Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_16s0098g00850.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:16:21165470:21178109:1 gene:VIT_16s0098g00850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGTTCGACCAGTATGACCCCAACAACTATCCTAGAGTCAGATGAGGAGGCATCTCTG TTTTCCATGCAGCTCGTCAGTGCCTCAGTTCTCCCCATGGTCCTCAAATCAGCTTTGGAG CTCGACCTTCTTGAGATAATCGCCAAGGCTGGCCCTGGGGCGTTTGTCTCCACTTCTGAG ATTGCTGCTCAGATCCCCACCCACAACCCAGAAGCCCCTGTCATGCTGGACCGTATCCTC CGCCTTCTTGCCACCTATGCTGTGGTCAAGTGCTCTCTTCGCAACCTCCCTGATGGAGGG GTTGAGAGGCTCTATGGGCTCGCCCCTGTCTGCAAGTACTTGACTAGGAACGAAGATGGG GTGTCTGTAGCCCCTCTTCTCCTCATGAATCAGGACAAGGTCCTCATGGAGAGCTGGTAC TATTTGAAAGATGCAGTTCTTGATGGTGGAATCCCCTTCAACAAAGCCTATGGAATGACT GCCTTTGAGTATCATGGCACAGATCCTAGATTCAACAAGGTGTTCAACAATGGAATGTCT GGTCATTCCACCATTACCATGAAGAAAATTCTTGAAGCCTACAAGGGTTTTGAGGGCCTC ACCTCAATTGTTGATGTTGGTGGTGGGACTGGAGCCACCCTTAACATGATCATATCCAAA TACCCCACTATTAAGGGCATTAACTTTGACTTGCCTCATGTTATTGATGATGCCCCATCT TATCCTGGTGTGGAGAATGTTGGGGGAGACATGTTTGTGAGTGTCCCAAAGGGAGATGCC ATCTTCATGAAGTGGATATGCCATGATTGGAGTGATGCTCATTGCTTGAAGTTCTTGAAG AACTGTTATCAGGCACTTCCAGACAATGGGAAGGTAATTGTTGCTGAATGCATCCTTCCT GTGGCCCCAGACACCAGCCTAGCCACCAAGGGTGTCGTCCATATCGACGTTATCATGTTG GCTCATAACCCTGGTGGAAAAGAGAGGACCGAGAAAGAATTCGAAGCCTTGGCCAAGGGA GCTGGATTCCAAGGCTTCAAGGTAGTGTGTTGTGCCTTCAACACTTGGATCATGGAATTT TGTAAAACTAACGGTTCGAACAGTATGAACCAAGGTTTTTCTTCTTCTGCCGAGTTCAAT TCCCCCGTCCCAGCAACTATCCCAAAGTCAGAGGAAGATACGTTTGTGTTTGCCACTCTT CTCACCAGTGCCTCAGTTCTCCCCATGGCCCTCAAATCAGCTTTGGAGCTCGACCTTCTT GAGATAATCGCCAAGGCTGGCCCTGGGGCGTTTGTCTCCACTTCTGAGATTGCTGCTAAG GTCACCAAACGCAACCCAAAAGCCCCTGTCATGCTAGACCGTATCCTCCGCCTTCTTGCC ACCTATGATGTGGTCAAGTGCTCTCTCCGCGACAGCCCTGATGGAGGGGTTGAGAGGCTC TATGGGCTCGGCCCTGTCTGCAAGTACTTCACTACGAACGAAGATGGGGTGTCTGTAGCC CCTCTTCTCCTCATGAATCAGGACAAGGTCCCCATGCAGAGCTGGTACCATTTGAAAGAT GCAGTTCTTGATGGTGGAATCCCCTTCAACAAGGCCTATGGAATGACTGACTTTGAGTAT CATGGCACAGAACCTAGATTCAACAAGGTATTCAACAATGGAGTGTCTGGTCATCCCACC ATTACCATGAAGAAAATTCTTGAAGCCTACAAGGGTTTTGAGGGCCTCACCTCAATTGTT GATGTTGGTGGTGGGACTGGAGCCACCCTTAACATGATCATATCCAAATACCCCACTATT AAGGGCATTAACTTTGACTTGCCTCATGTTATTGATGATGCCCCATCTTATCCTGGTGTG GAGCATGTTGGGGGAGACATGTTTGTGAGTGTCCCAAAGGGAGATGCCATCTTCATGAAG TGGATGTGCTATGAGTGGGATGATGCTCATTGCTTGAAGTTCTTGGAGAATTGTTATCAG GCACTTCCAGACAATGGAAAGGTAATTGTTGCTGAGTGCATCCTTCCTGTGGTCCCAGAC ACCAGCCTAGCCACCAAGACTGCCGTCCATATTGACGTTATTATGTTGGCTTATAACACT GGTGGAAAAGCGAGGACAGAGAAAGAGTTCGAAGCCTTAGCCAAGGGAGCTGGATTCCAA GGTTTCAAGGTAGTGTGTTGTGCCTTCAACAGTTGGATCATGGAATTTTGTAAAACTGCT TGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_16s0098g00850.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:16:21165470:21178109:1 gene:VIT_16s0098g00850 transcript:VIT_16s0098g00850.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MGSTSMTPTTILESDEEASLFSMQLVSASVLPMVLKSALELDLLEIIAKAGPGAFVSTSE IAAQIPTHNPEAPVMLDRILRLLATYAVVKCSLRNLPDGGVERLYGLAPVCKYLTRNEDG VSVAPLLLMNQDKVLMESWYYLKDAVLDGGIPFNKAYGMTAFEYHGTDPRFNKVFNNGMS GHSTITMKKILEAYKGFEGLTSIVDVGGGTGATLNMIISKYPTIKGINFDLPHVIDDAPS YPGVENVGGDMFVSVPKGDAIFMKWICHDWSDAHCLKFLKNCYQALPDNGKVIVAECILP VAPDTSLATKGVVHIDVIMLAHNPGGKERTEKEFEALAKGAGFQGFKVVCCAFNTWIMEF CKTNGSNSMNQGFSSSAEFNSPVPATIPKSEEDTFVFATLLTSASVLPMALKSALELDLL EIIAKAGPGAFVSTSEIAAKVTKRNPKAPVMLDRILRLLATYDVVKCSLRDSPDGGVERL YGLGPVCKYFTTNEDGVSVAPLLLMNQDKVPMQSWYHLKDAVLDGGIPFNKAYGMTDFEY HGTEPRFNKVFNNGVSGHPTITMKKILEAYKGFEGLTSIVDVGGGTGATLNMIISKYPTI KGINFDLPHVIDDAPSYPGVEHVGGDMFVSVPKGDAIFMKWMCYEWDDAHCLKFLENCYQ ALPDNGKVIVAECILPVVPDTSLATKTAVHIDVIMLAYNTGGKARTEKEFEALAKGAGFQ GFKVVCCAFNSWIMEFCKTA

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_16s0098g00850.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:16:21165470:21178109:1 gene:VIT_16s0098g00850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ACCCCCATCTTCTTCTTCTTCCTGTGATTCTGATTCTGGTTCTTGGGTTTTTCTTTCTTG TTGAAATTGAATATGGGTTCGACCAGTATGACCCCAACAACTATCCTAGAGTCAGATGAG GAGGCATCTCTGTTTTCCATGCAGCTCGTCAGTGCCTCAGTTCTCCCCATGGTCCTCAAA TCAGCTTTGGAGCTCGACCTTCTTGAGATAATCGCCAAGGCTGGCCCTGGGGCGTTTGTC TCCACTTCTGAGATTGCTGCTCAGATCCCCACCCACAACCCAGAAGCCCCTGTCATGCTG GACCGTATCCTCCGCCTTCTTGCCACCTATGCTGTGGTCAAGTGCTCTCTTCGCAACCTC CCTGATGGAGGGGTTGAGAGGCTCTATGGGCTCGCCCCTGTCTGCAAGTACTTGACTAGG AACGAAGATGGGGTGTCTGTAGCCCCTCTTCTCCTCATGAATCAGGACAAGGTCCTCATG GAGAGCTGGTACTATTTGAAAGATGCAGTTCTTGATGGTGGAATCCCCTTCAACAAAGCC TATGGAATGACTGCCTTTGAGTATCATGGCACAGATCCTAGATTCAACAAGGTGTTCAAC AATGGAATGTCTGGTCATTCCACCATTACCATGAAGAAAATTCTTGAAGCCTACAAGGGT TTTGAGGGCCTCACCTCAATTGTTGATGTTGGTGGTGGGACTGGAGCCACCCTTAACATG ATCATATCCAAATACCCCACTATTAAGGGCATTAACTTTGACTTGCCTCATGTTATTGAT GATGCCCCATCTTATCCTGGTGTGGAGAATGTTGGGGGAGACATGTTTGTGAGTGTCCCA AAGGGAGATGCCATCTTCATGAAGTGGATATGCCATGATTGGAGTGATGCTCATTGCTTG AAGTTCTTGAAGAACTGTTATCAGGCACTTCCAGACAATGGGAAGGTAATTGTTGCTGAA TGCATCCTTCCTGTGGCCCCAGACACCAGCCTAGCCACCAAGGGTGTCGTCCATATCGAC GTTATCATGTTGGCTCATAACCCTGGTGGAAAAGAGAGGACCGAGAAAGAATTCGAAGCC TTGGCCAAGGGAGCTGGATTCCAAGGCTTCAAGGTAGTGTGTTGTGCCTTCAACACTTGG ATCATGGAATTTTGTAAAACTAACGGTTCGAACAGTATGAACCAAGGTTTTTCTTCTTCT GCCGAGTTCAATTCCCCCGTCCCAGCAACTATCCCAAAGTCAGAGGAAGATACGTTTGTG TTTGCCACTCTTCTCACCAGTGCCTCAGTTCTCCCCATGGCCCTCAAATCAGCTTTGGAG CTCGACCTTCTTGAGATAATCGCCAAGGCTGGCCCTGGGGCGTTTGTCTCCACTTCTGAG ATTGCTGCTAAGGTCACCAAACGCAACCCAAAAGCCCCTGTCATGCTAGACCGTATCCTC CGCCTTCTTGCCACCTATGATGTGGTCAAGTGCTCTCTCCGCGACAGCCCTGATGGAGGG GTTGAGAGGCTCTATGGGCTCGGCCCTGTCTGCAAGTACTTCACTACGAACGAAGATGGG GTGTCTGTAGCCCCTCTTCTCCTCATGAATCAGGACAAGGTCCCCATGCAGAGCTGGTAC CATTTGAAAGATGCAGTTCTTGATGGTGGAATCCCCTTCAACAAGGCCTATGGAATGACT GACTTTGAGTATCATGGCACAGAACCTAGATTCAACAAGGTATTCAACAATGGAGTGTCT GGTCATCCCACCATTACCATGAAGAAAATTCTTGAAGCCTACAAGGGTTTTGAGGGCCTC ACCTCAATTGTTGATGTTGGTGGTGGGACTGGAGCCACCCTTAACATGATCATATCCAAA TACCCCACTATTAAGGGCATTAACTTTGACTTGCCTCATGTTATTGATGATGCCCCATCT TATCCTGGTGTGGAGCATGTTGGGGGAGACATGTTTGTGAGTGTCCCAAAGGGAGATGCC ATCTTCATGAAGTGGATGTGCTATGAGTGGGATGATGCTCATTGCTTGAAGTTCTTGGAG AATTGTTATCAGGCACTTCCAGACAATGGAAAGGTAATTGTTGCTGAGTGCATCCTTCCT GTGGTCCCAGACACCAGCCTAGCCACCAAGACTGCCGTCCATATTGACGTTATTATGTTG GCTTATAACACTGGTGGAAAAGCGAGGACAGAGAAAGAGTTCGAAGCCTTAGCCAAGGGA GCTGGATTCCAAGGTTTCAAGGTAGTGTGTTGTGCCTTCAACAGTTGGATCATGGAATTT TGTAAAACTGCTTGAGCCTCTAGCTTGGTGTCCATTGCAAGTAGTTTGTGAGTATCCTGA TTCTATATCTTGTCTTCTTTCATAAGTGGCTTCATACTGTGTATGAAGTTGTTATACAAT GAAATCAGAAGCTATTTTTGTCATTTCTTATATCAAATAAGATTCTTCATGTTGATTAGT C