Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_15s0048g01090.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:15:15216017:15224263:1 gene:VIT_15s0048g01090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGTTGCATTCGGGAAAAAGTTGAAAGCGAATCAAATTCAAGAATGGCAAGGGCACTAC ATTAACTATAAGTTAATGAAGAAGAAAGTAAACAGATATGCTCAGCAAATTGAGGTGGGA GCGCAAAACCGCCTTTATGTTCTTATGGATTTTGCAAAATTGCTGGATAGTCAGATTGAA AAGATTGTTTTGTTTCTGTTGGAACAACAAGGGATACTCGCAAGCAGATTATCCAATCTC AGAGAACAGCATGATGCTCTTTCACAACAGCCAGATGGATTAAAAGTATCTGAAGTAAAA GAAGCATATAGAGCAGTGGGGAGGGATCTTTTACAGCTTCTCTTTTTTGTGGAAATGAAT GCTATTGGTCTGCGTAAGATATTGAAAAAGTTTGATAAGCGCTTTGGCTACAAGTTTACA AATTACTATGTTAAAACTCGTGCAAATCATCCTTACTCCTTGCTGCAACAAGTGTTCAAG CATGTGGGTATTGGGGCTGTAGTAGGAGCCATATCACGCAATCTTGCAGATCTTCAGGAC CATCAGGGGAGCTACATATCAATTTATGATCAACCTGCTTCTTCACTTACGGATCCTGTC ATTGATTCTATTAATGCTGCTGTAGACAGGTTAACAAACTCAACGAATTTCCTTCACTTT TTGGGAAAACATGCGCTTATTATGCAAGAGGAGTTGCCGACTCCATCTGAGGATCATGCT GTTGACCAGAGATATCATTTTATGTCTCTTCTCTTGAACTTGGCAAACACATTTCTGTAT ATGGTCAACACATATATTATTGTCCCAACAGCAGATAACTACTCTCTGAGCCTTGGAGCT GCAGCAACTGTTTGTGGTGTTGTGATTGGGGCGATGGCTGTTGCACAAGTGTTCTCTTCA GTATATTTTAGTGCATGGTCAAATAAATCGTACATGAGACCTCTATTATTTAGCAGTATT GTTCTTCTTGTTGGAAATGTCTTATACGCACTAGCTTATGATCTTGACTCGATATCGGTT CTCATTATTGGTCGTCTATTCTGTGGGTTAGGTTCTGCAAGAGCTGTCAACAGGCGCTAT ATCAGTGATTGTGTTCCGCTTAAACTACGAATGCAGGCTTCTGCAGGTTTTGTTAGTGCA AGTGCACTTGGAATGGCATGTGGTCCTGCTCTTGCATGCTTATTTCAAACCAATTTTAAG ATTTACAAAATCACATTCAACGACAACACACTACCTGGTTGGTTTATGGTGCTGGCATGG CTTGTCTATTTATTGTGGTTGTGGATTTCTTTCAGAGAGCCTTTTCATGAGGCTAAGGAG AATATTGCACCCCTGGAAGTTAATGCTGCCTTATTAGTAAATGAGGCTGTGGAGAGTGGC TCGACACAACCATTGCTGTTGAACTCAAAAGCTAAAGAGGAAGATGAAGACCAAGAATGC GATGGTGCTGAAGAAGATTCTAATGACATTCAAAAACCTGTCACTTCTCTTGTATTGGCA TATAGATTACTTACACCATCTGTAAAGGTTCAATTATATATTTATTTTATGCTCAAATAT GCTATGGAGGTTCTGCTTGCTGGATCAAGTGTCATCACCACATACTACTTTGTTTGGTCA ACCAGACATGTGGCAATTTTTCTTGCATGTCTTGGGCTAACAGTGCTCCCAGTAAACATG GTTGTTGGGAGCTACATCAGCAACATGTTTGAAGAAAGGCAAGTTTTACTGGCATCTGAA ATTATGGTATGCATAGGAACACTCCTAAGCTTCAATGTAGTTATCCCTTACTCGGTGCTG CAGTATGTTGGCTCAGGACTCATCACATTCGTGTCTGCTGAAGTTCTTGAGGGTGTGAAC CTATCACTCCTATCAAGGGTCATGTCTTCAAGGCTTTCTCAAGGAACCTACAATGGTGGA CTGCTTTCAACAGAGGCTGGAACCTTGGCTCGAGTAGTTGCAGATGGAACAATAACCCTT GCTGGGTACTTGGGTGAGGGTATGGTCTTGAATGTCACCTTACTGACTTCACTCTTCATC TGTATCTCTTCCATTGTCGCCACCTGCTTCACCTACAACACACTCTACTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_15s0048g01090.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:15:15216017:15224263:1 gene:VIT_15s0048g01090 transcript:VIT_15s0048g01090.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MVAFGKKLKANQIQEWQGHYINYKLMKKKVNRYAQQIEVGAQNRLYVLMDFAKLLDSQIE KIVLFLLEQQGILASRLSNLREQHDALSQQPDGLKVSEVKEAYRAVGRDLLQLLFFVEMN AIGLRKILKKFDKRFGYKFTNYYVKTRANHPYSLLQQVFKHVGIGAVVGAISRNLADLQD HQGSYISIYDQPASSLTDPVIDSINAAVDRLTNSTNFLHFLGKHALIMQEELPTPSEDHA VDQRYHFMSLLLNLANTFLYMVNTYIIVPTADNYSLSLGAAATVCGVVIGAMAVAQVFSS VYFSAWSNKSYMRPLLFSSIVLLVGNVLYALAYDLDSISVLIIGRLFCGLGSARAVNRRY ISDCVPLKLRMQASAGFVSASALGMACGPALACLFQTNFKIYKITFNDNTLPGWFMVLAW LVYLLWLWISFREPFHEAKENIAPLEVNAALLVNEAVESGSTQPLLLNSKAKEEDEDQEC DGAEEDSNDIQKPVTSLVLAYRLLTPSVKVQLYIYFMLKYAMEVLLAGSSVITTYYFVWS TRHVAIFLACLGLTVLPVNMVVGSYISNMFEERQVLLASEIMVCIGTLLSFNVVIPYSVL QYVGSGLITFVSAEVLEGVNLSLLSRVMSSRLSQGTYNGGLLSTEAGTLARVVADGTITL AGYLGEGMVLNVTLLTSLFICISSIVATCFTYNTLY

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_15s0048g01090.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:15:15216017:15224263:1 gene:VIT_15s0048g01090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGTTGCATTCGGGAAAAAGTTGAAAGCGAATCAAATTCAAGAATGGCAAGGGCACTAC ATTAACTATAAGTTAATGAAGAAGAAAGTAAACAGATATGCTCAGCAAATTGAGGTGGGA GCGCAAAACCGCCTTTATGTTCTTATGGATTTTGCAAAATTGCTGGATAGTCAGATTGAA AAGATTGTTTTGTTTCTGTTGGAACAACAAGGGATACTCGCAAGCAGATTATCCAATCTC AGAGAACAGCATGATGCTCTTTCACAACAGCCAGATGGATTAAAAGTATCTGAAGTAAAA GAAGCATATAGAGCAGTGGGGAGGGATCTTTTACAGCTTCTCTTTTTTGTGGAAATGAAT GCTATTGGTCTGCGTAAGATATTGAAAAAGTTTGATAAGCGCTTTGGCTACAAGTTTACA AATTACTATGTTAAAACTCGTGCAAATCATCCTTACTCCTTGCTGCAACAAGTGTTCAAG CATGTGGGTATTGGGGCTGTAGTAGGAGCCATATCACGCAATCTTGCAGATCTTCAGGAC CATCAGGGGAGCTACATATCAATTTATGATCAACCTGCTTCTTCACTTACGGATCCTGTC ATTGATTCTATTAATGCTGCTGTAGACAGGTTAACAAACTCAACGAATTTCCTTCACTTT TTGGGAAAACATGCGCTTATTATGCAAGAGGAGTTGCCGACTCCATCTGAGGATCATGCT GTTGACCAGAGATATCATTTTATGTCTCTTCTCTTGAACTTGGCAAACACATTTCTGTAT ATGGTCAACACATATATTATTGTCCCAACAGCAGATAACTACTCTCTGAGCCTTGGAGCT GCAGCAACTGTTTGTGGTGTTGTGATTGGGGCGATGGCTGTTGCACAAGTGTTCTCTTCA GTATATTTTAGTGCATGGTCAAATAAATCGTACATGAGACCTCTATTATTTAGCAGTATT GTTCTTCTTGTTGGAAATGTCTTATACGCACTAGCTTATGATCTTGACTCGATATCGGTT CTCATTATTGGTCGTCTATTCTGTGGGTTAGGTTCTGCAAGAGCTGTCAACAGGCGCTAT ATCAGTGATTGTGTTCCGCTTAAACTACGAATGCAGGCTTCTGCAGGTTTTGTTAGTGCA AGTGCACTTGGAATGGCATGTGGTCCTGCTCTTGCATGCTTATTTCAAACCAATTTTAAG ATTTACAAAATCACATTCAACGACAACACACTACCTGGTTGGTTTATGGTGCTGGCATGG CTTGTCTATTTATTGTGGTTGTGGATTTCTTTCAGAGAGCCTTTTCATGAGGCTAAGGAG AATATTGCACCCCTGGAAGTTAATGCTGCCTTATTAGTAAATGAGGCTGTGGAGAGTGGC TCGACACAACCATTGCTGTTGAACTCAAAAGCTAAAGAGGAAGATGAAGACCAAGAATGC GATGGTGCTGAAGAAGATTCTAATGACATTCAAAAACCTGTCACTTCTCTTGTATTGGCA TATAGATTACTTACACCATCTGTAAAGGTTCAATTATATATTTATTTTATGCTCAAATAT GCTATGGAGGTTCTGCTTGCTGGATCAAGTGTCATCACCACATACTACTTTGTTTGGTCA ACCAGACATGTGGCAATTTTTCTTGCATGTCTTGGGCTAACAGTGCTCCCAGTAAACATG GTTGTTGGGAGCTACATCAGCAACATGTTTGAAGAAAGGCAAGTTTTACTGGCATCTGAA ATTATGGTATGCATAGGAACACTCCTAAGCTTCAATGTAGTTATCCCTTACTCGGTGCTG CAGTATGTTGGCTCAGGACTCATCACATTCGTGTCTGCTGAAGTTCTTGAGGGTGTGAAC CTATCACTCCTATCAAGGGTCATGTCTTCAAGGCTTTCTCAAGGAACCTACAATGGTGGA CTGCTTTCAACAGAGGCTGGAACCTTGGCTCGAGTAGTTGCAGATGGAACAATAACCCTT GCTGGGTACTTGGGTGAGGGTATGGTCTTGAATGTCACCTTACTGACTTCACTCTTCATC TGTATCTCTTCCATTGTCGCCACCTGCTTCACCTACAACACACTCTACTGATGCTTTGCT ATCGGTATTCCTCCCTTCATGTATCATCCTGTATAGTATAG