Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_16s0039g02130.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:16:2181507:2188198:-1 gene:VIT_16s0039g02130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCGCTTGCCATTGAACCCCTCAAAACCTCCTTCATCTGCACCACTCCGCCACTTCCC CTTAAACCCTCCAAAAACCTCAAGAGCTGCCAAAATCCCAAGAAACCCAGAAATCTCATT ATCCACTGCTCAGTCCACCCAGACCCATGGTCGCTTAGCACAGGGAACCGCCCAAAACCC ATCTCCAAAAACCCAAAAAACCCCCTCTCGGACGACAATGCTCGCCGTATAATCAAGGGC AAAGCCCGGTACCTGAGTGTTCTTAGGCGAAATCAGGGCCCTCAAGCCCAGACCCCCAAG TGGATCAAGAGGACGCCGGAGCAGATGGTGCAGTACCTTCAGGATGACCGCAATGGGCAC CTCTATGGAAAGCATGTGGTGGCGGCCATCAGGATTGTGCGGAGCCTTGCGGCGAGGCCT GATGGGTCGTATAATATGAGGGAGGTGATGGGGTCGTTTGTGGCGAAGCTCTCGTTTAGA GAGATGTGTGTGGTTTTGAAGGAGCAGAGGGGGTGGAGGCAGGCAAGGGACTTCTTTGGA TGGATGAAACTGCAGCTAAGCTACCAACCCAGTGTTATAGTCTACACAATTCTTTTGCGT GTGTATGGACAAGTTGGAAAGATCAAGCTTGCTGAACAGGCTTTCTTGGAGATGCTTGAA GCAGGGTGTGAACCAGATGAAGTTGCTTGTGGTACCATGTTGTGTACATATGCTAGATGG GGTCGCCATAAGGCTATGCTGTCATTTTATTCTGCTGTCCAGGAAAGGGGAATTATACCA TCTATTGCAGTTTTCAATTTTATGCTGTCATCTTTGCAGAAAAAATCACTCCATGGAAAG GTCATAGATTTGTGGAGGGAAATGGTGGACAAAGGGGTGGTGCCCAACAGTTTTACTTAT ACTGTAGTCATTAGCTCACTTGTCAAAGACGGTCTTGTTGAGGAGTCTTTCAAGACTTTC TATGAGATGAAGAATTTAGGTTTTGTGCCTGAGGAGGTAACTTATAGCCTTCTTATTAGT TTAAGTTCCAAAACCGGTAACCGAGATGAAGCAATAAAGCTTTATGAGGACATGAGATAC CGCAGAATTGTTCCAAGTAACTACACATGTGCTTCCCTTCTAACCCTTTATTACAAAAAT GGGGATTATTCAAGGGCTGTTTCCCTCTTTTCAGAAATGGAAAAAAATAAAATTGTAGCT GATGAAGTCATTTATGGTTTGCTTATTAGGATATACGGAAAACTTGGTCTTTATGAGGAT GCTGAGAAAACTTTCAAAGAGACTGAACAGTTGGGCCTCCTTACCAACGAGAAAACGTAT ATAGCAATGGCACAAGTTCATCTCAATTCAGGGAACTTTGAGAAAGCTTTAACCATTATG GAGCTGATGAGGTCTAGGAACATTTGGTTCTCCAGATTCTCTTATATAGTTTTGTTGCAG TGTTACGTTATGAAGGAAGATTTGGCATCTGCTGAAGCTACATTTCAGGCTCTCTCCAAG ACTGGACTTCCTGATGCTGGTTCTTGTAATGACATGCTTAATTTGTACATCAAACTGGAT TTACTTGAGAAGGCCAAGGATTTTATTTTCCAGATAAGGAAAGATCCAGTGGAGTTTGAC ATGGAGCTTTGCAAGACAGTTATGAAGGTATATTGCAAGAAGGGAATGTTAAGAGATGCC AAGCAGTTGATTCAAGAAATGGGTACAAATGGATTGTTCAAGGATAGTGAATTTATCCAA ACCCTTTCTCTGGTTATGCATGAAGAATCTGAGAGACCTGATTATGTGGATGATACTGTT GAGGCCTTGAACCAAAACAATACTTTGGCCCTTGAGCTGATGCTTGGTCTGTATTCGGAA GTTGGCAACGCTTGTAAGGTGGAAGAGATTTTGAAAATGTTGCTCAAGACTGCTGGTGGT TTATCAGTGGCAAGTCACCTAATTAGCAAATTTACTAGAGAAGGTGATATATCTAAAGCA CAAAATCTTAATGATCAATTGGTCAAGCTAGGCCGTGGAGCAGAGGATGCTTCAATTGCT TCTTTGATTACTTTATATGGGAAGCAACACAAGCTGAAGAAAGCCATAGAAGTTTTTTCT GCAATAGAAGGCTGTACATCTGGGAAACTCATATATATCTCAATGATTGATGCATATGCC AAATGTGGTAAAGCTGAAGAGGCATACCACCTTTATGAAGAAGTGACTGGGAAAGGGATT GAACTCGGTGTTGTTTCCATCAGCAAAGTTGTGCATGCTTTGGCTAATTATGGCAAACAT CAAGAGGCTGAGAATGTAATTCGTAGGAGTTTTGAAGATGGCTTGGAGCTTGATACTGTG GCATACAATACCTTCATCAATGCAATGCTAGGAGCAGGTAGATTGCATTTTGCTAACAGC ATCTATGACCGCATGGTTTCCCTCGGAGTTGCTCCATCAATTCAGACATATAACACCATG ATCAGTGTGTATGGACGAGGTCGAAAACTGGATAAGGCTGTAGAGATGTTCAACAAGGCT CGCTGCTCAGGTGTAGGTGTGTCCCTGGATGAGAAGACATACACGAATCTGATTAGCTAT TATGGGAAGGCTGGTAAGAGCCATGAAGCATCCCTTCTTTTTAGAGAAATGCAGGAAGAA GGAATAAAACCTGGCAAGGTCAGCTACAATATTATGATCAACGTATATGCTACTGCAGGA CTTCATCATGAAGCACAAGAACTTTTCCAAGCCATGCTAAGAGATGGCTGCTCACCCGAC TCCCTCACTTACCTTGCCCTTATTCGAGCTTATACACAGAGTTTTAAATTCTTGGAAGCT GAGGAAACCATCATGTCTATGCAAAATGAAGGGGTTCTACCTTCCTGTGTTCATTTCAAC CAATTACTCTCTGCTTTTGCTAAAGCAGGTTTCACAGAGGAAGCTGAAAGGGTTTATCAT ACACTACTATCTGCTGGTTTAAGTCCAGATGTAGCATGCTATCGGACTATGCTAAGGGGT TACTTGGACTATGGATGTGTGGAGAAAGGCATCACTTTCTTTGAACAAATAAGAGAGTCT GTGGAGCCAGACCGGTTTATTATGAGTTCAGCTGTGCATTTTTACAAGCTTGCAGGCAAG GAATTGGAAGCTGAAGGCATTTTGGATTCCATGAAAAGTTTGGGGATCCCATTCCTGAAA AACCTTGAAGTTGGATCAAAGACAAAAGCACCCTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_16s0039g02130.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:16:2181507:2188198:-1 gene:VIT_16s0039g02130 transcript:VIT_16s0039g02130.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MALAIEPLKTSFICTTPPLPLKPSKNLKSCQNPKKPRNLIIHCSVHPDPWSLSTGNRPKP ISKNPKNPLSDDNARRIIKGKARYLSVLRRNQGPQAQTPKWIKRTPEQMVQYLQDDRNGH LYGKHVVAAIRIVRSLAARPDGSYNMREVMGSFVAKLSFREMCVVLKEQRGWRQARDFFG WMKLQLSYQPSVIVYTILLRVYGQVGKIKLAEQAFLEMLEAGCEPDEVACGTMLCTYARW GRHKAMLSFYSAVQERGIIPSIAVFNFMLSSLQKKSLHGKVIDLWREMVDKGVVPNSFTY TVVISSLVKDGLVEESFKTFYEMKNLGFVPEEVTYSLLISLSSKTGNRDEAIKLYEDMRY RRIVPSNYTCASLLTLYYKNGDYSRAVSLFSEMEKNKIVADEVIYGLLIRIYGKLGLYED AEKTFKETEQLGLLTNEKTYIAMAQVHLNSGNFEKALTIMELMRSRNIWFSRFSYIVLLQ CYVMKEDLASAEATFQALSKTGLPDAGSCNDMLNLYIKLDLLEKAKDFIFQIRKDPVEFD MELCKTVMKVYCKKGMLRDAKQLIQEMGTNGLFKDSEFIQTLSLVMHEESERPDYVDDTV EALNQNNTLALELMLGLYSEVGNACKVEEILKMLLKTAGGLSVASHLISKFTREGDISKA QNLNDQLVKLGRGAEDASIASLITLYGKQHKLKKAIEVFSAIEGCTSGKLIYISMIDAYA KCGKAEEAYHLYEEVTGKGIELGVVSISKVVHALANYGKHQEAENVIRRSFEDGLELDTV AYNTFINAMLGAGRLHFANSIYDRMVSLGVAPSIQTYNTMISVYGRGRKLDKAVEMFNKA RCSGVGVSLDEKTYTNLISYYGKAGKSHEASLLFREMQEEGIKPGKVSYNIMINVYATAG LHHEAQELFQAMLRDGCSPDSLTYLALIRAYTQSFKFLEAEETIMSMQNEGVLPSCVHFN QLLSAFAKAGFTEEAERVYHTLLSAGLSPDVACYRTMLRGYLDYGCVEKGITFFEQIRES VEPDRFIMSSAVHFYKLAGKELEAEGILDSMKSLGIPFLKNLEVGSKTKAP

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_16s0039g02130.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:16:2181507:2188198:-1 gene:VIT_16s0039g02130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCGCTTGCCATTGAACCCCTCAAAACCTCCTTCATCTGCACCACTCCGCCACTTCCC CTTAAACCCTCCAAAAACCTCAAGAGCTGCCAAAATCCCAAGAAACCCAGAAATCTCATT ATCCACTGCTCAGTCCACCCAGACCCATGGTCGCTTAGCACAGGGAACCGCCCAAAACCC ATCTCCAAAAACCCAAAAAACCCCCTCTCGGACGACAATGCTCGCCGTATAATCAAGGGC AAAGCCCGGTACCTGAGTGTTCTTAGGCGAAATCAGGGCCCTCAAGCCCAGACCCCCAAG TGGATCAAGAGGACGCCGGAGCAGATGGTGCAGTACCTTCAGGATGACCGCAATGGGCAC CTCTATGGAAAGCATGTGGTGGCGGCCATCAGGATTGTGCGGAGCCTTGCGGCGAGGCCT GATGGGTCGTATAATATGAGGGAGGTGATGGGGTCGTTTGTGGCGAAGCTCTCGTTTAGA GAGATGTGTGTGGTTTTGAAGGAGCAGAGGGGGTGGAGGCAGGCAAGGGACTTCTTTGGA TGGATGAAACTGCAGCTAAGCTACCAACCCAGTGTTATAGTCTACACAATTCTTTTGCGT GTGTATGGACAAGTTGGAAAGATCAAGCTTGCTGAACAGGCTTTCTTGGAGATGCTTGAA GCAGGGTGTGAACCAGATGAAGTTGCTTGTGGTACCATGTTGTGTACATATGCTAGATGG GGTCGCCATAAGGCTATGCTGTCATTTTATTCTGCTGTCCAGGAAAGGGGAATTATACCA TCTATTGCAGTTTTCAATTTTATGCTGTCATCTTTGCAGAAAAAATCACTCCATGGAAAG GTCATAGATTTGTGGAGGGAAATGGTGGACAAAGGGGTGGTGCCCAACAGTTTTACTTAT ACTGTAGTCATTAGCTCACTTGTCAAAGACGGTCTTGTTGAGGAGTCTTTCAAGACTTTC TATGAGATGAAGAATTTAGGTTTTGTGCCTGAGGAGGTAACTTATAGCCTTCTTATTAGT TTAAGTTCCAAAACCGGTAACCGAGATGAAGCAATAAAGCTTTATGAGGACATGAGATAC CGCAGAATTGTTCCAAGTAACTACACATGTGCTTCCCTTCTAACCCTTTATTACAAAAAT GGGGATTATTCAAGGGCTGTTTCCCTCTTTTCAGAAATGGAAAAAAATAAAATTGTAGCT GATGAAGTCATTTATGGTTTGCTTATTAGGATATACGGAAAACTTGGTCTTTATGAGGAT GCTGAGAAAACTTTCAAAGAGACTGAACAGTTGGGCCTCCTTACCAACGAGAAAACGTAT ATAGCAATGGCACAAGTTCATCTCAATTCAGGGAACTTTGAGAAAGCTTTAACCATTATG GAGCTGATGAGGTCTAGGAACATTTGGTTCTCCAGATTCTCTTATATAGTTTTGTTGCAG TGTTACGTTATGAAGGAAGATTTGGCATCTGCTGAAGCTACATTTCAGGCTCTCTCCAAG ACTGGACTTCCTGATGCTGGTTCTTGTAATGACATGCTTAATTTGTACATCAAACTGGAT TTACTTGAGAAGGCCAAGGATTTTATTTTCCAGATAAGGAAAGATCCAGTGGAGTTTGAC ATGGAGCTTTGCAAGACAGTTATGAAGGTATATTGCAAGAAGGGAATGTTAAGAGATGCC AAGCAGTTGATTCAAGAAATGGGTACAAATGGATTGTTCAAGGATAGTGAATTTATCCAA ACCCTTTCTCTGGTTATGCATGAAGAATCTGAGAGACCTGATTATGTGGATGATACTGTT GAGGCCTTGAACCAAAACAATACTTTGGCCCTTGAGCTGATGCTTGGTCTGTATTCGGAA GTTGGCAACGCTTGTAAGGTGGAAGAGATTTTGAAAATGTTGCTCAAGACTGCTGGTGGT TTATCAGTGGCAAGTCACCTAATTAGCAAATTTACTAGAGAAGGTGATATATCTAAAGCA CAAAATCTTAATGATCAATTGGTCAAGCTAGGCCGTGGAGCAGAGGATGCTTCAATTGCT TCTTTGATTACTTTATATGGGAAGCAACACAAGCTGAAGAAAGCCATAGAAGTTTTTTCT GCAATAGAAGGCTGTACATCTGGGAAACTCATATATATCTCAATGATTGATGCATATGCC AAATGTGGTAAAGCTGAAGAGGCATACCACCTTTATGAAGAAGTGACTGGGAAAGGGATT GAACTCGGTGTTGTTTCCATCAGCAAAGTTGTGCATGCTTTGGCTAATTATGGCAAACAT CAAGAGGCTGAGAATGTAATTCGTAGGAGTTTTGAAGATGGCTTGGAGCTTGATACTGTG GCATACAATACCTTCATCAATGCAATGCTAGGAGCAGGTAGATTGCATTTTGCTAACAGC ATCTATGACCGCATGGTTTCCCTCGGAGTTGCTCCATCAATTCAGACATATAACACCATG ATCAGTGTGTATGGACGAGGTCGAAAACTGGATAAGGCTGTAGAGATGTTCAACAAGGCT CGCTGCTCAGGTGTAGGTGTGTCCCTGGATGAGAAGACATACACGAATCTGATTAGCTAT TATGGGAAGGCTGGTAAGAGCCATGAAGCATCCCTTCTTTTTAGAGAAATGCAGGAAGAA GGAATAAAACCTGGCAAGGTCAGCTACAATATTATGATCAACGTATATGCTACTGCAGGA CTTCATCATGAAGCACAAGAACTTTTCCAAGCCATGCTAAGAGATGGCTGCTCACCCGAC TCCCTCACTTACCTTGCCCTTATTCGAGCTTATACACAGAGTTTTAAATTCTTGGAAGCT GAGGAAACCATCATGTCTATGCAAAATGAAGGGGTTCTACCTTCCTGTGTTCATTTCAAC CAATTACTCTCTGCTTTTGCTAAAGCAGGTTTCACAGAGGAAGCTGAAAGGGTTTATCAT ACACTACTATCTGCTGGTTTAAGTCCAGATGTAGCATGCTATCGGACTATGCTAAGGGGT TACTTGGACTATGGATGTGTGGAGAAAGGCATCACTTTCTTTGAACAAATAAGAGAGTCT GTGGAGCCAGACCGGTTTATTATGAGTTCAGCTGTGCATTTTTACAAGCTTGCAGGCAAG GAATTGGAAGCTGAAGGCATTTTGGATTCCATGAAAAGTTTGGGGATCCCATTCCTGAAA AACCTTGAAGTTGGATCAAAGACAAAAGCACCCTAG