSNYV VLLNIYNRSGRLEEAAAVIQTLKRRGLRMLPACSWIEIKKQPYGFISGDKCHAQSKEIYQ KLDELMLEISKHGYVPQDKFLLPDVDEQEERVLLYHSEKLAIAFGLINTSDWTPLQIVQS HRICGDCHSAIKLIALVTRREIVVRDASRFHHFKDGSCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_17s0000g01430.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:17:1017857:1022224:1 gene:VIT_17s0000g01430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATATCCCGCTGTCTCGTAATCAGAACATGTCAATGGATCAGATCCAGAGTAACTGT GGCTTGCCGCATTTGTTCTCAGTTGACGAGATTCTGAGAGAAAAGTCCTTTTCTCAGCGT TTGCTTCCATTCAACAGAAGAAAACGGAGGACCCCATTTTCTCAGATCAGGTGTTCTTCC TTGGAACAAGGTCTGCAACCACGGCCCAAGCCGAAACCTTCGACTATTGAGCTGAATGTG GGAAAAGAAGCTCAAGTAAATGAAACACAACTCAGGAAACCCAGTTCAGAGCTATGTGGT CAGATCGAGAAATTAGTTTTCTTTAAGAGGTACCATGAGGCACTTGAATTATTTGAAATT TTAGAGTTGAATGGTGCTTATGATATGGATAGCGAGACATATGATGCATTAGTGAGTGCG TGTATTGGGTTGAAATCAATTAGAGGGGTGAAAAAGGTGTTCAATTATATGATTAATAGT GGGCTTGATCCGGATGAGTATTTGAGGAACAGGGTTTTGTTAATGCATGTGAAATGTGGG ATGATGATTGATGCACGTAGATTGTTTGATGAAATGCCAGAAAAGAACATTTTGTCCTGG AATACGATAATTGGGGGACTTGTGGATGCTGGAGATTATTTCGAGGCATTCCGGTTGTTT CTAATGATGTGGCAGGATTTTTCTGATGCTGGGTCCCGGATGTTTGTGACAATGATTCGG GCATCTGCTGGACTGGGGCTCATTTTTGCTGGAAGACAATTACACTCTTGTTCTTTGAAG ACAGGTGTAGGTGGAGATGTTTTTGTGGCTTGTGCACTGATTGACATGTACAGTAAGTGT GGGAGCATTGAAGATGCTCAGTGTGTTTTCGATCAGATGCCAGAGAAGACCACAGTAGGA TGGAATTCCATTATTGCGGGTTATGCACTTCATGGTTATAGCGAGGAAGCATTGAGTATG TATTATGAAATGCGGGATTCTGGCGTCAAAATAGACAATTTCACTTTTTCAATTATTATA AGAATATGTGCTAGGTTAGCTTCATTAGAACATGCTAAGCAAGCTCATGCAGGTCTAGTT CGTCATGGTTTTGGTTTAGATATTGTAGCTAACACAGCGCTTGTGGACTTGTATAGCAAA TGGGGAAGGATTGAAGATGCGAAGCATGTTTTTGACATGATGCCTCACAAGAATGTCATA TCTTGGAATGCCTTGATTGCGGGTTATGGTAATCATGGTCGAGGAGTTGAGGCTGTTGAG ATGTTTGAACGGATGCTTCATGAAGGAATGGTGCCTAACCATGTCACTTTTCTTGCTGTT CTGTCTGCTTGTAGCTATTCAGGTTTATCAGATCGTGGTTGGGAGATTTTTGAATCGATG AGTAGGGATCACAAGATTAAGCCCCGAGCAATGCACTATGCTTGTATGATTGAATTATTG GGTCGAGAAGGGCTTTTGGATGAAGCCTTTGCATTGATAAAAGATGCTCCTTTTAAGCCT ACAGTGAATATGTGGGCTGCCTTGCTGACAGCTTGTAGGGTGCACAAGAATTTTGAGCTC GGAAAATTTGCTGCTGAGAAACTTTATGGAATGGGGCCTGAAAAGCTGAGTAATTATGTT GTGCTTTTGAATATATATAACAGGTCTGGCAGGTTGGAGGAAGCTGCTGCTGTCATTCAG ACCCTGAAAAGAAGGGGTTTAAGAATGCTTCCTGCATGTAGTTGGATTGAGATTAAGAAG CAGCCATATGGTTTCATTTCTGGAGATAAATGTCATGCTCAATCAAAAGAGATCTACCAG AAATTAGACGAGTTGATGCTGGAGATCTCAAAACATGGTTATGTTCCCCAGGATAAATTC TTGCTTCCGGATGTCGATGAACAGGAAGAGCGTGTATTGTTGTACCACAGTGAGAAGTTG GCAATTGCTTTTGGGCTTATCAATACTTCAGATTGGACACCATTGCAAATTGTGCAGAGC CATCGGATTTGTGGTGACTGCCATAGTGCAATTAAGTTGATAGCCCTGGTCACTAGACGT GAAATTGTTGTGAGGGATGCTAGCAGATTCCACCATTTCAAAGATGGGAGTTGTTCTTGT GGGGACTACTGGTGATCGTGAAATATCTTATTTAGGAATACATTGAGCATGGGTGGATGA AGGAATGTGATGAGCGCAGGTAGTTTGAGCATCAGCAGCAAGGCAAAAACTGCCTTGGTT GATCTTTGCTGCTTATTGTGCATTGGACACTTCACTAATTAAGAGTATGGCATCTTGAAG TGCTCATTTGAAGAGCCTCGGCCCCATGAGAAGGAAAAGCTTGCCAAGGCTTTGGCAGGA GGACAAGAATCACAGTCTTGGCCTCAGAAAGATCTCATTTCTCAGTCACCCCACTTATTG AAGAATCTCTGCCGTTGGTGGTATGGGGATGGGGCCACTGATCAGCATTCATCCCATTGA ACCCAGTTGGAGACTTTGCAGAAATGA