Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_16s0013g00200.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:16:5109843:5112272:-1 gene:VIT_16s0013g00200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGACAAGACACTTGAACACATACCAACACCCCGAGATTCGCCGCAGTGTTGAGCATTTC
AACGTTTTGATTGATGGGTATTGCAGAAATGGAGAGATAAGCCGTGCGGTGGAGCTTCTG
GAGGGAATGAAGACTGAGGGCCCAGCTCCAGACATCGTGACATACAACACTCTGATGAAC
GGGTTCTGCAAAATTGGCGATTTATTCACTGCCAAGAAACTCATGGGTGAGATTTCGTTG
GTGAATTTGGAACCTAACGTTATTACTTACACTACATTGATTGATGCTTATTGTAAGAGT
CAGTGTCTCGAAGATGCACTCTATATGTATGATGAAATGACTGTGAAAAGTTTGGTGCCT
GACGTGGTTACTTATACTTGTATTATGAACGGGCTTTGCAAGAGTGGGAAGGTCGAGGAG
GCGAAATCGGTTTTTAGGGAGATGGAAGAGGTGGGTGTGGTCCCGAATCGTTTTTCATAC
GCAACTCTCATTGATTCGCTCTTTAAGGAGGGGAATGTGGCCGAAGCATTTGTGCTTCAA
GGTCGAATGGTTGTTCGGGGAATTGGGTTTGATGTGGTTGTGTATACTGCATTGATGGAT
GGGCTTTTTAAGGCTGGGATGGCCAATAATGCTGAGGATATGTTTCAGGTGCTTTTGGAG
GAGAGTCTAGTTCCGAATTGTGTTACATATTCTGCCTTGATTGATGGGCATTGCAAGTTG
GGAGATGTGAATAAGGGGGAGTTACTGTTGCAAGAAATGGAGGAGAAACACATTTTTCCG
AATGTCATTGTTTATTCTTCTATAGTTGATGGGTACACCAAGAAGGGGCTGCTTAATGAA
GCCATGGATGTCATGAGAAAGATGGTGCAGAGAAATATTTTGCCAAATGTTTTTGTTTAT
GGTACATTAATAGATGGATATTTCAAAGCAGATCAACGAGGAATTGCCCTTGATCTATTT
AAGGAAATGAAGTCAAGAGGATTGGAGGAGAACAATTTTGTAATTGATTCTTTTGTGAAT
AACTTAAAGAGAAGTGGAAGGATGGAGGAAGCTGATGAGTTATTTAAGGATATGATGTCA
AGGGGCTTGCTACCTGATCGTGTTAACTACACTTCTATGATGGATGGCTTCTTCAAAGCG
GGAAAAGAGTCGGATGCTTTTAACATTGCCCAAGAAATGACAGAGAAAAGTTCTGGTTTT
GATGTTGTTGCCTATAATGTCTTAATAAATGGTCTGTTTAAGCTTGGAAAGTATGAATCA
GAATCATTTCATACTGGAATGAGACAGTTGGGTTTGGCTCCAGACTCTGCTACATTCAAC
ACCATGATCAATGCATACTGCAAAGAGGGAAACTTAGGGAATGCTTTAAAACTCTTGAAT
GAGATGAAGAGCTATGGGTTGAAGCCCAATTCAATCACTTGTAACATTCTGGTGCAAAGG
CTTTGTGCAGCTGGCGAGATTGAGAAAACAATGGATTTGTTGAATGATATGTTGGTTATG
GGGTTTCACCCTACTCCAACTACTCACAAAGCTGTCCTTGATGCATCTTCAAAGAGTAGA
AGGGCTGATGTGATTTTGCATATGCATGATCAACTTGTAGGGATGGGGGTTAAACTCGAT
CTGTCAACTTATAACACTCTTATTAGTACCTTTTGTAGGTTGGGAATGATCAGGAGAGCC
ACTTTAGTATTCAAAGATATGATGGGAAAAGGCATTTTAGCAGATATTATTACTTATAAT
GCCCTTATACATGGATATTGCATAAGCAGCCATTTGAAGAAAGCTTTTGCTGTGCATTCT
CAAATGTTGACTGAAGGAGTTTCTCCAAATGTTGAAACATACAATATCCTTTTAGGGGGC
CTCTCAGCTGCTCGGTTGATTAAAGAGGCGGCTGGACTAGTTAATCAAATGAAGGAAAGG
GGCTTGGTCCCTAATGCTACTACTTATGATATTTTAGTTTCTGGCCATGGTAAGATTGGA
AATATGAAGGAATGTGTAAAACTTTACTGTGAAATGATTACCAAAGGCTTTGTTCCCAAA
ACTAGAACCTATAATGTGCTTATCAGTTGTTTTGCCAAAGGGAAAAAGATGAGTCAGGCT
AAAGAACTCATGCAAGAGATGCAAGTGAGAGGGATCCCACCTAATTCTTCGACTTATGAC
ATTCTAATCTGTGGATGGTACAAACTATCTAAGCAGCCAGAGCTGAACAAGTCATTAAAA
CGATCATACCAGGCTGAAGCAAAAAGATTATTTGAAGAGATGAATGAGAAAGGGTTTATA
CCATGTGAAAATACCCTTGCTTGTATCAGTTTTACCCTTGCAAAACCAGGAAAGAAGGCT
GATGCTCAGAGGATTTTAAACAAACTGTACAAGAAAAAGGTTAAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_16s0013g00200.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:16:5109843:5112272:-1 gene:VIT_16s0013g00200 transcript:VIT_16s0013g00200.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MTRHLNTYQHPEIRRSVEHFNVLIDGYCRNGEISRAVELLEGMKTEGPAPDIVTYNTLMN
GFCKIGDLFTAKKLMGEISLVNLEPNVITYTTLIDAYCKSQCLEDALYMYDEMTVKSLVP
DVVTYTCIMNGLCKSGKVEEAKSVFREMEEVGVVPNRFSYATLIDSLFKEGNVAEAFVLQ
GRMVVRGIGFDVVVYTALMDGLFKAGMANNAEDMFQVLLEESLVPNCVTYSALIDGHCKL
GDVNKGELLLQEMEEKHIFPNVIVYSSIVDGYTKKGLLNEAMDVMRKMVQRNILPNVFVY
GTLIDGYFKADQRGIALDLFKEMKSRGLEENNFVIDSFVNNLKRSGRMEEADELFKDMMS
RGLLPDRVNYTSMMDGFFKAGKESDAFNIAQEMTEKSSGFDVVAYNVLINGLFKLGKYES
ESFHTGMRQLGLAPDSATFNTMINAYCKEGNLGNALKLLNEMKSYGLKPNSITCNILVQR
LCAAGEIEKTMDLLNDMLVMGFHPTPTTHKAVLDASSKSRRADVILHMHDQLVGMGVKLD
LSTYNTLISTFCRLGMIRRATLVFKDMMGKGILADIITYNALIHGYCISSHLKKAFAVHS
QMLTEGVSPNVETYNILLGGLSAARLIKEAAGLVNQMKERGLVPNATTYDILVSGHGKIG
NMKECVKLYCEMITKGFVPKTRTYNVLISCFAKGKKMSQAKELMQEMQVRGIPPNSSTYD
ILICGWYKLSKQPELNKSLKRSYQAEAKRLFEEMNEKGFIPCENTLACISFTLAKPGKKA
DAQRILNKLYKKKVK

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_16s0013g00200.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:16:5109843:5112272:-1 gene:VIT_16s0013g00200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

CTCTTCCCATCACCAATACTCCAACAATTCCTGCCCACAACGATGACAAGACACTTGAAC
ACATACCAACACCCCGAGATTCGCCGCAGTGTTGAGCATTTCAACGTTTTGATTGATGGG
TATTGCAGAAATGGAGAGATAAGCCGTGCGGTGGAGCTTCTGGAGGGAATGAAGACTGAG
GGCCCAGCTCCAGACATCGTGACATACAACACTCTGATGAACGGGTTCTGCAAAATTGGC
GATTTATTCACTGCCAAGAAACTCATGGGTGAGATTTCGTTGGTGAATTTGGAACCTAAC
GTTATTACTTACACTACATTGATTGATGCTTATTGTAAGAGTCAGTGTCTCGAAGATGCA
CTCTATATGTATGATGAAATGACTGTGAAAAGTTTGGTGCCTGACGTGGTTACTTATACT
TGTATTATGAACGGGCTTTGCAAGAGTGGGAAGGTCGAGGAGGCGAAATCGGTTTTTAGG
GAGATGGAAGAGGTGGGTGTGGTCCCGAATCGTTTTTCATACGCAACTCTCATTGATTCG
CTCTTTAAGGAGGGGAATGTGGCCGAAGCATTTGTGCTTCAAGGTCGAATGGTTGTTCGG
GGAATTGGGTTTGATGTGGTTGTGTATACTGCATTGATGGATGGGCTTTTTAAGGCTGGG
ATGGCCAATAATGCTGAGGATATGTTTCAGGTGCTTTTGGAGGAGAGTCTAGTTCCGAAT
TGTGTTACATATTCTGCCTTGATTGATGGGCATTGCAAGTTGGGAGATGTGAATAAGGGG
GAGTTACTGTTGCAAGAAATGGAGGAGAAACACATTTTTCCGAATGTCATTGTTTATTCT
TCTATAGTTGATGGGTACACCAAGAAGGGGCTGCTTAATGAAGCCATGGATGTCATGAGA
AAGATGGTGCAGAGAAATATTTTGCCAAATGTTTTTGTTTATGGTACATTAATAGATGGA
TATTTCAAAGCAGATCAACGAGGAATTGCCCTTGATCTATTTAAGGAAATGAAGTCAAGA
GGATTGGAGGAGAACAATTTTGTAATTGATTCTTTTGTGAATAACTTAAAGAGAAGTGGA
AGGATGGAGGAAGCTGATGAGTTATTTAAGGATATGATGTCAAGGGGCTTGCTACCTGAT
CGTGTTAACTACACTTCTATGATGGATGGCTTCTTCAAAGCGGGAAAAGAGTCGGATGCT
TTTAACATTGCCCAAGAAATGACAGAGAAAAGTTCTGGTTTTGATGTTGTTGCCTATAAT
GTCTTAATAAATGGTCTGTTTAAGCTTGGAAAGTATGAATCAGAATCATTTCATACTGGA
ATGAGACAGTTGGGTTTGGCTCCAGACTCTGCTACATTCAACACCATGATCAATGCATAC
TGCAAAGAGGGAAACTTAGGGAATGCTTTAAAACTCTTGAATGAGATGAAGAGCTATGGG
TTGAAGCCCAATTCAATCACTTGTAACATTCTGGTGCAAAGGCTTTGTGCAGCTGGCGAG
ATTGAGAAAACAATGGATTTGTTGAATGATATGTTGGTTATGGGGTTTCACCCTACTCCA
ACTACTCACAAAGCTGTCCTTGATGCATCTTCAAAGAGTAGAAGGGCTGATGTGATTTTG
CATATGCATGATCAACTTGTAGGGATGGGGGTTAAACTCGATCTGTCAACTTATAACACT
CTTATTAGTACCTTTTGTAGGTTGGGAATGATCAGGAGAGCCACTTTAGTATTCAAAGAT
ATGATGGGAAAAGGCATTTTAGCAGATATTATTACTTATAATGCCCTTATACATGGATAT
TGCATAAGCAGCCATTTGAAGAAAGCTTTTGCTGTGCATTCTCAAATGTTGACTGAAGGA
GTTTCTCCAAATGTTGAAACATACAATATCCTTTTAGGGGGCCTCTCAGCTGCTCGGTTG
ATTAAAGAGGCGGCTGGACTAGTTAATCAAATGAAGGAAAGGGGCTTGGTCCCTAATGCT
ACTACTTATGATATTTTAGTTTCTGGCCATGGTAAGATTGGAAATATGAAGGAATGTGTA
AAACTTTACTGTGAAATGATTACCAAAGGCTTTGTTCCCAAAACTAGAACCTATAATGTG
CTTATCAGTTGTTTTGCCAAAGGGAAAAAGATGAGTCAGGCTAAAGAACTCATGCAAGAG
ATGCAAGTGAGAGGGATCCCACCTAATTCTTCGACTTATGACATTCTAATCTGTGGATGG
TACAAACTATCTAAGCAGCCAGAGCTGAACAAGTCATTAAAACGATCATACCAGGCTGAA
GCAAAAAGATTATTTGAAGAGATGAATGAGAAAGGGTTTATACCATGTGAAAATACCCTT
GCTTGTATCAGTTTTACCCTTGCAAAACCAGGAAAGAAGGCTGATGCTCAGAGGATTTTA
AACAAACTGTACAAGAAAAAGGTTAAATGA