Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_16s0098g01350.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:16:21600133:21603633:-1 gene:VIT_16s0098g01350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTGAGATTGGTGAAGCTGCAGCCATGGAGGCTGGAGTTTCCTACGAGTGTCCTATC AAACAAGTGGATGTCACAGTTCCTAAAACTGATGATCCCACTATTCCTGTTCTCACCTTC AGAATGTGGGTTCTGGGTCTGTCTTCATGTATTGTTTTATCCTTTGTGAACCAGTTCTTC TGGTACAGATCACAGCCATTGATAATTTCATCAATATCTGCACAGATTGCTGTTGTGCCT ATAGGCCATTTGATGGCCAAAAAGATCACAAAGCGGGTGTTCTTAAAGGGTTCTAGGTGG GAGTTTACACTTAATCCTGGGCCTTTTAATGTCAAGGAGCATGTTTTGATCACCATTTTC GCCAACTCGGGTGCTGGAACTGTTTATGCTACTCATATCTTGACTGCAGTGAAGCTTCTG TATAAGAGGAACCTCACTTTCATTCCTGCCTTGCTTGTTATGACAACCACTCAGGTGTTG GGGTTCGGCTGGGCAGGACTTTTCCGGAAATTTCTGGTTGAGCCGGGAGAGATGTGGTGG CCTTCTAACCTGGTTCAGGTTTCACTGTTCAGAGCTCTACATGAGAAGGAAAAGAGGCCT AAAGGCGGCACAACCCGGACTCAGTTCTTCCTCATAGTCTTTATTTGCAGTTTCACATAC TATGTGGCTCCTGGGTATCTCATCAACATGTTAACATCTTTCTCCTGGGTCTGTTGGCTT GCTCCTAAATCCATTCTGGTGCAACAACTCGGGTCAGGCTTGGAAGGCCTAGGAATCGGC TCAATTGGGTTGGATTGGTCTACGATTTCATCATATCTAGGGAGTCCATTGGCTAGCCCC TGGTTTGCCACAGCCAACGTTGCCCTTGGATTCTGCCTAGTGATGTATGTGATGACACCT GCCACATACTGGAGCAATGTCTACAATGCCAAGAACTTCCCTCTATATTCTGAAAAGCTT TTCACGTCGAATGGTTCACGTTATAACATTTTAAGCATCATTGATTCTAACTTTCATCTT AGTAAAGAACAATATGTGAAGAGTGGGCCTTTAAATATGAGCACCTTCTTTGCTATGACC TATGGTCTCGGGTTTGCCACACTTTCTGCTACTATTGTCCATGTCGCACTCTTCAATGGC AGTGAGCTATGGAAACAAACAAAAGGTGCCTTTGGAGAGAAAAAGATGGATATACATACA TGGCTTATGAAGAAGTACAAGTCAGTGCCCAATTGGTGGTTTTTTGTGATCCACGTTGTG AACATTGCCACTATCATATTTGCATGTGAGTATTACAATGACGTACTTCAGTTGCCATGG TGGGGTGTCTTGCTTGCTTGTGCCATTGCCTTTTTCTTCACCCTTCCAATCGGCATCATC ACTGCTACAACAAACCAGACACCAGGTTTGAACATTGTAACAGAATATGTTATGGGATAT ATGTACCCAGGCCGTCCTGTTGCCAACATGTGCTTCAAGGTTTATGGGTACATCAGCATG ACTCAAGCTCTAACCTTTCTGGCCGACTTCAAGCTGGGCCACTACATGAAGATTCCACCT AGATCAATGTTCATGGCACAGGTGGTAGGAACAGTTGTGGCTGTAATTGTATACGTGATA ACTGCCTGGTGGCTGATGGCAACCATTCCCAACCTCTGTGATACCACTATGTTGCCTGCA GACAGTCCATGGAGATGCCCAATGGACAATGTCTTCTTCGATGCCTCTGTTATTTGGGGG CTTATTGGCACTCGCCGAATCTTTGGAAACCTGGGTGCCTACTCGAATGTCAACTGGTTC TTTCTGCTTGGAGCCATTGCCCCTCTCCTAGTCTGGCTCATGCACAAGGCATTCCCAAAA AAGAAATGGATTCCCCTTATCCACATGCCAGTCTTGTTAGGTTCCACAGCAATGATGCCC CCAGCCTCTGCTGTTAACTTCACGAGTTGGATCATTGTTGGGTTCCTCTCTGGATTTGTA ATCTTCAGGCACAAACCAAAGTTGTGGGAGCGCTATAACTATGTTGTTTCTGGTGGTCTT GATGCTGGAACTGCCTTCATGACCATATTAATATTCCTTACCCTCGGGTCCAGGAATGTT AGCATCGACTGGTGGGGAAACAATCCAGAAGGATGCCCCTTGGCTTCATGCCCAACTGCC AAAGGAATTGTAGTTGATGGCTGCCCTGTTTTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_16s0098g01350.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:16:21600133:21603633:-1 gene:VIT_16s0098g01350 transcript:VIT_16s0098g01350.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAEIGEAAAMEAGVSYECPIKQVDVTVPKTDDPTIPVLTFRMWVLGLSSCIVLSFVNQFF WYRSQPLIISSISAQIAVVPIGHLMAKKITKRVFLKGSRWEFTLNPGPFNVKEHVLITIF ANSGAGTVYATHILTAVKLLYKRNLTFIPALLVMTTTQVLGFGWAGLFRKFLVEPGEMWW PSNLVQVSLFRALHEKEKRPKGGTTRTQFFLIVFICSFTYYVAPGYLINMLTSFSWVCWL APKSILVQQLGSGLEGLGIGSIGLDWSTISSYLGSPLASPWFATANVALGFCLVMYVMTP ATYWSNVYNAKNFPLYSEKLFTSNGSRYNILSIIDSNFHLSKEQYVKSGPLNMSTFFAMT YGLGFATLSATIVHVALFNGSELWKQTKGAFGEKKMDIHTWLMKKYKSVPNWWFFVIHVV NIATIIFACEYYNDVLQLPWWGVLLACAIAFFFTLPIGIITATTNQTPGLNIVTEYVMGY MYPGRPVANMCFKVYGYISMTQALTFLADFKLGHYMKIPPRSMFMAQVVGTVVAVIVYVI TAWWLMATIPNLCDTTMLPADSPWRCPMDNVFFDASVIWGLIGTRRIFGNLGAYSNVNWF FLLGAIAPLLVWLMHKAFPKKKWIPLIHMPVLLGSTAMMPPASAVNFTSWIIVGFLSGFV IFRHKPKLWERYNYVVSGGLDAGTAFMTILIFLTLGSRNVSIDWWGNNPEGCPLASCPTA KGIVVDGCPVF

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_16s0098g01350.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:16:21600133:21603633:-1 gene:VIT_16s0098g01350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTGAGATTGGTGAAGCTGCAGCCATGGAGGCTGGAGTTTCCTACGAGTGTCCTATC AAACAAGTGGATGTCACAGTTCCTAAAACTGATGATCCCACTATTCCTGTTCTCACCTTC AGAATGTGGGTTCTGGGTCTGTCTTCATGTATTGTTTTATCCTTTGTGAACCAGTTCTTC TGGTACAGATCACAGCCATTGATAATTTCATCAATATCTGCACAGATTGCTGTTGTGCCT ATAGGCCATTTGATGGCCAAAAAGATCACAAAGCGGGTGTTCTTAAAGGGTTCTAGGTGG GAGTTTACACTTAATCCTGGGCCTTTTAATGTCAAGGAGCATGTTTTGATCACCATTTTC GCCAACTCGGGTGCTGGAACTGTTTATGCTACTCATATCTTGACTGCAGTGAAGCTTCTG TATAAGAGGAACCTCACTTTCATTCCTGCCTTGCTTGTTATGACAACCACTCAGGTGTTG GGGTTCGGCTGGGCAGGACTTTTCCGGAAATTTCTGGTTGAGCCGGGAGAGATGTGGTGG CCTTCTAACCTGGTTCAGGTTTCACTGTTCAGAGCTCTACATGAGAAGGAAAAGAGGCCT AAAGGCGGCACAACCCGGACTCAGTTCTTCCTCATAGTCTTTATTTGCAGTTTCACATAC TATGTGGCTCCTGGGTATCTCATCAACATGTTAACATCTTTCTCCTGGGTCTGTTGGCTT GCTCCTAAATCCATTCTGGTGCAACAACTCGGGTCAGGCTTGGAAGGCCTAGGAATCGGC TCAATTGGGTTGGATTGGTCTACGATTTCATCATATCTAGGGAGTCCATTGGCTAGCCCC TGGTTTGCCACAGCCAACGTTGCCCTTGGATTCTGCCTAGTGATGTATGTGATGACACCT GCCACATACTGGAGCAATGTCTACAATGCCAAGAACTTCCCTCTATATTCTGAAAAGCTT TTCACGTCGAATGGTTCACGTTATAACATTTTAAGCATCATTGATTCTAACTTTCATCTT AGTAAAGAACAATATGTGAAGAGTGGGCCTTTAAATATGAGCACCTTCTTTGCTATGACC TATGGTCTCGGGTTTGCCACACTTTCTGCTACTATTGTCCATGTCGCACTCTTCAATGGC AGTGAGCTATGGAAACAAACAAAAGGTGCCTTTGGAGAGAAAAAGATGGATATACATACA TGGCTTATGAAGAAGTACAAGTCAGTGCCCAATTGGTGGTTTTTTGTGATCCACGTTGTG AACATTGCCACTATCATATTTGCATGTGAGTATTACAATGACGTACTTCAGTTGCCATGG TGGGGTGTCTTGCTTGCTTGTGCCATTGCCTTTTTCTTCACCCTTCCAATCGGCATCATC ACTGCTACAACAAACCAGACACCAGGTTTGAACATTGTAACAGAATATGTTATGGGATAT ATGTACCCAGGCCGTCCTGTTGCCAACATGTGCTTCAAGGTTTATGGGTACATCAGCATG ACTCAAGCTCTAACCTTTCTGGCCGACTTCAAGCTGGGCCACTACATGAAGATTCCACCT AGATCAATGTTCATGGCACAGGTGGTAGGAACAGTTGTGGCTGTAATTGTATACGTGATA ACTGCCTGGTGGCTGATGGCAACCATTCCCAACCTCTGTGATACCACTATGTTGCCTGCA GACAGTCCATGGAGATGCCCAATGGACAATGTCTTCTTCGATGCCTCTGTTATTTGGGGG CTTATTGGCACTCGCCGAATCTTTGGAAACCTGGGTGCCTACTCGAATGTCAACTGGTTC TTTCTGCTTGGAGCCATTGCCCCTCTCCTAGTCTGGCTCATGCACAAGGCATTCCCAAAA AAGAAATGGATTCCCCTTATCCACATGCCAGTCTTGTTAGGTTCCACAGCAATGATGCCC CCAGCCTCTGCTGTTAACTTCACGAGTTGGATCATTGTTGGGTTCCTCTCTGGATTTGTA ATCTTCAGGCACAAACCAAAGTTGTGGGAGCGCTATAACTATGTTGTTTCTGGTGGTCTT GATGCTGGAACTGCCTTCATGACCATATTAATATTCCTTACCCTCGGGTCCAGGAATGTT AGCATCGACTGGTGGGGAAACAATCCAGAAGGATGCCCCTTGGCTTCATGCCCAACTGCC AAAGGAATTGTAGTTGATGGCTGCCCTGTTTTCTGATACAGCCTTT