Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_15s0107g00400.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:15:8652780:8654779:-1 gene:VIT_15s0107g00400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCCCTATCTTCTTCATCATCTTCTCTTGCTTCCACGCTCCCACATGACTTCAACCCA CACAAATTATCATTTCTTTCCACACTCCAAACCTGCAAATCCATTAAAGGGCTCAAGCAA ATCCATGCTTCTATCATCAAAACAATGCCTTCTCCCGATGCCCAACTCACCATTTCCACC AGACTCTCTGCTTTATGCGCTCAGTCTTTGCCTATAGACCCCAGATACGCACTTTCACTT TTGGCCCAACTGCGCACCCCAAATCTTCCTCTTTACAATGCCATTATCAGGGGTTTGGCT ACTTCCAATAATGACTCAATTGAAGGTTTGGTGGTGTACAAACAAATGCTTAGTAAAGGC ATTGTTCCTGATAATTACACCATCCCTTTTGTTCTCAAGGCGTGTGCGGAGTCTCGGGCG GTGAGAGAGGGTGAGGAGGTTCACGGGCAGGCAATTAAGATGGGTTTGGCTTCAGATGTG TATGTGAGTAACACACTGATGAGGATGTATGCAGTTTGTGATGTTATTCGGAGTGCCCGG AAGGTGTTCGATACAAGTCCTCAACGGGACTTGGTTTCCTGGACAACGATGATTCAGGGG TATGTGAAAATGGGTTTTGCGAGGGAAGGGGTTGGGCTGTTCTTTGAGATGTGTGGGGAG AATTTACAGGCTGATGGAATGACTCTGGTGATTGTACTTTCCTCTTGTGCTAGATTGGGT GATTTGAGATTGGGGAGGAAGTTACATAGGTATATTATTCGTAATAGTAATGTGAATTTG GATGTTTTTGTTGGGAATGCTTTGGTTGATATGTACTTGAAGTGTGGGGATGCTAATTTT GCTCGTAAGGTATTTCAAGAGATGCCCGTAAAAAATGTGGTTTCTTGGAATTCTATGATA TCAGGGCTAGCTCAGAAGGGGCAGTTTAAGGAATCCTTGTACATGTTTCGGAAAATGCAA AGGCTGGGTGTCAAGCCAGATGATGTCACTTTAGTTGCTGTTCTCAACTCTTGTGCCAAT CTTGGAGTACTTGAGTTGGGGAAGTGGGTCCATGCATATCTAGATAGAAATCAGATCAGA GCAGATGGGTTTATCGGGAATGCTCTAGTGGATATGTATGCAAAGTGTGGAAGCATAGAT CAAGCCTGTTGGGTATTTCAAGCCATGAACCGTAAAGATGTTTATTCGTACACTGCCATG ATTGTGGGGTTAGCTATGCATGGGCAAGGGGGGAAAGCATTGGATCTCTTCTCAGAGATG CCTAAAATGGGCATAGAGCCAGATGAGGTGACTTTTGTTGGTGTCCTCACTGCATGTAGT CATGTAGGACTTGTGGAGGAAGGCCGAAAATATTTTGAAGACATGTCAACAATCTACAAC CTAAGACCTCAATTGGAGCACTATGGTTGCATGGTTGACCTTTTGGGCCGTGCTGGATTA ATAAATGAGGCAGAGGAATTTATCAGAAACATGCCAATTGAACCAGATGCTTTTGTTTTG GGGGCGTTACTCGGAGCTTGTAAAATCCATGGAAAAGTTGAGCTTGGGGAAAGTGTAATG AAAAAAATTGAGAAGATTGAACCTAGAAAGGATGGTGCTTATGTACTTATGTCAAACATA TATTCCTCTGCAAACAGATGGAGGGATGCATTGAAGTTGAGAAAGACAATGAAAGAGAGA AATTTGGAGAAGACTCCTGGGTGTAGTTCAATTGAACTTGATGGTGTGATTCATGAATTC CAGAAAGGGGATAAATCACACCCAAAGATTAAAGAGATTTACAAGTTGCTTGATGAGATC ATGAGCCATTTAAAGAACAATGAGTGCTTGACACGCACTAGCGTGTTTTCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_15s0107g00400.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:15:8652780:8654779:-1 gene:VIT_15s0107g00400 transcript:VIT_15s0107g00400.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MALSSSSSSLASTLPHDFNPHKLSFLSTLQTCKSIKGLKQIHASIIKTMPSPDAQLTIST RLSALCAQSLPIDPRYALSLLAQLRTPNLPLYNAIIRGLATSNNDSIEGLVVYKQMLSKG IVPDNYTIPFVLKACAESRAVREGEEVHGQAIKMGLASDVYVSNTLMRMYAVCDVIRSAR KVFDTSPQRDLVSWTTMIQGYVKMGFAREGVGLFFEMCGENLQADGMTLVIVLSSCARLG DLRLGRKLHRYIIRNSNVNLDVFVGNALVDMYLKCGDANFARKVFQEMPVKNVVSWNSMI SGLAQKGQFKESLYMFRKMQRLGVKPDDVTLVAVLNSCANLGVLELGKWVHAYLDRNQIR ADGFIGNALVDMYAKCGSIDQACWVFQAMNRKDVYSYTAMIVGLAMHGQGGKALDLFSEM PKMGIEPDEVTFVGVLTACSHVGLVEEGRKYFEDMSTIYNLRPQLEHYGCMVDLLGRAGL INEAEEFIRNMPIEPDAFVLGALLGACKIHGKVELGESVMKKIEKIEPRKDGAYVLMSNI YSSANRWRDALKLRKTMKERNLEKTPGCSSIELDGVIHEFQKGDKSHPKIKEIYKLLDEI MSHLKNNECLTRTSVFS

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_15s0107g00400.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:15:8652780:8654779:-1 gene:VIT_15s0107g00400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCCCTATCTTCTTCATCATCTTCTCTTGCTTCCACGCTCCCACATGACTTCAACCCA CACAAATTATCATTTCTTTCCACACTCCAAACCTGCAAATCCATTAAAGGGCTCAAGCAA ATCCATGCTTCTATCATCAAAACAATGCCTTCTCCCGATGCCCAACTCACCATTTCCACC AGACTCTCTGCTTTATGCGCTCAGTCTTTGCCTATAGACCCCAGATACGCACTTTCACTT TTGGCCCAACTGCGCACCCCAAATCTTCCTCTTTACAATGCCATTATCAGGGGTTTGGCT ACTTCCAATAATGACTCAATTGAAGGTTTGGTGGTGTACAAACAAATGCTTAGTAAAGGC ATTGTTCCTGATAATTACACCATCCCTTTTGTTCTCAAGGCGTGTGCGGAGTCTCGGGCG GTGAGAGAGGGTGAGGAGGTTCACGGGCAGGCAATTAAGATGGGTTTGGCTTCAGATGTG TATGTGAGTAACACACTGATGAGGATGTATGCAGTTTGTGATGTTATTCGGAGTGCCCGG AAGGTGTTCGATACAAGTCCTCAACGGGACTTGGTTTCCTGGACAACGATGATTCAGGGG TATGTGAAAATGGGTTTTGCGAGGGAAGGGGTTGGGCTGTTCTTTGAGATGTGTGGGGAG AATTTACAGGCTGATGGAATGACTCTGGTGATTGTACTTTCCTCTTGTGCTAGATTGGGT GATTTGAGATTGGGGAGGAAGTTACATAGGTATATTATTCGTAATAGTAATGTGAATTTG GATGTTTTTGTTGGGAATGCTTTGGTTGATATGTACTTGAAGTGTGGGGATGCTAATTTT GCTCGTAAGGTATTTCAAGAGATGCCCGTAAAAAATGTGGTTTCTTGGAATTCTATGATA TCAGGGCTAGCTCAGAAGGGGCAGTTTAAGGAATCCTTGTACATGTTTCGGAAAATGCAA AGGCTGGGTGTCAAGCCAGATGATGTCACTTTAGTTGCTGTTCTCAACTCTTGTGCCAAT CTTGGAGTACTTGAGTTGGGGAAGTGGGTCCATGCATATCTAGATAGAAATCAGATCAGA GCAGATGGGTTTATCGGGAATGCTCTAGTGGATATGTATGCAAAGTGTGGAAGCATAGAT CAAGCCTGTTGGGTATTTCAAGCCATGAACCGTAAAGATGTTTATTCGTACACTGCCATG ATTGTGGGGTTAGCTATGCATGGGCAAGGGGGGAAAGCATTGGATCTCTTCTCAGAGATG CCTAAAATGGGCATAGAGCCAGATGAGGTGACTTTTGTTGGTGTCCTCACTGCATGTAGT CATGTAGGACTTGTGGAGGAAGGCCGAAAATATTTTGAAGACATGTCAACAATCTACAAC CTAAGACCTCAATTGGAGCACTATGGTTGCATGGTTGACCTTTTGGGCCGTGCTGGATTA ATAAATGAGGCAGAGGAATTTATCAGAAACATGCCAATTGAACCAGATGCTTTTGTTTTG GGGGCGTTACTCGGAGCTTGTAAAATCCATGGAAAAGTTGAGCTTGGGGAAAGTGTAATG AAAAAAATTGAGAAGATTGAACCTAGAAAGGATGGTGCTTATGTACTTATGTCAAACATA TATTCCTCTGCAAACAGATGGAGGGATGCATTGAAGTTGAGAAAGACAATGAAAGAGAGA AATTTGGAGAAGACTCCTGGGTGTAGTTCAATTGAACTTGATGGTGTGATTCATGAATTC CAGAAAGGGGATAAATCACACCCAAAGATTAAAGAGATTTACAAGTTGCTTGATGAGATC ATGAGCCATTTAAAGAACAATGAGTGCTTGACACGCACTAGCGTGTTTTCTTAATGCAAC TTTGTAGAGAGCATAATTAAGAAAAAACAGAGACTGGGCATACCTCTCAGGTGTTTCAGC ATGATTACACAGGACATCACTGAGGATTTTGGGGACTTTGGGGACCTCTCTCTCCTACTG AGTGAGCTGTAAGCAGGAGG