Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_15s0046g01060.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:15:18136473:18139214:-1 gene:VIT_15s0046g01060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAAAAACTAGTTCCATTGCACCACCTCCACCCACCTCTTCAAAATCCACTCACCCAC AAGCCAATCAAAACCCCAACCTCCAAGCTTTACTTGGATTCTCATTCTTCAGATGATTCC AATGTAATCACTTCTCTTACTTCAGTCAAAATGATGCACGCCCAGATGATAAAATTGCCC CAAAAGTGGAATCCTGATGCTGCAGCCAAAAATTTGATCTCCAGTTACTTGGGATTTGGT GATTTTTGGTCTGCTGCCATGGTTTTCTATGTGGGCTTGCCAAGAAACTATCTTAAATGG AACTCTTTTGTGGAGGAATTCAAGAGTTCTGCAGGGAGTTTACATATTGTTCTTGAGGTT TTCAAGGAGCTGCATGGTAAAGGAGTGGTATTTGATAGTGAAGTTTATAGTGTTGCTTTG AAAACTTGCACTAGGGTAATGGATATATGGCTTGGAATGGAGATCCATGGATGTTTAATC AAAAGGGGTTTTGATTTGGATGTGTATCTGAGGTGTGCTCTGATGAATTTCTATGGGAGG TGTTGGGGTTTAGAGAAAGCAAACCAAGTGTTTCATGAAATGCCAAACCCAGAAGCTCTA TTGTGGAATGAGGCAATTATACTGAATTTACAGAGTGAGAAATTGCAGAAGGGTGTAGAG CTGTTTCGAAAAATGCAATTTTCATTTTTGAAAGCTGAGACTGCTACAATTGTGAGAGTC CTCCAAGCTTGTGGAAAAATGGGGGCTCTCAATGCAGCAAAGCAGATTCATGGGTATGTT TTTAGATTTGGATTAGACTCAGATGTATCCTTATGCAATCCTCTGATTAGCATGTACTCC AAAAATGGCAAACTTGAACTAGCTAGAAGAGTTTTTGATTCAATGGAAAACAGGAACACA TCTTCATGGAACTCAATGATTTCCAGTTATGCTGCACTTGGTTTTTTGAATGATGCATGG AGTCTTTTCTATGAGTTAGAATCCTCTGATATGAAACCAGACATTGTAACTTGGAATTGC CTTTTATCAGGTCATTTTCTTCATGGTTATAAGGAAGAAGTACTGAATATTTTACAGAGA ATGCAAGGTGAGGGCTTCAAGCCTAACTCAAGCTCCATGACTAGTGTTCTTCAAGCTATT AGTGAACTGGGTTTCTTGAATATGGGGAAGGAAACTCATGGATATGTGTTGAGAAATGGG TTTGACTGTGATGTATATGTAGGAACTTCACTAATAGACATGTACGTGAAGAATCATAGC TTAACCAGTGCTCAAGCAGTTTTTGACAACATGAAGAACAGAAACATCTTTGCTTGGAAC TCTTTGGTTTCAGGATATTCCTTCAAGGGCATGTTTGAAGATGCTCTAAGGCTATTGAAT CAGATGGAAAAGGAAGGAATCAAACCCGATTTGGTGACATGGAATGGTATGATTTCAGGG TATGCAATGTGGGGCTGTGGTAAGGAAGCGTTGGCTGTGCTCCATCAAACCAAAAGTCTG GGATTGACCCCTAATGTGGTCTCATGGACTGCTCTGATATCAGGATCCTCACAGGCGGGA AACAATAGAGATTCCCTCAAGTTTTTTGCCCAAATGCAGCAAGAAGGCGTCATGCCTAAT TCAGCTAGCATCACATGCTTGCTTCGCGCTTGTGCCAGCCTGTCTTTGCTGCAGAAGGGC AAAGAGATACACTGTCTCAGTATAAGAAACGGTTTCATTGAAGATGTTTTTGTAGCAACA GCTCTCATTGACATGTACAGCAAGTCCAGCAGCTTAAAGAATGCTCACAAGGTTTTCAGG AGGATTCAGAACAAAACATTAGCCTCCTGGAACTGTATGATCATGGGGTTTGCCATTTTT GGGCTTGGGAAAGAGGCTATATCTGTTTTTAATGAAATGCAGAAAGTGGGTGTCGGCCCT GATGCCATAACCTTCACTGCTCTCCTCTCTGCTTGCAAAAATTCAGGTTTGATTGGGGAA GGATGGAAATACTTTGACAGTATGATAACAGATTATAGAATAGTCCCTAGGCTTGAACAT TACTGCTGCATGGTTGATCTTCTGGGTAGAGCTGGCTATCTTGATGAAGCTTGGGATTTA ATTCATACTATGCCACTAAAACCTGATGCTACCATCTGGGGTGCTCTTCTTGGATCCTGT CGAATCCATAAAAACCTCAAGTTTGCAGAGACTGCAGCAAAGAATCTCTTCAAGTTGGAA CCTAATAACTCTGCTAATTACATCTTAATGATGAACTTATACTCAATTTTCAACAGATGG GAAGACATGGATCATCTTAGAGAATTGATGGGCGCTGCAGGGGTGAGGAACCGGCAGGTG TGGAGCTGGATACAAATTAACCAGAGGGTTCATGTGTTCTCTTCTGATGAGAAACCCCAT CCAGATGCAGGGAAAATATATTTTGAGCTGTACCAGTTAGTTTCAGAAATGAAGAAACTG GGATATGTGCCTGATGTCAACTGTGTATATCAAAACATGGATGAGGTAGAGAAGCAGAAG ATTCTGTTAAGCCACACTGAGAAACTGGCCATCACCTATGGACTGATCAAGATGAAAGCA GGTGAACCCATAAGGGTAATCAAGAACACAAGAATATGTTCCGACTGTCACTCGGCTGCA AAATACATATCACTGGTAAAAGCCCGGGAGCTTTTCCTCCGGGATGGTGTTCGGTTTCAC CATTTCAGGGAAGGGAAGTGTTCCTGTAATGATTTCTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_15s0046g01060.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:15:18136473:18139214:-1 gene:VIT_15s0046g01060 transcript:VIT_15s0046g01060.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MEKLVPLHHLHPPLQNPLTHKPIKTPTSKLYLDSHSSDDSNVITSLTSVKMMHAQMIKLP QKWNPDAAAKNLISSYLGFGDFWSAAMVFYVGLPRNYLKWNSFVEEFKSSAGSLHIVLEV FKELHGKGVVFDSEVYSVALKTCTRVMDIWLGMEIHGCLIKRGFDLDVYLRCALMNFYGR CWGLEKANQVFHEMPNPEALLWNEAIILNLQSEKLQKGVELFRKMQFSFLKAETATIVRV LQACGKMGALNAAKQIHGYVFRFGLDSDVSLCNPLISMYSKNGKLELARRVFDSMENRNT SSWNSMISSYAALGFLNDAWSLFYELESSDMKPDIVTWNCLLSGHFLHGYKEEVLNILQR MQGEGFKPNSSSMTSVLQAISELGFLNMGKETHGYVLRNGFDCDVYVGTSLIDMYVKNHS LTSAQAVFDNMKNRNIFAWNSLVSGYSFKGMFEDALRLLNQMEKEGIKPDLVTWNGMISG YAMWGCGKEALAVLHQTKSLGLTPNVVSWTALISGSSQAGNNRDSLKFFAQMQQEGVMPN SASITCLLRACASLSLLQKGKEIHCLSIRNGFIEDVFVATALIDMYSKSSSLKNAHKVFR RIQNKTLASWNCMIMGFAIFGLGKEAISVFNEMQKVGVGPDAITFTALLSACKNSGLIGE GWKYFDSMITDYRIVPRLEHYCCMVDLLGRAGYLDEAWDLIHTMPLKPDATIWGALLGSC RIHKNLKFAETAAKNLFKLEPNNSANYILMMNLYSIFNRWEDMDHLRELMGAAGVRNRQV WSWIQINQRVHVFSSDEKPHPDAGKIYFELYQLVSEMKKLGYVPDVNCVYQNMDEVEKQK ILLSHTEKLAITYGLIKMKAGEPIRVIKNTRICSDCHSAAKYISLVKARELFLRDGVRFH HFREGKCSCNDFW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_15s0046g01060.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:15:18136473:18139214:-1 gene:VIT_15s0046g01060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAAAAACTAGTTCCATTGCACCACCTCCACCCACCTCTTCAAAATCCACTCACCCAC AAGCCAATCAAAACCCCAACCTCCAAGCTTTACTTGGATTCTCATTCTTCAGATGATTCC AATGTAATCACTTCTCTTACTTCAGTCAAAATGATGCACGCCCAGATGATAAAATTGCCC CAAAAGTGGAATCCTGATGCTGCAGCCAAAAATTTGATCTCCAGTTACTTGGGATTTGGT GATTTTTGGTCTGCTGCCATGGTTTTCTATGTGGGCTTGCCAAGAAACTATCTTAAATGG AACTCTTTTGTGGAGGAATTCAAGAGTTCTGCAGGGAGTTTACATATTGTTCTTGAGGTT TTCAAGGAGCTGCATGGTAAAGGAGTGGTATTTGATAGTGAAGTTTATAGTGTTGCTTTG AAAACTTGCACTAGGGTAATGGATATATGGCTTGGAATGGAGATCCATGGATGTTTAATC AAAAGGGGTTTTGATTTGGATGTGTATCTGAGGTGTGCTCTGATGAATTTCTATGGGAGG TGTTGGGGTTTAGAGAAAGCAAACCAAGTGTTTCATGAAATGCCAAACCCAGAAGCTCTA TTGTGGAATGAGGCAATTATACTGAATTTACAGAGTGAGAAATTGCAGAAGGGTGTAGAG CTGTTTCGAAAAATGCAATTTTCATTTTTGAAAGCTGAGACTGCTACAATTGTGAGAGTC CTCCAAGCTTGTGGAAAAATGGGGGCTCTCAATGCAGCAAAGCAGATTCATGGGTATGTT TTTAGATTTGGATTAGACTCAGATGTATCCTTATGCAATCCTCTGATTAGCATGTACTCC AAAAATGGCAAACTTGAACTAGCTAGAAGAGTTTTTGATTCAATGGAAAACAGGAACACA TCTTCATGGAACTCAATGATTTCCAGTTATGCTGCACTTGGTTTTTTGAATGATGCATGG AGTCTTTTCTATGAGTTAGAATCCTCTGATATGAAACCAGACATTGTAACTTGGAATTGC CTTTTATCAGGTCATTTTCTTCATGGTTATAAGGAAGAAGTACTGAATATTTTACAGAGA ATGCAAGGTGAGGGCTTCAAGCCTAACTCAAGCTCCATGACTAGTGTTCTTCAAGCTATT AGTGAACTGGGTTTCTTGAATATGGGGAAGGAAACTCATGGATATGTGTTGAGAAATGGG TTTGACTGTGATGTATATGTAGGAACTTCACTAATAGACATGTACGTGAAGAATCATAGC TTAACCAGTGCTCAAGCAGTTTTTGACAACATGAAGAACAGAAACATCTTTGCTTGGAAC TCTTTGGTTTCAGGATATTCCTTCAAGGGCATGTTTGAAGATGCTCTAAGGCTATTGAAT CAGATGGAAAAGGAAGGAATCAAACCCGATTTGGTGACATGGAATGGTATGATTTCAGGG TATGCAATGTGGGGCTGTGGTAAGGAAGCGTTGGCTGTGCTCCATCAAACCAAAAGTCTG GGATTGACCCCTAATGTGGTCTCATGGACTGCTCTGATATCAGGATCCTCACAGGCGGGA AACAATAGAGATTCCCTCAAGTTTTTTGCCCAAATGCAGCAAGAAGGCGTCATGCCTAAT TCAGCTAGCATCACATGCTTGCTTCGCGCTTGTGCCAGCCTGTCTTTGCTGCAGAAGGGC AAAGAGATACACTGTCTCAGTATAAGAAACGGTTTCATTGAAGATGTTTTTGTAGCAACA GCTCTCATTGACATGTACAGCAAGTCCAGCAGCTTAAAGAATGCTCACAAGGTTTTCAGG AGGATTCAGAACAAAACATTAGCCTCCTGGAACTGTATGATCATGGGGTTTGCCATTTTT GGGCTTGGGAAAGAGGCTATATCTGTTTTTAATGAAATGCAGAAAGTGGGTGTCGGCCCT GATGCCATAACCTTCACTGCTCTCCTCTCTGCTTGCAAAAATTCAGGTTTGATTGGGGAA GGATGGAAATACTTTGACAGTATGATAACAGATTATAGAATAGTCCCTAGGCTTGAACAT TACTGCTGCATGGTTGATCTTCTGGGTAGAGCTGGCTATCTTGATGAAGCTTGGGATTTA ATTCATACTATGCCACTAAAACCTGATGCTACCATCTGGGGTGCTCTTCTTGGATCCTGT CGAATCCATAAAAACCTCAAGTTTGCAGAGACTGCAGCAAAGAATCTCTTCAAGTTGGAA CCTAATAACTCTGCTAATTACATCTTAATGATGAACTTATACTCAATTTTCAACAGATGG GAAGACATGGATCATCTTAGAGAATTGATGGGCGCTGCAGGGGTGAGGAACCGGCAGGTG TGGAGCTGGATACAAATTAACCAGAGGGTTCATGTGTTCTCTTCTGATGAGAAACCCCAT CCAGATGCAGGGAAAATATATTTTGAGCTGTACCAGTTAGTTTCAGAAATGAAGAAACTG GGATATGTGCCTGATGTCAACTGTGTATATCAAAACATGGATGAGGTAGAGAAGCAGAAG ATTCTGTTAAGCCACACTGAGAAACTGGCCATCACCTATGGACTGATCAAGATGAAAGCA GGTGAACCCATAAGGGTAATCAAGAACACAAGAATATGTTCCGACTGTCACTCGGCTGCA AAATACATATCACTGGTAAAAGCCCGGGAGCTTTTCCTCCGGGATGGTGTTCGGTTTCAC CATTTCAGGGAAGGGAAGTGTTCCTGTAATGATTTCTGGTGA