Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_15s0048g00370.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:15:14506758:14510674:-1 gene:VIT_15s0048g00370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGCTTCTTCGTCTTCTCTCTCCATTTCTCAAGCCATTGTCGCCGGAGCCCTCAACCAC
CGCGGCTCCACTAATTCCTCTGATCGCCTACCCCTGCGGTCATTCACTATTCCCACCTTC
TCCGGCCTCAAATCCACCACCTCAGCTGCTTCATGCCCTTCTCGCCTCGGCTCAGCTCGG
CGGAGGCTGTGCCGGAGATTGGCGGTGCAGGCTGCTTCGGTGGAGACCTTGGAGAAGACG
GAAACTACCTTGATCGAGAAATCGGTGAACACCATCCGGTTTCTGGCCGTCGATTCGGTG
GAGAAGGCGAACTCGGGTCACCCGGGTTTGCCAATGGGTTGTGCTCCAATGGGCCATGTT
TTATACGATGAGTTCATGAAGTTTAACCCCAAGAACCCCTACTGGTTCAATCGTGATCGC
TTTGTTCTCTCTGCCGGACATGGATGCATGCTTCAGTACGCTCTGCTTCACCTTGCTGGC
TACGACAGTGTCAGGGAAGAAGACTTGAAAAGTTTCCGTCAATGGGGAAGCACAACACCT
GGTCACCCAGAAAATTTTGAGACACCTGGTGTTGAAGTCACTACTGGTCCTCTTGGTCAG
GGTATTGCCAATGCTGTTGGCTTGGCTCTTGCGGAGAGGCACTTGGCTGCTCGATTCAAC
AAACCAGACAATGAGATTGTTGATCACTACACATACGTGATACTGGGGGATGGTTGTCAA
ATGGAGGGTGTTGCACATGAAGCTTGTTCACTTGCTGGACATTGGGGTCTTGGGAAGCTG
ATAGCTTTGTATGATGATAACCACATCTCTATTGATGGTGACACTGAGATTGCTTTCACG
GAGAATGTTGACTTACGTTTTGAGGCTCTTGGTTGGCATGTTATCTGGGTGAAGAATGGA
AATACTGGCTATGATGAGATTCGTGCTGCCATCAAGGAAGCAAAGACTGTCAAAGACAAA
CCCACTTTAATCAAGGTGACTACAACCATTGGTTATGGATCCCCAAACAAGTCAAACTCA
TACAGTGTACATGGAAGTGCACTAGGTCCTAAGGAGTTGGATGCCACAAGGAAGAACCTT
CGATGGCCATATGAGCCTTTCCATGTACCCGAGGATGTCAAGAAGCATTGGAGCCGCCAT
GTCCCTGAAGGTGCAGCTCTGGAAGCTGAATGGAATGCCCAGTTTGCTGAATACGAACGC
AAGTATAAAGAAGAAGCTGCAGTATTGAAGTCTCTCATCAATGGTGAATTACCTGCAGGT
TGGGAGAAGGCACTTCCGACGTATACTCCAGAGAGCCCAGCAGAAGCCACGAGAAATTCA
TCACAACAATGTCTAAATGCCCTTGCAAATGTTCTCCCTGGTCTGCTTGGTGGCAGTGCT
GATCTTGCTTCCTCCAACCTGTCGGTGATGAAGCAGTTTGGGAACTTCCAAAAGGGCACA
CCAGAAGAGCGCAATGTCAGGTTTGGTGTTCGGGAGCATGGAATGGGAGCCATCTGCAAT
GGGATTGTCCTTCACTGCCCCGGCCTTATTCCATATTGTGCAACTTTCTTTGTTTTCACT
GACTACTTGAGACCTGCCATGAGGATTTCTGCCTTGTGTGAAGCTGGAGTCATCTATGTT
ATGACACACGATTCAATTGGGCTTGGAGAAGATGGACCTACACATCAGCCTATAGAGCAC
TTGGCAAGTTTTCGGGCTATGCCCAACATTTTGATGCTTCGCCCTGCTGATGGGACTGAG
ACAGCTGCAGCTTACAAGATTGCAGTCCTTAACAGGAAGAGACCCTCAGTCCTTGCCCTT
GGTCGGCGAGATGTCTCCCAGCTTCGTGGAACATCCATTGAGGGAGTTGAGAAGGGAGGT
TACATCGTAACAGACAACTCTTCAGGCAACAAACCAGATGTTATATTGATTGGAACTGGT
TCGGAATTGGAAATTGCTGCCAAAGCAGCTGATGAACTCAGAAAGGAAGGGAAAGCTGTC
AGGGTTGTTTCCTTGGTTTGCTGGGCGCTTTTTGATGAACAATCAGATGCTTACAAGGAA
AGTGTTTTGCCAGCAGCTGTATCAGCCCGGGTCAGCGTTGAAGCTGCATCAACATTTGGG
TGGGAGAAGTTTGTTGGGAGCAAAGGGAAGTCAATTGGTATTGATCGGTTTGGGGCAAGT
GCACCTGCACTAAAGTTGTACAAGGAGCTTGGCGTAACAGCAGAGGCTGTTATAGCGGCA
GCTAAATCAATTTGCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_15s0048g00370.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:15:14506758:14510674:-1 gene:VIT_15s0048g00370 transcript:VIT_15s0048g00370.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MASSSSLSISQAIVAGALNHRGSTNSSDRLPLRSFTIPTFSGLKSTTSAASCPSRLGSAR
RRLCRRLAVQAASVETLEKTETTLIEKSVNTIRFLAVDSVEKANSGHPGLPMGCAPMGHV
LYDEFMKFNPKNPYWFNRDRFVLSAGHGCMLQYALLHLAGYDSVREEDLKSFRQWGSTTP
GHPENFETPGVEVTTGPLGQGIANAVGLALAERHLAARFNKPDNEIVDHYTYVILGDGCQ
MEGVAHEACSLAGHWGLGKLIALYDDNHISIDGDTEIAFTENVDLRFEALGWHVIWVKNG
NTGYDEIRAAIKEAKTVKDKPTLIKVTTTIGYGSPNKSNSYSVHGSALGPKELDATRKNL
RWPYEPFHVPEDVKKHWSRHVPEGAALEAEWNAQFAEYERKYKEEAAVLKSLINGELPAG
WEKALPTYTPESPAEATRNSSQQCLNALANVLPGLLGGSADLASSNLSVMKQFGNFQKGT
PEERNVRFGVREHGMGAICNGIVLHCPGLIPYCATFFVFTDYLRPAMRISALCEAGVIYV
MTHDSIGLGEDGPTHQPIEHLASFRAMPNILMLRPADGTETAAAYKIAVLNRKRPSVLAL
GRRDVSQLRGTSIEGVEKGGYIVTDNSSGNKPDVILIGTGSELEIAAKAADELRKEGKAV
RVVSLVCWALFDEQSDAYKESVLPAAVSARVSVEAASTFGWEKFVGSKGKSIGIDRFGAS
APALKLYKELGVTAEAVIAAAKSIC

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_15s0048g00370.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:15:14506758:14510674:-1 gene:VIT_15s0048g00370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

TTCTTTCTGTTTCTCTCTGTACAATCGACGATGGCTTCTTCGTCTTCTCTCTCCATTTCT
CAAGCCATTGTCGCCGGAGCCCTCAACCACCGCGGCTCCACTAATTCCTCTGATCGCCTA
CCCCTGCGGTCATTCACTATTCCCACCTTCTCCGGCCTCAAATCCACCACCTCAGCTGCT
TCATGCCCTTCTCGCCTCGGCTCAGCTCGGCGGAGGCTGTGCCGGAGATTGGCGGTGCAG
GCTGCTTCGGTGGAGACCTTGGAGAAGACGGAAACTACCTTGATCGAGAAATCGGTGAAC
ACCATCCGGTTTCTGGCCGTCGATTCGGTGGAGAAGGCGAACTCGGGTCACCCGGGTTTG
CCAATGGGTTGTGCTCCAATGGGCCATGTTTTATACGATGAGTTCATGAAGTTTAACCCC
AAGAACCCCTACTGGTTCAATCGTGATCGCTTTGTTCTCTCTGCCGGACATGGATGCATG
CTTCAGTACGCTCTGCTTCACCTTGCTGGCTACGACAGTGTCAGGGAAGAAGACTTGAAA
AGTTTCCGTCAATGGGGAAGCACAACACCTGGTCACCCAGAAAATTTTGAGACACCTGGT
GTTGAAGTCACTACTGGTCCTCTTGGTCAGGGTATTGCCAATGCTGTTGGCTTGGCTCTT
GCGGAGAGGCACTTGGCTGCTCGATTCAACAAACCAGACAATGAGATTGTTGATCACTAC
ACATACGTGATACTGGGGGATGGTTGTCAAATGGAGGGTGTTGCACATGAAGCTTGTTCA
CTTGCTGGACATTGGGGTCTTGGGAAGCTGATAGCTTTGTATGATGATAACCACATCTCT
ATTGATGGTGACACTGAGATTGCTTTCACGGAGAATGTTGACTTACGTTTTGAGGCTCTT
GGTTGGCATGTTATCTGGGTGAAGAATGGAAATACTGGCTATGATGAGATTCGTGCTGCC
ATCAAGGAAGCAAAGACTGTCAAAGACAAACCCACTTTAATCAAGGTGACTACAACCATT
GGTTATGGATCCCCAAACAAGTCAAACTCATACAGTGTACATGGAAGTGCACTAGGTCCT
AAGGAGTTGGATGCCACAAGGAAGAACCTTCGATGGCCATATGAGCCTTTCCATGTACCC
GAGGATGTCAAGAAGCATTGGAGCCGCCATGTCCCTGAAGGTGCAGCTCTGGAAGCTGAA
TGGAATGCCCAGTTTGCTGAATACGAACGCAAGTATAAAGAAGAAGCTGCAGTATTGAAG
TCTCTCATCAATGGTGAATTACCTGCAGGTTGGGAGAAGGCACTTCCGACGTATACTCCA
GAGAGCCCAGCAGAAGCCACGAGAAATTCATCACAACAATGTCTAAATGCCCTTGCAAAT
GTTCTCCCTGGTCTGCTTGGTGGCAGTGCTGATCTTGCTTCCTCCAACCTGTCGGTGATG
AAGCAGTTTGGGAACTTCCAAAAGGGCACACCAGAAGAGCGCAATGTCAGGTTTGGTGTT
CGGGAGCATGGAATGGGAGCCATCTGCAATGGGATTGTCCTTCACTGCCCCGGCCTTATT
CCATATTGTGCAACTTTCTTTGTTTTCACTGACTACTTGAGACCTGCCATGAGGATTTCT
GCCTTGTGTGAAGCTGGAGTCATCTATGTTATGACACACGATTCAATTGGGCTTGGAGAA
GATGGACCTACACATCAGCCTATAGAGCACTTGGCAAGTTTTCGGGCTATGCCCAACATT
TTGATGCTTCGCCCTGCTGATGGGACTGAGACAGCTGCAGCTTACAAGATTGCAGTCCTT
AACAGGAAGAGACCCTCAGTCCTTGCCCTTGGTCGGCGAGATGTCTCCCAGCTTCGTGGA
ACATCCATTGAGGGAGTTGAGAAGGGAGGTTACATCGTAACAGACAACTCTTCAGGCAAC
AAACCAGATGTTATATTGATTGGAACTGGTTCGGAATTGGAAATTGCTGCCAAAGCAGCT
GATGAACTCAGAAAGGAAGGGAAAGCTGTCAGGGTTGTTTCCTTGGTTTGCTGGGCGCTT
TTTGATGAACAATCAGATGCTTACAAGGAAAGTGTTTTGCCAGCAGCTGTATCAGCCCGG
GTCAGCGTTGAAGCTGCATCAACATTTGGGTGGGAGAAGTTTGTTGGGAGCAAAGGGAAG
TCAATTGGTATTGATCGGTTTGGGGCAAGTGCACCTGCACTAAAGTTGTACAAGGAGCTT
GGCGTAACAGCAGAGGCTGTTATAGCGGCAGCTAAATCAATTTGCTAGAACTTTTTACTA
GTGGCTGGTGCCACTCAAATGTTTGTTGGCCATTGGCATTTGGGTTCTGGTTTTGGAGGT
TATAGTGAACAATCCCCTCTTAAGAGCTTTGGGTTGCTGCACACTGCCTTCTTGCCACGT
AATAAACGCAGATAAAAATTTTCATCTGCTGCATTTATCTTCTTCAGTGGAGCAGCTGAG
TCTGCAACCTGAATCTAGACTGTTCAATGAATTTGTACCACCTGCTAGACCTTTTTGAGT
TTTTGTAATGTCATGTGGTTGTTTCTTTAGCCAGGTTTTGATTATCCTCCATCACAA