Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_15s0046g03020.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:15:19672585:19675581:-1 gene:VIT_15s0046g03020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCTAATATCGTTGCCACGCCTAAAGCCAAAGCCTCCACTTCTCTTCCTCACCACCTTC TTCTTCTCCACTGCGTCATCAACCACTGATCTCACCTCCACCCTCTTCCACCAATGCAAA TCCCTAGCGTCCGCCGAGCTCATCCACCAACAACTCCTCGTCCAAGGCCTACCCCATGAC CCCACCCACATCATCTCCATGTACCTCACCTTCAACTCCCCCGCCAAAGCCTTGTCAGTC CTCCGGCGCCTCCACCCATCTTCACATACTGTTTTCTGGTGGAATCAGCTGATTAGACGA AGTGTGCATCTGGGTTTTCTCGAAGATGTCCTCCAACTTTACCGGCGGATGCAGAGGCTG GGGTGGAGGCCGGATCATTATACCTTCCCTTTTGTCCTCAAGGCTTGTGGGGAGATTCCG TCGTTTCGATGTGGGGCTTCGGTGCATGCGGTGGTGTTTGCTAGTGGGTTTGAGTGGAAT GTGTTTGTGGGTAATGGGTTGGTATCGATGTACGGGCGGTGTGGGGCTTGGGAGAATGCG AGACAGGTGTTTGATGAAATGCGGGAGAGGGGAGTTGGAGATTTGGTTTCGTGGAATTCG ATTGTGGCAGCTTATATGCAGGGTGGTGATTCAATTAGGGCGATGAAGATGTTTGAGAGA ATGACCGAGGATCTTGGAATCCGCCCGGATGCTGTTAGCCTTGTTAATGTACTCCCTGCT TGTGCTTCAGTGGGTGCGTGGTCGCGGGGCAAGCAGGTTCATGGTTATGCTCTTCGGAGT GGATTGTTTGAGGATGTGTTCGTGGGTAATGCTGTGGTTGATATGTATGCAAAGTGTGGC ATGATGGAGGAGGCAAACAAGGTTTTTGAGCGAATGAAGGTTAAGGATGTGGTTTCTTGG AATGCTATGGTTACTGGGTATTCTCAGATTGGTAGATTTGATGATGCCCTGGGTTTGTTT GAGAAGATTCGGGAGGAGAAGATTGAGCTCAATGTAGTGACTTGGAGTGCTGTGATTGCC GGGTATGCTCAGAGGGGTCTTGGTTTCGAAGCCCTGGACGTGTTTCGGCAAATGCGACTT TGTGGATCAGAGCCTAATGTTGTTACCCTTGTGTCCCTTCTATCAGGTTGTGCTTTGGCA GGAACACTACTTCATGGGAAGGAAACTCATTGTCATGCCATCAAATGGATTCTGAACCTA GATGAGAATGATCCAGGGGATGATCTGATGGTGATTAATGCTCTTATTGATATGTATTCC AAGTGCAAAAGCCCTAAAGCTGCACGAGCAATGTTTGATTTGATACCACCAAAAGATAGG AGTGTGGTGACTTGGACAGTCTTGATTGGTGGAAATGCCCAGCATGGGGAAGCTAACGAA GCCTTAGAACTTTTCTCCCAGATGCTCCAACCTGATAACTTTGTAATGCCAAATGCTTTT ACTATATCTTGTGCTCTGATGGCGTGTGCTCGTTTGGGTGCACTAAGATTTGGTAGACAA ATTCATGCTTATGTATTACGTAACCGTTTTGAGTCTGCGATGTTATTTGTGGCTAATTGC CTTATAGACATGTATTCCAAATCTGGAGATGTTGATGCAGCTCGGGTTGTTTTTGACAAC ATGCACCAGAGGAATGGTGTTTCCTGGACATCCCTAATGACAGGCTATGGCATGCATGGG CGTGGAGAAGAAGCTCTGCAGATTTTTTATGAGATGCAGAAAGTGGGTCTGGTGCCTGAT GGTGTGACCTTTGTAGTTGTGCTCTATGCTTGCAGCCATTCTGGGATGGTTGATCAGGGG ATCAATTACTTTAATGGCATGAACAAGGACTTTGGAGTGGTTCCTGGAGCAGAACACTAT GCCTGCATGGTTGATCTCTTGAGTCGTGCTGGTCGTTTGGATGAAGCTATGGAACTCATA AGAGGCATGCCTATGAAACCAACCCCAGCAGTGTGGGTAGCATTGCTTAGTGCTTGCAGG GTCTATGCAAATGTTGAACTTGGGGAATATGCCGCAAACCAGTTATTAGAGTTGGAGTCG GGGAATGATGGGTCCTATACCCTACTCTCAAACATTTATGCCAATGCCAGGTGTTGGAAA GATGTGGCTAGGATCAGATATTTGATGAAAAATACAGGGATCAAGAAGAGACCAGGTTGC AGTTGGGTCCAAGGGAGGAAGGGCACTGCAACATTTTTTGCAGGAGACTGGTCTCATCCA ATGTCTCAACAAATCTATGATCTCCTTAGAGATCTTATGCAACGCATCAAAGCCCTCGGC TATGTTCCCGACAATAGGTTTGCTCTCCATGATGTGGATGATGAGGAGAAAGGTGATCTT CTTTCTGAACACAGTGAGAAGTTGGCTCTTGCTTATGGTATTCTAACAACAGCTCCAGGG GCTCCTATTCGCATCACCAAGAACCTTCGTGCATGTGGTGATTGCCATAGTGCCTTTACA TATATCTCTATAATCATTGAACATGAAATCATAGTCAGAGACTCGAGCCGCTTCCATCAT TTCAAGAATGGATCTTGCTCCTGCAGAGGCTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_15s0046g03020.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:15:19672585:19675581:-1 gene:VIT_15s0046g03020 transcript:VIT_15s0046g03020.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MLISLPRLKPKPPLLFLTTFFFSTASSTTDLTSTLFHQCKSLASAELIHQQLLVQGLPHD PTHIISMYLTFNSPAKALSVLRRLHPSSHTVFWWNQLIRRSVHLGFLEDVLQLYRRMQRL GWRPDHYTFPFVLKACGEIPSFRCGASVHAVVFASGFEWNVFVGNGLVSMYGRCGAWENA RQVFDEMRERGVGDLVSWNSIVAAYMQGGDSIRAMKMFERMTEDLGIRPDAVSLVNVLPA CASVGAWSRGKQVHGYALRSGLFEDVFVGNAVVDMYAKCGMMEEANKVFERMKVKDVVSW NAMVTGYSQIGRFDDALGLFEKIREEKIELNVVTWSAVIAGYAQRGLGFEALDVFRQMRL CGSEPNVVTLVSLLSGCALAGTLLHGKETHCHAIKWILNLDENDPGDDLMVINALIDMYS KCKSPKAARAMFDLIPPKDRSVVTWTVLIGGNAQHGEANEALELFSQMLQPDNFVMPNAF TISCALMACARLGALRFGRQIHAYVLRNRFESAMLFVANCLIDMYSKSGDVDAARVVFDN MHQRNGVSWTSLMTGYGMHGRGEEALQIFYEMQKVGLVPDGVTFVVVLYACSHSGMVDQG INYFNGMNKDFGVVPGAEHYACMVDLLSRAGRLDEAMELIRGMPMKPTPAVWVALLSACR VYANVELGEYAANQLLELESGNDGSYTLLSNIYANARCWKDVARIRYLMKNTGIKKRPGC SWVQGRKGTATFFAGDWSHPMSQQIYDLLRDLMQRIKALGYVPDNRFALHDVDDEEKGDL LSEHSEKLALAYGILTTAPGAPIRITKNLRACGDCHSAFTYISIIIEHEIIVRDSSRFHH FKNGSCSCRGYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_15s0046g03020.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:15:19672585:19675581:-1 gene:VIT_15s0046g03020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCTAATATCGTTGCCACGCCTAAAGCCAAAGCCTCCACTTCTCTTCCTCACCACCTTC TTCTTCTCCACTGCGTCATCAACCACTGATCTCACCTCCACCCTCTTCCACCAATGCAAA TCCCTAGCGTCCGCCGAGCTCATCCACCAACAACTCCTCGTCCAAGGCCTACCCCATGAC CCCACCCACATCATCTCCATGTACCTCACCTTCAACTCCCCCGCCAAAGCCTTGTCAGTC CTCCGGCGCCTCCACCCATCTTCACATACTGTTTTCTGGTGGAATCAGCTGATTAGACGA AGTGTGCATCTGGGTTTTCTCGAAGATGTCCTCCAACTTTACCGGCGGATGCAGAGGCTG GGGTGGAGGCCGGATCATTATACCTTCCCTTTTGTCCTCAAGGCTTGTGGGGAGATTCCG TCGTTTCGATGTGGGGCTTCGGTGCATGCGGTGGTGTTTGCTAGTGGGTTTGAGTGGAAT GTGTTTGTGGGTAATGGGTTGGTATCGATGTACGGGCGGTGTGGGGCTTGGGAGAATGCG AGACAGGTGTTTGATGAAATGCGGGAGAGGGGAGTTGGAGATTTGGTTTCGTGGAATTCG ATTGTGGCAGCTTATATGCAGGGTGGTGATTCAATTAGGGCGATGAAGATGTTTGAGAGA ATGACCGAGGATCTTGGAATCCGCCCGGATGCTGTTAGCCTTGTTAATGTACTCCCTGCT TGTGCTTCAGTGGGTGCGTGGTCGCGGGGCAAGCAGGTTCATGGTTATGCTCTTCGGAGT GGATTGTTTGAGGATGTGTTCGTGGGTAATGCTGTGGTTGATATGTATGCAAAGTGTGGC ATGATGGAGGAGGCAAACAAGGTTTTTGAGCGAATGAAGGTTAAGGATGTGGTTTCTTGG AATGCTATGGTTACTGGGTATTCTCAGATTGGTAGATTTGATGATGCCCTGGGTTTGTTT GAGAAGATTCGGGAGGAGAAGATTGAGCTCAATGTAGTGACTTGGAGTGCTGTGATTGCC GGGTATGCTCAGAGGGGTCTTGGTTTCGAAGCCCTGGACGTGTTTCGGCAAATGCGACTT TGTGGATCAGAGCCTAATGTTGTTACCCTTGTGTCCCTTCTATCAGGTTGTGCTTTGGCA GGAACACTACTTCATGGGAAGGAAACTCATTGTCATGCCATCAAATGGATTCTGAACCTA GATGAGAATGATCCAGGGGATGATCTGATGGTGATTAATGCTCTTATTGATATGTATTCC AAGTGCAAAAGCCCTAAAGCTGCACGAGCAATGTTTGATTTGATACCACCAAAAGATAGG AGTGTGGTGACTTGGACAGTCTTGATTGGTGGAAATGCCCAGCATGGGGAAGCTAACGAA GCCTTAGAACTTTTCTCCCAGATGCTCCAACCTGATAACTTTGTAATGCCAAATGCTTTT ACTATATCTTGTGCTCTGATGGCGTGTGCTCGTTTGGGTGCACTAAGATTTGGTAGACAA ATTCATGCTTATGTATTACGTAACCGTTTTGAGTCTGCGATGTTATTTGTGGCTAATTGC CTTATAGACATGTATTCCAAATCTGGAGATGTTGATGCAGCTCGGGTTGTTTTTGACAAC ATGCACCAGAGGAATGGTGTTTCCTGGACATCCCTAATGACAGGCTATGGCATGCATGGG CGTGGAGAAGAAGCTCTGCAGATTTTTTATGAGATGCAGAAAGTGGGTCTGGTGCCTGAT GGTGTGACCTTTGTAGTTGTGCTCTATGCTTGCAGCCATTCTGGGATGGTTGATCAGGGG ATCAATTACTTTAATGGCATGAACAAGGACTTTGGAGTGGTTCCTGGAGCAGAACACTAT GCCTGCATGGTTGATCTCTTGAGTCGTGCTGGTCGTTTGGATGAAGCTATGGAACTCATA AGAGGCATGCCTATGAAACCAACCCCAGCAGTGTGGGTAGCATTGCTTAGTGCTTGCAGG GTCTATGCAAATGTTGAACTTGGGGAATATGCCGCAAACCAGTTATTAGAGTTGGAGTCG GGGAATGATGGGTCCTATACCCTACTCTCAAACATTTATGCCAATGCCAGGTGTTGGAAA GATGTGGCTAGGATCAGATATTTGATGAAAAATACAGGGATCAAGAAGAGACCAGGTTGC AGTTGGGTCCAAGGGAGGAAGGGCACTGCAACATTTTTTGCAGGAGACTGGTCTCATCCA ATGTCTCAACAAATCTATGATCTCCTTAGAGATCTTATGCAACGCATCAAAGCCCTCGGC TATGTTCCCGACAATAGGTTTGCTCTCCATGATGTGGATGATGAGGAGAAAGGTGATCTT CTTTCTGAACACAGTGAGAAGTTGGCTCTTGCTTATGGTATTCTAACAACAGCTCCAGGG GCTCCTATTCGCATCACCAAGAACCTTCGTGCATGTGGTGATTGCCATAGTGCCTTTACA TATATCTCTATAATCATTGAACATGAAATCATAGTCAGAGACTCGAGCCGCTTCCATCAT TTCAAGAATGGATCTTGCTCCTGCAGAGGCTACTGGTGATCGCTAACTAATGATCAAGTT GGATGCTTTGCACTGGGAGAGCAAGTTATACAAGGCAAAAAGAAACTCATAAAGCAGCCA AATAATTCAAGATATCGTCAAAATTGATCTCAATTGGCCAGTATAACTGAAGACTGAGCA GAGGCTTTCACCACAGCTAATACATTAATTATTCTTTTAGATGGGTTGCTCATTGGTCAT TGGAAGCTTATTTGGATGGTGAGAAAATAATGGGAAGAGGTAAGAAAGAAAAGATTACTG TTATATTTCTCTTGTTTTGACATCCAAAACATTGTGAATTTATATGACCTTTCAATTTCA AGGTCAAAATAATGAGAAACCACACTCTTTGCGGCACTCCCAAGGCCTTACAAACAGCTT TAGAGGCATCAAGGACATTAGGTCATGGGGGCTGGTAGTCATGGTCAGCATCACACG