Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_16s0100g00300.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:16:15675466:15679078:1 gene:VIT_16s0100g00300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGGAAAAGGAGGGATGTCTCAGGGCGGAGATGGAAGAGGTGAAGGAGAAGAGAACATG
GCAGCATGGCTTCTTGGGGTTAACAACCTCAAGATCCAACCTTTCATCCTCCCTCCTCTT
GGTCCTCATGATGTTAGAGTTAGGATGAAGGCTGTTGGTATATGTGGAAGTGATGTTCAC
TACCTCAAGAAATTGAGATGTGCAGATTTTATTGTTAAAGAGCCTATGGTGATCGGCCAT
GAATGTGCTGGGATCATTGATGAAGTTGGTCCCCAGGTGAAGTCTCTGGTGCCAGGGGAT
CGAGTGGCATTGGAGCCTGGAATCAGTTGCTGGCGATGCCAACTCTGCAAAGAAGGCCGA
TACAATCTGTGCCCTGAGATGAAATTTTTTGCTACACCTCCTGTTCATGGTTCTCTTGCC
AATCAGGTTGTGCATCCTGCAGATCTATGCTTTAAACTGCCAGACAATGTGAGCTTGGAG
GAAGGGGCAATGTGTGAGCCATTAAGTGTTGGTGTTCATGCTTGTCGCCGTGCTGATATA
GGTCCAGAGTCGAATGTATTGGTCATGGGTGCAGGGCCAATTGGGCTTGTTACAATGCTT
GCAGCTCGTGCTTTTGGAGCACCCAGAATTGTCATTGTGGATGTGGACGATTACCGGTTA
TCTGTTGCAAAGGATCTTGGTGCAGATGAGATTGTTAAAGTTTCGACAAATATTCAGGAT
GTAGCTGAAGAAGTGGTGCAGATACATAAAGCTATGGGAGCTAGAGTGGATGTGAGCTTT
GATTGTGCCGGCTTTGATAAAACCATGTCAACCGCTCTAAGTGCCACTTCTACTGGTGGC
AAAGTTTGTCTTGTGGGGATGGGGCACAATGAAATGACGGTTCCGCTTACTCCTGCTGCT
GCAAGGGAAGTTGATGTGGTTGGTGTGTTCCGGTACAAGAACACATGGCCGATATGCATC
GAGTTCCTGAGGAGTGTGAAGATCGACGTGAAGCCCCTGATAACACATAGGTTCGGCTTC
TCCCAAAGGGAGGTAGAAGAAGCCTTTGAAACCAGTGCTCGTGGTGGTACTGCCATTAAG
GTCATGTTCAACCTCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_16s0100g00300.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:16:15675466:15679078:1 gene:VIT_16s0100g00300 transcript:VIT_16s0100g00300.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MGKGGMSQGGDGRGEGEENMAAWLLGVNNLKIQPFILPPLGPHDVRVRMKAVGICGSDVH
YLKKLRCADFIVKEPMVIGHECAGIIDEVGPQVKSLVPGDRVALEPGISCWRCQLCKEGR
YNLCPEMKFFATPPVHGSLANQVVHPADLCFKLPDNVSLEEGAMCEPLSVGVHACRRADI
GPESNVLVMGAGPIGLVTMLAARAFGAPRIVIVDVDDYRLSVAKDLGADEIVKVSTNIQD
VAEEVVQIHKAMGARVDVSFDCAGFDKTMSTALSATSTGGKVCLVGMGHNEMTVPLTPAA
AREVDVVGVFRYKNTWPICIEFLRSVKIDVKPLITHRFGFSQREVEEAFETSARGGTAIK
VMFNL

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_16s0100g00300.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:16:15675466:15679078:1 gene:VIT_16s0100g00300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

TGAGGGTGATCCTAGAAAACCTTTTGCTGCTGTGTCTTCCGTCACCTCAGAGGAGTCTCA
CTGAGTTACTGAGAAGAGATTAGGGAGAGAAAAAATGGGAAAAGGAGGGATGTCTCAGGG
CGGAGATGGAAGAGGTGAAGGAGAAGAGAACATGGCAGCATGGCTTCTTGGGGTTAACAA
CCTCAAGATCCAACCTTTCATCCTCCCTCCTCTTGGTCCTCATGATGTTAGAGTTAGGAT
GAAGGCTGTTGGTATATGTGGAAGTGATGTTCACTACCTCAAGAAATTGAGATGTGCAGA
TTTTATTGTTAAAGAGCCTATGGTGATCGGCCATGAATGTGCTGGGATCATTGATGAAGT
TGGTCCCCAGGTGAAGTCTCTGGTGCCAGGGGATCGAGTGGCATTGGAGCCTGGAATCAG
TTGCTGGCGATGCCAACTCTGCAAAGAAGGCCGATACAATCTGTGCCCTGAGATGAAATT
TTTTGCTACACCTCCTGTTCATGGTTCTCTTGCCAATCAGGTTGTGCATCCTGCAGATCT
ATGCTTTAAACTGCCAGACAATGTGAGCTTGGAGGAAGGGGCAATGTGTGAGCCATTAAG
TGTTGGTGTTCATGCTTGTCGCCGTGCTGATATAGGTCCAGAGTCGAATGTATTGGTCAT
GGGTGCAGGGCCAATTGGGCTTGTTACAATGCTTGCAGCTCGTGCTTTTGGAGCACCCAG
AATTGTCATTGTGGATGTGGACGATTACCGGTTATCTGTTGCAAAGGATCTTGGTGCAGA
TGAGATTGTTAAAGTTTCGACAAATATTCAGGATGTAGCTGAAGAAGTGGTGCAGATACA
TAAAGCTATGGGAGCTAGAGTGGATGTGAGCTTTGATTGTGCCGGCTTTGATAAAACCAT
GTCAACCGCTCTAAGTGCCACTTCTACTGGTGGCAAAGTTTGTCTTGTGGGGATGGGGCA
CAATGAAATGACGGTTCCGCTTACTCCTGCTGCTGCAAGGGAAGTTGATGTGGTTGGTGT
GTTCCGGTACAAGAACACATGGCCGATATGCATCGAGTTCCTGAGGAGTGTGAAGATCGA
CGTGAAGCCCCTGATAACACATAGGTTCGGCTTCTCCCAAAGGGAGGTAGAAGAAGCCTT
TGAAACCAGTGCTCGTGGTGGTACTGCCATTAAGGTCATGTTCAACCTCTAGACTCAGCC
GGCCTGCTTTTATGTAAATATTTATTTGAATAAAATGGATTTAAAAATAAATGGTATGAA
TAAAACAGTCTTACCAGTCTAGATGGTGATGTGATTTCCATAAATTGTAGTCTCTACCAA
TCACTATGTAGAAATAGTTGCTATGGTAAAATCCCTTAATAGTTTGATGTTTTATTCTCT
TTC