Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_16s0013g02120.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:16:10063604:10066529:1 gene:VIT_16s0013g02120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCCTCCCTGAAGTTTTCCGTTTCTGTTGATACCTATGATTCCAACAAGTTTCATTTC TCTGTAAACCCATCTCTGCCCATTATCAATTCTTTCGCTAGGGTTAAACCCATCAATATT TCTCGGTTAGAGGCCGAGTCTTGGGACACTTCCGATTCTAACTCCGTTGTTGATAATATA AAAACTTGGAATAAGGATTCAGGTAGTGAGAATTTGATTCTGGAAAGCTCAAATTTTCGA AATGACATCTGGAGGCGGGTTCAGGGTGTGAAGAGAGTAAGGAGAAGAGACCCAAATTCA AAATTTAGGTCTATAAGGAATGATAATGGACATGAAGAGCAAAAATCTGTGAATCATTTT GATGATGAAATAGATGTGAATGAATATGGTATTGGGCCGGAGTTGAGCGTTGAGCGTTGT AATGCCATCTTGAAAGGGCTAGAGAGGTGTAGTGATAGCAAGACCATGAAGTTTTTTGAG TGGATGAGGGAAAATGGAAAATTGGAAGGGAATGTGAGTGCTTATAATTTGGCGCTCCGG GTGTTGGGTAGGAGAGGAGATTGGGATGCAGCAGAGACGATGATTTGGGAAATGAATGGT GATTCAGATTGTCAAGTCAATTTTCAAGTTTACAACACACTTATTTATGCTTGTTATAAA CAGGGGCATGTGGAGTTGGGTACCAAGTGGTTCAGATTGATGTTGGAGAATGGGGTTCGG CCTAATGTTGCAACCTTTGGTATGGTCATGAGTTTGTACCAGAAGGGTTGGAATGTTGCG GATTCAGAGTACGCTTTTTCTCAAATGAGGAGCTTTGGAATTACATGTCAGTCTGCATAC TCAGCAATGATAACAATTTACACCCGAATGAGTTTGTATGATAAAGCAGAAGAGGTTATT GACTTCATACAAGAAGATAAGGTGATTTTGAATTTGGAGAATTGGTTGGTTTTGCTTAAT GCTTATAGTCAACAAGGGAAGCTACAGGAGGCTGAAAGGGTACTGTTCTCAATGCAGAAT GCTGGGTTTTCACCAAATATAGTTGCATACAACATGTTGATTACTGGGTATGGGAAAGCA TCCAATATGGATGCTGCTCAACATATATTCAGGAACCTCAAAAATGTTGGACTAGAGCCT GATGAAAGTACTTATAGGTCCATGATTGAAGGTTGGGGTCGTGCTGAAAATTATAAGGAG GCAGAATGGTATTACAATGAACTCAAGCGGTTGGGATTCAAACCTAACTCATCAAACTTG TATACAATGATAAACTTGCAAGCCAAGTATGCAGATGGAGAGGATGCTGCCAGAACTCTT GATGATATGAAGAGGATAGGTTGCCAGTATTCTTCTGTCCTCGGTACCCTTTTACAAGCA TATGAGAGAGCTGGAAGGATTGACAGAGTGCCTCTAATTTTGAAAGGTTCCTTCTATGAG TATGTTCTTGTTAATCAAACATCGTGCTCAATTCTTGTCATGGCATATGTGAAACACTGT TTGGTGGATGATGCTATAAAAGTCCTACAGGAAAAACAGTGGAAGGATACCATCTTTGAG GATAACTTGTACCATTTGGTAATTTGCTCCTGTAAGGAATTGGGTCGTCTTGAAAATGCT GTTAAGATATACAGTCAAATGCCCAACAAGAAGCCAAACTTGCACATCATGTGCACAATG ATTGACATTTACAGCACCCTGGGTCGATTCTCTGATGCAGAGAACCTCTATCTGAAGTTG AAATCTTCAGAAATTTCCTTGGACATGATTGCCTTTAGCATTGTTGTAAGGATGTATGTA AAATCTGGGTCTTTGAAAGATGCTTGCTCCGTTCTAGAAACAATGGATGAACAAAAGAAC ATTGTTCCAGATATCTACCTGTTTTGTGATATGCTTCGAATTTATCAACAATGTGGCATG TTGGATAAATTACAAGATCTGTACTATAGAATCTTGAAGACGGGAGTCACTTGGGATTCT GAAATGTACAACTGTGTCATAAACTGCTGTGCACGTGCTTTGCCAGTTGATGAACTTTCC AGGCTTTTTGATGAGATGCTTTTACATGGGTTTGCTCCCAATACCATTACCTTAAATGTT ATGCTTGATGTTTATGGAAAATCCAGGCTTTTCAAAAAGGCTAGGAAGGTGCTTTGGCTG GCCAGAAAACGAGGCTTGGTTGATGTTATTTCTTACAATACCATTATAGCTGCCTATGGG CAAAGCAAAGACTTAAAGAAAATGTTATCAACTGTTCGACAAATGCAATTTAATGGCTTT TCAGTTTCCCTTGAAGTCTATAATTGCATGTTGGATTCCTACGGGAAAGAAGGCCAAATA GAGAGTTTCAGAAGTGTCTTGAGGAGAATGAAGGAATCAAGTTGTGCATCCGACCACTAT ACTTACAACATTATGATCAATATTTATGGAGAGCAAGGATGGATTGAAGAAGTTGCTAAT GTTCTGACAGAGTTGAAAGAATCTGGGCTGGGACCTGATTTGTGCAGCTATAACACATTG ATAAAGGCATACGGAATTGCAGGAATGGTTGAAGATGCTGTGGTTTTGGTTAAGGAAATG AGAGAAAATGGGATCCAACCTGACAGAATAACCTACATTAATCTCATCAATGCACTGCGC AAAAACGATGAGTTTTTAGAGGCTGTTAAGTGGTCCTTATGGATGAAGCAGATGGGATTG TGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_16s0013g02120.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:16:10063604:10066529:1 gene:VIT_16s0013g02120 transcript:VIT_16s0013g02120.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MASLKFSVSVDTYDSNKFHFSVNPSLPIINSFARVKPINISRLEAESWDTSDSNSVVDNI KTWNKDSGSENLILESSNFRNDIWRRVQGVKRVRRRDPNSKFRSIRNDNGHEEQKSVNHF DDEIDVNEYGIGPELSVERCNAILKGLERCSDSKTMKFFEWMRENGKLEGNVSAYNLALR VLGRRGDWDAAETMIWEMNGDSDCQVNFQVYNTLIYACYKQGHVELGTKWFRLMLENGVR PNVATFGMVMSLYQKGWNVADSEYAFSQMRSFGITCQSAYSAMITIYTRMSLYDKAEEVI DFIQEDKVILNLENWLVLLNAYSQQGKLQEAERVLFSMQNAGFSPNIVAYNMLITGYGKA SNMDAAQHIFRNLKNVGLEPDESTYRSMIEGWGRAENYKEAEWYYNELKRLGFKPNSSNL YTMINLQAKYADGEDAARTLDDMKRIGCQYSSVLGTLLQAYERAGRIDRVPLILKGSFYE YVLVNQTSCSILVMAYVKHCLVDDAIKVLQEKQWKDTIFEDNLYHLVICSCKELGRLENA VKIYSQMPNKKPNLHIMCTMIDIYSTLGRFSDAENLYLKLKSSEISLDMIAFSIVVRMYV KSGSLKDACSVLETMDEQKNIVPDIYLFCDMLRIYQQCGMLDKLQDLYYRILKTGVTWDS EMYNCVINCCARALPVDELSRLFDEMLLHGFAPNTITLNVMLDVYGKSRLFKKARKVLWL ARKRGLVDVISYNTIIAAYGQSKDLKKMLSTVRQMQFNGFSVSLEVYNCMLDSYGKEGQI ESFRSVLRRMKESSCASDHYTYNIMINIYGEQGWIEEVANVLTELKESGLGPDLCSYNTL IKAYGIAGMVEDAVVLVKEMRENGIQPDRITYINLINALRKNDEFLEAVKWSLWMKQMGL

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_16s0013g02120.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:16:10063604:10066529:1 gene:VIT_16s0013g02120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCCTCCCTGAAGTTTTCCGTTTCTGTTGATACCTATGATTCCAACAAGTTTCATTTC TCTGTAAACCCATCTCTGCCCATTATCAATTCTTTCGCTAGGGTTAAACCCATCAATATT TCTCGGTTAGAGGCCGAGTCTTGGGACACTTCCGATTCTAACTCCGTTGTTGATAATATA AAAACTTGGAATAAGGATTCAGGTAGTGAGAATTTGATTCTGGAAAGCTCAAATTTTCGA AATGACATCTGGAGGCGGGTTCAGGGTGTGAAGAGAGTAAGGAGAAGAGACCCAAATTCA AAATTTAGGTCTATAAGGAATGATAATGGACATGAAGAGCAAAAATCTGTGAATCATTTT GATGATGAAATAGATGTGAATGAATATGGTATTGGGCCGGAGTTGAGCGTTGAGCGTTGT AATGCCATCTTGAAAGGGCTAGAGAGGTGTAGTGATAGCAAGACCATGAAGTTTTTTGAG TGGATGAGGGAAAATGGAAAATTGGAAGGGAATGTGAGTGCTTATAATTTGGCGCTCCGG GTGTTGGGTAGGAGAGGAGATTGGGATGCAGCAGAGACGATGATTTGGGAAATGAATGGT GATTCAGATTGTCAAGTCAATTTTCAAGTTTACAACACACTTATTTATGCTTGTTATAAA CAGGGGCATGTGGAGTTGGGTACCAAGTGGTTCAGATTGATGTTGGAGAATGGGGTTCGG CCTAATGTTGCAACCTTTGGTATGGTCATGAGTTTGTACCAGAAGGGTTGGAATGTTGCG GATTCAGAGTACGCTTTTTCTCAAATGAGGAGCTTTGGAATTACATGTCAGTCTGCATAC TCAGCAATGATAACAATTTACACCCGAATGAGTTTGTATGATAAAGCAGAAGAGGTTATT GACTTCATACAAGAAGATAAGGTGATTTTGAATTTGGAGAATTGGTTGGTTTTGCTTAAT GCTTATAGTCAACAAGGGAAGCTACAGGAGGCTGAAAGGGTACTGTTCTCAATGCAGAAT GCTGGGTTTTCACCAAATATAGTTGCATACAACATGTTGATTACTGGGTATGGGAAAGCA TCCAATATGGATGCTGCTCAACATATATTCAGGAACCTCAAAAATGTTGGACTAGAGCCT GATGAAAGTACTTATAGGTCCATGATTGAAGGTTGGGGTCGTGCTGAAAATTATAAGGAG GCAGAATGGTATTACAATGAACTCAAGCGGTTGGGATTCAAACCTAACTCATCAAACTTG TATACAATGATAAACTTGCAAGCCAAGTATGCAGATGGAGAGGATGCTGCCAGAACTCTT GATGATATGAAGAGGATAGGTTGCCAGTATTCTTCTGTCCTCGGTACCCTTTTACAAGCA TATGAGAGAGCTGGAAGGATTGACAGAGTGCCTCTAATTTTGAAAGGTTCCTTCTATGAG TATGTTCTTGTTAATCAAACATCGTGCTCAATTCTTGTCATGGCATATGTGAAACACTGT TTGGTGGATGATGCTATAAAAGTCCTACAGGAAAAACAGTGGAAGGATACCATCTTTGAG GATAACTTGTACCATTTGGTAATTTGCTCCTGTAAGGAATTGGGTCGTCTTGAAAATGCT GTTAAGATATACAGTCAAATGCCCAACAAGAAGCCAAACTTGCACATCATGTGCACAATG ATTGACATTTACAGCACCCTGGGTCGATTCTCTGATGCAGAGAACCTCTATCTGAAGTTG AAATCTTCAGAAATTTCCTTGGACATGATTGCCTTTAGCATTGTTGTAAGGATGTATGTA AAATCTGGGTCTTTGAAAGATGCTTGCTCCGTTCTAGAAACAATGGATGAACAAAAGAAC ATTGTTCCAGATATCTACCTGTTTTGTGATATGCTTCGAATTTATCAACAATGTGGCATG TTGGATAAATTACAAGATCTGTACTATAGAATCTTGAAGACGGGAGTCACTTGGGATTCT GAAATGTACAACTGTGTCATAAACTGCTGTGCACGTGCTTTGCCAGTTGATGAACTTTCC AGGCTTTTTGATGAGATGCTTTTACATGGGTTTGCTCCCAATACCATTACCTTAAATGTT ATGCTTGATGTTTATGGAAAATCCAGGCTTTTCAAAAAGGCTAGGAAGGTGCTTTGGCTG GCCAGAAAACGAGGCTTGGTTGATGTTATTTCTTACAATACCATTATAGCTGCCTATGGG CAAAGCAAAGACTTAAAGAAAATGTTATCAACTGTTCGACAAATGCAATTTAATGGCTTT TCAGTTTCCCTTGAAGTCTATAATTGCATGTTGGATTCCTACGGGAAAGAAGGCCAAATA GAGAGTTTCAGAAGTGTCTTGAGGAGAATGAAGGAATCAAGTTGTGCATCCGACCACTAT ACTTACAACATTATGATCAATATTTATGGAGAGCAAGGATGGATTGAAGAAGTTGCTAAT GTTCTGACAGAGTTGAAAGAATCTGGGCTGGGACCTGATTTGTGCAGCTATAACACATTG ATAAAGGCATACGGAATTGCAGGAATGGTTGAAGATGCTGTGGTTTTGGTTAAGGAAATG AGAGAAAATGGGATCCAACCTGACAGAATAACCTACATTAATCTCATCAATGCACTGCGC AAAAACGATGAGTTTTTAGAGGCTGTTAAGTGGTCCTTATGGATGAAGCAGATGGGATTG TGATATCTTCAGCGAATTTGCCTCCATATCGAAAAGCAGATTGAACATTTCCTACTCAAA CATCCCTGGAAATTTTGCTAATCAAGGTATTGTATTTTCTGTATGTATCTAGAGAAGCTG ATTTTTTCCCTTTCTCCATCCCTTTTTTTTTTTTTTGTTGAATGTTTATATGTCTATTGG TAACTTGTATCATGATAAAGGTTGATAGTAATACCATAATATTCTT