Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_16s0050g02550.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:16:19516019:19518211:-1 gene:VIT_16s0050g02550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATGTTGATCAAAGCTTCCATTTCCAAAGCTTGGAAACACCAAAGGCTAAAGGAGTTC AAATTATACACAGCACATCAATCCAATCTCAGTGAAATTATATCCACAAACATTGCTATA AGCAATTATGCAAAACAATCAAAACTGGATGTTGCCCGCCAACTGTTCGACCAGATGCCT CAACGAACTGTCGTGTCGTGGAACACTATGATATCTAGCTACTCAAAGCATGGACGATTC AGTGAAGCTCTATTTCTAGTTTACTCCATGCACCGCAGCCATATGAAGCTCAGTGAATCC ACGTTCTCGTCGGTTTTGAGTGTTTGTGCTCGTTTGAGGTGTTTGCGCGACGGGAAGTTG ATCCATTGTCTTGTTCTAAAATCTGGGTCGGAGAGTTTTGAGCTTGTGGGGAGTGCTTTG CTGTATTTTTATGCAAGTTGCTTTGAAATTGGGGAGGCACGGCGGGTTTTTGATGTGTTG GTTCGGAGGAATGAGGTGTTGTGGAGTTTGATGCTTGTGGGGTATGTGACTTGTAATGTG ATGGATGATGCTTTGAGTGTGTTTGTGAAGATGCCGAGGAGAGATGTTGTTGCCTGGACG ACTTTGATTTCTGGGTTTTCTAAGAATGGGGATGGTTGTGGGAAGGCCTTGGAGATTTTT AGGTTGATGATGAGGAGTGGTGAAACGACTCCCAATGAGTTTACTTTTGATTGTGTGGTG AGGGCTTGTGGTAGACTCGGGATTTTGAGTGTAGGGAGGACTGTTCATGGGCTTTTGATG AAATGTGGGTTGGAATATGATCCCTCAATTGGAGGGGCTCTTGTTGAGTTCTATTGTGAA TGCGAAGCTATTGATGATGCCTTGAGAGTGTGTAAAGGCGTTGTTAACCCGTGTTTAAAT GCTTTGAATTCCTTAATTGAAGGGCTTATATCGATGGGCAGAATTGAGGATGCTGAGCTG GTTTTTAACGGAATGACAGAGATGAATCCAGTTTCATATAACTTAATGATTAAAGGGTAT GCAGTTGGTGGTCAAATGGATGATTCTAAGAGATTGTTTGAGAAAATGCCTTGCAGAACT ATATTTTCTTCAAATACTATGATTTCAGTGTACTCTAGGAATGGAGAAATTGATAAAGCT TTGGAACTTTTTGAAGAAACTAAGAATGAAAAAGATCCTGTGACATGGAATTCAATGATA TCGGGTTATATTCATAGTGGTCAACCTGAAGAGGCTTTGAAACTATATATAACAATGCAC AGATTATCAATACAACAAACTCAATCTACATTCTCTGCTCTGTTCCATGCATGTTCATGT CTTGGATCCCTTCATCAAGGACAATTACTGCATGCCCATCTGATTAAAACACCATTTGAA TCAAATGTTTATGTTGGAACATCCCTCATAGATATGTACTCCAAATGTGGGAGCATCATG GAGGCTCAAACATCTTTTGTGAGCATCTTTTCACCCAACGTGGCAGCTTGGACGGCTCTG ATCAATGGTCATGCATATCATGGGCTCGGGTCTGAGGCAATTTCACTCTTTGATCGTATG ATAGAGCAAGGATTAGCCCCAAATGGAGCTACTTTTGTTGGAGTTCTGTCTGCTTGTAGT CGTGCAGGTCTGGTCAATGAAGGAATGAAAATTTTCCACTCAATGGAGAGATGTTATAGT GTAACCCCAACATTAGAACACTATGCATGTGTGGTTGATCTTCTGGGCCGATCAGGCCAT ATACGAGAAGCAGAGGAGTTTATCAAGAAGATGCCACTTGAAGCAGATGGGGTTGTCTGG GGAGCATTGCTTAGTGCTTGTTGGTTCTGGATGGACCTGGAAGTGGGTGAGAGAGTGGCT GAGAAGATGTTTAGTTTTGATCCCAAGCCAATCTCTTCTTATGTTATTTTGTCCAACATA TATGCAGGGCTAGGGAGGTGGAGGGAGAAGATGATGGTAAGGAAGATATTGAGGGGTTTC AAAGTGAAGAAGGATCCTGGATGTAGTTGGATTGAGCTTAACAATAAAATTCATGTGTTC TCTATAGAAGATAGATCCCATCCATATTGTAATATGATTTATGCAACTTTGGAGCACCTA ACAGCAAATATAAACTCAGTTGTTCATTTTGATCATGTTTCTATACCAATAACACAGGCT GTTAATTTCAGCACACCATCCTTTAATTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_16s0050g02550.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:16:19516019:19518211:-1 gene:VIT_16s0050g02550 transcript:VIT_16s0050g02550.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MMLIKASISKAWKHQRLKEFKLYTAHQSNLSEIISTNIAISNYAKQSKLDVARQLFDQMP QRTVVSWNTMISSYSKHGRFSEALFLVYSMHRSHMKLSESTFSSVLSVCARLRCLRDGKL IHCLVLKSGSESFELVGSALLYFYASCFEIGEARRVFDVLVRRNEVLWSLMLVGYVTCNV MDDALSVFVKMPRRDVVAWTTLISGFSKNGDGCGKALEIFRLMMRSGETTPNEFTFDCVV RACGRLGILSVGRTVHGLLMKCGLEYDPSIGGALVEFYCECEAIDDALRVCKGVVNPCLN ALNSLIEGLISMGRIEDAELVFNGMTEMNPVSYNLMIKGYAVGGQMDDSKRLFEKMPCRT IFSSNTMISVYSRNGEIDKALELFEETKNEKDPVTWNSMISGYIHSGQPEEALKLYITMH RLSIQQTQSTFSALFHACSCLGSLHQGQLLHAHLIKTPFESNVYVGTSLIDMYSKCGSIM EAQTSFVSIFSPNVAAWTALINGHAYHGLGSEAISLFDRMIEQGLAPNGATFVGVLSACS RAGLVNEGMKIFHSMERCYSVTPTLEHYACVVDLLGRSGHIREAEEFIKKMPLEADGVVW GALLSACWFWMDLEVGERVAEKMFSFDPKPISSYVILSNIYAGLGRWREKMMVRKILRGF KVKKDPGCSWIELNNKIHVFSIEDRSHPYCNMIYATLEHLTANINSVVHFDHVSIPITQA VNFSTPSFN

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_16s0050g02550.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:16:19516019:19518211:-1 gene:VIT_16s0050g02550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATGTTGATCAAAGCTTCCATTTCCAAAGCTTGGAAACACCAAAGGCTAAAGGAGTTC AAATTATACACAGCACATCAATCCAATCTCAGTGAAATTATATCCACAAACATTGCTATA AGCAATTATGCAAAACAATCAAAACTGGATGTTGCCCGCCAACTGTTCGACCAGATGCCT CAACGAACTGTCGTGTCGTGGAACACTATGATATCTAGCTACTCAAAGCATGGACGATTC AGTGAAGCTCTATTTCTAGTTTACTCCATGCACCGCAGCCATATGAAGCTCAGTGAATCC ACGTTCTCGTCGGTTTTGAGTGTTTGTGCTCGTTTGAGGTGTTTGCGCGACGGGAAGTTG ATCCATTGTCTTGTTCTAAAATCTGGGTCGGAGAGTTTTGAGCTTGTGGGGAGTGCTTTG CTGTATTTTTATGCAAGTTGCTTTGAAATTGGGGAGGCACGGCGGGTTTTTGATGTGTTG GTTCGGAGGAATGAGGTGTTGTGGAGTTTGATGCTTGTGGGGTATGTGACTTGTAATGTG ATGGATGATGCTTTGAGTGTGTTTGTGAAGATGCCGAGGAGAGATGTTGTTGCCTGGACG ACTTTGATTTCTGGGTTTTCTAAGAATGGGGATGGTTGTGGGAAGGCCTTGGAGATTTTT AGGTTGATGATGAGGAGTGGTGAAACGACTCCCAATGAGTTTACTTTTGATTGTGTGGTG AGGGCTTGTGGTAGACTCGGGATTTTGAGTGTAGGGAGGACTGTTCATGGGCTTTTGATG AAATGTGGGTTGGAATATGATCCCTCAATTGGAGGGGCTCTTGTTGAGTTCTATTGTGAA TGCGAAGCTATTGATGATGCCTTGAGAGTGTGTAAAGGCGTTGTTAACCCGTGTTTAAAT GCTTTGAATTCCTTAATTGAAGGGCTTATATCGATGGGCAGAATTGAGGATGCTGAGCTG GTTTTTAACGGAATGACAGAGATGAATCCAGTTTCATATAACTTAATGATTAAAGGGTAT GCAGTTGGTGGTCAAATGGATGATTCTAAGAGATTGTTTGAGAAAATGCCTTGCAGAACT ATATTTTCTTCAAATACTATGATTTCAGTGTACTCTAGGAATGGAGAAATTGATAAAGCT TTGGAACTTTTTGAAGAAACTAAGAATGAAAAAGATCCTGTGACATGGAATTCAATGATA TCGGGTTATATTCATAGTGGTCAACCTGAAGAGGCTTTGAAACTATATATAACAATGCAC AGATTATCAATACAACAAACTCAATCTACATTCTCTGCTCTGTTCCATGCATGTTCATGT CTTGGATCCCTTCATCAAGGACAATTACTGCATGCCCATCTGATTAAAACACCATTTGAA TCAAATGTTTATGTTGGAACATCCCTCATAGATATGTACTCCAAATGTGGGAGCATCATG GAGGCTCAAACATCTTTTGTGAGCATCTTTTCACCCAACGTGGCAGCTTGGACGGCTCTG ATCAATGGTCATGCATATCATGGGCTCGGGTCTGAGGCAATTTCACTCTTTGATCGTATG ATAGAGCAAGGATTAGCCCCAAATGGAGCTACTTTTGTTGGAGTTCTGTCTGCTTGTAGT CGTGCAGGTCTGGTCAATGAAGGAATGAAAATTTTCCACTCAATGGAGAGATGTTATAGT GTAACCCCAACATTAGAACACTATGCATGTGTGGTTGATCTTCTGGGCCGATCAGGCCAT ATACGAGAAGCAGAGGAGTTTATCAAGAAGATGCCACTTGAAGCAGATGGGGTTGTCTGG GGAGCATTGCTTAGTGCTTGTTGGTTCTGGATGGACCTGGAAGTGGGTGAGAGAGTGGCT GAGAAGATGTTTAGTTTTGATCCCAAGCCAATCTCTTCTTATGTTATTTTGTCCAACATA TATGCAGGGCTAGGGAGGTGGAGGGAGAAGATGATGGTAAGGAAGATATTGAGGGGTTTC AAAGTGAAGAAGGATCCTGGATGTAGTTGGATTGAGCTTAACAATAAAATTCATGTGTTC TCTATAGAAGATAGATCCCATCCATATTGTAATATGATTTATGCAACTTTGGAGCACCTA ACAGCAAATATAAACTCAGTTGTTCATTTTGATCATGTTTCTATACCAATAACACAGGCT GTTAATTTCAGCACACCATCCTTTAATTAGCAC