Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_16s0098g01410.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:16:21629131:21632027:-1 gene:VIT_16s0098g01410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCTTGGCCTACAACCACAGACCACCACCCCTCAGCCACCACCACCCCCACAACATGAT TTCAATGTTCCTCGCAAACCCACTAACCTCTCCTTTCAAAGCCCAAACTCCACTCCCCAA TCCATGCATCTTTCTACAGCAGCCCACCACACCCATCTTTCACTACTTGATAAACAAATT GATTCAAGCACTTACGCTTCACTTCTTGAATCTTGCAGAACCCTTAACCTAGGAAAACAA GTTCATGCCCACACCCTCAAAACTGGGTTTCATGGTCATGAGTTTGTTGAAACCAAATTG CTACAAATGTACGGGAGATTTGGTTGTTTGGATGATGCAAACTTGGTGTTTGTAAAAATG CCCCAAAGAAACTTGTACTCTTGGACAGCCATTCTGAGTGTTCATGTAGATCATGGTTAC TTTGAGGAAGCTCTTTCACTCTTTGAAAAGCTGCAGCTTGATGATATTGGGTTGGAGTTT TTCGTGTTTCCCGTCGTGTTGAAGTTATGCGGTGGGCTCCGAGTATTGGAACTGGGAAGG CAGTTGCATGGGGTGGTGATCAAGTATCAACATGTTTCGAATATTTATGTGGGAAATGCT CTGATAGATATGTATGGTAAATGTGGAAGCTTAGATGATGCGAAGAAGGTTTTAGCATCG ATGAGAGAGATTGATCGGGTTTCGTGGAACTCCATTGTTACCGCTTGTGCTGCCAATGGC AAGGTGTATGAGGCTTTGGGGCTTCTGGAAAGAATGTCTTGTTCTGAAAATTCAAAGCCA AATCTTGTTTCTTGGAGTGCAGTTATAGGTGGGTTCGCACAGAATGGCTACGACAAGGAA GCTCTTGAGCTGCTGTGCAGAATGCAAGCAGCAGGGTTTGAACCAAATGCCCGAACCCTA GCTAGTGTTCTTCCTGCCTGTGCCAGATTACAAAACCTAAACCTTGGCAAGGAAATCCAT GGCTACGTCACGAGACACGGGTTCATGTCCAACCCTTTCGTTGTGAATGGATTGGTAGAT GTGTATAGGAGGTGCGCTGATATGGGAAGCGCTCTCAAGATCTTTTCAGGGTTTTCGGTG AAAAATGTGGTTTCGTATAATACAATGATAGTAGGGTACTGTGAGAATGGTAATGTGGAA AAGGCCAAGGAGTTGTTTGATCAGATGGAGCTGGTGGGGAAGGATACAATTTCATGGAAC TCGATGATTTCAGGATATGCTGACAACTTACTGTTTGATGAAGCTTTGAGCATGTTCCGG GATTTGCTGATGGAAGAAGGGATTGAAGCTGATTCTTTTACCCTAGGGAGTGTTCTTGCT GCTTGTGCAGATATGGCTTCTTTGAGACGAGGGAAGGAGGTACATGCTCAAGCCGTTGTT AGAGGTCTGCATTGGAATACCTTTGTGGGTGGAGCTTTGGTTGAAATGTACAGCAAATGT GAAGATTTGAAGGCTGCTCAGTTGGCTTTTGATGGAGTAACGGAAAGGGATACTGCTACA TGGAACGTGTTGATCTCTGGCTATGCCTGCTGCAATCAGCTTGAGAACATTCAGAATCTT ATTCAGAAGATGAAAGGAGATGGTTTTGAGCCAAATGTATATACCTGGAATGGAATTATT TCGGGTCATGTGGAGAACGGCCACAATGAGCTTGCTCTGAGATTATTCACTGAGATGCAG ACTTCAAGTCTGAGGCCTGATATATACACAGTTGGAATAATTTTACCTGCCTGCGCAAGG TTGGCGACCATTGCACGAGGCAAGCAGGTTCATGCACATTCAATAAGACAAGGATATGAG TTGGATGTTCACATTGGAGCAGCTCTAGTGGACATGTATGCAAAATGCGGAAGCATAAAG CATGCAATGCAGGTCTATAACAGGATCTCAAACCCTAATTTGGTGTCTCAAAACGCCATG CTTACTGCATATGCAATGCATGGACATGGGGATGAAGGAATTGCCCTATTTCGTAACATG CTGGGAAATGGCTTTAGACCTGACCATGTGACTTTCCTATCAGTTCTTTCTTCATGTGTG CACGCTGGGGCAGTTGAGACTGGCCATGAGTTCTTTGATCTGATGACGTATTATAATGTG ACACCAAGTTTAAAACACTACACATGTATCGTTGATCTCCTAAGTCGAGCAGGAAGGCTA GACGAAGCTTATGAGCTCGTTAAGAAAATACCAAGGAAGCCTGATTCAGTTATGTGGGGT GCCCTACTTGGGGGATGTGTTATTTGGGGTAACGTTGAGTTGGGAGAAATTGCAGCAGAA AGTCTCATAGAGTTGGAACCAAATAATACTGGAAACTATGTTCTGCTGGCAAACTTGTAT GCTTATGCAGGGAGGTGGCATGACCTAGATAGAACAAGGCAGATGATTAAGGATAGGGGA ATGCACAAGAGCCCAGGATGCAGTTGGATTGAAGATAGAGAAGATATTCATGTGTTTCTT TCCTGTGACAAATCTCATGAGAAAACAGAGGATATTTATACAACTCTAGATAATTTGAAC ACTCACATGAGAACAGGGTTAGAACACGTATATAATTGTAAGAATATAGCATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_16s0098g01410.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:16:21629131:21632027:-1 gene:VIT_16s0098g01410 transcript:VIT_16s0098g01410.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MLGLQPQTTTPQPPPPPQHDFNVPRKPTNLSFQSPNSTPQSMHLSTAAHHTHLSLLDKQI DSSTYASLLESCRTLNLGKQVHAHTLKTGFHGHEFVETKLLQMYGRFGCLDDANLVFVKM PQRNLYSWTAILSVHVDHGYFEEALSLFEKLQLDDIGLEFFVFPVVLKLCGGLRVLELGR QLHGVVIKYQHVSNIYVGNALIDMYGKCGSLDDAKKVLASMREIDRVSWNSIVTACAANG KVYEALGLLERMSCSENSKPNLVSWSAVIGGFAQNGYDKEALELLCRMQAAGFEPNARTL ASVLPACARLQNLNLGKEIHGYVTRHGFMSNPFVVNGLVDVYRRCADMGSALKIFSGFSV KNVVSYNTMIVGYCENGNVEKAKELFDQMELVGKDTISWNSMISGYADNLLFDEALSMFR DLLMEEGIEADSFTLGSVLAACADMASLRRGKEVHAQAVVRGLHWNTFVGGALVEMYSKC EDLKAAQLAFDGVTERDTATWNVLISGYACCNQLENIQNLIQKMKGDGFEPNVYTWNGII SGHVENGHNELALRLFTEMQTSSLRPDIYTVGIILPACARLATIARGKQVHAHSIRQGYE LDVHIGAALVDMYAKCGSIKHAMQVYNRISNPNLVSQNAMLTAYAMHGHGDEGIALFRNM LGNGFRPDHVTFLSVLSSCVHAGAVETGHEFFDLMTYYNVTPSLKHYTCIVDLLSRAGRL DEAYELVKKIPRKPDSVMWGALLGGCVIWGNVELGEIAAESLIELEPNNTGNYVLLANLY AYAGRWHDLDRTRQMIKDRGMHKSPGCSWIEDREDIHVFLSCDKSHEKTEDIYTTLDNLN THMRTGLEHVYNCKNIA

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_16s0098g01410.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:16:21629131:21632027:-1 gene:VIT_16s0098g01410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	CTCTCCTCTACTACCCGGCACAATCTGATTGGTAAATGTGACGAAAATAGACCCATCCTT TATCCATCATAAACCCTTCTTAAACCTTCGTTATAACTTTTGCCTTTGTTCCCCACAGCC AAAATGCTTGGCCTACAACCACAGACCACCACCCCTCAGCCACCACCACCCCCACAACAT GATTTCAATGTTCCTCGCAAACCCACTAACCTCTCCTTTCAAAGCCCAAACTCCACTCCC CAATCCATGCATCTTTCTACAGCAGCCCACCACACCCATCTTTCACTACTTGATAAACAA ATTGATTCAAGCACTTACGCTTCACTTCTTGAATCTTGCAGAACCCTTAACCTAGGAAAA CAAGTTCATGCCCACACCCTCAAAACTGGGTTTCATGGTCATGAGTTTGTTGAAACCAAA TTGCTACAAATGTACGGGAGATTTGGTTGTTTGGATGATGCAAACTTGGTGTTTGTAAAA ATGCCCCAAAGAAACTTGTACTCTTGGACAGCCATTCTGAGTGTTCATGTAGATCATGGT TACTTTGAGGAAGCTCTTTCACTCTTTGAAAAGCTGCAGCTTGATGATATTGGGTTGGAG TTTTTCGTGTTTCCCGTCGTGTTGAAGTTATGCGGTGGGCTCCGAGTATTGGAACTGGGA AGGCAGTTGCATGGGGTGGTGATCAAGTATCAACATGTTTCGAATATTTATGTGGGAAAT GCTCTGATAGATATGTATGGTAAATGTGGAAGCTTAGATGATGCGAAGAAGGTTTTAGCA TCGATGAGAGAGATTGATCGGGTTTCGTGGAACTCCATTGTTACCGCTTGTGCTGCCAAT GGCAAGGTGTATGAGGCTTTGGGGCTTCTGGAAAGAATGTCTTGTTCTGAAAATTCAAAG CCAAATCTTGTTTCTTGGAGTGCAGTTATAGGTGGGTTCGCACAGAATGGCTACGACAAG GAAGCTCTTGAGCTGCTGTGCAGAATGCAAGCAGCAGGGTTTGAACCAAATGCCCGAACC CTAGCTAGTGTTCTTCCTGCCTGTGCCAGATTACAAAACCTAAACCTTGGCAAGGAAATC CATGGCTACGTCACGAGACACGGGTTCATGTCCAACCCTTTCGTTGTGAATGGATTGGTA GATGTGTATAGGAGGTGCGCTGATATGGGAAGCGCTCTCAAGATCTTTTCAGGGTTTTCG GTGAAAAATGTGGTTTCGTATAATACAATGATAGTAGGGTACTGTGAGAATGGTAATGTG GAAAAGGCCAAGGAGTTGTTTGATCAGATGGAGCTGGTGGGGAAGGATACAATTTCATGG AACTCGATGATTTCAGGATATGCTGACAACTTACTGTTTGATGAAGCTTTGAGCATGTTC CGGGATTTGCTGATGGAAGAAGGGATTGAAGCTGATTCTTTTACCCTAGGGAGTGTTCTT GCTGCTTGTGCAGATATGGCTTCTTTGAGACGAGGGAAGGAGGTACATGCTCAAGCCGTT GTTAGAGGTCTGCATTGGAATACCTTTGTGGGTGGAGCTTTGGTTGAAATGTACAGCAAA TGTGAAGATTTGAAGGCTGCTCAGTTGGCTTTTGATGGAGTAACGGAAAGGGATACTGCT ACATGGAACGTGTTGATCTCTGGCTATGCCTGCTGCAATCAGCTTGAGAACATTCAGAAT CTTATTCAGAAGATGAAAGGAGATGGTTTTGAGCCAAATGTATATACCTGGAATGGAATT ATTTCGGGTCATGTGGAGAACGGCCACAATGAGCTTGCTCTGAGATTATTCACTGAGATG CAGACTTCAAGTCTGAGGCCTGATATATACACAGTTGGAATAATTTTACCTGCCTGCGCA AGGTTGGCGACCATTGCACGAGGCAAGCAGGTTCATGCACATTCAATAAGACAAGGATAT GAGTTGGATGTTCACATTGGAGCAGCTCTAGTGGACATGTATGCAAAATGCGGAAGCATA AAGCATGCAATGCAGGTCTATAACAGGATCTCAAACCCTAATTTGGTGTCTCAAAACGCC ATGCTTACTGCATATGCAATGCATGGACATGGGGATGAAGGAATTGCCCTATTTCGTAAC ATGCTGGGAAATGGCTTTAGACCTGACCATGTGACTTTCCTATCAGTTCTTTCTTCATGT GTGCACGCTGGGGCAGTTGAGACTGGCCATGAGTTCTTTGATCTGATGACGTATTATAAT GTGACACCAAGTTTAAAACACTACACATGTATCGTTGATCTCCTAAGTCGAGCAGGAAGG CTAGACGAAGCTTATGAGCTCGTTAAGAAAATACCAAGGAAGCCTGATTCAGTTATGTGG GGTGCCCTACTTGGGGGATGTGTTATTTGGGGTAACGTTGAGTTGGGAGAAATTGCAGCA GAAAGTCTCATAGAGTTGGAACCAAATAATACTGGAAACTATGTTCTGCTGGCAAACTTG TATGCTTATGCAGGGAGGTGGCATGACCTAGATAGAACAAGGCAGATGATTAAGGATAGG GGAATGCACAAGAGCCCAGGATGCAGTTGGATTGAAGATAGAGAAGATATTCATGTGTTT CTTTCCTGTGACAAATCTCATGAGAAAACAGAGGATATTTATACAACTCTAGATAATTTG AACACTCACATGAGAACAGGGTTAGAACACGTATATAATTGTAAGAATATAGCATGAGAT TCGAAGCTATGTATCATATTTGTACAACTTGAAAGCATAAGTTTTCTCCAGTGTCATGTT GAACCATTACTCTGATAAATAATGGTTAATAGACAGAACAAATAAAAGCTCGATGGAACA CTTCCTACTTGCAAGACAACAATGCAAAAATGCCTGTTAAGTACCAGAAATGTGAAACTG AGCACCTATGTTTTGAT