Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_16s0050g01500.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:16:18393312:18395825:-1 gene:VIT_16s0050g01500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGTTTTCAAGAAGACATGTTTCTTAGTAACAATCTGTTGTCTCTATATGGAAAGTGT TTTGGAGTGGCAGAAGCACGCCAATTGTTCGATGAAATGCCTTGTAGAGATGTTGCGTCT TGGACAATGCTCATGTCCGCTTATGGGAAAATTGGAAACCATGAAGAGGCTCTTGAACTG TTTGACTCAATGTTGATTTCTGGGGAATACCCAAATGAGTTTACGCTCTCGACTGCATTG CGGTCGTGTTCTGCTTTGAGGGAATTCAATCATGGGACTCGATTTCAGGCGCTTGTGACA AAGTCTGGGTTTGATTCAAATCCGGTTTTAGGCAGTGCTTTGATTGATTTTTACTCCAAA TGTGGGTGTACTCAAGAAGCATACAGAGTATTTGAGTATATGAACAATGGGGATATTGTT TCTTGGACTATGATGGTGTCTTCCTTTGTTGAAGCAGGGAGTTGGAGTCAAGCTTTACAA CTTTATCACCGAATGATCCAAACTGGGGTTGCTCCAAATGAGTTTACCTTTGTGAAGCTT TTGGCTGCATCCAGTTTTCTTGGTTTGAATTATGGGAAATTAGTGCACGCCCATTTGATG ATGTGGCGGATTGAACTGAATTTGGTTTTGAAGACAGCCCTTGTAGATATGTACTGTAAA TGCCAGAGCATAGAGGATGCTGTCAAGGTTTCAAAACTGACTCTAGAATATGATGTATTT TTGTGGACTGCCATCATCTCTGGTTTCACTCAAAGCTTGAAGTTCAGGGAGGCTATCACT GCATTTCATGAGATGGAGACCTCTGGAGTTGTACCGAATAATTTTACCTATTCTGGTATC CTGAATGCTTGTTCATCAATCCTGGCACTGGACTTGGGTAAACAGATTCACTCAAGGGTT GTCATGGCTGGATTGGAGAATGATGTCTCTGTTGGAAATTCACTTGTCGACATGTATATG AAATGTTCCAACATGATAGAAGATGCTGTGAGGGCATTTAGAGGGATAGCATCACCCAAT GTCATCTCTTGGACCTCTCTGATTGCTGGTTTTTCTGAACATGGACTTGAGGAAGAATCG ATTAAGGTGTTTGGAGCAATGCAAGGTGTAGGGGTGCGACCAAATTCCTTTACGCTCTCT ACTATCCTTGGAGCTTGTGGAACAATAAAGTCTCTAACTCAAACAAGGAAGCTTCACGGG TATATAATTAAAAACAATGCGGATAATGATGTAGTCGTTGGCAATGCTCTTGTAGATGCT TATGCTGGATTGGGGATGGTGGATGATGCATGGCATGTGACCAGTATGATGAAGCATAGA GATGTCATCACATACACAAGCTTAGCCACAAGAATAAATCAGACAGGTAATCATGAAATG GCATTAAACATCATCACTCACATGAACAAGGATGATGTTAGAATGGATGGATTCAGTCTC GCAAGCTTCTTATCCGCAGCAGCAGGTATACCGATAATGGAAACTGGAAAGCAGCTTCAC TGTTACTCTGTCAAGTCTGGCTTAGGCAGCTGGATTTCAGTCTCAAATGGCCTGGTTGAC TTGTATGGGAAATGTGGATGCATACATGATGCACATAGATCTTTTCTGGAAATTACTGAG CCGGATGCCGTATCATGGAATGGGTTAATATTTGGATTGGCATCAAATGGGCATGTCTCA TCTGCCTTATCTGCCTTTGAAGATATGAGGTTAGCTGGAGTTGAACCAGATCAGATTACA TGCTTGTTAGTACTTTACGCTTGCAGTCATGGCGGCTTGGTTGATATGGGGTTGGACTAT TTCCAATCTATGAGAGAAAAACATGGTATCAGACCACAACTAGATCACTATGTTTGTTTA GTTGATCTCCTTGGTCGAGCAGGCCGGCTAGAGGAGGCCATGAATGTAATAGAAACCATG CCTTTCAAACCAGATGCATTGATCTACAAAACACTATTGGGTGCCTGCAAACTACATGGG AACATACCTCTTGGGGAACATATGGCAAGACAAGGCCTCGAGCTCGACCCTTCTGATCCA GCATTCTATGTACTGCTTGCTAACCTGTATGATGATTCTGGCCGGTCTGAGCTAGGGGAG AAAACTCGGAGGATGATGAGGGAGAGAGGCGTGAGGAAGAATCCTGGTCAGAGCTGGATG GAGGAGAGGAACATGGTTCATCTCTTCACAGCAGGAGATACATCACATCCACAGATAGGT AAGATTCATGAAAAGATTGAATCACTGATAGCTCAGTTTAGGAATCAGGGAATTTGGTAT CAAGAAAATAGAGCTTTGGCCCATCACAGTGAGAAGTTGGCTGTTGCATTCGGCCTTATC AGTACACCACCAAAAGCTCCAATACGCATTATTAAGAACATTCGCATTTGCAGAGATTGT CATGACTTTATAATGAACGTGACTAGGTTGGTTGATAGAGAGATCATTGTGAGGGATGGG AACCGCTTCCATTCCTTCAAGAAAGGTGAGTGCTCATGTAGAGGCTATTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_16s0050g01500.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:16:18393312:18395825:-1 gene:VIT_16s0050g01500 transcript:VIT_16s0050g01500.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MGFQEDMFLSNNLLSLYGKCFGVAEARQLFDEMPCRDVASWTMLMSAYGKIGNHEEALEL FDSMLISGEYPNEFTLSTALRSCSALREFNHGTRFQALVTKSGFDSNPVLGSALIDFYSK CGCTQEAYRVFEYMNNGDIVSWTMMVSSFVEAGSWSQALQLYHRMIQTGVAPNEFTFVKL LAASSFLGLNYGKLVHAHLMMWRIELNLVLKTALVDMYCKCQSIEDAVKVSKLTLEYDVF LWTAIISGFTQSLKFREAITAFHEMETSGVVPNNFTYSGILNACSSILALDLGKQIHSRV VMAGLENDVSVGNSLVDMYMKCSNMIEDAVRAFRGIASPNVISWTSLIAGFSEHGLEEES IKVFGAMQGVGVRPNSFTLSTILGACGTIKSLTQTRKLHGYIIKNNADNDVVVGNALVDA YAGLGMVDDAWHVTSMMKHRDVITYTSLATRINQTGNHEMALNIITHMNKDDVRMDGFSL ASFLSAAAGIPIMETGKQLHCYSVKSGLGSWISVSNGLVDLYGKCGCIHDAHRSFLEITE PDAVSWNGLIFGLASNGHVSSALSAFEDMRLAGVEPDQITCLLVLYACSHGGLVDMGLDY FQSMREKHGIRPQLDHYVCLVDLLGRAGRLEEAMNVIETMPFKPDALIYKTLLGACKLHG NIPLGEHMARQGLELDPSDPAFYVLLANLYDDSGRSELGEKTRRMMRERGVRKNPGQSWM EERNMVHLFTAGDTSHPQIGKIHEKIESLIAQFRNQGIWYQENRALAHHSEKLAVAFGLI STPPKAPIRIIKNIRICRDCHDFIMNVTRLVDREIIVRDGNRFHSFKKGECSCRGYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_16s0050g01500.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:16:18393312:18395825:-1 gene:VIT_16s0050g01500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGTTTTCAAGAAGACATGTTTCTTAGTAACAATCTGTTGTCTCTATATGGAAAGTGT TTTGGAGTGGCAGAAGCACGCCAATTGTTCGATGAAATGCCTTGTAGAGATGTTGCGTCT TGGACAATGCTCATGTCCGCTTATGGGAAAATTGGAAACCATGAAGAGGCTCTTGAACTG TTTGACTCAATGTTGATTTCTGGGGAATACCCAAATGAGTTTACGCTCTCGACTGCATTG CGGTCGTGTTCTGCTTTGAGGGAATTCAATCATGGGACTCGATTTCAGGCGCTTGTGACA AAGTCTGGGTTTGATTCAAATCCGGTTTTAGGCAGTGCTTTGATTGATTTTTACTCCAAA TGTGGGTGTACTCAAGAAGCATACAGAGTATTTGAGTATATGAACAATGGGGATATTGTT TCTTGGACTATGATGGTGTCTTCCTTTGTTGAAGCAGGGAGTTGGAGTCAAGCTTTACAA CTTTATCACCGAATGATCCAAACTGGGGTTGCTCCAAATGAGTTTACCTTTGTGAAGCTT TTGGCTGCATCCAGTTTTCTTGGTTTGAATTATGGGAAATTAGTGCACGCCCATTTGATG ATGTGGCGGATTGAACTGAATTTGGTTTTGAAGACAGCCCTTGTAGATATGTACTGTAAA TGCCAGAGCATAGAGGATGCTGTCAAGGTTTCAAAACTGACTCTAGAATATGATGTATTT TTGTGGACTGCCATCATCTCTGGTTTCACTCAAAGCTTGAAGTTCAGGGAGGCTATCACT GCATTTCATGAGATGGAGACCTCTGGAGTTGTACCGAATAATTTTACCTATTCTGGTATC CTGAATGCTTGTTCATCAATCCTGGCACTGGACTTGGGTAAACAGATTCACTCAAGGGTT GTCATGGCTGGATTGGAGAATGATGTCTCTGTTGGAAATTCACTTGTCGACATGTATATG AAATGTTCCAACATGATAGAAGATGCTGTGAGGGCATTTAGAGGGATAGCATCACCCAAT GTCATCTCTTGGACCTCTCTGATTGCTGGTTTTTCTGAACATGGACTTGAGGAAGAATCG ATTAAGGTGTTTGGAGCAATGCAAGGTGTAGGGGTGCGACCAAATTCCTTTACGCTCTCT ACTATCCTTGGAGCTTGTGGAACAATAAAGTCTCTAACTCAAACAAGGAAGCTTCACGGG TATATAATTAAAAACAATGCGGATAATGATGTAGTCGTTGGCAATGCTCTTGTAGATGCT TATGCTGGATTGGGGATGGTGGATGATGCATGGCATGTGACCAGTATGATGAAGCATAGA GATGTCATCACATACACAAGCTTAGCCACAAGAATAAATCAGACAGGTAATCATGAAATG GCATTAAACATCATCACTCACATGAACAAGGATGATGTTAGAATGGATGGATTCAGTCTC GCAAGCTTCTTATCCGCAGCAGCAGGTATACCGATAATGGAAACTGGAAAGCAGCTTCAC TGTTACTCTGTCAAGTCTGGCTTAGGCAGCTGGATTTCAGTCTCAAATGGCCTGGTTGAC TTGTATGGGAAATGTGGATGCATACATGATGCACATAGATCTTTTCTGGAAATTACTGAG CCGGATGCCGTATCATGGAATGGGTTAATATTTGGATTGGCATCAAATGGGCATGTCTCA TCTGCCTTATCTGCCTTTGAAGATATGAGGTTAGCTGGAGTTGAACCAGATCAGATTACA TGCTTGTTAGTACTTTACGCTTGCAGTCATGGCGGCTTGGTTGATATGGGGTTGGACTAT TTCCAATCTATGAGAGAAAAACATGGTATCAGACCACAACTAGATCACTATGTTTGTTTA GTTGATCTCCTTGGTCGAGCAGGCCGGCTAGAGGAGGCCATGAATGTAATAGAAACCATG CCTTTCAAACCAGATGCATTGATCTACAAAACACTATTGGGTGCCTGCAAACTACATGGG AACATACCTCTTGGGGAACATATGGCAAGACAAGGCCTCGAGCTCGACCCTTCTGATCCA GCATTCTATGTACTGCTTGCTAACCTGTATGATGATTCTGGCCGGTCTGAGCTAGGGGAG AAAACTCGGAGGATGATGAGGGAGAGAGGCGTGAGGAAGAATCCTGGTCAGAGCTGGATG GAGGAGAGGAACATGGTTCATCTCTTCACAGCAGGAGATACATCACATCCACAGATAGGT AAGATTCATGAAAAGATTGAATCACTGATAGCTCAGTTTAGGAATCAGGGAATTTGGTAT CAAGAAAATAGAGCTTTGGCCCATCACAGTGAGAAGTTGGCTGTTGCATTCGGCCTTATC AGTACACCACCAAAAGCTCCAATACGCATTATTAAGAACATTCGCATTTGCAGAGATTGT CATGACTTTATAATGAACGTGACTAGGTTGGTTGATAGAGAGATCATTGTGAGGGATGGG AACCGCTTCCATTCCTTCAAGAAAGGTGAGTGCTCATGTAGAGGCTATTGGTAG