Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_15s0046g01830.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:15:18657101:18665933:1 gene:VIT_15s0046g01830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATCTCCAAATGCCGTTTTCTCTCCACTTTCATTGCGAATTTCAAATCTCACTCATCA GCTTCACCAACCCCATCTCCAACTCTCACTGGAGCCACCAAAAATGCTCCAAGCCACGAC CCACATCGTCAATCTCACTCATTTCCCTACCTGGGTGGCCTCAGAGCTTCATTGCCGGAA ACGGGGTTTACCAACTTGGTCGATTCTTGCTCAACCCATTCTTTCTCATCCCACGCCCTC AAAATCTCCGCCAAATTGGGGTTTCTTCATGGAGGAAAACAACTTCACGCACACGTAATA AAGTTAGGAAACTGTAACTTGCTGTCATTGCAAAATCAAGTTTTGCATGTTTATGTAAAA TGTAAGGAATTCAATGATGTATGCAAAATGTTCGATGAAATGCCTCTGAAGAATGTGGTA TCCTGGAACACGCTGATTTGTGGGGTAGTCGAGGGTAACTGTAAATTTGCATTGGTTCGT TTAGGGTTTCATTATTTTAGGCAGATGGTCTTGGAAATGATGGCTCCAAATTGCATAACC CTTAATGGTCTACTACGTGCTTCTATTGAGCTGAATGATGTTGGGATATGCAGACAGTTG CATTGTTTTATATTGAAATCAGGGTTTGATTCAAATTGTTTTGTGGGTAGTGCTCTTGTT GATTCATATGCAAAATTTGGTCTAGTTGATGAAGCTCAGTCTGCTTTTGATGAAGTTTCG AGTAGAGATTTGGTTTTGTGGAATGTGATGGTGTCTTGTTATGCTCTGAATGGTGTGCAA GGAAAGGCTTTTGGGGTCTTCAAATTGATGCGGTTGGAGGGTGTCAAGGGGGATAATTTC ACCTTCACTAGTATGATCAATTCATGTGGTGTTTTGGGATCTTGTGGATTGGGGAAGCAG GTTCATGGCCTTATTATTAGACTATCTTTTGATTTAGATGTATTGGTAGCTAGTGCTCTT GTTGATATGTACTCAAAGAATGAAAATATAGAAGATGCCCGAAAAGCCTTTGATGGGATG ATCGTTAAAAACATTGTGTCATGGACCACCATGATCGTGGGGTATGGACAGCATGGAGAT GGGAAGGAGGCTATGAGGCTTCTTCAAGAAATGATTCGAGTATATACTTACCCTGATGAG TTAGCCTTGGCTAGTATCCTTAGCTCATGTGGAAACTTATCAGCAACTAGTGAAGTTGTT CAAGTTCATGCTTATGTTGTAGAAAATGGGTTTGAAGCTTTTTTATCCATTGCAAATGCT CTAGTAAGTGCATATTCCAAGTGTGGCAGCATTGGCAGCGCGTTCCAATCCTTTAGCTCA GTTGCAGAGCCTGATATCATTTCATGGACTTCATTGATGGGTGCTTATGCCTTCCATGGT CTTTCAAAAGAAGGTGTAGAAGTTTTTGAGAAGATGTTATTTAGTAATGTGAGGCCAGAT AAAGTTGCCTTTCTTGGAGTCCTTTCTGCCTGTGCCCATGGGGGCTTTGTTCTTGAGGGG CTTCATTACTTCAATCTAATGATCAATGTATATCAAATTATGCCTGATTCAGAGCATTAC ACTTGCATTATTGATCTTCTTGGGCGTGCTGGTTTTTTGGATGAAGCTATCAATCTTTTG ACCTCAATGCCAGTTGAGCCCAGATCGGACACCTTGGGAGCATTCCTTGGGGCATGTAAA GTACACAGAAATGTGGGGTTAGCAAGATGGGCATCAGAAAAGCTTTTTGTAATGGAGCCA AATGAACCTGCGAATTATAGCCTTATGTCTAACATGTACGCTTCCGTTGGGCATTGGTTT GATGTTGCCAGGGTTCGGAAACTGATGAGGGAGAGGTGTGATTTTAAAGTACCAGGTTGT AGCTGGATGGAGATTGCTGGTGAGGTTCATACATTTGTGTCAAGGGATAAGACCCACCCG CGAGCTGTACAGGTTTACGGTATGTTAGATTTGTTGGTTAGGCTCATGGAGGAAGATGAT GTTTCTGATATGGAGGTTTTAGGTCTCTCTCTCGCAGAGACAATGAAGAACCCAAATTTG ATGTACGGGAACCGGAACCATGGCTCCGGAGCACGAAGAACGCCGGACCGGCTAACGTAC TCGCCTAGTACCGTCGACTACGACGCATCCTCCATCCAGAAGTCGCGTAGCGGCCGGAAT CCGATGATGATGGCGGTCAAGTCAGTGGCTGGAGTTTTTGTTTCGTGCTTCACTCCGCCG GAAACAACGAGTTCGAAGAACTTTGGAGATTCTGACGAATTTAGAGCTCCTTCGGTTGCA TCCGATGTTTCGCGAGCTGGAAGTGTGAGAAGACGTGTCTCAGGCTCAAGTCATGGTATC TATGCCAATTCATACAATTCAACACATGGGAGAGAACCTGGGAGTGTGAAATTCACTTTG GAGGAGATCTACAAGGCAACAAGGAACTTCTCCCCTTCTTGGAAGATTGGACAAGGTGGT TTTGGGACAGTCTACAAGGGCAGACTTGAAGATGGAACCCTTGTTGCTGTCAAACGCGCT AAGAAGAGTCTGTATGATAAACATTTAGGTGTGGAATTTCAGAGTGAGATCCAGACACTG GCACAGGTCGAGCATTTGAATTTGGTGAGGTTTTATGGGTATTTGGAGCATGGAGATGAA AGAATTGTTGTTGTGGAGTATGTCCCCAATGGAACCCTCAGAGAACACTTGGATTGTGTA CAAGGCAACATTCTTGATTTTGCTGCACGGCTGGATGTTGCAATTGATGTGGCCCATGCC ATCACCTATCTTCACATGTACACAGATCACCCTATCATCCATAGAGACATTAAGTCTTCC AATATTCTTCTCACCGAAAATCTTCGAGCCAAGGTTGCCGACTTTGGTTTTGCTAGATTG GCAGCTGATACCGAATCAGGTGCCACCCATGTATCCACCCAAGTGAAAGGAACGGCTGGC TACCTAGACCCAGAATATCTGAGAACCTATCAACTCACTGAGAAGAGTGATGTCTACTCA TTTGGTGTATTACTTGTGGAACTAGTCACAGGTAGGTGCCCCATTGAAGCTAAACGGGAA CTCCCGGAGCGAATAACTGCCAAATGGGCCATGAAGAAATTCACCGACGGAGATGCAATT TTTACCTTGGATCCTAGACTGGAAAGGAATGCTGCAAATAACCTAGCACTGGAAAAGATT CTTGAACTAGCATTACAATGTTTGGCTCCACAGAAACAGAACCGACCAAGCATGAGGAGG TGTGCAGAGATCCTTTGGAGTATCCGGAAGGACCACAGGGAGCTATCAGCCTCAGACACT CGGTCACTCTCGTCTCATTCCCAGAAGAGTATTCAACTCAGAGAAGGATAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_15s0046g01830.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:15:18657101:18665933:1 gene:VIT_15s0046g01830 transcript:VIT_15s0046g01830.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MISKCRFLSTFIANFKSHSSASPTPSPTLTGATKNAPSHDPHRQSHSFPYLGGLRASLPE TGFTNLVDSCSTHSFSSHALKISAKLGFLHGGKQLHAHVIKLGNCNLLSLQNQVLHVYVK CKEFNDVCKMFDEMPLKNVVSWNTLICGVVEGNCKFALVRLGFHYFRQMVLEMMAPNCIT LNGLLRASIELNDVGICRQLHCFILKSGFDSNCFVGSALVDSYAKFGLVDEAQSAFDEVS SRDLVLWNVMVSCYALNGVQGKAFGVFKLMRLEGVKGDNFTFTSMINSCGVLGSCGLGKQ VHGLIIRLSFDLDVLVASALVDMYSKNENIEDARKAFDGMIVKNIVSWTTMIVGYGQHGD GKEAMRLLQEMIRVYTYPDELALASILSSCGNLSATSEVVQVHAYVVENGFEAFLSIANA LVSAYSKCGSIGSAFQSFSSVAEPDIISWTSLMGAYAFHGLSKEGVEVFEKMLFSNVRPD KVAFLGVLSACAHGGFVLEGLHYFNLMINVYQIMPDSEHYTCIIDLLGRAGFLDEAINLL TSMPVEPRSDTLGAFLGACKVHRNVGLARWASEKLFVMEPNEPANYSLMSNMYASVGHWF DVARVRKLMRERCDFKVPGCSWMEIAGEVHTFVSRDKTHPRAVQVYGMLDLLVRLMEEDD VSDMEVLGLSLAETMKNPNLMYGNRNHGSGARRTPDRLTYSPSTVDYDASSIQKSRSGRN PMMMAVKSVAGVFVSCFTPPETTSSKNFGDSDEFRAPSVASDVSRAGSVRRRVSGSSHGI YANSYNSTHGREPGSVKFTLEEIYKATRNFSPSWKIGQGGFGTVYKGRLEDGTLVAVKRA KKSLYDKHLGVEFQSEIQTLAQVEHLNLVRFYGYLEHGDERIVVVEYVPNGTLREHLDCV QGNILDFAARLDVAIDVAHAITYLHMYTDHPIIHRDIKSSNILLTENLRAKVADFGFARL AADTESGATHVSTQVKGTAGYLDPEYLRTYQLTEKSDVYSFGVLLVELVTGRCPIEAKRE LPERITAKWAMKKFTDGDAIFTLDPRLERNAANNLALEKILELALQCLAPQKQNRPSMRR CAEILWSIRKDHRELSASDTRSLSSHSQKSIQLREG

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_15s0046g01830.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:15:18657101:18665933:1 gene:VIT_15s0046g01830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATCTCCAAATGCCGTTTTCTCTCCACTTTCATTGCGAATTTCAAATCTCACTCATCA GCTTCACCAACCCCATCTCCAACTCTCACTGGAGCCACCAAAAATGCTCCAAGCCACGAC CCACATCGTCAATCTCACTCATTTCCCTACCTGGGTGGCCTCAGAGCTTCATTGCCGGAA ACGGGGTTTACCAACTTGGTCGATTCTTGCTCAACCCATTCTTTCTCATCCCACGCCCTC AAAATCTCCGCCAAATTGGGGTTTCTTCATGGAGGAAAACAACTTCACGCACACGTAATA AAGTTAGGAAACTGTAACTTGCTGTCATTGCAAAATCAAGTTTTGCATGTTTATGTAAAA TGTAAGGAATTCAATGATGTATGCAAAATGTTCGATGAAATGCCTCTGAAGAATGTGGTA TCCTGGAACACGCTGATTTGTGGGGTAGTCGAGGGTAACTGTAAATTTGCATTGGTTCGT TTAGGGTTTCATTATTTTAGGCAGATGGTCTTGGAAATGATGGCTCCAAATTGCATAACC CTTAATGGTCTACTACGTGCTTCTATTGAGCTGAATGATGTTGGGATATGCAGACAGTTG CATTGTTTTATATTGAAATCAGGGTTTGATTCAAATTGTTTTGTGGGTAGTGCTCTTGTT GATTCATATGCAAAATTTGGTCTAGTTGATGAAGCTCAGTCTGCTTTTGATGAAGTTTCG AGTAGAGATTTGGTTTTGTGGAATGTGATGGTGTCTTGTTATGCTCTGAATGGTGTGCAA GGAAAGGCTTTTGGGGTCTTCAAATTGATGCGGTTGGAGGGTGTCAAGGGGGATAATTTC ACCTTCACTAGTATGATCAATTCATGTGGTGTTTTGGGATCTTGTGGATTGGGGAAGCAG GTTCATGGCCTTATTATTAGACTATCTTTTGATTTAGATGTATTGGTAGCTAGTGCTCTT GTTGATATGTACTCAAAGAATGAAAATATAGAAGATGCCCGAAAAGCCTTTGATGGGATG ATCGTTAAAAACATTGTGTCATGGACCACCATGATCGTGGGGTATGGACAGCATGGAGAT GGGAAGGAGGCTATGAGGCTTCTTCAAGAAATGATTCGAGTATATACTTACCCTGATGAG TTAGCCTTGGCTAGTATCCTTAGCTCATGTGGAAACTTATCAGCAACTAGTGAAGTTGTT CAAGTTCATGCTTATGTTGTAGAAAATGGGTTTGAAGCTTTTTTATCCATTGCAAATGCT CTAGTAAGTGCATATTCCAAGTGTGGCAGCATTGGCAGCGCGTTCCAATCCTTTAGCTCA GTTGCAGAGCCTGATATCATTTCATGGACTTCATTGATGGGTGCTTATGCCTTCCATGGT CTTTCAAAAGAAGGTGTAGAAGTTTTTGAGAAGATGTTATTTAGTAATGTGAGGCCAGAT AAAGTTGCCTTTCTTGGAGTCCTTTCTGCCTGTGCCCATGGGGGCTTTGTTCTTGAGGGG CTTCATTACTTCAATCTAATGATCAATGTATATCAAATTATGCCTGATTCAGAGCATTAC ACTTGCATTATTGATCTTCTTGGGCGTGCTGGTTTTTTGGATGAAGCTATCAATCTTTTG ACCTCAATGCCAGTTGAGCCCAGATCGGACACCTTGGGAGCATTCCTTGGGGCATGTAAA GTACACAGAAATGTGGGGTTAGCAAGATGGGCATCAGAAAAGCTTTTTGTAATGGAGCCA AATGAACCTGCGAATTATAGCCTTATGTCTAACATGTACGCTTCCGTTGGGCATTGGTTT GATGTTGCCAGGGTTCGGAAACTGATGAGGGAGAGGTGTGATTTTAAAGTACCAGGTTGT AGCTGGATGGAGATTGCTGGTGAGGTTCATACATTTGTGTCAAGGGATAAGACCCACCCG CGAGCTGTACAGGTTTACGGTATGTTAGATTTGTTGGTTAGGCTCATGGAGGAAGATGAT GTTTCTGATATGGAGGTTTTAGGTCTCTCTCTCGCAGAGACAATGAAGAACCCAAATTTG ATGTACGGGAACCGGAACCATGGCTCCGGAGCACGAAGAACGCCGGACCGGCTAACGTAC TCGCCTAGTACCGTCGACTACGACGCATCCTCCATCCAGAAGTCGCGTAGCGGCCGGAAT CCGATGATGATGGCGGTCAAGTCAGTGGCTGGAGTTTTTGTTTCGTGCTTCACTCCGCCG GAAACAACGAGTTCGAAGAACTTTGGAGATTCTGACGAATTTAGAGCTCCTTCGGTTGCA TCCGATGTTTCGCGAGCTGGAAGTGTGAGAAGACGTGTCTCAGGCTCAAGTCATGGTATC TATGCCAATTCATACAATTCAACACATGGGAGAGAACCTGGGAGTGTGAAATTCACTTTG GAGGAGATCTACAAGGCAACAAGGAACTTCTCCCCTTCTTGGAAGATTGGACAAGGTGGT TTTGGGACAGTCTACAAGGGCAGACTTGAAGATGGAACCCTTGTTGCTGTCAAACGCGCT AAGAAGAGTCTGTATGATAAACATTTAGGTGTGGAATTTCAGAGTGAGATCCAGACACTG GCACAGGTCGAGCATTTGAATTTGGTGAGGTTTTATGGGTATTTGGAGCATGGAGATGAA AGAATTGTTGTTGTGGAGTATGTCCCCAATGGAACCCTCAGAGAACACTTGGATTGTGTA CAAGGCAACATTCTTGATTTTGCTGCACGGCTGGATGTTGCAATTGATGTGGCCCATGCC ATCACCTATCTTCACATGTACACAGATCACCCTATCATCCATAGAGACATTAAGTCTTCC AATATTCTTCTCACCGAAAATCTTCGAGCCAAGGTTGCCGACTTTGGTTTTGCTAGATTG GCAGCTGATACCGAATCAGGTGCCACCCATGTATCCACCCAAGTGAAAGGAACGGCTGGC TACCTAGACCCAGAATATCTGAGAACCTATCAACTCACTGAGAAGAGTGATGTCTACTCA TTTGGTGTATTACTTGTGGAACTAGTCACAGGTAGGTGCCCCATTGAAGCTAAACGGGAA CTCCCGGAGCGAATAACTGCCAAATGGGCCATGAAGAAATTCACCGACGGAGATGCAATT TTTACCTTGGATCCTAGACTGGAAAGGAATGCTGCAAATAACCTAGCACTGGAAAAGATT CTTGAACTAGCATTACAATGTTTGGCTCCACAGAAACAGAACCGACCAAGCATGAGGAGG TGTGCAGAGATCCTTTGGAGTATCCGGAAGGACCACAGGGAGCTATCAGCCTCAGACACT CGGTCACTCTCGTCTCATTCCCAGAAGAGTATTCAACTCAGAGAAGGATAAGCAGGTAGG TGAACGGTGTCAGCAAGAGTTGCCATATCGCTGAAGTTGAATTTGTATCAGAGATCACAA CATACAGAGAGGAATCCCGCATGGATTACCATAGATATCCCACATGGATTGCCATGGATC AAAACAGTTCCAGTATTTGAAAGGAGCCATGGAAGAAGCATGCCAATGATCTTGGTAAAC AGCCTAAAATTTCACTCCAAGAAGCTTTTTTTTGCTATAAAAATTAGAGTCTCTACATGG AGTTAGCTTTTTTATGTATAGGAAATTCAGTTTTGAAATGGTTTATTGCTTTGCTTCCTC TAGATCCTTGTGTGAGTTTTTCCTTTTCATTTTTCCCTCTTGTGTGAGCTTTAGATATTT TTTCAGAAGATTTTATTTTTATCTATTCGAAACATTGGGATAATGTATTCTTTCTACCAT TTTTCACTGTGTCTCAGTGAAAATATCTTATTGTTTACACATGAAGAAAAAAAAAAAACA TATGGACCA