Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_16s0039g02020.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:16:2094787:2099944:1 gene:VIT_16s0039g02020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCATCAAAATCATTCAAGGCCAGCCGATCATCCTTATCAACAACCTCAGATGTCTCT GATTCGATCCACAACAAGCCTCCCCTGCCTCCAACTGTGACATTTGGCCGAAGGACATCC TCAGGCAGGTATATAAGCTATTCAAGGGATGATCTTGATAGTGAACTTGGTAGTGGTGAA TTTATGAACTACACTGTACACATACCACCTACACCTGACAACCAACCTATGGAAGGCTCC ATGGATCCATCCATCTCACAGAAGGTTGAGGAGCAATATGTGTCGAATTCGCTCTTCACG GGTGGATTCAATAGTGTGACACGAGCTCATCTCATGGACAAGGTGATTGAATCCGAAACC AGCCATCCCCAGATGGCTGGCGCAAAAGGATCTTCATGTGCAATTCTCGGGTGCGATGCA AAGGTGATGAGTGATGAAAGGGGAGCAGACATTCTTCCTTGTGAATGTGATTTCAAAATA TGCCGAGATTGTTATTTGGATGCGGTTAAAACTGGTGGTGGGATTTGCCCTGGATGTAAG GAGCCATATAAAGCCTTGGATTTGGATGAACTGGCGGTGGAAAATGGGCGTCCGCTTCCA CTTCCACCACCAGCTGGGATGTCAAAAATGGAGAGGAGGTTGTCATTGATGAAATCGACA AAGTCAGTGCTGATGAGGAGCCAGACTGGGGATTTTGATCACAATCGATGGTTGTTTGAG ACAAGGGGGACTTACGGGTATGGGAATGCTATTTGGCCAAAGGATGGGGTTTTTGGGAAT GGGAAAGAAGATGATGCATCTGAGCCTCAAGAGTTAGTGAGCAAACCTTGGAGGCCACTC ACACGAAAATTAAAGATACCTGCTGCTGTTCTGAGCCCATATCGGCTTCTAATCTTTGTA CGGATGGTAGCTCTTGGATTGTTCTTGGAATGGAGGGTCACGAATAAAAACGAGGATGCA GTCTGGTTATGGGGGATGTCGGTGGTTTGTGAGATTTGGTTTGCCTTCTCTTGGCTTCTT GATCAACTGCCCAAGCTCTGTCCTATTAATCGTTCCACCGATCTTAATGTTTTGAAGGAG AAATTTGAAACACCTAGCCCCAACAACCCCACTGGAAAATCTGATCTCCCAGGCATAGAT ATTTTTGTCTCCACTGCTGATCCAGAGAAGGAACCGCCTCTTGTCACTGCAAATACCATC TTGTCCATCCTAGCTGCTGATTATCCTGTTGAAAAGCTTGCTTGCTATGTTTCTGATGAT GGAGGTGCACTGCTAACTTTTGAAGCCATGGCAGAAGCTGCTAGCTTTGCAAACACATGG GTTCCGTTTTGCAGAAAGCATGATATTGAGCCAAGGAACCCAGAAACTTATTTCAATTTA AAGAGGGATCCTTATAAGAACAAAGTGCGGCCTGACTTTGTCAAGGACCGTAGACGGGTC AAGCGTGAGTATGATGAGTTCAAGGTGAGAATCAATGGCTTGCCTGATTCTATCCGTCGC CGATCTGATGCATATCATGCTCGGGAGGAAATCAAGGCAATGAAACTTCAGAGACAGAAT AGAGACGATGAAGCTGTGGAGACTGTGAAGGTCCCTAAAGCTACTTGGATGGCTGATGGA ACCCATTGGCCTGGGACTTGGATGAATCCTGGATCCGAGCACTCTAAGGGTGATCATGCT GGAATAATACAGGTGATGCTGAAACCCCCGAGTGATGAGCCTTTGCAAAGTACTGCTGAT GATACCAGACTAATTGACCTCACTGATGTGGACATTCGTCTCCCCTTGCTTGTTTATGTT TCCCGTGAGAAGCGTCCTGGCTATGATCACAACAAGAAAGCAGGGGCCATGAATGCATTG GTTCGAGCATCAGCAATCATGTCCAATGGTCCTTTCATTCTCAACCTTGACTGTGACCAC TACATCTACAACTCCCAGGCCATGAGAGAAGGCATGTGTTTCATGATGGACCGGGGTGGT GATCGCATTTGCTATGTACAGTTCCCTCAGAGGTTTGAGGGTATTGATCCATCTGATCGA TATGCAAATCACAACACTGTTTTCTTTGATGTCAATATGCGTGCCCTTGATGGATTACAG GGCCCAGTCTATGTTGGAACTGGATGCCTCTTCAGAAGGATTGCCCTTTATGGCTTTGAC CCACCTAGATCAAAAGAACACCATCCTGGTTGCTGCAGCTGCTGCTTTTCTCGTCGCAAG AAGCATGTTAGTGTTGCCACTACCCCAGAAGAGAACCGAGCCTTGAGGATGGGCGATTCT GATGATGAAGAAATGAGCCTCTCCCTTCTTCCTAAGAGGTTTGGAAACTCAAATTTCCTA ATTGATTCAATCCCAGTGGCAGAGTTTCAAGGCCGTCCCCTGGCAGATCATCCAGCCGTG AAGAATGGACGGCCACCTGGTGCTCTTACCATTCCTCGAGAGCTTCTTGATGCATCAACT GTTGCAGAGGCAATCAGTGTCATCTCCTGCTGGTATGAAGATAAGACTGAGTGGGGAAAT CGTGTCGGGTGGATTTATGGGTCTGTTACTGAAGATGTGGTTACTGGGTACAGGATGCAC AACAGAGGATGGAAATCTGTTTACTGTGTCACCAAGAGGGATGCCTTTCGGGGAACTGCT CCCATCAATCTCACTGATAGGCTCCATCAAGTCCTCAGGTGGGCTACTGGCTCAGTTGAA ATTTTCTTCTCCCGTAACAATGCTCTCCTGGCCAGCCCAAGAATGAAGCTTCTGCAGAGG GTAGCCTACCTTAATGTCGGAATCTACCCCTTTACCTCAATCTTCTTGATCGTCTATTGC TTCCTTCCTGCACTCTCTCTCTTCTCTGGCCAGTTCATCGTTCAGACCCTCAATGTCACT TTCCTTACCTACCTCCTGGTTATCACTGTGACCCTATGTATGCTTGCTGTGCTCGAGATT AAATGGTCTGGAATTGAGCTTGAAGAGTGGTGGAGGAATGAGCAGTTTTGGTTGATTGGA GGCACTAGTGCTCATCTTGCTGCCGTTCTTCAGGGGCTACTGAAAGTCATTGCAGGGATA GAAATATCCTTCACCTTGACATCCAAATCAGGCGGTGATGACATTGATGATGAGTATGCA GATCTCTATGTTGTCAAATGGACATCACTGATGATTCCACCAATCACAATCATGATGACC AACTTGATTGCAATTGCAGTTGCTTTTAGCCGAACAATATATAGTGTGTTACCTCAGTGG AGCCGTCTGCTAGGTGGGGTTTTCTTCAGCTTCTGGGTCTTGGCTCATCTCTACCCCTTT GCCAAGGGACTCATGGGAAGAAGAGGAAGGACTCCCACCATTGTTTTTGTATGGTCGGGA CTCATTGCAATCACCATTTCCCTCCTTTGGGTGGCTATCAGCCCCCCATCAGGTTCTACC CAAATTGGAGGTTCATTTGAGTTCCCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_16s0039g02020.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:16:2094787:2099944:1 gene:VIT_16s0039g02020 transcript:VIT_16s0039g02020.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MASKSFKASRSSLSTTSDVSDSIHNKPPLPPTVTFGRRTSSGRYISYSRDDLDSELGSGE FMNYTVHIPPTPDNQPMEGSMDPSISQKVEEQYVSNSLFTGGFNSVTRAHLMDKVIESET SHPQMAGAKGSSCAILGCDAKVMSDERGADILPCECDFKICRDCYLDAVKTGGGICPGCK EPYKALDLDELAVENGRPLPLPPPAGMSKMERRLSLMKSTKSVLMRSQTGDFDHNRWLFE TRGTYGYGNAIWPKDGVFGNGKEDDASEPQELVSKPWRPLTRKLKIPAAVLSPYRLLIFV RMVALGLFLEWRVTNKNEDAVWLWGMSVVCEIWFAFSWLLDQLPKLCPINRSTDLNVLKE KFETPSPNNPTGKSDLPGIDIFVSTADPEKEPPLVTANTILSILAADYPVEKLACYVSDD GGALLTFEAMAEAASFANTWVPFCRKHDIEPRNPETYFNLKRDPYKNKVRPDFVKDRRRV KREYDEFKVRINGLPDSIRRRSDAYHAREEIKAMKLQRQNRDDEAVETVKVPKATWMADG THWPGTWMNPGSEHSKGDHAGIIQVMLKPPSDEPLQSTADDTRLIDLTDVDIRLPLLVYV SREKRPGYDHNKKAGAMNALVRASAIMSNGPFILNLDCDHYIYNSQAMREGMCFMMDRGG DRICYVQFPQRFEGIDPSDRYANHNTVFFDVNMRALDGLQGPVYVGTGCLFRRIALYGFD PPRSKEHHPGCCSCCFSRRKKHVSVATTPEENRALRMGDSDDEEMSLSLLPKRFGNSNFL IDSIPVAEFQGRPLADHPAVKNGRPPGALTIPRELLDASTVAEAISVISCWYEDKTEWGN RVGWIYGSVTEDVVTGYRMHNRGWKSVYCVTKRDAFRGTAPINLTDRLHQVLRWATGSVE IFFSRNNALLASPRMKLLQRVAYLNVGIYPFTSIFLIVYCFLPALSLFSGQFIVQTLNVT FLTYLLVITVTLCMLAVLEIKWSGIELEEWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKVIAGI EISFTLTSKSGGDDIDDEYADLYVVKWTSLMIPPITIMMTNLIAIAVAFSRTIYSVLPQW SRLLGGVFFSFWVLAHLYPFAKGLMGRRGRTPTIVFVWSGLIAITISLLWVAISPPSGST QIGGSFEFP

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_16s0039g02020.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:16:2094787:2099944:1 gene:VIT_16s0039g02020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	TTTGGTAGTATTCAATTATGGCATCAAAATCATTCAAGGCCAGCCGATCATCCTTATCAA CAACCTCAGATGTCTCTGATTCGATCCACAACAAGCCTCCCCTGCCTCCAACTGTGACAT TTGGCCGAAGGACATCCTCAGGCAGGTATATAAGCTATTCAAGGGATGATCTTGATAGTG AACTTGGTAGTGGTGAATTTATGAACTACACTGTACACATACCACCTACACCTGACAACC AACCTATGGAAGGCTCCATGGATCCATCCATCTCACAGAAGGTTGAGGAGCAATATGTGT CGAATTCGCTCTTCACGGGTGGATTCAATAGTGTGACACGAGCTCATCTCATGGACAAGG TGATTGAATCCGAAACCAGCCATCCCCAGATGGCTGGCGCAAAAGGATCTTCATGTGCAA TTCTCGGGTGCGATGCAAAGGTGATGAGTGATGAAAGGGGAGCAGACATTCTTCCTTGTG AATGTGATTTCAAAATATGCCGAGATTGTTATTTGGATGCGGTTAAAACTGGTGGTGGGA TTTGCCCTGGATGTAAGGAGCCATATAAAGCCTTGGATTTGGATGAACTGGCGGTGGAAA ATGGGCGTCCGCTTCCACTTCCACCACCAGCTGGGATGTCAAAAATGGAGAGGAGGTTGT CATTGATGAAATCGACAAAGTCAGTGCTGATGAGGAGCCAGACTGGGGATTTTGATCACA ATCGATGGTTGTTTGAGACAAGGGGGACTTACGGGTATGGGAATGCTATTTGGCCAAAGG ATGGGGTTTTTGGGAATGGGAAAGAAGATGATGCATCTGAGCCTCAAGAGTTAGTGAGCA AACCTTGGAGGCCACTCACACGAAAATTAAAGATACCTGCTGCTGTTCTGAGCCCATATC GGCTTCTAATCTTTGTACGGATGGTAGCTCTTGGATTGTTCTTGGAATGGAGGGTCACGA ATAAAAACGAGGATGCAGTCTGGTTATGGGGGATGTCGGTGGTTTGTGAGATTTGGTTTG CCTTCTCTTGGCTTCTTGATCAACTGCCCAAGCTCTGTCCTATTAATCGTTCCACCGATC TTAATGTTTTGAAGGAGAAATTTGAAACACCTAGCCCCAACAACCCCACTGGAAAATCTG ATCTCCCAGGCATAGATATTTTTGTCTCCACTGCTGATCCAGAGAAGGAACCGCCTCTTG TCACTGCAAATACCATCTTGTCCATCCTAGCTGCTGATTATCCTGTTGAAAAGCTTGCTT GCTATGTTTCTGATGATGGAGGTGCACTGCTAACTTTTGAAGCCATGGCAGAAGCTGCTA GCTTTGCAAACACATGGGTTCCGTTTTGCAGAAAGCATGATATTGAGCCAAGGAACCCAG AAACTTATTTCAATTTAAAGAGGGATCCTTATAAGAACAAAGTGCGGCCTGACTTTGTCA AGGACCGTAGACGGGTCAAGCGTGAGTATGATGAGTTCAAGGTGAGAATCAATGGCTTGC CTGATTCTATCCGTCGCCGATCTGATGCATATCATGCTCGGGAGGAAATCAAGGCAATGA AACTTCAGAGACAGAATAGAGACGATGAAGCTGTGGAGACTGTGAAGGTCCCTAAAGCTA CTTGGATGGCTGATGGAACCCATTGGCCTGGGACTTGGATGAATCCTGGATCCGAGCACT CTAAGGGTGATCATGCTGGAATAATACAGGTGATGCTGAAACCCCCGAGTGATGAGCCTT TGCAAAGTACTGCTGATGATACCAGACTAATTGACCTCACTGATGTGGACATTCGTCTCC CCTTGCTTGTTTATGTTTCCCGTGAGAAGCGTCCTGGCTATGATCACAACAAGAAAGCAG GGGCCATGAATGCATTGGTTCGAGCATCAGCAATCATGTCCAATGGTCCTTTCATTCTCA ACCTTGACTGTGACCACTACATCTACAACTCCCAGGCCATGAGAGAAGGCATGTGTTTCA TGATGGACCGGGGTGGTGATCGCATTTGCTATGTACAGTTCCCTCAGAGGTTTGAGGGTA TTGATCCATCTGATCGATATGCAAATCACAACACTGTTTTCTTTGATGTCAATATGCGTG CCCTTGATGGATTACAGGGCCCAGTCTATGTTGGAACTGGATGCCTCTTCAGAAGGATTG CCCTTTATGGCTTTGACCCACCTAGATCAAAAGAACACCATCCTGGTTGCTGCAGCTGCT GCTTTTCTCGTCGCAAGAAGCATGTTAGTGTTGCCACTACCCCAGAAGAGAACCGAGCCT TGAGGATGGGCGATTCTGATGATGAAGAAATGAGCCTCTCCCTTCTTCCTAAGAGGTTTG GAAACTCAAATTTCCTAATTGATTCAATCCCAGTGGCAGAGTTTCAAGGCCGTCCCCTGG CAGATCATCCAGCCGTGAAGAATGGACGGCCACCTGGTGCTCTTACCATTCCTCGAGAGC TTCTTGATGCATCAACTGTTGCAGAGGCAATCAGTGTCATCTCCTGCTGGTATGAAGATA AGACTGAGTGGGGAAATCGTGTCGGGTGGATTTATGGGTCTGTTACTGAAGATGTGGTTA CTGGGTACAGGATGCACAACAGAGGATGGAAATCTGTTTACTGTGTCACCAAGAGGGATG CCTTTCGGGGAACTGCTCCCATCAATCTCACTGATAGGCTCCATCAAGTCCTCAGGTGGG CTACTGGCTCAGTTGAAATTTTCTTCTCCCGTAACAATGCTCTCCTGGCCAGCCCAAGAA TGAAGCTTCTGCAGAGGGTAGCCTACCTTAATGTCGGAATCTACCCCTTTACCTCAATCT TCTTGATCGTCTATTGCTTCCTTCCTGCACTCTCTCTCTTCTCTGGCCAGTTCATCGTTC AGACCCTCAATGTCACTTTCCTTACCTACCTCCTGGTTATCACTGTGACCCTATGTATGC TTGCTGTGCTCGAGATTAAATGGTCTGGAATTGAGCTTGAAGAGTGGTGGAGGAATGAGC AGTTTTGGTTGATTGGAGGCACTAGTGCTCATCTTGCTGCCGTTCTTCAGGGGCTACTGA AAGTCATTGCAGGGATAGAAATATCCTTCACCTTGACATCCAAATCAGGCGGTGATGACA TTGATGATGAGTATGCAGATCTCTATGTTGTCAAATGGACATCACTGATGATTCCACCAA TCACAATCATGATGACCAACTTGATTGCAATTGCAGTTGCTTTTAGCCGAACAATATATA GTGTGTTACCTCAGTGGAGCCGTCTGCTAGGTGGGGTTTTCTTCAGCTTCTGGGTCTTGG CTCATCTCTACCCCTTTGCCAAGGGACTCATGGGAAGAAGAGGAAGGACTCCCACCATTG TTTTTGTATGGTCGGGACTCATTGCAATCACCATTTCCCTCCTTTGGGTGGCTATCAGCC CCCCATCAGGTTCTACCCAAATTGGAGGTTCATTTGAGTTCCCTTGATAGGTCATTTTTT TTTTCATATCAAAGTGAAATTGTTTTCAGAGTTTCCTTTATTAATTCTTTGTACAAGTTG ATCATGTTGGTGCACAGACTAGGTGTGTT